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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-15
Resolving sensitivity, specificity and signal contamination in Xenium spatial transcriptomics
2026-Jun, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文对Xenium空间转录组技术的灵敏度、特异性和信号污染进行了系统评估,并提出了信号纯化方法SPLIT 首次利用大规模乳腺癌和肺癌组织切片数据集系统解析Xenium技术噪声,并开发了SPLIT方法有效改善背景校正和细胞类型分辨率 研究主要基于乳腺癌和肺癌样本,未涉及其他组织类型;SPLIT方法的普适性有待进一步验证 系统评估Xenium空间转录组技术性能并开发信号纯化方法 超过40个乳腺癌和肺癌组织切片 数字病理学 乳腺癌, 肺癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据, 单细胞核RNA测序数据 超过40个肿瘤组织切片 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 Xenium Xenium空间转录组平台,多种基因面板
22 2026-06-15
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-Jun, Gene expression patterns : GEP IF:1.0Q4
研究论文 探究热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中的细胞及亚细胞分布差异 首次揭示HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层中具有不同的细胞类型和亚细胞分布模式 未明确阐述实验局限性 阐明HSP90同工型在大脑皮层中的独特功能角色 小鼠大脑皮层 机器学习 NA 免疫荧光染色, 荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 小鼠大脑皮层样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium NA
23 2026-06-15
CLEC14A correlates with neutrophil infiltration in hepatocellular carcinoma and mediates neutrophil recruitment across liver endothelial cells
2026-Jun-01, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 揭示CLEC14A与肝细胞癌中性粒细胞浸润的相关性,并介导中性粒细胞经肝内皮细胞的招募 首次发现血管生成受体CLEC14A在中性粒细胞招募中的新作用,并证明其不依赖已知配体MMRN2 主要基于体外和动物模型,缺乏临床干预验证;CLEC14A与免疫治疗疗效的直接关联尚未明确 阐明CLEC14A在肝细胞癌中性粒细胞跨内皮招募中的机制,为免疫治疗提供新靶点 肝细胞癌肿瘤血管、急性肝损伤血管、中性粒细胞 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学、siRNA敲低、抗体阻断、体外灌流实验、缺血再灌注模型 NA 基因表达数据、空间转录组数据、组织样本 公共数据集及手术切除肝细胞癌组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
24 2026-06-15
CD163⁺ monocytes and soluble CD163 as prognostic indicators in severe fever with thrombocytopenia syndrome: An integrative analysis
2026-Jun, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 整合分析揭示CD163⁺单核细胞和可溶性CD163作为发热伴血小板减少综合征预后指标的潜在价值 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和流式细胞术,结合多中心临床队列,建立基于CD163⁺单核细胞和sCD163的预测模型,并提出包含sCD163和血尿素氮的双标志物评分系统 三层次风险评分内的进一步亚组分析受限于样本量较小,结果应视为探索性 寻找发热伴血小板减少综合征入院时30天死亡风险的生物标志物和预测模型 发热伴血小板减少综合征患者、健康对照 数字病理学 感染性疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、酶联免疫吸附测定 Cox比例风险模型 基因表达数据、临床数据 单细胞RNA测序:15名SFTS患者和4名健康对照;临床队列:150名患者(132名幸存者,18名非幸存者) NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-06-15
Multi-Omics Integration Reveals Incomplete Reactivation of Developmental Cell-Cycle Programs in Adult Human Infarcted Hearts
2026-Jun, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 整合多组学数据揭示成年人类梗死心脏中发育期细胞周期程序的不完全再激活 首次通过多组学整合分析(单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq和ATAC-seq)揭示成年心脏梗死区域心肌细胞虽能进入细胞周期,但无法完成分裂的关键分子机制,并鉴定出ANLN、KIF18A等五个发育期相关基因的不完全再激活是主要瓶颈 基于公共数据集的分析可能受限于样本异质性和批次效应;人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞模型可能与体内实际情况存在差异 探究成年人类心肌梗死后细胞周期活跃的心肌细胞为何无法完成分裂的分子机制 人类胎儿心脏和成年梗死心脏样本 生物信息学 心血管疾病 单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq、ATAC-seq NA 基因表达数据、染色质开放性数据 多个公共数据集,具体样本数量未明确提及 NA 单核RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq、批量ATAC-seq NA NA
26 2026-06-15
Interleukin-34-Induced Arg1+ Macrophages Play a Key Role in Breast Cancer Brain Metastasis
2026-Jun-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过建立同基因免疫活性小鼠乳腺癌脑转移模型,发现白细胞介素-34诱导的Arg1+巨噬细胞在乳腺癌脑转移中发挥关键作用 首次揭示IL34通过诱导ARG1+巨噬细胞促进乳腺癌小脑转移的机制,并证实靶向IL34受体CSF1R的抗体可导致肿瘤缩小 基于小鼠模型,且IL34在人类样本中的表达仅依赖两个独立数据集,需进一步验证临床转化潜力 探究乳腺癌脑转移中IL34诱导的免疫微环境机制及其治疗靶点 小鼠乳腺癌脑转移模型、人类乳腺癌脑转移样本 机器学习 乳腺癌 空间转录组学 NA 转录组数据 两个独立人类脑转移样本数据集,小鼠模型未明确样本数量 NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-06-15
G-CSF enhances neutrophil function with potential involvement of INHBA during Aspergillus fumigatus infection
2026-Jun, International journal of medical microbiology : IJMM IF:4.5Q1
研究论文 研究G-CSF激活的中性粒细胞在烟曲霉感染中的功能增强作用,并探索INHBA的可能参与 首次揭示G-CSF通过下调INHBA增强中性粒细胞抗真菌功能,并提出离体G-CSF激活的中性粒细胞过继转移作为一种新的免疫治疗策略 未完全阐明INHBA调控中性粒细胞功能障碍的分子机制,且研究仅限于小鼠模型 探究G-CSF激活中性粒细胞对侵袭性烟曲霉感染的治疗潜力及INHBA的调控作用 烟曲霉感染小鼠模型及中性粒细胞 数字病理学 侵袭性曲霉病 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA 基因表达数据 免疫抑制小鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
28 2026-06-15
Targeting Osteoporosis-Osteoarthritis Comorbidity: Multi-Omics Identification of SON and Exploration of Therapeutic Agents
2026-May-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过多组学方法鉴定SON蛋白作为骨质疏松与骨关节炎共病的关键蛋白,并探索潜在治疗药物尼洛替尼 首次利用WGCNA、Mendelian randomization和单细胞测序等多组学方法鉴定SON蛋白是连接骨质疏松和骨关节炎的关键分子,并通过FDA药物数据库虚拟筛选发现尼洛替尼作为候选药物 需要进一步的功能研究来确认SON蛋白的因果作用,且尼洛替尼的抑制作用仅在体外实验中验证 探索骨质疏松和骨关节炎共病的共享分子通路并鉴定潜在治疗靶点 骨质疏松和骨关节炎共病中的分子机制及SON蛋白 机器学习 骨质疏松,骨关节炎 WGCNA, Mendelian randomization, 单细胞测序, 虚拟筛选 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
29 2026-06-15
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2026-May-27, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用具有脑回结构的雪貂模型,系统表征了皮层放射状胶质细胞的分子特征和谱系动态,揭示了保守的调控程序及其在神经发生和胶质发生中的作用 首次在雪貂模型中系统解析了外层放射状胶质细胞的ERK/PKA信号协同作用,并发现YAP/TAZ和SHH通路分别调控不同区域胶质放射状胶质细胞的谱系分化,提出了一个整合信号网络共同调控皮层神经发生、胶质发生和进化扩张的模型 未提及具体局限性 揭示皮层放射状胶质细胞在神经发生和胶质发生中的分子特征和谱系分化调控机制 雪貂和人类皮层组织中的放射状胶质细胞 机器学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 雪貂和人类皮层样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
30 2026-06-15
Region-Resolved Integrative Multi-Omic Characterization Reveals Diverse Tumor and Microenvironment Features of Pituitary Neuroendocrine Tumors
2026-May-12, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 首次整合蛋白质组、代谢组和单细胞转录组的多组学分析,揭示垂体神经内分泌肿瘤海绵窦区和鞍区的区域异质性及肿瘤微环境特征 首次对垂体神经内分泌肿瘤的不同解剖区域(海绵窦和鞍区)进行整合多组学分析,发现海绵窦肿瘤中癌相关成纤维细胞通过IGF1-IGF1R-MAPK1轴驱动肿瘤细胞增殖,并揭示脯氨酸作为关键代谢物促进微环境重塑 标题与摘要未明确说明研究局限性 探究垂体神经内分泌肿瘤海绵窦侵袭的区域差异,揭示其分子机制和微环境特征,为精准治疗提供靶点 从海绵窦和鞍区获取的垂体神经内分泌肿瘤样本 分子生物学 垂体神经内分泌肿瘤 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞转录组测序 NA 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-06-15
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-May, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞转录组学解析高产蛋鸡斑点蛋的分子特征 首次通过单细胞RNA测序构建斑点蛋壳的细胞图谱,揭示不同细胞类型的分子特征及斑点组与对照组间的细胞通信差异 未提及 探究蛋壳斑点表型的遗传机制和细胞基础 高产蛋鸡的子宫组织 单细胞转录组学 禽类蛋壳品质问题 10X Genomics单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 斑点蛋率分组,每组子宫组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
32 2026-06-15
Genetic profile of Lepr+ skeletal stem/progenitor cells in the periodontal ligament and functional compensation during aging and bone repair
2026-May, Bone IF:3.5Q2
研究论文 通过谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示了牙周膜中Lepr阳性骨骼干/祖细胞的遗传特征及其在衰老和骨修复中的功能补偿 首次识别出以Thy1表达为特征、缺乏Runx2的Lepr PDLC亚群在谱系顶端,并揭示其与长骨来源Lepr SSPCs的共享表达谱及独特Kitl表达 Lepr PDLCs对骨细胞和牙骨质细胞的贡献在数量上有限,随年龄下降,可能具有性别二态性;遗传消融后骨再生体积不减,表明贡献有限并存在其他SSPCs的代偿 研究牙周膜中Lepr阳性骨骼干/祖细胞的分层组织、干性维持及其与骨骼稳态的关系 小鼠牙周膜中的Lepr阳性骨骼干/祖细胞(尤其是Lepr PDLCs) 数字病理学 NA 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
33 2026-06-15
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究识别并验证了系统性硬化症相关间质性肺病中一个扩增的CD57+细胞毒性CD8+ T细胞亚群,揭示了其与肺纤维化的关联 首次发现CD57+效应记忆CD8+ T细胞在SSc-ILD患者中特异性扩增,并阐明CD155-CD226共刺激通路增强其细胞毒性功能 研究主要基于外周血样本,肺组织样本来源于独立的患者队列且未经配对外周血比较;scRNA-seq分析依赖公共数据集,未进行原位功能验证 揭示系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 系统性硬化症合并间质性肺病患者的外周血T细胞和肺组织 免疫学 系统性硬化症相关间质性肺病 单细胞RNA测序, 免疫组化 NA 单细胞转录组数据, 组织样本 SSc-ILD患者外周血样本(具体数量未明确),独立患者队列的肺活检或切除标本 NA 单细胞RNA测序 NA 公共多发性ILD队列的单细胞RNA测序数据集
34 2026-06-15
ScRNA-Seq: A way to reveal the potential mechanisms of metastasis in small cell lung cancer
2026-May, Bulletin du cancer IF:1.1Q4
综述 本文综述了单细胞测序技术在揭示小细胞肺癌转移潜在机制中的应用 通过单细胞测序技术揭示肿瘤细胞异质性、肿瘤微环境和细胞间通讯网络,为小细胞肺癌转移机制提供新视角 主要讨论当前肺癌研究中遇到的挑战,但未提供具体实验数据或解决方案 探讨单细胞测序技术在小细胞肺癌转移机制研究中的应用和前景 小细胞肺癌的转移机制 数字病理学 小细胞肺癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-06-15
Hemp seed oil mediates injury mitigation and anti-inflammation in radiated splenic T cells
2026-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 探究大麻籽油对辐射后脾脏T细胞的损伤缓解和抗炎作用 首次通过单细胞RNA测序结合网络药理学揭示大麻籽油通过成纤维细胞Itgb8信号促进Treg细胞分化从而缓解辐射损伤的机制 未提及 阐明大麻籽油对急性辐射损伤的防护机制 辐射暴露小鼠的脾脏T细胞 机器学习和生物信息学 放射性损伤 单细胞RNA测序、HPLC、网络药理学 NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-03-13
MT2A buffering exhaustion marks cuproptosis in severe COVID-19: Multi-omics integration, computational modeling, and experimental validation
2026-May, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究通过整合多组学数据、计算建模和实验验证,揭示了MT2A在严重COVID-19中通过铜缓冲耗竭触发铜死亡的作用机制 提出了“铜缓冲-执行失衡”假说,首次将MT2A耗竭与铜死亡联系起来,并利用单细胞转录组学、蛋白质组学和计算模拟验证了这一机制 研究主要基于公开数据集和小鼠模型,缺乏大规模临床样本的直接验证,且LUS放射组学作为宏观标志物的特异性有待进一步确认 阐明严重COVID-19中铜死亡的分子机制,并识别新的氧化还原检查点作为治疗干预靶点 严重COVID-19患者的外周血单核细胞、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本,以及LPS诱导的小鼠模型 计算生物学 COVID-19 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 计算建模, 虚拟敲除模拟, 床边肺超声放射组学 scTenifoldKnk, 单细胞伪时间分析 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 三个独立数据集:GSE158055(PBMC单细胞转录组,24个基因)、GSE145926(BALF单细胞转录组,31个基因)、Nie2021(肺组织蛋白质组,26个蛋白质),以及LPS诱导的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
37 2026-06-15
Single-cell profiling reveals distinct populations of tumor-associated macrophages and metastatic tumor cells in breast cancer brain metastasis
2026-Apr-25, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞测序揭示乳腺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞和转移性肿瘤细胞的不同亚群特征 首次在单细胞水平全面解析乳腺癌脑转移的肿瘤免疫微环境,并鉴定了GABRB3和NRXN1作为脑转移适应性的候选调控因子 研究样本量较小(仅7例患者用于scRNA-seq),且功能验证仅限于异种移植模型,可能无法完全代表人类疾病 探索乳腺癌脑转移的分子机制,鉴定关键调控因子 乳腺癌脑转移患者组织样本、脑脊液、循环肿瘤细胞及原发肿瘤 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 批量DNA测序 NA 基因表达数据, DNA测序数据 7例患者用于scRNA-seq,47例患者用于批量DNA测序,共131,880个单细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量DNA测序 NA NA
38 2026-06-15
Spatial profiling of chronic liver disease: a pilot spatial case series
2026-Apr-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用测序空间转录组学分析酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎的组织微环境与功能分区 首次通过病毒感知工作流程实现肝炎病毒RNA的原位检测,并结合组织学指导的生态位注释和细胞间通讯分析,揭示慢性肝病组织中反复出现的假小叶功能结构 样本量较小(仅4例通过质控),且乙型肝炎病毒剖面的补充分析未纳入核心下游分析 探究不同病因背景下慢性肝病的空间组织特征及其共享功能架构 酒精相关肝病、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎和慢性丙型肝炎的肝脏组织样本 数字病理学 慢性肝病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 8例肝脏组织(4例通过质控纳入核心分析) NA 空间转录组学 NA 基于测序的空间转录组学
39 2026-06-15
Alzheimer's disease risk protein SorLA regulates ER homeostasis and lipid metabolism in human microglia, with conserved effects in neurons
2026-04-06, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 该研究揭示了阿尔茨海默病风险蛋白SorLA在人小胶质细胞中调控内质网稳态和脂质代谢的功能,并发现其在神经元中具有保守效应 首次阐明SorLA在小胶质细胞内质网稳态和脂质代谢中的新角色,超越了其已知的内吞运输功能,并发现该通路在神经元中保守存在 主要基于体外细胞模型和有限的人脑组织样本,可能无法完全反映体内复杂环境 探究SorLA蛋白在阿尔茨海默病相关小胶质细胞功能障碍中的分子机制 人脑组织、快速尸检原代小胶质细胞、CRISPR工程化人iPSC衍生小胶质细胞和神经元 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 脂质组学, 蛋白质组学, CRISPR基因编辑 NA 基因表达数据, 脂质组学数据, 蛋白质组学数据 多个人脑组织样本及iPSC衍生细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-06-15
Integrative multimodal transcriptomics identifies a cancer-associated fibroblast membrane signature for predicting prognosis and therapeutic response in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-06, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 通过整合单细胞、空间和批量RNA-seq数据,识别胰腺导管腺癌中成纤维细胞膜基因特征,构建预后模型PaFMS 首次系统鉴定PDAC特异性CAF膜基因,并基于LASSO-Cox模型构建11基因预后特征PaFMS,在多队列中验证其预测生存、药物敏感性和免疫治疗反应的能力 未提及具体局限性,但基于数据库分析可能受样本异质性和验证队列规模影响 识别PDAC中CAF膜蛋白表达特征,构建预后模型以预测患者生存和治疗反应 胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞膜蛋白 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据 33个单细胞样本(87,949个细胞)、2个空间转录组样本(7,011个点)、7个批量RNA-seq样本(642个样本) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
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