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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-06-23
A multi-tissue single-cell atlas of moso bamboo (Phyllostachys edulis) reveals cellular heterogeneity and lineage trajectories
2026-Jun-22, Tree physiology IF:3.5Q1
研究论文 对毛竹幼苗进行单细胞RNA测序,构建了包含31658个高质量转录组的细胞图谱,揭示了不同组织的细胞异质性和谱系发育轨迹 首次系统构建毛竹多组织单细胞转录组图谱,揭示根、茎、叶发育轨迹差异及关键调控因子 仅分析了幼苗阶段,未涵盖成年竹子的发育过程;功能验证实验需要进一步开展 阐明毛竹快速生长和适应环境的细胞基础 毛竹(Phyllostachys edulis)幼苗 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 毛竹幼苗,31658个高质量单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-06-23
Spatiotemporal Dynamics of NK Cell Immune Checkpoints Tim-3 and Lag-3 in Human Pregnancy: An Integrated Peripheral and Decidual Compartment Analysis
2026-Jun-22, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究综合外周血和蜕膜组织分析,探讨免疫检查点Tim-3和Lag-3在人类妊娠中的时空动态变化及其在复发性流产中的作用 首次整合外周血和蜕膜组织,揭示妊娠期Tim-3和Lag-3在NK细胞亚群中的时空特异性表达模式,并发现可溶性Tim-3与膜结合Tim-3的负相关关系 样本量有限,未明确提及具体数量;未深入探讨Tim-3和Lag-3的功能机制 阐明免疫检查点Tim-3和Lag-3在母胎免疫调节中的时空动态变化 人类妊娠期外周血和蜕膜组织中的NK细胞和T细胞 数字病理学 复发性流产 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括正常妊娠和复发性流产患者的样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
23 2026-06-23
Targeting a Myeloid-Regulatory B Cell Network Reverses Immune Paralysis in Periprosthetic Joint Infections
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示假体周围关节感染中免疫抑制网络,并发现靶向CXCR4阳性多形核髓系抑制细胞可逆转免疫麻痹 首次鉴定出高表达CXCR4的PMN-MDSC亚群与AHR和TIM1阳性调节性B细胞相互作用形成免疫抑制轴,并通过药物筛选发现阿仑膦酸钠可直接通过STAT3通路抑制该细胞亚群 未提及 探究假体周围关节感染中局部免疫抑制微环境的机制并开发临床可用的免疫调节策略 假体周围关节感染小鼠模型 机器学学习, 数字病理学 感染性疾病, 骨骼疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠假体周围关节感染模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
24 2026-06-23
An Integrative Strategy Delineates Modular Metabolic Remodeling and Potential Therapeutic Targets Across Metabolic Diseases
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据构建跨代谢疾病的代谢图谱,揭示模块化代谢重塑并鉴定潜在治疗靶点 首次建立跨7种主要代谢疾病的单细胞代谢图谱,并开发整合分析策略将227条代谢通路组织为15个协同代谢模块,阐明模块特异性重塑的跨细胞类型调控回路 未明确提及,但可能包括数据来源异质性、功能验证不足等 探究不同代谢通路在代谢疾病中的临床相关性及机制 来自86名患者的562699个单细胞,涵盖七种主要代谢疾病 机器学习 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 86名患者的562699个单细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-06-23
Condition-Associated Pattern Extraction and Recovery From Multi-Condition Single-Cell RNA-seq Data With CAPER
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 CAPER是一个矩阵分解框架,用于从多条件单细胞RNA-seq数据中提取并恢复与条件相关的生物学信号 CAPER能够明确区分共同生物学状态与条件特异性变异,直接输出可解释且批次校正的表达矩阵,保留并分离目标信号,优于现有方法 文章未明确提及局限性 开发一种鲁棒且可解释的工具,从多条件单细胞RNA-seq数据中恢复生物学信号,支持疾病研究和功能基因组学发现 多条件单细胞RNA-seq数据中的生物学信号和条件特异性变异 机器学习 肺腺癌, 1型糖尿病 单细胞RNA测序 矩阵分解 基因表达数据 包括模拟数据及三个真实数据集:高信噪比的PBMC免疫刺激数据、混杂信噪比的LUAD肿瘤微环境数据、低信噪比的T1D复杂自身免疫疾病数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-06-23
Longitudinal Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Evolution of Micro- and Macro-states in Chronic Myeloid Leukemia
2026-Jun-22, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 利用纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微状态和宏状态的演变 通过整合单细胞与批量转录组数据,运用状态转换理论,从理论层面解释了为何单细胞层面的离散疾病表型不清晰,而聚合的宏状态层面能清晰显现,为理解疾病演变提供了新框架 主要基于慢性髓系白血病数据验证,在其他癌症和复杂疾病中的通用性有待进一步验证 探索单细胞RNA测序与批量转录组数据中慢性髓系白血病的信息内容,澄清离散疾病表态如何从噪声单细胞数据中涌现 慢性髓系白血病患者的单细胞转录组数据 机器学习 慢性髓系白血病 单细胞RNA测序 状态转换模型 基因表达数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2026-06-23
Comparative transcriptional profiling of key macrophage and fibroblast subpopulations in rheumatoid arthritis-associated lung disease
2026-Jun-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 使用FLEX单细胞RNA测序比较类风湿关节炎相关肺疾病中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱 首次通过FLEX单细胞RNA测序技术对固定肺组织标本进行转录组分析,对比类风湿关节炎相关间质性肺疾病与类风湿关节炎肺结节中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的差异基因表达,并揭示与特发性肺纤维化的重叠纤维化程序 样本量较小(RA-ILD 9例,RA结节3例,非疾病对照4例),且仅限于肺组织标本,可能影响结果的普适性 比较类风湿关节炎相关肺疾病不同亚型中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱差异 类风湿关节炎相关间质性肺疾病和类风湿关节炎肺结节患者的肺组织标本 单细胞转录组学 类风湿关节炎相关肺病 FLEX单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 非疾病对照4例,RA-ILD 9例,RA结节3例 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium FLEX单细胞RNA测序采用探针捕获法分析固定肺组织标本
28 2026-06-23
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-Jun-22, The British journal of dermatology
综述 本文综述了单细胞和空间多组学技术揭示系统性硬化症皮肤分子异质性的研究,并探讨其对疾病分层和皮肤评估的意义 整合2021年至2025年间单细胞RNA测序和空间转录组学的研究成果,挑战了皮肤纤维化为统一过程的传统观点,提出不同细胞和空间程序可能贡献于临床上相似的皮肤受累模式 研究依赖于已发表文献,缺乏前瞻性队列验证;结论能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估取决于在更大规模临床特征明确的队列中的前瞻性验证 综合单细胞和空间多组学研究的发现,探讨分子异质性与临床表型的关系,以及其对皮肤评估、治疗反应异质性和患者亚组划分的意义 系统性硬化症患者的皮肤 数字病理学 系统性硬化症 单细胞RNA测序,空间转录组学 不适用 基因表达数据,空间转录组数据 不适用 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞测序平台,10x Visium空间转录组平台
29 2026-06-23
Immune subtyping of colorectal adenoma identifies a subtype with activated adaptive immunity ahead of progressing to cancer
2026-Jun-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过免疫分型鉴定结直肠腺瘤中具有活化适应性免疫的亚型,该亚型在进展为癌症前已存在 首次对结直肠腺瘤进行基于免疫基因的分子亚型分析,结合单细胞转录组数据揭示腺瘤中早期出现的TIGIT活化和CD8 T细胞耗竭特征 未提及具体限制 通过免疫分型表征结直肠腺瘤的免疫微环境,并评估其与癌症进展、基因表达特征及功能通路的关联 多个队列的结直肠腺瘤样本的转录组数据及单细胞转录组数据 机器学习 结直肠癌 RNA-seq 非负矩阵分解 基因表达数据 多个结直肠腺瘤队列样本 NA NA NA NA
30 2026-06-23
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals a prognostic neuro-mimicry signature in papillary thyroid carcinoma
2026-Jun-22, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 联合批量与单细胞RNA测序揭示甲状腺乳头状癌中一种预后相关的神经拟态特征 首次在甲状腺乳头状癌中通过整合批量与单细胞RNA测序数据,鉴定出一个由8个离子通道基因构成、可预测淋巴结转移的预后特征,并证实该特征源于恶性甲状腺细胞而非免疫细胞,揭示了肿瘤内在的神经拟态机制 该发现尚需实验验证,且数据仅来源于公共数据库(TCGA和GSE184362),缺乏独立外部队列的验证 探索甲状腺乳头状癌中离子通道基因的神经拟态作用及其临床预后意义 521例甲状腺乳头状癌患者的转录组数据及7个整合肿瘤样本中的65,744个单细胞 机器学习 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO逻辑回归 基因表达数据, 单细胞转录组数据 521例患者(TCGA队列),7个肿瘤样本(65,744个单细胞) Illumina 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA RNA-seq数据(Illumina平台),GSE184362单细胞RNA-seq数据
31 2026-06-23
Integrated bioinformatics, single-cell analysis, and experimental validation identify quercetin as a potential therapeutic candidate for intervertebral disc degeneration
2026-Jun-22, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
research paper 整合生物信息学、单细胞分析和实验验证,确定槲皮素为椎间盘退变的潜在治疗候选药物 首次通过整合差异表达基因分析、WGCNA、PPI网络、LASSO回归及单细胞RNA测序,鉴定出ZEB2、COL6A2、CCND1、RAP1A和GATA3五个关键枢纽基因,并利用分子对接和体外实验验证了槲皮素对这些基因表达的逆转作用 未在体内模型中验证槲皮素的治疗效果;单细胞分析基于公开数据集,可能无法完全代表体内微环境;分子对接仅提供初步计算证据,未进行结合亲和力的实验测定 探索椎间盘退变的分子机制并筛选潜在治疗化合物 椎间盘退变患者的髓核组织样本及LPS诱导的髓核细胞 machine learning, digital pathology 椎间盘退变 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 WGCNA, LASSO回归, PPI网络分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GSE70362数据集包含椎间盘退变和对照髓核样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-06-23
Integrative single-cell profiling and explainable AI identify monocyte-metabolic signatures as diagnostic biomarkers and candidate therapeutic targets in tuberculosis
2026-Jun-22, Archives of microbiology IF:2.3Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和可解释人工智能,发现并验证了结核病中单核细胞免疫代谢相关的6基因诊断标志物及潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序与大规模共识机器学习框架(113种算法组合),筛选出反映单核细胞免疫代谢重编程的6基因标志物,并通过可解释性分析(SHAP)和临床ELISA验证其诊断价值,同时利用网络药理学预测天然化合物靶向治疗潜力 临床验证队列规模较小,且ELISA检测仅评估了蛋白质水平,未深入探讨标志物在不同结核病亚型(如潜伏感染、活动性结核)的区分能力 开发基于宿主免疫代谢失调的可靠、可解释的诊断标志物及候选治疗靶点,以改进结核病的快速诊断和宿主导向治疗 结核病患者的外周血单核细胞及转录组公共数据 机器学习, 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 分子对接 glmBoost + 随机森林(RF)集成模型 基因表达数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 多个转录组公共队列及一个独立的初步临床队列(具体样本量未在摘要中明确说明) 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 NA
33 2026-06-23
Investigating the shared genetic architecture between selective immunoglobulin A deficiency and autoimmune diseases
2026-Jun-22, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 系统分析选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病的共享遗传结构 通过跨性状全基因组关联研究荟萃分析,首次系统揭示IgAD与10种常见自身免疫性疾病间的多效性位点和共享遗传基础,并利用单细胞RNA测序鉴定受影响的细胞类型 仅基于大规模GWAS汇总统计数据,缺乏原始个体级数据验证;分析限于欧洲血统人群,可能不适用于其他人群 探究选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病之间的共享遗传结构及潜在机制 选择性免疫球蛋白A缺乏症和10种常见自身免疫性疾病 机器学习 自身免疫性疾病 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、孟德尔随机化 NA 遗传数据、单细胞转录组数据 大规模GWAS汇总统计数据,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-06-23
Establishment and validation of the NEX-RiboTag system for profiling the excitatory neuronal translatome in the postnatal mouse forebrain
2026-Jun-21, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 建立并验证了 NEX-RiboTag 系统,用于分析出生后小鼠前脑中兴奋性神经元的翻译组 首次建立了 NEX-RiboTag 小鼠品系,实现了对皮质和海马兴奋性神经元中核糖体结合 mRNA 的靶向分析,填补了转录身份与细胞类型特异性翻译输出之间的空白 可能存在 Cre 重组酶活性或RiboTag 标记效率的潜在限制,且研究仅限于出生后早期阶段(1周龄) 桥接转录组与翻译组之间的差距,探索兴奋性神经元特异性翻译调控 出生后小鼠前脑(皮质和海马)的兴奋性神经元 神经科学, RNA测序 不适用 RNA-seq, RiboTag, Cre-loxP 系统 不适用 RNA测序数据 出生后1周龄小鼠的皮质和海马组织样本 不适用 RNA-seq 不适用 不适用
35 2026-06-23
The Transcription Factor EGR2 Plays a Central Role in the Expansion and Function of TCRαβ+CD4-CD8- Double Negative T Cells in lpr Lupus Mice
2026-Jun-21, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 揭示转录因子EGR2在lpr狼疮小鼠中调控TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞扩增与功能中的核心作用 首次发现EGR2在调控狼疮小鼠中TCRβDNT细胞的扩增、异质性和功能方面起关键作用,并可能通过胸腺和外周阶段促进该类细胞生成 研究仅限于小鼠模型,且未明确EGR2在人类狼疮中的直接作用机制 探究转录因子EGR2在狼疮小鼠中TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞扩增和功能中的角色 B6/lpr狼疮小鼠及条件性敲除Egr2的淋巴细胞(CD2-CreEgr2B6/lpr)模型 免疫学 狼疮 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 B6/lpr小鼠两组(Egr2条件敲除组和对照组),涉及胸腺和脾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-06-23
Mitochondrial DNA heteroplasmy drives cortical neuronal disturbances in human organoids harbouring the common m.3243A>G mutation
2026-Jun-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过人类iPSC衍生的大脑类器官切片模型,研究常见m.3243A>G线粒体DNA异质性对皮质神经元的影响 首次利用人类iPSC源性大脑类器官模型模拟m.3243A>G突变的线粒体疾病,揭示异质性依赖性转录变化及深层层神经元的脆弱性 未提及具体限制 阐明异质性m.3243A>G突变如何引发皮质神经元功能障碍,为线粒体疾病机制提供见解并探索治疗策略 人类iPSC来源的大脑类器官切片模型,以及一位MELAS患者的脑尸检样本 机器学习 线粒体脑肌病伴乳酸中毒及卒中样发作(MELAS型) 单细胞RNA测序,iPSC衍生类器官培养 NA 单细胞转录组数据 人类iPSC源性大脑类器官切片模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-06-23
Identification of macrophage-enriched genes in ovarian cancer by single-cell RNA sequencing and establishment of a prognosis model
2026-Jun-21, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定卵巢癌中巨噬细胞富集的基因并建立预后模型 首次利用单细胞RNA测序结合hdWGCNA和LASSO回归构建七基因预后模型,揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性和促转移机制 模型验证仅在GEO数据集中进行,缺乏独立临床队列的外部验证;基因功能依赖生物信息学推断,需进一步实验验证 开发卵巢癌预后模型并探究肿瘤微环境中巨噬细胞的免疫调节作用 卵巢癌患者的肿瘤组织和正常组织中的免疫细胞,特别是肿瘤相关巨噬细胞 机器学习和数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 Cox回归和LASSO回归 单细胞转录组数据和基因表达数据 卵巢癌和正常组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
38 2026-06-23
Foxe1 deficiency impairs thyroid fate while supporting lung differentiation
2026-Jun-21, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 通过小鼠干细胞系、单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示Foxe1基因缺失破坏甲状腺分化而促进肺命运的决定 首次证明Foxe1缺失导致Nkx2-1+前肠祖细胞从甲状腺命运转向肺命运,且无需额外染色质重塑 研究仅基于体外小鼠干细胞模型,尚未在体内验证 探索Foxe1在甲状腺与肺谱系分化中的调控机制 小鼠干细胞系及分化形成的类器官 数字病理学 甲状腺疾病 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序 NA 转录组和染色质可及性数据 多个小鼠干细胞系和类器官样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2026-06-23
PD-1 H (VISTA) drives immunosuppressive reprogramming of glioma-associated myeloid cells to promote glioma progression
2026-Jun-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
research paper 本文研究了PD-1 H(VISTA)在胶质瘤相关髓系细胞中驱动免疫抑制重编程并促进胶质瘤进展的作用机制 首次系统阐明髓系限制性免疫检查点PD-1 H在胶质瘤相关髓系细胞中的功能角色,揭示了其通过AKT/NF-κB通路介导免疫抑制重编程的新机制,并验证了靶向PD-1 H的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类胶质瘤中PD-1 H的临床转化验证有限,且未涉及PD-1 H与其他免疫检查点的联合作用 探索髓系限制性免疫检查点PD-1 H在胶质瘤进展中的功能作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 胶质瘤相关髓系细胞,包括小胶质细胞和浸润巨噬细胞 digital pathology glioma 单细胞RNA测序,免疫组化,转录组分析 NA 图像,文本数据 人类胶质瘤组织样本及小鼠原位胶质瘤模型 NA single-cell RNA-seq NA NA
40 2026-06-23
Integrating MRI radiomics and transcriptomics to predict IDH mutation status and prognosis in glioma
2026-Jun-21, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 整合MRI影像组学和转录组学预测胶质瘤IDH突变状态和预后 结合MRI影像组学特征与转录组学分析,识别与IDH突变相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证这些基因在特定细胞亚群中的表达及其与免疫浸润细胞的相关性 样本量较小,且验证集为外部数据集,可能需要更多多中心数据进一步验证 研究MRI影像组学特征与IDH突变相关基因的关联,以预测胶质瘤IDH突变状态和预后 胶质瘤患者 数字病理学 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Western blotting LASSO回归 图像, 文本 来自TCIA的61个MRI文件(训练集和验证集7:3)和66名经病理确认的胶质瘤患者作为外部验证集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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