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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-03-17
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-Mar-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的病人来源类器官,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 首次在单个胃癌肿瘤内多个部位建立PDOs,并通过单细胞分析揭示其基因表达相似性和差异性,特别是神经内分泌肿瘤标志物的上调及热休克蛋白的变异性 PDOs在捕捉肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 评估病人来源类器官是否能够准确反映胃癌肿瘤内的异质性 来自单个胃癌肿瘤不同部位的病人来源类器官 数字病理学 胃癌 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自单个胃癌肿瘤多个部位的PDOs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-03-17
BGN/MDK Axis in the Melanoma Tumor Microenvironment Strengthens Tumor Malignancy by Modulating Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts Crosstalk
2026-Mar-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过空间转录组学、单细胞RNA测序等技术,揭示了黑色素瘤肿瘤微环境中BGN/MDK轴通过调节癌细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用,增强肿瘤恶性程度的关键机制 首次发现m6A修饰因子协同上调BGN表达,并阐明BGN通过AEBP1调节MDK在CAFs中的表达,形成BGN/MDK轴驱动肿瘤恶性进展及免疫抑制 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证及直接靶向BGN的治疗策略探索不足 探究黑色素瘤肿瘤微环境中BGN的功能及其调控CAFs形成的分子机制 黑色素瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、正常成纤维细胞及肿瘤微环境 数字病理学 黑色素瘤 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 体外/体内实验, 功能分析, 分子检测 NA 转录组数据, 空间数据, 单细胞数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-03-17
A Soft Matrix Microenvironment Promotes Laterally Spreading Tumors via Oxidative Phosphorylation-Dependent Cell Adhesion
2026-Mar-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了侧向扩散肿瘤在软基质微环境中通过氧化磷酸化依赖性细胞粘附机制促进其横向生长的分子机制 首次将软基质微环境、氧化磷酸化代谢重编程和细胞粘附抑制联系起来,提出了ENTPD1-ADORA2B轴在调控侧向扩散肿瘤生长中的核心作用 研究主要基于临床样本和类器官模型,体内验证和临床转化应用仍需进一步探索 探究侧向扩散肿瘤与常规突出性腺瘤在分子机制和生长模式上的差异 侧向扩散肿瘤、常规突出性腺瘤及相邻正常组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 临床样本数据 临床标本和患者来源的类器官模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
24 2026-03-17
SlGRF1 mediates gibberellin signaling to control cut-budding in tomato
2026-Mar-15, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子基础,重点关注生长调节因子1(SlGRF1)及其与赤霉素(GA)信号传导的关联 结合单细胞RNA测序、时序转录组分析和遗传验证,阐明了芽再生的关键阶段,并鉴定出SlGRF1作为关键调节因子,揭示了GA信号通过抑制SlGRF1表达负调控芽起始的新机制 NA 研究番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子机制 番茄(Solanum lycopersicum) 植物分子生物学 NA 单细胞RNA测序,时序转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除,ChIP-seq分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
25 2026-03-17
DNA Methylation Profiling Reveals a Novel Subtype Harboring IDH Mutation in H3-altered Gliomas
2026-Mar-14, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过全基因组DNA甲基化分析,在H3突变胶质瘤中发现了一个新的IDH/H3共突变亚型,并揭示了其与改善生存相关的表观遗传特征 首次在H3突变胶质瘤中鉴定出IDH/H3共突变亚型,该亚型表现出全球DNA高甲基化和神经发育基因程序富集,与显著改善的生存相关 研究样本量相对较小(49例代表性病例),且依赖于临床队列和TCGA数据进行验证,可能无法完全代表所有H3突变胶质瘤的异质性 重新定义H3突变胶质瘤的分子分类,揭示其临床和表观遗传多样性,并识别亚型特异性治疗脆弱性 H3突变胶质瘤(特别是H3K27M和H3G34R/V突变)患者样本 数字病理学 胶质瘤 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、ChIP-seq、空间转录组学 无监督聚类分析 DNA甲基化数据、RNA测序数据、染色质免疫沉淀数据、空间转录组数据 49例代表性病例(来自375例H3突变胶质瘤临床队列),并使用TCGA数据进行验证 NA 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、ChIP-seq、空间转录组学 NA NA
26 2026-03-17
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型、三维显微镜和空间转录组学,揭示了肝脏纤维化中2型淋巴细胞(T2Ls)与3型淋巴细胞(T3Ls)在成纤维细胞微环境中的空间互作机制 首次发现T2Ls(主要是ILC2s)在肝脏纤维化中通过空间定位限制T3Ls(主要是γδ T细胞)的活性,从而调节肝脏修复过程 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类肝脏疾病中得到验证,且空间转录组学技术的分辨率可能限制细胞互作细节的解析 探究肝脏纤维化过程中淋巴细胞与成纤维细胞微环境的空间互作机制及其对病理纤维化的影响 小鼠肝脏纤维化模型中的2型淋巴细胞、3型淋巴细胞和成纤维细胞 空间转录组学 肝脏纤维化 三维显微镜、空间转录组学 NA 图像、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-03-17
Spatiotemporal molecular profiling of macrophage-fibroblast crosstalk defines checkpoints orchestrating onset and resolution of inflammation
2026-Mar-13, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,揭示了炎症性关节炎中巨噬细胞与成纤维细胞在炎症起始和消退阶段的异质信号通路 首次结合单细胞转录组和染色质可及性数据,系统解析了巨噬细胞-成纤维细胞互作在炎症动态过程中的分子机制,并识别了关键调控节点 研究主要基于关节炎模型,结果在其他炎症疾病中的普适性有待验证,且未涉及体内功能验证实验 阐明炎症性疾病起始和消退过程中巨噬细胞与成纤维细胞互作的分子机制 滑膜巨噬细胞和滑膜成纤维细胞亚群 数字病理学 关节炎 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 生物信息学建模方法 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
28 2026-03-17
Extracellular vesicle-mediated transcellular mitophagy as a modulatory target for moderate hyperoxia-induced alveolar developmental arrest in bronchopulmonary dysplasia
2026-Mar-13, Free radical biology & medicine
研究论文 本研究揭示了中度高氧通过成纤维细胞来源的细胞外囊泡介导的跨细胞线粒体自噬抑制,导致肺泡发育停滞的新机制,并提出了潜在的治疗靶点 首次发现成纤维细胞通过富含线粒体外膜蛋白VDAC1的细胞外囊泡,与肺泡II型上皮细胞形成VDAC1-GCN2复合物,从而抑制BNIP3依赖性线粒体自噬启动,阐明了高氧诱导支气管肺发育不良的新病理机制 研究基于动物模型,其结论在人类早产儿中的直接适用性仍需进一步验证;GW4869和hUC-MSC来源EVs的治疗效果及长期安全性需更多临床前研究 探究中度高氧暴露下成纤维细胞在支气管肺发育不良肺泡发育停滞中的功能作用及细胞间通讯机制 早产儿支气管肺发育不良模型中的肺成纤维细胞和肺泡II型上皮细胞 数字病理学 支气管肺发育不良 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-03-17
SEMA3C/PLXND1 Interaction Regulates Collagen Metabolism in Keloid Fibroblasts via the TGF-β1 Signaling Pathway
2026-Mar-13, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了SEMA3C/PLXND1信号轴通过激活TGF-β1通路调控瘢痕疙瘩成纤维细胞胶原代谢的新机制 首次证明SEMA3C/PLXND1相互作用通过TGF-β1信号通路驱动瘢痕疙瘩纤维化,并发现该配体-受体对是瘢痕疙瘩样本中最普遍的相互作用 研究主要基于体外细胞实验和公共数据集分析,缺乏体内动物模型验证 鉴定调控瘢痕疙瘩发病机制的新信号轴 瘢痕疙瘩成纤维细胞 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序, 转录组测序, qPCR, Western blotting, 免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 8个瘢痕疙瘩样本和8个正常皮肤样本(来自4个公共数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-03-17
Whole-embryo spatial transcriptomics at subcellular resolution from gastrulation to organogenesis
2026-03-12, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究开发了一种名为weMERFISH的全胚胎成像平台,用于在亚细胞分辨率下对斑马鱼胚胎进行空间转录组分析 首次实现了从原肠胚形成到器官发生阶段的全胚胎空间转录组分析,并创建了包含25,872个基因表达和294,954个染色质区域可及性的在线图谱 仅分析了495个基因的亚细胞表达模式,未覆盖全部基因;研究局限于斑马鱼模型 系统检测胚胎发育过程中的基因表达模式及其调控机制 斑马鱼胚胎 空间转录组学 NA 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH),活体成像 NA 空间基因表达数据,染色质可及性数据,成像数据 斑马鱼胚胎(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学,荧光原位杂交 weMERFISH(全胚胎MERFISH平台) 全胚胎成像平台,用于亚细胞分辨率的多重错误鲁棒荧光原位杂交
31 2026-03-17
A multi-scale biocompatibility atlas of porous silicon nanoparticles: From whole embryo to single-cell resolution
2026-Mar-12, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,结合整体表型分析和单细胞RNA测序,建立了从整体胚胎到单细胞分辨率的多尺度生物相容性评估体系,以评估多孔硅纳米颗粒的安全性 首次将斑马鱼整体表型分析与单细胞RNA测序技术整合,构建了一个从生物体到单细胞水平的多尺度生物相容性评估框架,为纳米药物的安全性评价提供了新方法 研究仅在斑马鱼胚胎模型中进行,尚未在哺乳动物或人体中进行验证;且主要关注急性暴露效应,长期生物相容性有待进一步评估 评估多孔硅纳米颗粒的生物相容性和安全性,为其作为下一代药物递送和诊疗一体化平台的临床应用提供依据 多孔硅纳米颗粒在斑马鱼胚胎中的生物效应 生物医学工程 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,表型数据 斑马鱼胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-03-17
Precision Neurodegeneration: Integrating Molecular Mechanisms, Biomarkers, and Targeted Therapeutics
2026-Mar-11, CNS & neurological disorders drug targets
综述 本文综述了神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)的分子机制、生物标志物和靶向治疗的最新进展,强调精准医学的整合应用 整合了蛋白质错误折叠、小胶质细胞反应、表观遗传失调和代谢失败等多机制,并展示了基于生物标志物的精准诊断和自适应平台试验的创新方法 NA 综述神经退行性疾病的分子机制、生物标志物和靶向治疗的最新进展,推动精准医学在临床中的应用 神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病及相关tau蛋白病) NA 神经退行性疾病 Cryo-EM, 单细胞转录组学, CRISPR-dCas9, PET, 表观遗传编辑 NA 分子机制数据、生物标志物数据、临床试验数据 NA NA NA NA NA
33 2026-03-17
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
研究论文 本研究识别了RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 首次将RPS14确定为年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因早期改变的生物标志物,并揭示了其与睾丸免疫微环境及肥大细胞的关联 研究样本量有限,且机制探索主要基于通路分析,需要进一步实验验证 识别与衰老相关的生物标志物,以早期检测年轻男性精子生成功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 年轻男性精子生成功能障碍患者的睾丸组织、老年小鼠、老年男性以及具有完全精子生成或精子生成功能障碍的育龄患者 数字病理学 男性不育症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量微阵列、免疫荧光 NA RNA测序数据、微阵列数据、组织图像 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集,以及来自老年小鼠、老年男性、育龄患者(具有完全精子生成或精子生成功能障碍)的睾丸组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
34 2026-03-17
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-10, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台,该平台通过增强局部药物暴露和免疫微环境重塑发挥双重抗肿瘤作用 开发了一种结合热敏局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束,并首次采用无针喷射注射技术进行瘤内给药,同时利用单细胞测序等多组学技术揭示了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 未明确提及临床前研究的动物模型具体类型及样本数量,长期毒性和免疫原性数据可能尚不完整 开发一种新型黑色素瘤局部治疗策略,以克服紫杉醇的溶解度低、全身毒性大和瘤内滞留不足等局限性 黑色素瘤 NA 黑色素瘤 单细胞测序、空间转录组学、蛋白质组学 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
35 2026-03-17
Liquiritigenin targets transferrin receptor to potentiate ferroptosis sensitivity in colorectal cancer cells
2026-Mar-09, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过高通量筛选发现甘草素(LIQ)作为结直肠癌细胞的铁死亡增敏剂,并揭示其通过靶向转铁蛋白受体(TFRC)抑制其泛素化降解,从而促进铁积累和脂质过氧化,增强铁死亡敏感性 首次发现甘草素(LIQ)作为天然化合物能通过稳定TFRC蛋白来增敏结直肠癌细胞的铁死亡,并验证了其与铁死亡诱导剂的协同抗肿瘤效果 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;机制研究虽深入,但其他潜在靶点或通路的影响未完全排除 通过高通量筛选鉴定能增敏结直肠癌细胞铁死亡的天然化合物,并阐明其分子机制 结直肠癌细胞、皮下异种移植模型、人源类器官模型 癌症生物学 结直肠癌 高通量筛选、分子对接与动力学模拟、单细胞RNA测序数据分析、免疫共沉淀、泛素化检测 NA 实验数据(细胞活力、铁水平、脂质过氧化等)、公共单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及细胞系、动物模型和类器官模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
36 2026-03-17
Distinct NK Cell Signatures Define Prognosis in HPV-Positive Versus HPV-Negative Head and Neck Cancer
2026-Mar-05, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的单细胞RNA测序数据,揭示了HPV状态如何塑造肿瘤浸润自然杀伤(NK)细胞的组成和功能,并识别了与预后相关的NK细胞亚群和可靶向的免疫逃逸机制 首次在HPV分层的HNSCC中系统描绘了肿瘤浸润NK细胞的转录组景观,识别出HPV阳性肿瘤中富集、与良好生存相关的特异性细胞毒性NK细胞亚群(CX3CR1+KLRB1+),并揭示了HPV阴性肿瘤中CLEC2-KLRB1抑制性轴这一新的免疫逃逸机制 临床转化需要在大型、前瞻性设计、解剖部位匹配的队列中进行验证,以区分HPV特异性效应与解剖部位依赖的免疫环境差异 阐明HPV状态在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中导致生存差异的免疫学机制,并识别新的治疗靶点 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者,根据HPV状态分为HPV阳性和HPV阴性两组 单细胞组学 头颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学(IHC) NA 单细胞转录组数据,组织切片图像数据 28名HNSCC患者(10名HPV阳性,18名HPV阴性)的scRNA-seq数据;10份FFPE组织切片的独立验证队列;TCGA-HNSC队列数据用于预后评估 NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-03-17
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
综述 本文综述了小麦穗发育过程中调控小穗数量的基因网络及其对产量的影响 整合了空间转录组学、单细胞分析和多组学研究,加速了新基因的发现,并探讨了超数小穗或分支结构的形成机制 将突变引入商业小麦品种时面临育性和粒重的权衡,需要进一步研究和育种努力 调控小麦穗发育中的小穗数量以提升谷物产量 小麦穗及其小穗的发育过程 植物发育生物学 NA 空间转录组学, 单细胞分析, 多组学研究 NA 转录组数据, 多组学数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞分析 NA NA
38 2026-03-17
Optic Nerve Head Spatial Transcriptomic Change in Nonhuman Primate Early Experimental Glaucoma
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用免疫组织化学和空间转录组学技术,探究了非人灵长类早期实验性青光眼中视神经头层状胶原和层后髓鞘的表达变化 首次在非人灵长类早期青光眼模型中,结合空间转录组学和免疫组化,揭示了视神经头不同区域(层前、层状、层后)的分子表达差异,特别是髓鞘相关基因的下调 样本量较小(n=3),且为实验性青光眼模型,结果向人类青光眼的直接外推需谨慎 探究早期青光眼发病过程中视神经头的空间分子变化 非人灵长类(食蟹猴)的视神经头组织 空间转录组学 青光眼 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间基因表达数据,组织图像 3只非人灵长类(单侧实验性青光眼模型) NA 空间转录组学 NA NA
39 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveal heat shock protein dysregulation in severe SARS-CoV-2-associated pediatric encephalopathy
2026-Mar-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了严重SARS-CoV-2相关儿童脑病中热休克蛋白基因的异常上调 首次在严重SARS-CoV-2相关儿童脑病中,通过单细胞RNA测序发现热休克蛋白基因HSPA1A和HSPB1在多种免疫细胞类型中特异性上调,并验证其作为潜在生物标志物 样本量较小,仅包括一名严重患者和少数对照;细胞间通讯分析发现的信号通路并非SARS-CoV-2相关脑病特有;需进一步研究验证热休克蛋白的致病机制 探究严重SARS-CoV-2相关儿童脑病的潜在致病机制 儿童患者的外周血单个核细胞 数字病理学 SARS-CoV-2相关脑病 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验 NA 单细胞转录组数据,血浆和血清蛋白数据 一名严重SARS-CoV-2相关脑病患儿,两名轻度脑病患儿,一名非SARS-CoV-2病原体引起的热性惊厥患儿,以及公开的儿科COVID-19无神经并发症数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2026-03-17
Integrative single‑cell multi‑omics network analysis to elucidate epigenetic regulation in neurodevelopmental disorders
2026-Mar, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究提出一个整合单细胞多组学框架,结合scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据,揭示神经发育障碍中表观遗传调控机制 整合单细胞多组学数据,构建细胞类型特异性表观遗传调控网络,量化染色质可及性、甲基化状态和转录输出的协同偏差,识别SOX11和CHD8作为多层主调控因子 未明确说明样本量或数据来源的具体限制,可能受限于单细胞多组学技术的整合复杂性 阐明神经发育障碍的表观遗传调控机制 发育中的人和小鼠脑组织以及患者来源的神经祖细胞模型 单细胞多组学 神经发育障碍 scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞DNA甲基化测序 典型相关分析、流形对齐、潜变量建模、网络推断 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
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