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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-26 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Oct, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
|
综述 | 探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应的差异,并指出单细胞RNA测序研究揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平变化与微血管结果的能力,且缺乏针对微血管氧化还原信号的特效疗法 | 阐明氧化还原机制在微血管功能调节和疾病发病机制中的作用 | 微血管系统及其内皮细胞 | 血管生物学 | 心血管疾病,自身免疫疾病,感染性疾病,血红蛋白病,炎症性疾病,血管炎,代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-26 |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix Domain Containing 1 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Transforming Growth Factor Beta Receptor 1 in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Oct, Genetic testing and molecular biomarkers
IF:1.1Q4
DOI:10.1177/19450265251384161
PMID:41022542
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研究论文 | 本研究探讨了CHCHD1通过调节TGF-β1信号通路促进肝细胞癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次揭示CHCHD1在肝细胞癌中通过调节TGF-β受体1影响肿瘤免疫微环境的新功能 | 研究样本量相对有限,机制研究主要在细胞系中进行,需要更多体内实验验证 | 探究CHCHD1在肝细胞癌进展中的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫浸润分析,蛋白质印迹,细胞迁移/侵袭实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 272例HCC组织和50例正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-26 |
TYK2 Promotes Immunosurveillance of Colorectal Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-24, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4224
PMID:40991399
|
研究论文 | 本研究通过小鼠结直肠癌类器官移植模型发现TYK2通过树突状细胞依赖的机制控制结直肠癌肝转移的免疫监视 | 首次揭示TYK2通过树突状细胞依赖的MHC-I抗原交叉呈递机制调控结直肠癌肝转移免疫监视 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索结直肠癌肝转移免疫监视的调控机制 | 结直肠癌肝转移小鼠模型和免疫细胞亚群 | 癌症免疫学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序,类器官移植模型 | NA | 基因表达数据,实验观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-26 |
PPARγ accelerates OSCC progression via Th17 polarization and CEBPA/IL-17C signaling
2025-Sep-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06296-6
PMID:40954243
|
研究论文 | 本研究揭示了PPARγ通过调控Th17细胞分化和CEBPA/IL-17C信号通路促进口腔鳞状细胞癌进展的新机制 | 首次发现PPARγ/CEBPA/IL-17C/IL-17A信号轴在促进Th17分化及OSCC肿瘤相关炎症中的作用 | 研究主要基于4NQO诱导的OSCC模型,临床样本验证尚不充分 | 探索PPARγ在调节肿瘤微环境及影响OSCC进展中的作用 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞、CD4+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、细胞共培养、动物模型 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-26 |
Abatacept restores dysregulated transcriptomic and proteomic profile in disorders of CTLA-4 insufficiency
2025-Sep-16, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.027
PMID:40967277
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法系统评估阿巴西普治疗对LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者的免疫调节作用 | 首次采用纵向流式细胞术、靶向转录组学、单细胞转录组学和血浆蛋白质组学整合分析,揭示阿巴西普治疗对免疫系统的多维度调控机制 | 研究对象为罕见疾病患者,样本量有限;未明确说明具体样本数量 | 探究阿巴西普治疗对CTLA-4功能不全相关疾病的免疫调节机制 | LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者 | 免疫学 | 原发性免疫失调疾病 | 流式细胞术, 转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 流式细胞数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-26 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-May, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
|
研究论文 | 本研究揭示了血管紧张素转换酶依赖性肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中导致PCYT2下调、线粒体膜破坏和活性氧过度生成的关键作用 | 首次发现ACE依赖性肾内AngII通过下调PCYT2破坏肾小管线粒体膜稳态并导致ROS过度生成的机制 | 研究主要基于动物模型,需要进一步临床验证;ACE抑制剂仅能部分改善肾小管损伤 | 探讨ACE依赖性肾内AngII在糖尿病肾小管损伤中的作用机制 | 2型糖尿病小鼠模型和肾小管细胞 | 肾脏病学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,肾动脉注射,酶活性检测 | NA | 基因表达数据,生化指标数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-25 |
A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.531610
PMID:36993575
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术构建了水螅神经系统的分子、空间和调控图谱 | 首次对水螅神经系统进行了最全面的分子和空间表征,识别了8种神经元类型和15种转录亚型,并构建了基因调控网络 | NA | 揭示水螅神经系统发育、稳态和再生的分子机制 | 水螅(Hydra vulgaris)神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,轨迹推断 | NA | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-25 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2024-Apr-24, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
|
研究论文 | 通过BARseq高通量原位测序技术揭示大脑皮层区域身份如何依赖于输入信号 | 首次在全皮层范围应用高通量原位测序技术,同时分析千万级细胞和数百万神经元,建立了转录组特征与皮层区域身份的关联 | 研究仅针对小鼠前脑,且基因panel限于104个细胞类型标记基因 | 探究大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中及其发育机制 | 小鼠前脑皮层神经元 | 神经科学 | NA | 原位测序,高通量测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 1030万细胞,包括419万皮层神经元,覆盖9个小鼠前脑半球 | NA | 原位测序 | BARseq | BARseq高通量原位测序技术 |
| 29 | 2025-10-24 |
Piezo1-Mediated Calcium Flux Transfers Mechanosignal to Yes-Associated Protein to Stimulate Matrix Production in Keloid
2025-Nov, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.03.039
PMID:40254148
|
研究论文 | 本研究揭示了Piezo1通过钙流调控YAP核转位促进瘢痕疙瘩基质产生的机械信号传导机制 | 首次发现Piezo1/钙流/YAP信号轴在瘢痕疙瘩机械信号传导中的关键作用,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探索机械力诱导瘢痕疙瘩形成的分子机制并寻找治疗靶点 | 人瘢痕疙瘩成纤维细胞和患者来源的瘢痕疙瘩异种移植模型 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞转录组分析、原子力显微镜、钙离子荧光指示剂、免疫荧光染色、转录组学 | NA | 基因表达数据、生物力学数据、影像数据 | 人瘢痕疙瘩成纤维细胞与正常皮肤成纤维细胞的比较研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-24 |
Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202419870
PMID:40605669
|
研究论文 | 本研究开发了一种具有非典型晶体结构的磷酸钙脂质体纳米材料,通过激活干扰素通路增强抗肿瘤免疫治疗 | 发现具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa,通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路激活干扰素,增强抗肿瘤免疫反应 | NA | 开发新型纳米材料以增强免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 骨髓源性树突状细胞、CT26肿瘤模型、肿瘤引流淋巴结中的免疫细胞 | 纳米医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-24 |
Spatial dissimilarity analysis in single-cell transcriptomics
2025-Sep-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101141
PMID:40840441
|
研究论文 | 开发空间差异分析方法用于揭示单细胞和空间转录组数据中的复杂双变量关系 | 提出空间差异分析方法,能够检测选择性剪接和等位基因特异性表达,在神经元和肿瘤细胞分析中表现出优于现有工具的准确性和灵敏度 | NA | 开发新方法以更好地理解单细胞和空间转录组数据中的细胞异质性和基因表达动态 | 神经元、肿瘤细胞、正常人类细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、全外显子组测序 | 空间差异分析方法 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-24 |
Randomized Spatial PCA (RASP): a computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629785
PMID:39763720
|
研究论文 | 提出一种名为RASP的计算高效空间转录组数据降维方法 | 开发了随机化两阶段PCA框架,比现有技术快数个数量级,支持非转录组协变量的灵活整合 | NA | 开发计算高效的空间转录组数据降维方法 | 人类和小鼠组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 随机化主成分分析(PCA) | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, 10x Xenium, 同时包含Stereo-Seq和MERFISH技术 |
| 33 | 2025-10-24 |
Analysis of individual patient pathway coordination in a cross-species single-cell kidney atlas
2025-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02285-0
PMID:40775269
|
研究论文 | 本研究构建了跨物种单细胞肾脏图谱并开发了CellSpectra计算工具,用于分析个体患者细胞类型特异性通路基因表达协调变化 | 开发了能量化基因表达协调变化的CellSpectra计算工具,创建了包含140个样本、超过100万细胞的跨物种单细胞肾脏图谱 | NA | 推进单细胞方法在临床精准医学中的应用,解决个体患者细胞类型特异性分子变化识别难题 | 人类和啮齿类动物的肾脏细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | CellSpectra计算工具 | 单细胞基因表达数据 | 140个样本,超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-23 |
MerQuaCo: a computational tool for quality control in image-based spatial transcriptomics
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.04.626766
PMID:39677693
|
研究论文 | 开发用于图像空间转录组学数据质量控制的自动化计算工具MerQuaCo | 首个能够自动检测和量化空间转录组学数据缺陷的计算工具,无需人工输入 | 研究基于641个小鼠脑切片数据,主要针对Vizgen MERSCOPE平台 | 开发空间转录组学数据质量控制的自动化方法 | 641个新鲜冷冻成年小鼠脑切片 | 空间转录组学 | NA | 图像空间转录组学 | NA | 空间转录组图像数据 | 641个小鼠脑切片 | Vizgen | 空间转录组学 | MERSCOPE | Vizgen MERSCOPE平台 |
| 35 | 2025-10-23 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了人类血管壁中早期间充质祖细胞的分布特征和功能特性 | 首次详细描绘了人类血管外膜干细胞微环境,发现CD201(PROCR)高表达定义了更原始的间充质祖细胞亚群 | NA | 表征人类血管周围祖细胞的表型、潜能和微解剖分布 | 人类血管组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-23 |
Accurate estimation of rare cell type fractions from tissue omics data via hierarchical deconvolution
2023-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.532820
PMID:36993280
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研究论文 | 提出一种名为HiDecon的分层反卷积方法,用于从组织组学数据中准确估计稀有细胞类型的比例 | 使用单细胞RNA测序参考和分层细胞类型树来建模细胞类型间的相似性和分化关系,通过跨层级协调细胞比例来校正估计偏差 | 需要单细胞RNA测序参考数据,且在细胞类型高度相关或极稀有情况下仍可能存在估计挑战 | 开发能够准确估计组织中细胞类型比例的方法,特别是针对稀有细胞类型 | 组织样本中的细胞类型比例 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,分层反卷积 | 分层反卷积模型 | 批量转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-22 |
SAMHD1 deficiency disrupts macrophage autophagy-lysosomal homeostasis and promotes inflammation via the mTOR-MITF-CTSD axis in ulcerative colitis
2025-Oct, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147188
PMID:40886983
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研究论文 | 本研究揭示了SAMHD1通过调控mTOR-MITF-CTSD轴维持巨噬细胞自噬-溶酶体稳态并抑制溃疡性结肠炎炎症的机制 | 首次发现SAMHD1在溃疡性结肠炎巨噬细胞中的关键调控作用,并阐明其通过mTOR-MITF-CTSD轴影响自噬-溶酶体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究SAMHD1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其分子调控机制 | 巨噬细胞、髓系特异性SAMHD1缺陷小鼠、结肠组织 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-22 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除Ptbp1基因评估其在视网膜神经发生和细胞命运决定中的作用 | 首次在发育过程中系统性评估Ptbp1在视网膜神经发生中的功能,挑战了Ptbp1作为神经发生主要抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育,未评估其他神经系统区域;主要使用小鼠模型,物种特异性需进一步验证 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用机制 | 小鼠视网膜祖细胞和Müller胶质细胞 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 条件性基因敲除, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 剪接模式数据, 转录组数据 | 胚胎期E16和成熟期小鼠视网膜样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-10-22 |
CD226 identifies effector CD8+ T cells during tuberculosis and costimulates recognition of Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116184
PMID:40886314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了结核病中CD8+ T细胞的不同谱系,并发现CD226在效应T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞中的关键共刺激作用 | 首次发现CD226是区分结核病中效应性和耗竭性CD8+ T细胞谱系的最显著差异表达基因,并证明CD226对CD8+ T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞具有关键共刺激功能 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,未在人类样本中验证 | 研究慢性结核分枝杆菌感染如何影响肺实质CD8+ T细胞的多样性及其识别感染巨噬细胞的机制 | C57BL/6J小鼠的肺实质CD8+ T细胞和结核分枝杆菌感染的巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染6周和41周的C57BL/6J小鼠细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-22 |
Phospholipid Scramblase 1 (PLSCR1) Regulates Interferon-Lambda Receptor 1 (IFN-λR1) and IFN-λ Signaling in Influenza A Virus (IAV) Infection
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624469
PMID:39605457
|
研究论文 | 本研究揭示了磷脂爬行酶1(PLSCR1)通过调控干扰素-λ受体1(IFN-λR1)和干扰素-λ信号通路在甲型流感病毒感染中的抗病毒机制 | 首次发现PLSCR1作为转录激活因子直接结合Ifn-λr1启动子,并在肺上皮细胞表面与IFN-λR1相互作用,其脂质爬行酶活性对抗流感功能非必需 | 仅使用有限动物模型研究组织水平作用机制 | 阐明PLSCR1在甲型流感病毒感染中的抗病毒机制 | 小鼠模型、气道上皮细胞 | 分子生物学 | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |