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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-03 |
Breast pericytes: a newly identified driver of tumor cell proliferation
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1455484
PMID:39741968
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和细胞培养实验,揭示了乳腺周细胞作为肿瘤微环境中的关键因子,能显著促进乳腺癌细胞增殖 | 首次成功分离并纯化乳腺周细胞,利用单细胞RNA测序定义了其异质性,并发现周细胞在部分乳腺肿瘤中脱离血管成为主要间充质细胞类型,且能诱导肿瘤细胞快速生长 | 周细胞在肿瘤中的具体刺激机制尚未完全阐明,且样本量可能有限,需要进一步研究验证 | 探究乳腺周细胞在乳腺癌微环境中的作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 | 乳腺组织中的周细胞和乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | FACS, 单细胞RNA测序, 转录组深度测序 | NA | RNA序列数据, 细胞培养数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-04-03 |
Combined near infrared photoacoustic imaging and ultrasound detects vulnerable atherosclerotic plaque
2023-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究结合近红外自发光声成像与超声成像,用于检测动脉粥样硬化斑块的脆弱性 | 首次将NIRAPA成像与超声结合,以区分稳定与脆弱斑块,并通过空间转录组学和蛋白质组学验证信号来源 | 研究为离体实验,样本量较小(25例患者),临床适用性需进一步验证 | 开发一种成像方法以检测动脉粥样硬化斑块的脆弱性 | 动脉粥样硬化斑块,特别是脆弱斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 近红外自发光声成像,超声成像,免疫组化,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 图像,分子数据 | 25例患者的切除斑块样本 | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 23 | 2026-04-03 |
JAK-STAT activation contributes to cytotoxic T cell-mediated basal cell death in human chronic lung allograft dysfunction
2023-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167082
PMID:36946463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了JAK-STAT信号通路在慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)中通过上调气道基底细胞MHC-I表达、介导细胞毒性T细胞杀伤的机制 | 首次在人类CLAD移植组织中结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析,发现JAK-STAT信号通过上调气道基底细胞MHC-I表达介导T细胞杀伤的新机制 | 研究基于移植组织样本,样本来源有限;机制验证主要在观察层面,缺乏体内干预实验 | 探究慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)的发病机制 | 人类肺移植受者的移植组织(CLAD患者) | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | 人类肺移植受者的移植组织样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-04-03 |
Single-cell transcriptomic dissection of the cellular and molecular events underlying the triclosan-induced liver fibrosis in mice
2023-02-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00441-3
PMID:36814339
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,系统解析了三氯生(TCS)暴露诱导小鼠肝纤维化的细胞和分子机制 | 首次提供了TCS暴露下小鼠肝脏的全面单细胞图谱,揭示了TCS如何调控多种特定细胞类型的活动和命运,以及细胞间配体-受体相互作用,从而促进肝纤维化 | 研究基于小鼠模型和短期TCS暴露,可能无法完全反映人类长期暴露的复杂情况;体外细胞模型的验证仍需进一步扩展 | 阐明TCS在起始阶段诱导肝毒性的潜在细胞和分子机制 | C57BL/6小鼠、正常肝细胞MIHA和肝星状细胞LX-2 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、免疫荧光、Masson三色染色、天狼星红染色、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、蛋白质数据、代谢物数据 | TCS处理组和对照组小鼠肝脏,超过76,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-04-03 |
Targeting macrophagic 17β-HSD7 by fenretinide for the treatment of nonalcoholic fatty liver disease
2023-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2022.04.003
PMID:36815031
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研究论文 | 本研究揭示了17β-HSD7通过调节巨噬细胞极化在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)发病机制中的作用,并发现芬维A胺可通过抑制该靶点治疗NAFLD | 首次发现17β-HSD7通过增加游离胆固醇含量触发NLRP3炎症小体激活,从而促进巨噬细胞M1极化;首次将FDA批准药物芬维A胺重新用于靶向17β-HSD7治疗NAFLD | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证芬维A胺对NAFLD的疗效 | 探究巨噬细胞极化在NAFLD发病中的调控机制并寻找潜在治疗靶点 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型、肝非实质细胞、巨噬细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型、细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型同窝小鼠与巨噬细胞特异性17-HSD7敲除小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-04-03 |
Elevated pentose phosphate pathway flux supports appendage regeneration
2022-10-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111552
PMID:36288713
|
研究论文 | 本文通过多模态方法研究了非洲爪蟾附肢再生过程中的代谢重编程,发现戊糖磷酸途径通量升高支持再生过程 | 揭示了再生过程中葡萄糖被导向戊糖磷酸途径而非糖酵解,以产生核苷酸前体驱动细胞增殖的新机制 | 研究基于非洲爪蟾模型,结果在哺乳动物中的普适性有待验证 | 探究再生过程中支持快速生长的代谢途径 | 非洲爪蟾的尾部再生组织 | 代谢组学与单细胞转录组学 | NA | 液相色谱-质谱联用代谢物分析, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-04-03 |
Lipopolysaccharide distinctively alters human microglia transcriptomes to resemble microglia from Alzheimer's disease mouse models
2022-10-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049349
PMID:36254682
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,比较了脂多糖(LPS)等免疫刺激对人类诱导多能干细胞来源的小胶质细胞转录组的影响,并发现LPS+IFN-γ刺激能使其转录组特征更接近阿尔茨海默病(AD)小鼠模型中的小胶质细胞 | 首次系统比较了不同免疫刺激(包括LPS、IFN-γ和ATPγS)对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的时序影响,并发现LPS+IFN-γ组合能特异性地诱导其转录组变化与AD小鼠模型中的小胶质细胞特征相似 | 研究主要基于体外培养的iPSC来源小胶质细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境;且仅分析了24小时和48小时两个时间点,缺乏更长期的动态观察 | 探究不同免疫刺激对人类iPSC来源小胶质细胞转录组的影响,并评估其与阿尔茨海默病病理的相关性 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多个处理组(PGE2、LPS+IFN-γ、ATPγS单独或组合处理)在两个时间点(24小时和48小时)的转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-03 |
Spatial transcriptomics of dorsal root ganglia identifies molecular signatures of human nociceptors
2022-02-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj8186
PMID:35171654
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,对八名器官捐献者的背根神经节(DRG)单神经元进行分子特征分析,鉴定了人类伤害性感受器的分子特征 | 首次对人类背根神经节伤害性感受器进行全面的空间转录组学表征,系统鉴定了12种人类感觉神经元亚型,并与小鼠及非人灵长类动物进行了直接比较,揭示了物种差异和潜在的药物靶点 | 样本量有限(仅8名器官捐献者),且为死后组织,可能无法完全反映活体状态下的基因表达情况 | 鉴定人类伤害性感受器的转录组特征,识别物种差异并寻找潜在药物靶点,以开发更好的急慢性疼痛治疗方法 | 人类背根神经节(DRG)中的感觉神经元,特别是伤害性感受器 | 空间转录组学 | 疼痛障碍(急慢性疼痛) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 8名人类器官捐献者的背根神经节组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 29 | 2026-04-03 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
|
研究论文 | 本研究通过开发一种新型肽激动剂C660,探讨了蛋白酶激活受体3(PAR3)在痛觉感知中的作用 | 开发了选择性激活PAR3的脂质锚定激动剂C660,并首次在体内证明了PAR3对机械超敏和痛觉可塑性的贡献 | 研究主要基于小鼠模型,PAR3在人类痛觉中的具体作用仍需进一步验证 | 探究PAR3在外周感觉神经系统中的功能及其在痛觉调节中的作用 | 小鼠背根神经节神经元和三叉神经神经元 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-03 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析发现循环中的testican-2是一种足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏健康中的关键作用,证明其可作为肾脏功能和预后的新型生物标志物 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性研究,需要进一步验证其因果关系 | 探索肾脏释放到循环中的分子是否能够反映肾脏健康状况 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 适体蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据 | 22名接受侵入性采样的个体,Jackson心脏研究(1,928名非裔美国人),Framingham心脏研究(1,621名白人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-04-03 |
Prospective isolation of chondroprogenitors from human iPSCs based on cell surface markers identified using a CRISPR-Cas9-generated reporter
2020-02-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01597-8
PMID:32070421
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9生成的报告基因系统,识别并分离了人诱导多能干细胞中表达特定表面标志物的软骨祖细胞亚群 | 首次利用CRISPR-Cas9编辑的COL2A1-GFP报告基因hiPSC系结合表面标志物筛选,鉴定出CD146+/CD166+/PDGFRβ+/CD45-的独特软骨祖细胞亚群 | 研究仅基于体外实验,未验证体内修复效果;样本量未明确说明 | 提高hiPSC软骨分化的同质性和效率,为软骨组织工程和疾病建模提供纯化细胞源 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其衍生的软骨祖细胞 | 干细胞与再生医学 | 骨关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-03 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DSAVE的新方法,用于评估单细胞转录组簇的纯度并识别错误分类的细胞 | 开发了基于下采样的变异估计方法,通过消除采样噪声差异并使用基于对数似然的度量来识别错误分类的细胞,这是现有类似工具无法检测的 | 未在摘要中明确说明 | 评估单细胞RNA测序数据中细胞亚群的纯度并检测错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇和细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets
IF:2.5Q2
DOI:10.1080/09537104.2026.2651849
PMID:41918402
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研究论文 | 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学,系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 | 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析,系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因,并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 | 研究主要基于计算生物学和体外数据验证,缺乏体内实验的直接功能验证;样本量可能有限,且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 | 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制,并探索其治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物(罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕)的靶点 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 | hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据(具体样本数未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-02 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本的单细胞转录组数据,构建了一个基于癌症干细胞样细胞特征的12基因签名,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次在患者样本中识别出具有癌症干细胞样特征的罕见细胞群,并基于此构建了CARS评分系统,揭示了其与索拉非尼耐药性和免疫检查点抑制剂敏感性的关联 | 研究基于单细胞转录组数据,样本量有限,需要更大规模的临床验证来确认CARS的预测价值 | 开发一个基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因签名,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌患者样本中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 基因签名评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法,整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究,系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据,结合孟德尔随机化框架,识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断,需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-04-02 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了多囊肾病囊肿微环境中受损细胞、特征基因及细胞通讯模式 | 首次应用10x Genomics Visium空间基因表达技术于多囊肾病研究,结合单细胞测序数据进行点解卷积,增强了空间分辨率并识别了囊肿相关的基因特征和细胞通讯 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类多囊肾病,且空间转录组学技术本身存在分辨率限制 | 探究多囊肾病囊肿微环境的细胞组成、基因表达变化及细胞间通讯模式 | 野生型和Pkd1缺陷型小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及野生型和Pkd1缺陷型小鼠肾脏 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Genomics Visium | 10x Genomics Visium空间基因表达平台 |
| 37 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术,识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇,并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光,苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析,细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据,图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学,总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 38 | 2026-04-02 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Apr, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和顺序免疫荧光技术,揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域,揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏中的情况可能有所不同;技术方法可能无法完全捕捉细胞间相互作用的复杂性 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 顺序免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-Apr, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了二维单层和三维球体两种人源肝脏微组织模型对乙酰氨基酚暴露的细胞反应差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了2D与3D肝脏微组织对药物暴露的转录组反应,揭示了氧气可用性与药物代谢之间的动态相互作用 | 仅使用单一药物(乙酰氨基酚)进行验证,暴露时间固定为24小时,未涵盖其他肝毒性药物或更长时间点的反应 | 评估和比较不同体外肝脏模型(2D单层与3D球体)在预测药物性肝损伤方面的生理相关性和机制差异 | 由原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的二维单层和三维球体肝脏微组织 | 单细胞转录组学 | 药物性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异,特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异,并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小(4名男性和5名女性患者),且仅关注了前交叉韧带,未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像 | 9名患者(4名男性,5名女性)的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |