单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43298 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-14 |
Spatial habitat radiomics predicts tertiary lymphoid structure status and identifies an IDO1+ migratory dendritic cell axis in breast cancer
2026-Sep-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015224
PMID:42692536
|
研究论文 | 该研究利用空间栖息地影像组学，基于动态增强MRI非侵入性预测乳腺癌三级淋巴结构状态，并结合多组学分析揭示了IDO1+迁移性树突状细胞轴 | 首次提出基于空间异质性的影像组学TLS特征（shTLS），利用DCE-MRI非侵入性预测TLS状态，并通过多组学整合分析揭示了shTLS低评分肿瘤中IDO1+ LAMP3+CCR7+迁移性树突状细胞介导的免疫抑制机制 | 研究未明确说明样本量的具体数量，且功能药物敏感性实验仅在体外进行，缺乏体内验证和前瞻性临床试验验证 | 开发非侵入性影像组学方法预测乳腺癌TLS状态，并阐明影像预测TLS背后的生物学机制 | 多中心乳腺癌队列患者 | 数字病理学, 影像组学 | 乳腺癌 | 动态增强MRI, 转录组学, 病理组学, 基因组学, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多重免疫荧光 | 影像组学模型 | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-09-14 |
LIM and SH3 protein 1 deficiency confers resistance to cytotoxic lymphocyte-mediated lysis and immunotherapy in gastric cancer by disrupting cytoskeleton dynamics
2026-Sep-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014475
PMID:42686372
|
研究论文 | 该研究揭示了LASP1缺失通过破坏细胞骨架动力学，影响免疫突触处细胞膜脂质组织，从而使胃癌细胞抵抗细胞毒性淋巴细胞介导的裂解和免疫治疗 | 首次发现LASP1作为支架蛋白调控Arp2/3复合物，通过重塑免疫突触处细胞骨架动力学和细胞膜脂质组织来介导免疫抵抗，并证明辛伐他汀联合抗PD-1治疗可逆转LASP1缺失肿瘤的免疫治疗抵抗 | 研究主要聚焦于胃癌，其他消化系统肿瘤中的适用性需进一步验证；LASP1调控Arp2/3复合物的具体分子机制尚需更深入研究 | 探究细胞骨架介导的免疫抵抗机制及参与其中的特定细胞骨架相关蛋白，明确LASP1在胃癌免疫逃逸中的作用 | 胃癌细胞、细胞毒性淋巴细胞、四种消化系统肿瘤样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 共免疫沉淀, 免疫荧光, 结构域缺失互补, Laurdan染色, 活细胞成像 | NA | 图像, 文本 | 四种消化系统肿瘤的单细胞RNA测序数据及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-09-14 |
Mycn regulates vascular development through PI3K signaling pathway in zebrafish
2026-Sep, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70104
PMID:41439407
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和活体成像技术，探究了mycn基因在斑马鱼血管发育中的作用及其通过PI3K信号通路的调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序和活体成像确认mycn在斑马鱼血管发生中表达，并揭示mycn通过PI3K信号通路调控血管发育，且激活PI3K信号可改善血管异常 | 研究主要基于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物或人类中验证；且未详细阐明PI3K信号通路下游的具体分子机制 | 探究Mycn在血管发育中的具体作用及其分子机制 | 斑马鱼胚胎及血管内皮细胞 | 发育生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-09-14 |
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Sep-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001053
PMID:41885952
|
研究论文 | 该研究通过断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序，揭示了母体低蛋白饮食通过损害肾单位祖细胞增殖与分化，导致胎儿肾脏肾单位数量减少的分子和细胞机制 | 结合断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序，全面解析了母体低蛋白饮食对胎儿肾脏分支形态发生和肾单位形成相关细胞与分子过程的影响，发现肾单位祖细胞增殖与分化受损是肾单位数量减少的关键机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究母体低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响，特别是对肾单位形成相关细胞和分子过程的调控机制 | 母体低蛋白饮食模型下的胎儿肾脏发育过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-14 |
Dynamic cellular programs of human cardiac allograft rejection revealed by spatial transcriptomics
2026-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00849-9
PMID:42576067
|
研究论文 | 该研究利用基于图像的亚细胞分辨率空间转录组学技术，对人类心脏移植受者的纵向活检样本进行分析，揭示了心脏同种异体移植排斥反应中的动态细胞程序 | 首次在亚细胞分辨率下利用基于图像的空间转录组学技术，对人类心脏移植活检样本进行纵向分析，揭示了排斥反应中转录状态的广泛重叠、排斥等级内的显著异质性，以及应答者与非应答者之间不同的转录组特征 | 样本量相对有限（62例），且研究主要基于观察性数据，需要进一步验证以确认所发现的细胞状态亚型与临床结局之间的因果关系 | 表征人类心脏移植受者在组织学诊断的排斥反应期间及之后的转录异质性，并识别与短期和长期结局相关的细胞特异性基因 | 62名成人和儿童心脏移植受者的纵向心脏活检样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 62名成人和儿童心脏移植受者的纵向心脏活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 基于图像的亚细胞分辨率空间转录组学 |
| 26 | 2026-09-14 |
Spatial Transcriptomics-Inspired Targeted Hydrogel for Dental Pulp Therapy via Strengthen Macrophage Communication
2026-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71573
PMID:42604446
|
研究论文 | 该研究整合空间转录组学与单细胞RNA测序，解析人类牙髓在健康与龋病状态下的细胞生态系统，并据此开发了一种增强巨噬细胞PDGFB递送的水凝胶，用于促进牙髓修复 | 首次将高分辨率空间转录组学与单细胞RNA测序相结合，系统解析人类牙髓在健康与龋病状态下的细胞生态系统，并基于PDGFB信号轴设计仿生靶向水凝胶，通过AAV载体增强巨噬细胞PDGFB递送以促进牙本质修复 | 摘要未提及具体局限性，需查阅全文 | 解析人类牙髓在健康与龋病状态下的细胞生态系统，阐明炎症信号如何驱动再生性细胞状态转变，并基于此开发靶向牙髓再生生物材料 | 人类牙髓组织（健康与龋病状态） | 数字病理学 | 龋病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-09-14 |
Blocking AGEs reduces airway epithelial viral susceptibility in diabetes-exacerbated COPD
2026-Sep, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00502-9
PMID:42608564
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病加重COPD患者气道上皮病毒易感性的机制，并发现靶向AGEs可作为一种潜在治疗策略 | 首次揭示了高血糖-AGEs-RAGE/MD2轴在糖尿病加重COPD气道上皮病毒易感性中的作用，并证明氨基胍抑制AGEs形成可显著降低病毒载量 | 摘要中未提及具体研究局限性 | 探究糖尿病对呼吸系统的影响，特别是糖尿病加重COPD气道上皮病毒易感性的潜在机制 | COPD患者的气道上皮细胞、COPD小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-09-14 |
CXCL8 Enhances Malignancy of GBM via TNFα-NFκB Mediated Suppression of Ferroptosis
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05759-x
PMID:42262679
|
研究论文 | 该研究揭示了CXCL8通过TNFα-NFκB通路抑制铁死亡从而增强胶质母细胞瘤恶性程度的作用机制 | 首次证明CXCL8与铁死亡程度显著相关，并通过空间转录组学发现MES样细胞与CXCL8+肿瘤相关巨噬细胞在铁死亡区域共定位，揭示了CXCL8-TNFα-NFκB轴抑制铁死亡导致GBM恶性行为的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探讨铁死亡与趋化因子在胶质母细胞瘤中的作用机制，特别是CXCL8对铁死亡的调控及其对GBM恶性程度的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞分析、空间转录组学、基因集富集分析、染色、透射电子显微镜 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-09-14 |
The development of novel chimeric antigen receptor gamma-delta T cells against multiple myeloma and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Sep, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.70660
PMID:42438316
|
研究论文 | 本研究开发了靶向BCMA的新型CAR γδ T细胞，并通过功能实验和单细胞RNA测序分析，比较了其与CAR αβ T细胞在多发性骨髓瘤中的疗效差异 | 开发了一系列靶向BCMA的新型CAR γδ T细胞，并通过单细胞转录组分析揭示了循环CAR γδ T细胞比例低是限制其持久性的关键机制 | CAR γδ T细胞在体内持久性有限，需要更高剂量才能达到与CAR αβ T细胞相当的肿瘤控制效果，增殖能力较低 | 开发新型CAR γδ T细胞用于治疗多发性骨髓瘤，并评估其与CAR αβ T细胞的疗效差异 | 多发性骨髓瘤细胞和CAR γδ T细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 嵌合抗原受体T细胞 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-09-14 |
Mechanisms of Hericium erinaceus polysaccharides on chronic atrophic gastritis: An integrated study of network pharmacology, molecular docking, in vivo experiments, and scRNA-seq
2026-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153556
PMID:42457054
|
研究论文 | 该研究通过网络药理学、分子对接、体内实验和单细胞RNA测序，探究了猴头菇多糖对慢性萎缩性胃炎的治疗效果及作用机制 | 首次整合网络药理学、分子对接、体内实验和单细胞RNA测序多种方法，系统揭示猴头菇多糖通过抗炎、抗氧化及结构依赖性NF-κB抑制发挥胃保护作用的机制，并验证IKKβ为关键功能靶点 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证；HEP的具体寡糖活性片段及其药代动力学特征有待进一步研究 | 评估猴头菇多糖对慢性萎缩胃炎的治疗效果并阐明其作用机制 | 慢性萎缩性胃炎小鼠模型及猴头菇多糖 | 机器学习, 网络药理学, 单细胞组学 | 慢性萎缩性胃炎, 胃癌 | 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 转录组学, HPLC, FT-IR, HPGPC, NMR, 甲基化分析 | NA | 文本, 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-14 |
Spatially guided in vivo single-cell functional genomics of postnatal heart
2026-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00861-z
PMID:42706440
|
研究论文 | 该研究通过整合单核RNA测序与基于图像的空间转录组学，构建了出生后小鼠心脏的高分辨率时空图谱，并开发了PIP-seq平台，在体内大规模功能验证了心肌细胞成熟的关键调控因子。 | 开发了PIP-seq（基于探针的 indel 可检测 Perturb-seq）高通量平台，能够在固定细胞核中同时检测sgRNA身份、推断基因编辑并分析转录组；结合空间转录组学与单核RNA测序，首次在出生后心脏中实现了空间引导的体内单细胞功能基因组学研究，并鉴定了21个先前未表征的心肌细胞成熟调控因子。 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类心脏中验证；PIP-seq平台可能受限于固定细胞核的转录本捕获效率；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析单细胞水平的细胞间相互作用。 | 解析出生后心脏发育过程中心肌细胞成熟的空间组织与细胞间相互作用如何塑造基因调控程序，并建立复杂组织中功能基因组学研究框架。 | 出生后小鼠心脏发育过程中心肌细胞及其微环境。 | 空间转录组学, 单细胞功能基因组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 基于图像的空间转录组学, Perturb-seq (PIP-seq) | NA | 图像, 文本（序列数据） | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'（用于单核RNA测序）, 10x Visium（用于空间转录组学） |
| 32 | 2026-09-14 |
Spatially guided translation from histology images to transcriptomic profiles using foundation model-driven contrastive learning
2026-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014762
PMID:42709893
|
研究论文 | 该论文提出了FOCST，一个基于基础模型驱动和空间引导对比学习的框架，用于从组织学图像预测空间转录组数据 | 结合UNI病理基础模型与空间引导对比学习，通过图神经网络融合位置信息，实现跨模态的基因表达预测与插补 | 基准测试仅使用了6张图像，样本量较小，需要在更大规模数据集上进一步验证 | 利用深度学习方法从组织学图像高效预测空间转录组数据，降低ST数据获取的成本和流程复杂度 | 乳腺癌组织样本的组织学图像及其对应的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 基础模型（UNI）、对比学习、图神经网络 | 图像 | 6张图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-09-14 |
Evolution of complex organelles in ocelloid-bearing dinoflagellates
2026-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag287
PMID:42725094
|
研究论文 | 本文通过对12种新物种进行单细胞转录组测序，研究含眼点的甲藻中复杂细胞器的演化。 | 扩展了单细胞转录组测序至12个新物种，包括两个未采样属，揭示了warnowiids可分为武装和非武装两个亚支，并发现眼点大小、形状、位置和基因表达在亚支间存在差异。 | 样本量相对较小，仅包括18个细胞来自5个属，且未涵盖该组内所有已知谱系。 | 探讨warnowiids中眼点复合体的功能和演化，特别是质体光合系统丢失情况及其与生态策略的关联。 | warnowiid甲藻，包括12个新物种和两个未采样属。 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 18个细胞来自5个属，以及12个新物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-09-14 |
CCR2/CCR5 Signaling Defines a Pathogenic Interstitial Macrophage Subset That Drives Severe Asthma
2026-Sep, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70201
PMID:42731116
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术在小鼠重症哮喘模型中鉴定出一群由CCR2/CCR5信号驱动的Lyve1loMHCIIhi间质巨噬细胞亚群，并验证了双重CCR2/CCR5拮抗剂Cenicriviroc的治疗潜力。 | 首次鉴定出Lyve1loMHCIIhi间质巨噬细胞亚群作为重症哮喘中主导性炎症细胞群，揭示其起源于经典单核细胞，并证明双重CCR2/CCR5拮抗可抑制其募集、恢复巨噬细胞平衡并改善肺功能。 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究间质巨噬细胞亚群在重症哮喘发病机制中的作用，并评估靶向CCR2/CCR5信号通路的治疗潜力。 | C57BL/6小鼠重症哮喘模型（CFA-HDM诱导）及U-BIOPRED哮喘队列患者转录组数据 | 机器学习 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 转录组分析 | NA | 文本, 图像 | C57BL/6小鼠重症哮喘模型及U-BIOPRED哮喘队列患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-14 |
Multi-omics characterization of a GPRC5A+ epithelial subpopulation associated with malignant features in colorectal cancer
2026-08-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08886-5
PMID:42723078
|
研究论文 | 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学数据，鉴定并表征了结直肠癌中一个与恶性特征相关的GPRC5A+上皮细胞亚群 | 首次构建了结直肠癌分期分层的单细胞图谱，解析了11个恶性上皮亚群，并鉴定出GPRC5A+Epi为晚期富集且与EMT、缺氧和炎症程序相关的恶性上皮状态，同时揭示了GPRC5A受FOSL1调控及其与POSTN+成纤维细胞的潜在相互作用 | GPRC5A+Epi与POSTN+成纤维细胞之间的关系及曲美替尼相关发现属于假设生成性质，尚需功能性串扰验证、直接结合实验和治疗性验证 | 阐明结直肠癌中与恶性相关的上皮程序及其细胞背景，鉴定关键的恶性上皮亚群及其调控机制 | 结直肠癌样本中的上皮细胞亚群，特别是GPRC5A+上皮细胞亚群及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, CRISPR功能实验, EMT免疫印迹, 异种移植, SCENIC/JASPAR/ChIP-qPCR转录因子分析, 药物反应预测, 分子对接和分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本 | 2,993例结直肠癌样本，包括批量RNA测序2,568例（两个OS/RFS队列）、单细胞RNA测序281,961个细胞/152个标本、空间转录组学6例、蛋白质组学267例 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2026-09-14 |
CCNA2 orchestrates the PI3K/AKT signaling axis to propel prostate cancer metastasis
2026-Aug-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2026-0511
PMID:42729059
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据及多种机器学习算法，系统评估了CCNA2在前列腺癌中的诊断和预后价值，并揭示其通过PI3K/AKT信号轴驱动肿瘤转移的机制 | 首次系统性地结合单细胞RNA测序、TCGA和GEO批量转录组数据以及多种机器学习算法，全面评估CCNA2在前列腺癌中的诊断和预后价值，并通过体外功能实验验证其通过PI3K/AKT信号通路促进前列腺癌转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列验证，机器学习诊断模型的临床转化仍需进一步多中心大样本研究证实 | 筛选与前列腺癌相关的关键机器学习生物标志物，系统评估CCNA2的诊断和预后价值，并阐明其在前列腺癌进展中的分子机制 | 前列腺癌患者转录组数据及前列腺癌细胞系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq, 免疫荧光 | 机器学习集成算法, Cox比例风险模型, Kaplan-Meier生存分析 | 转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-09-14 |
Integrated transcriptome analysis and machine learning to construct a homeostatic model of acetylation for bladder cancer and validate the key gene CES1
2026-Aug-31, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2026-0435
PMID:42729074
|
研究论文 | 该研究通过整合转录组分析和机器学习构建了膀胱癌乙酰化稳态模型，并验证了关键基因CES1的生物学功能 | 首次基于整合转录组分析和机器学习构建了膀胱癌乙酰化稳态模型，该模型由五个基因组成，能有效预测总生存期并作为独立预后因素，同时发现并验证了CES1作为关键基因通过调节细胞内辅酶A水平影响乙酰化稳态 | CES1与蛋白质乙酰化稳态的潜在关联需要进一步的机制验证 | 构建膀胱癌乙酰化稳态模型，用于生存分层和个性化治疗指导，并验证关键基因CES1 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | LASSO, Cox回归 | 转录组数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-09-14 |
Early immune dysregulation in Mtb/SIV co-infection resists cART treatment at the single-cell level
2026-Aug-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.116944
PMID:42565131
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学分析接受cART治疗的Mtb/SIV共感染恒河猴的支气管肺泡灌洗细胞，揭示了早期SIV共感染潜伏性结核时出现的严重免疫失调 | 在单细胞水平上揭示了Mtb/SIV共感染早期免疫失调对cART治疗抵抗的机制，发现了持续T细胞偏移环境和髓系炎症，以及CD4 T细胞-巨噬细胞串扰扩大和免疫稳态丧失 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究Mtb/SIV共感染早期免疫失调的机制及其对cART治疗的反应，为HIV感染中结核再激活提供转录组学框架 | Mtb/SIV共感染的恒河猴（接受cART治疗）的支气管肺泡灌洗细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-09-14 |
GM-CSF regulates conserved ILC-like transcriptional states and myeloid cell signaling during ulceration in Crohn's disease
2026-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703526
PMID:41676475
|
研究论文 | 该研究通过Xenium单细胞空间转录组学和斑马鱼模型，揭示了GM-CSF在克罗恩病溃疡区域中对髓系和淋巴样细胞互作的调控作用 | 首次利用Xenium单细胞空间转录组学解析克罗恩病中CSF的空间免疫生态位，发现GM-CSF特异性富集于溃疡区域，并通过跨物种单细胞分析揭示了保守的ILC基因模块和GM-CSF依赖的转录网络 | 未明确说明样本量大小，斑马鱼模型与人类克罗恩病的免疫复杂性存在差异，Xenium空间转录组学可能受限于基因panel覆盖度 | 揭示CSF（特别是GM-CSF）在克罗恩病中如何塑造空间免疫生态位及调控髓系-淋巴样细胞互作 | 克罗恩病患者回肠组织及斑马鱼肠道损伤模型 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium单细胞空间转录组学平台 |
| 40 | 2026-09-14 |
Immune Circuit Rewiring by HDAC Inhibition Enables Response to Dual Checkpoint Blockade in Metastatic Breast Cancer
2026-Aug-11, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-26-1086
PMID:42578817
|
研究论文 | 结合实验和临床数据与理论模型，研究HDAC抑制剂entinostat联合抗PD-1和抗CTLA-4治疗转移性乳腺癌的肿瘤微环境响应机制 | 通过知识引导的单细胞RNA测序亚聚类和细胞回路分析，结合空间蛋白质组学和流式细胞术，揭示了淋巴结和髓系细胞对HDAC抑制剂联合免疫检查点阻断治疗的贡献，并发现B细胞是治疗响应所必需的 | 未明确说明 | 阐明HDAC抑制剂entinostat联合抗PD-1和抗CTLA-4治疗转移性乳腺癌的响应机制 | 小鼠乳腺至肺转移模型和转移性乳腺癌患者活检及血液样本 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 流式细胞术 | 数学建模 | 图像, 文本 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |