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当前共找到 32150 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-05 |
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03879-0
PMID:41182638
|
研究论文 | 通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 | 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌患者样本和细胞数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,RNA测序,深度学习 | DeepSurv神经网络 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-11-05 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
|
研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架，用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了整合多组学单细胞数据的异构图变换器框架，能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 图注意力网络 | 异构图变换器, 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-11-05 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件，并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅观察12小时后的急性炎症反应，未评估长期慢性炎症效应 | 研究碳基纳米材料如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞测序分析 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-11-05 |
Identification of novel differentiation trajectories and gene network associations with ectopic pregnancy in fallopian tube epithelium
2025-Nov-03, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf200
PMID:41183511
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据网络建模识别输卵管上皮细胞分化轨迹及其与异位妊娠的基因网络关联 | 发现新型OVGP1+上皮祖细胞及其双向分化轨迹，通过因果网络模型揭示输卵管与子宫内膜分泌细胞的功能差异 | 育龄妇女样本量有限，未进行候选基因的体外或体内验证 | 识别输卵管上皮细胞发育轨迹及其与异位妊娠的分子机制 | 输卵管上皮细胞和子宫内膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 异位妊娠 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 网络建模, 表达数量性状位点分析 | 超图网络模型 | 单细胞转录组数据 | 13名女性的输卵管scRNA-seq样本和13名女性的子宫内膜scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-11-05 |
[Neural regulation mechanism in bone regeneration]
2025-Nov-03, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文系统阐述了神经系统在骨再生过程中的调控机制，重点关注神经肽和神经递质的关键作用 | 提出'神经-骨骼'调控轴概念，系统梳理交感与副交感神经系统在骨再生中的相反调控作用 | 神经肽之间的相互作用网络尚未完全阐明，需要更先进的研究模型和技术支持 | 探讨骨再生过程中的神经调控机制 | 骨骼系统与神经系统的相互作用机制 | 骨再生医学 | 退行性骨病、创伤性骨损伤 | 单细胞测序、三维生物打印骨模型、类器官技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-11-05 |
Effector Functions of Conventional and Unconventional Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-Specific T Cells
2025-Nov-03, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041829
PMID:41184129
|
综述 | 本文综述了结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能及其在免疫防御中的作用 | 整合单细胞和空间转录组学最新发现，揭示T细胞亚群的异质性、功能可塑性和空间区隔化 | NA | 探讨T细胞在结核分枝杆菌免疫防御中的效应功能和免疫病理作用 | 结核分枝杆菌特异性T细胞（包括常规和非常规T细胞） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-11-05 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
|
研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法，利用最优传输从空间转录组数据中学习细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析，能够学习空间信息化的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据中的细胞分化过程 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输，神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 28 | 2025-11-05 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合，学习瞬态细胞状态并预测时间和条件下高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应，促进细胞命运决定调控原理的理解 | 细胞分化、基因扰动、药物响应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-11-05 |
Spatiotemporal dynamics of the cardioimmune niche during lesion repair
2025-Nov-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00739-6
PMID:41184578
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，重建了小鼠心脏损伤后纤维化微环境的时空动态变化 | 首次揭示了Trem2巨噬细胞通过沉默成纤维细胞增殖来防止过度纤维化的新机制，并发现了一群罕见的祖细胞样心肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型，人类心脏组织的验证仍需进一步研究 | 探索心脏损伤修复过程中的细胞和分子调控机制 | 成年小鼠心脏组织和人心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠心脏损伤模型和人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-11-05 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Nov-03, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了海鞘心脏咽部祖细胞在细胞周期进程中转录组成熟的动态过程及其对多谱系分化能力的影响 | 首次提出'转录组成熟'概念，发现细胞周期驱动转录组动态变化赋予祖细胞多谱系分化能力，并鉴定出关键调控基因Depdc1b | 研究基于海鞘模型，在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究心脏咽部祖细胞在发育过程中如何获得多谱系分化能力 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转基因样本条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-11-05 |
IGF1-mediated mesenchymal-endothelial transition as a potential regulatory target in calcific aortic valve disease
2025-Nov-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04433-z
PMID:41184837
|
研究论文 | 本研究首次证实主动脉瓣间质细胞在钙化条件下具有向内皮细胞转分化的能力，并揭示了IGF1-PI3K-AKT-HIF通路介导的间质-内皮转化在钙化性主动脉瓣疾病中的作用 | 首次发现主动脉瓣间质细胞具有向内皮细胞转分化的能力，并鉴定出IGF1-PI3K-AKT-HIF通路介导的间质-内皮转化机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本数量有限（16例患者），需要更大规模的临床验证 | 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞向内皮细胞转分化的机制及其治疗潜力 | 人类钙化主动脉瓣组织、猪主动脉瓣间质细胞和内皮细胞、Col1a2-CreERT:R26R-tdTomato基因工程小鼠 | 心血管疾病研究 | 钙化性主动脉瓣疾病 | 石蜡切片免疫荧光分析、转录组测序、Western blot、qPCR、体内Matrigel plug实验、体外管形成实验、单细胞测序数据分析 | NA | 图像数据、基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据 | 16例CAVD患者钙化主动脉瓣、猪主动脉瓣原代细胞、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-11-05 |
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07174-y
PMID:41184884
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过调控LDHA表达促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现NETs通过PI3K/AKT通路调控LDHA表达促进结直肠癌转移，并证实抑制LDHA或NET形成可有效抑制肝转移 | 未明确NETs调控LDHA表达的具体分子机制，动物模型使用裸鼠可能无法完全模拟人体免疫环境 | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌肝转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞、裸鼠肝移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、体外实验、动物模型 | 裸鼠肝异种移植模型 | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-11-05 |
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07140-8
PMID:41184982
|
研究论文 | 本研究探讨FMR1基因通过c-MYC信号通路促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的机制 | 首次揭示FMR1在胃癌中通过稳定c-MYC蛋白促进肿瘤恶性表型，并发现其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于体外实验和数据库分析，需要更多体内实验验证 | 阐明FMR1基因在胃癌发生发展中的作用机制 | 胃癌细胞系和临床胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, ELISA, 免疫共沉淀, 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 | TCGA队列胃癌样本和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-11-05 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
|
研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化特异性标志物的表达特征和调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达，且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外细胞实验和免疫染色，缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞、结膜上皮细胞及其他表面外胚层来源上皮 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色、基因敲低、Western blot、集落形成实验、EdU细胞增殖检测 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞增殖数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-11-05 |
DISSyphilis and the Risk of HIV Infection: A Mendelian Randomization Study
2025-Nov, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析评估梅毒对HIV感染的因果效应 | 首次使用孟德尔随机化方法证实梅毒与HIV感染之间的直接因果关系，并发现RPAIN基因变异在疾病进展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库的基因组数据，样本特征和人群异质性可能影响结果推广 | 评估梅毒对HIV感染的因果效应及潜在分子机制 | 梅毒和HIV感染相关的基因组数据及基因表达数据 | 生物信息学 | HIV感染/梅毒 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | 加权中位数, MR Egger, 逆方差加权 | 基因组数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库和基因组关联研究获取的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-05 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
|
研究论文 | 本研究探讨18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞神经外胚层前后轴命运决定 | 首次揭示18q缺失通过TGFβ信号通路失衡导致神经外胚层前后轴命运决定异常的具体机制 | 研究仅针对体外培养的干细胞模型，未在体内验证 | 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 | 人胚胎干细胞及其分化产物 | 干细胞生物学 | 发育异常 | 单细胞RNA测序, 基因表达时序分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-11-05 |
BDNF as a Key Mediator in Eosinophilic Inflammation in CRSwNP: Insights From Transcriptomic and Functional Analysis
2025-Nov, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23628
PMID:40600933
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和功能分析揭示了BDNF在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中作为嗜酸性粒细胞炎症关键介质的作用机制 | 首次在CRSwNP中系统阐明BDNF通过上皮细胞-嗜酸性粒细胞相互作用驱动嗜酸性炎症的分子机制 | 样本量相对有限（23例组织样本和95例鼻腔分泌物），且为观察性研究 | 探究BDNF在CRSwNP嗜酸性炎症中的调控作用和功能机制 | 鼻腔黏膜组织、鼻腔分泌物、原代人鼻上皮细胞和嗜酸性粒细胞 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序, ELISA, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定量数据, 细胞功能数据 | 23例鼻腔黏膜样本和95例鼻腔分泌物样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-05 |
Single-cell transcriptome atlas and genome-wide Mendelian randomization reveal chemokine involvement in diverse immune cells in type 2 diabetes
2025-Nov, International journal of obesity (2005)
DOI:10.1038/s41366-025-01846-x
PMID:40684027
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱和全基因组孟德尔随机化分析揭示趋化因子在2型糖尿病多种免疫细胞中的参与机制 | 整合孟德尔随机化、动物模型验证和单细胞RNA测序构建2型糖尿病免疫病理中趋化因子信号传导的系统级框架 | 研究主要基于小鼠模型和外周血单核细胞，需要进一步在人类组织和更多细胞类型中验证 | 阐明趋化因子在2型糖尿病免疫失调中的因果作用和细胞特异性机制 | 2型糖尿病相关免疫细胞和趋化因子信号通路 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 血清学数据 | 链脲佐菌素诱导的小鼠2型糖尿病模型的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-11-05 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
|
研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析，揭示衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 首次在单细胞分辨率下比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征，发现细胞衰老与肿瘤发生之间存在方向相反的转录谱 | 研究主要基于转录组数据，对表观遗传调控机制的深入验证仍需进一步实验 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互关系 | 17种组织中的细胞类型（内皮细胞、T细胞、上皮细胞、巨噬细胞、成纤维细胞等） | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学、表观基因组学、bulk转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 17种组织，648个衰老依赖性衰老相关共调控模块 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-11-05 |
Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf174
PMID:41003697
|
研究论文 | 本研究揭示了同种异体移植炎症因子-1通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次发现AIF-1在复发性种植失败患者子宫内膜基质细胞中显著上调，并通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞中对胚胎植入的作用尚不明确 | 探究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序,定量PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 18例RIF患者,18例对照组患者,30例不同月经周期阶段的额外对照组患者,公共数据集(GSE111976,GSE250130,GSE183837) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |