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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-04 |
Spatially resolved osteoblast-traced transcriptomics uncovers TGF-β as a combination target with sclerostin in osteoporosis
2026-Apr-02, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00521-9
PMID:41927532
|
研究论文 | 本研究利用空间分辨的成骨细胞追踪转录组学,揭示了TGF-β信号在成骨细胞激活中的调控作用,并提出了与硬化蛋白联合靶向治疗骨质疏松的新策略 | 整合成骨细胞特异性谱系追踪与空间分辨激光激活细胞分选技术,首次在静息骨表面解析成骨细胞状态,并发现TGF-β作为联合靶点可增强抗硬化蛋白治疗的疗效 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;空间转录组学技术可能受限于分辨率和样本量 | 探究成骨细胞在静息骨表面的状态调控机制,并开发针对骨质疏松的联合治疗策略 | 小鼠成骨细胞及骨质疏松模型 | 数字病理学 | 骨质疏松 | 空间分辨转录组学、单细胞RNA测序、激光激活细胞分选、体外功能实验、体内模型 | NA | 转录组数据、空间位置数据 | 小鼠模型样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-04-04 |
MYC-induced USP10 stabilizes SOX4 to promote thymocyte proliferation and leukemia onset in mice
2026-Apr-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71084-w
PMID:41927540
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研究论文 | 本研究通过整合去泛素化酶文库筛选和单细胞RNA测序数据,揭示了USP10通过稳定SOX4促进胸腺细胞增殖和白血病发生的分子机制 | 首次发现USP10在胸腺细胞发育和T细胞急性淋巴细胞白血病中的关键作用,并阐明MYC-USP10-SOX4信号轴在白血病发生中的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证相对有限;USP10抑制剂的治疗效果和安全性需进一步评估 | 探究胸腺T细胞发育失调导致白血病转化的分子机制 | 小鼠和人类胸腺细胞、T细胞急性淋巴细胞白血病患者外周血样本 | 分子生物学 | 白血病 | 去泛素化酶文库筛选、单细胞RNA测序 | 小鼠白血病模型 | 基因表达数据、测序数据 | 未明确样本数量,包含小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-04-04 |
Alignment of spatial transcriptomics slices across diseases, platforms and conditions
2026-Apr-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01634-w
PMID:41928322
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-04-04 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 本文开发了一种基于Cre依赖性基因表达的平台,用于在体内持续生成靶向肿瘤相关抗原的CAR-T细胞,通过胸腺微环境促进其发育,并探讨了绕过中枢耐受的机制 | 创新点包括利用胸腺微环境支持短期造血干细胞并驱动T细胞谱系分化,通过减少CAR共刺激和修改内源性T细胞受体库来增强胸腺发育中细胞的存活,以及采用可诱导的CAR基因表达系统来绕过中枢耐受,实现持久、自我更新的CAR-T细胞疗法 | 研究未详细讨论长期安全性或潜在脱靶效应,且实验模型可能未完全模拟人类免疫系统的复杂性 | 研究目标是解决CAR-T细胞在体内持久性有限和肿瘤复发的问题,开发一种在体内持续生成CAR-T细胞的平台 | 研究对象包括造血干细胞和祖细胞、胸腺微环境、CD19 CAR-T细胞以及正常B细胞和CD19肿瘤细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 单细胞RNA测序、连续移植研究 | NA | 基因表达数据、序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-04-04 |
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02339-4
PMID:41457181
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据、临床验证和空间分析,鉴定出NNT作为肥胖相关结直肠癌的潜在预后生物标志物 | 首次通过多模态分子和空间分析,揭示了NNT在肥胖相关结直肠癌中的特异性预后价值及其与肿瘤微环境中氧化还原平衡和代谢适应状态的关系 | 研究依赖于回顾性队列数据,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证,空间分析仅针对候选基因进行,未全面探索其他分子特征 | 识别反映肥胖相关肿瘤特征的分子生物标志物并分层患者预后 | 结直肠癌患者样本,包括正常组织、健康体重患者肿瘤组织和肥胖患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学分析、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据 | TCGA-COADREAD数据集和独立验证队列 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx DSP | GeoMx数字空间分析仪 |
| 26 | 2026-04-04 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
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研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列,在衰老和肥胖小鼠模型中提高了mRNA疗法的治疗潜力 | 发现RPL18、RPL35和RPS9的5' UTR能增强合成mRNA在人和小鼠细胞中的蛋白质输出,尤其在活性氧水平高的细胞中效果显著,且独立于其末端寡嘧啶基序 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索5' UTR序列设计对mRNA疗法在衰老和肥胖模型中治疗潜力的影响 | 小鼠模型(衰老和肥胖)、人类和小鼠细胞 | 生物信息学 | 衰老和肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 核糖体分析, 交联免疫沉淀测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-04-04 |
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02346-z
PMID:41634388
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研究论文 | 本文探讨了YAP1驱动的肿瘤样癌症相关成纤维细胞(tCAFs)在胰腺导管腺癌(PDAC)中调节生物力学的作用 | 通过单细胞RNA测序识别了一种新的CAF亚群(tCAFs),并揭示了YAP1在调节mCAFs向tCAFs转化及ECM重塑中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本,可能无法完全反映人类PDAC的复杂性,且YAP1抑制剂与吉西他滨联合治疗的长期效果需进一步验证 | 研究YAP1如何与CAFs亚型相互作用以促进PDAC的基质重塑和疾病进展 | 胰腺导管腺癌(PDAC)中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)亚群,特别是肿瘤样CAFs(tCAFs) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),磁共振弹性成像(MRE) | NA | RNA测序数据,成像数据 | KPC小鼠模型和PDAC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-04 |
A comprehensive benchmarking study on computational tools for cross-omics label transfer from single-cell RNA to ATAC data
2026-Apr-01, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkag026
PMID:41655240
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研究论文 | 本研究对27种用于从单细胞RNA数据向ATAC数据跨组学标签转移的计算工具进行了全面的基准测试评估 | 首次系统性地大规模比较了跨组学(scRNA-seq到scATAC-seq)标签转移方法的性能,填补了该领域缺乏全面基准测试的空白 | 研究结果可能受限于所选数据集和评估指标,且未涵盖所有新兴方法 | 评估和比较不同计算工具在单细胞RNA到ATAC数据标签转移任务中的性能 | 人类和小鼠多种组织的单细胞RNA和ATAC数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | 多种计算工具(包括Bridge、GLUE、bindSC等深度学习算法) | 单细胞组学数据 | 来自多种人类和小鼠组织的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-04-04 |
Aberrant medial ganglionic eminence (MGE) GABAergic neurogenesis contributes to Huntington's disease pathogenesis
2026-Apr, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107297
PMID:41654201
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研究论文 | 本研究通过BACHD小鼠模型,探究了亨廷顿病中内侧神经节隆起来源的GABA能神经元发育异常及其对疾病发病机制的贡献 | 首次揭示了突变亨廷顿蛋白通过破坏早期MGE神经发生程序,特别是基底中间祖细胞的脆弱性,导致GABA能中间神经元缺陷,并证实了Nkx2-1谱系特异性基因救援可改善疾病表型 | 研究主要基于小鼠模型,人类HD患者中的类似发育机制尚未直接验证 | 阐明亨廷顿病发病机制中早期端脑中间神经元功能障碍的发育起源和因果贡献 | BACHD小鼠模型中的内侧神经节隆起(MGE)来源的GABA能神经元谱系 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学分析,谱系特异性基因救援 | BACHD小鼠模型 | 转录组数据,图像数据 | 胚胎期E12.5至出生后PND30的小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-04-04 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-Apr, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 本研究探讨了母体肥胖如何通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示了母体肥胖通过AP-1转录因子增强炎症基因可及性,从而抑制神经发生的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;体外实验未能完全模拟体内复杂的微环境 | 阐明母体肥胖影响胚胎神经发育的分子机制 | 肥胖母鼠的胚胎(E11.5和E13.5)及神经源性细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 基因本体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 未明确样本数量,使用对照饮食和高脂饮食喂养的母鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-04-04 |
Single Cell Analysis Reveals Dynamic Changes of Distinct Cell Populations in Human Nickel Allergy
2026-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70108
PMID:41090989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光分析,揭示了人类镍过敏中不同细胞群体的动态变化 | 首次在人类镍过敏中,利用单细胞RNA测序技术,明确了内皮细胞、基底上层角质形成细胞、成纤维细胞和CCR7+树突状细胞等特定细胞群体在过敏早期(8小时内)的激活,并发现皮肤驻留T细胞未参与早期反应,而中央记忆T细胞在72小时后大量浸润 | 研究样本可能有限,且仅针对镍过敏和布地奈德过敏,未涵盖其他金属过敏类型,长期动态变化和机制细节仍需进一步探索 | 探究人类镍过敏中不同细胞类型在致敏和激发阶段的作用,以阐明金属过敏的细胞机制 | 镍致敏供体的皮肤样本,在稀释剂和镍表皮暴露8或72小时后采集 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光分析 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 镍致敏供体的皮肤样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-04-04 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
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评论 | 本文评论了Spencer等人的研究,探讨了细菌病原体Chlamydia muridarum如何通过劫持杯状细胞引发区域特异性结肠炎 | 识别了Chlamydia muridarum作为区域限制性炎症的必要且充分驱动因素,并揭示了IDO1/kyneurine轴在炎症中的作用 | 研究基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA-seq分析,需要进一步验证 | 探索克罗恩病区域特异性炎症的机制 | 小鼠模型和克罗恩病患者的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq | TNF驱动的小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-04 |
Mechanism study of phthalate exposure promoting endometriosis: Based on the ferroptosis perspective
2026-Apr-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141670
PMID:41791190
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研究论文 | 本研究从铁死亡角度,整合多组学数据与计算方法,系统研究了邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的机制 | 首次从铁死亡角度系统揭示邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的微观机制,并构建了“PAEs - 铁死亡 - EMT - 子宫内膜异位症”轴 | 机制研究主要基于计算分析和体外模型,需要进一步的体内实验验证 | 探究邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的分子机制 | 子宫内膜异位症患者样本及相关细胞模型 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 网络毒理学, 多组学分析, 分子对接 | 多种机器学习方法, scTenifoldKnk算法 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-04-04 |
CD8 TRM-like T cells expressing perforin and IFN-γ define a pediatric activated T-cell acute liver failure endotype
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000926
PMID:41921202
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序,识别了儿童活化T细胞急性肝衰竭(TC-PALF)的两种不同内型,其中高CD8+穿孔素表达的患者具有独特的循环CD8 IFNγ+ Trm样细胞群和单核细胞激活 | 首次在TC-PALF中基于CD8+穿孔素表达和干扰素γ特征定义了两个不同的内型,揭示了高穿孔素表达患者中独特的CD8 IFNγ+ Trm样细胞群和单核细胞激活机制 | 样本量可能有限,且研究主要基于外周血和血清分析,肝脏组织样本的深入验证可能不足 | 表征TC-PALF的免疫病理学特征,探索T细胞定向疗法对改善无移植生存的效用 | TC-PALF患者、健康儿童及其他原因引起的PALF患者 | 免疫学 | 急性肝衰竭 | 多参数流式细胞术, 3'单细胞RNA测序, Olink炎症蛋白检测 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据, 血清蛋白数据 | TRIUMPH临床试验中的TC-PALF患者、健康儿童和疾病对照 | 10x Genomics, Olink | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | 10x Chromium, Olink Inflammation I 384 | 10x Chromium 3'单细胞RNA测序, Olink Inflammation I 384蛋白检测试剂盒 |
| 35 | 2026-04-04 |
Unveiling the Clinical Potential of Prostate Cancer Three-dimensional Models: A Systematic Review
2026-Apr-01, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2026.03.007
PMID:41927412
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系统综述 | 本文系统评估了前列腺癌三维模型的可行性、分子保真度及转化应用 | 首次系统性地评估了患者来源类器官和器官切片组织作为三维模型在前列腺癌研究中的临床潜力,并总结了其在分子保真度、生物标志物发现和药物筛选方面的应用 | 类器官建立成功率差异大,长期扩增能力有限,缺乏微环境成分,且建立过程耗时 | 评估前列腺癌三维模型作为转化工具在精准肿瘤学中的可行性、分子保真度及应用价值 | 人类来源的前列腺癌三维模型,包括患者来源类器官和器官切片组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,基因组学,转录组学,表观遗传学分析 | 3D 模型,患者来源类器官,器官切片组织 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-04-04 |
Single-cell and haplotype-resolved transcriptomics reveal molecular signatures of orchid floral structures
2026-Apr-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.016
PMID:41928475
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单倍型解析转录组学,揭示了兰花特殊花器官结构的细胞异质性和分子基础 | 首次对兰花(石斛属)花芽进行空间分辨的单细胞转录组普查,并结合单倍型解析基因组,揭示了亲本基因组通过细胞类型和等位基因特异性表达塑造种间杂交性状的机制 | 研究仅针对石斛属的一个杂交品种(Dendrobium Chao Praya Smile),结果在其他兰花物种中的普适性有待验证 | 解析兰花特殊花器官结构(如花粉块、唇瓣、色素分布)形成的细胞和分子机制 | 石斛属杂交品种Dendrobium Chao Praya Smile的花芽 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组学,单倍型解析基因组学 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 未明确样本数量,但分析了花芽中的14种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-04-04 |
Identifying maximally informative signal-aware representations of single-cell data using the information bottleneck
2026-Apr-01, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101571
PMID:41928515
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研究论文 | 本文介绍了一种基于信息瓶颈方法的框架bioIB,用于从单细胞RNA测序数据中提取与特定生物信号(如疾病状态)最优相关的可解释压缩表示 | 开发了bioIB框架,通过加权基因簇(metagenes)压缩数据,最大化信号特异性信息,并揭示metagenes的层次结构,以展示生物过程和细胞群体间的互连关系 | 未明确提及具体局限性,可能依赖于准确的细胞标签输入 | 旨在解决单细胞数据复杂性对特定生物信号分析任务的阻碍,提取最优信息表示 | 单细胞RNA测序数据,应用于阿尔茨海默病、上皮-间质转化、免疫发育和造血等生物背景 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 信息瓶颈方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-04 |
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70658
PMID:41930334
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用、挑战及新兴策略 | 系统整合了CAR-T疗法在自身免疫性疾病中的作用机制、临床挑战及面向精准医疗的创新策略,弥补了现有综述多聚焦肿瘤学或孤立技术层面的不足 | NA | 总结CAR-T疗法在自身免疫性疾病中的应用现状、核心挑战及未来发展方向 | 系统性风湿病和自身免疫性疾病 | NA | 系统性风湿病和自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学、空间图谱、B细胞受体/T细胞受体谱分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-04 |
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70709
PMID:41930352
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经纤维瘤恶性进展中SPP1KYNU巨噬细胞亚群通过色氨酸代谢重编程驱动基质重塑和免疫抑制的关键作用 | 首次在神经纤维瘤恶性转化过程中鉴定出具有独特代谢特征的SPP1KYNU巨噬细胞亚群,并阐明其通过色氨酸代谢重编程协调基质重塑与免疫抑制的双重机制 | 样本量相对有限(9个PNF和5个MPNST样本),功能验证实验仍需在更大队列中进一步确认 | 探究神经纤维瘤恶性进展的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 神经纤维瘤病1型患者的良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤组织 | 单细胞组学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个肿瘤样本(9个PNF,5个MPNST) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-04 |
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70650
PMID:41930340
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的“冲洗”方法,从人诱导多能干细胞中高效、高纯度地生成功能性的角膜内皮样细胞,并在兔模型中验证了其治疗角膜内皮功能障碍的安全性和有效性 | 提出了一种新型、高效、非细胞毒性的“冲洗”方法,用于去除未分化的iPSCs并获得高纯度的角膜内皮样细胞群体,并首次通过单细胞测序数据证实了经此方法处理的iPSC-CECs与人类原代CECs高度相似 | 研究仅在兔角膜内皮功能障碍模型中进行体内验证,尚未在更大型动物或人体中进行临床试验 | 建立一种稳健的方法,从诱导多能干细胞生成具有临床级质量的角膜内皮样细胞,以解决角膜内皮衰竭治疗中的供体短缺问题 | 人诱导多能干细胞、分化得到的角膜内皮样细胞、兔角膜内皮功能障碍模型 | 干细胞与再生医学 | 角膜内皮功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |