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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-23 |
Curcumin modulates the function of SPP1+ macrophages via NF-κB signaling to alleviate endometriosis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116644
PMID:42001649
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建子宫内膜异位病灶单细胞图谱,发现SPP1+巨噬细胞是关键的致病细胞亚群,并阐明姜黄素通过调控NF-κB信号通路缓解疾病的分子机制 | 首次通过单细胞图谱鉴定SPP1+巨噬细胞为子宫内膜异位症的关键致病亚群,并揭示其通过NF-κB通路促炎重编程及介导旁分泌串扰的机制,同时提出姜黄素靶向该信号轴的新治疗机制 | NA | 探索子宫内膜异位症的关键致病细胞亚群及其分子机制,并评估姜黄素的治疗作用 | 子宫内膜异位病灶中的巨噬细胞、基质细胞、上皮细胞及动物模型中的异位病灶组织 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、多组学分析、细胞通讯分析、功能验证、动物实验 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-06-23 |
Comprehensive Multi-Omics Profiling of Tertiary Lymphoid Structures Reveals Immunogenetic Landscapes and Prognostic Subtypes in Lung Adenocarcinoma
2026-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70120
PMID:42070266
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研究论文 | 通过对三级淋巴结构的综合多组学分析,揭示了肺腺癌的免疫遗传学景观和预后亚型 | 首次通过整合多组学策略构建了与三级淋巴结构相关的预后模型,并利用孟德尔随机化鉴定具有遗传支持的TLS相关基因 | 未明确提及 | 构建三级淋巴结构相关的预后模型并阐明相关的免疫遗传机制 | 肺腺癌患者及细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 逆转录定量聚合酶链反应, 孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本总数 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-06-23 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq Revealed the Role of Programmed Cell Death-Related Genes in the Prognosis of Glioblastoma Patients
2026-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05687-w
PMID:42008052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-06-23 |
Exploration of the Key Mechanism by Which Kaempferol Inhibits Glycolysis in Hepatocellular Carcinoma Cells via the AKT-mTOR Pathway
2026-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600141RR
PMID:42322592
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研究论文 | 探究山奈酚通过AKT-mTOR通路抑制肝细胞癌糖酵解的关键机制 | 首次结合转录组学、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示山奈酚通过靶向AKT-mTOR通路下调CA9基因表达来调控糖酵解,从而抑制肝细胞癌进展 | 未明确说明山奈酚在体内模型中的效果及长期安全性 | 阐明山奈酚抑制肝细胞癌细胞糖酵解的分子机制 | 肝细胞癌MHCC97H和Huh7细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, Western blot, 分光光度法 | NA | 转录组数据 | 两种肝细胞癌细胞系(MHCC97H和Huh7) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-06-23 |
TCF7L2 promotes abdominal aortic aneurysm through smooth muscle cell-mediated extracellular matrix remodeling
2026-Jun-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195681
PMID:42060473
|
研究论文 | 研究转录因子7类似物2(TCF7L2)在腹主动脉瘤发病机制中的作用,通过平滑肌细胞介导的细胞外基质重塑促进动脉瘤形成 | 首次整合汇总数据孟德尔随机化与单细胞RNA测序,确定TCF7L2在血管平滑肌细胞中富集并与腹主动脉瘤有因果关系,并揭示了其通过调节MMP14、TIMP3和ITGB1表达驱动细胞外基质重塑的新机制 | 未明确提及,但可能包括仅在动物模型中验证和缺乏直接人体干预数据 | 阐明TCF7L2在腹主动脉瘤发病中的角色和机制,探索潜在治疗靶点 | 人及小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 机器学习 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、汇总数据孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、文本 | 三个不同的腹主动脉瘤小鼠模型(血管紧张素II输注、β-氨基丙腈/血管紧张素II联合给药及弹性蛋白酶诱导) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-06-23 |
SpaVGMC: A Unified Representation Learning Framework via Structural and Semantic Alignment in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01121
PMID:42253102
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研究论文 | 提出SpaVGMC,一种通过结构和语义对齐进行统一表示学习的空间转录组学框架 | 首次将结构化变分表示学习、结构信息对齐和语义对齐统一在一个框架中,同时建模局部空间依赖和全局转录组织结构,无需数据增强即可实现分布感知的对比学习 | 未明确提及局限性 | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性,解决局部过度平滑、拓扑保真度受损和全局语义结构建模不足的问题 | 空间转录组学数据集中的组织切片及空间域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 结构化变分自编码器、图神经网络、对比学习模型 | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组学数据集(具体数量未提供) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-06-23 |
A multi-tissue single-cell atlas of moso bamboo (Phyllostachys edulis) reveals cellular heterogeneity and lineage trajectories
2026-Jun-22, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpag086
PMID:42324763
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研究论文 | 对毛竹幼苗进行单细胞RNA测序,构建了包含31658个高质量转录组的细胞图谱,揭示了不同组织的细胞异质性和谱系发育轨迹 | 首次系统构建毛竹多组织单细胞转录组图谱,揭示根、茎、叶发育轨迹差异及关键调控因子 | 仅分析了幼苗阶段,未涵盖成年竹子的发育过程;功能验证实验需要进一步开展 | 阐明毛竹快速生长和适应环境的细胞基础 | 毛竹(Phyllostachys edulis)幼苗 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 毛竹幼苗,31658个高质量单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-06-23 |
Spatiotemporal Dynamics of NK Cell Immune Checkpoints Tim-3 and Lag-3 in Human Pregnancy: An Integrated Peripheral and Decidual Compartment Analysis
2026-Jun-22, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag126
PMID:42324764
|
研究论文 | 本研究综合外周血和蜕膜组织分析,探讨免疫检查点Tim-3和Lag-3在人类妊娠中的时空动态变化及其在复发性流产中的作用 | 首次整合外周血和蜕膜组织,揭示妊娠期Tim-3和Lag-3在NK细胞亚群中的时空特异性表达模式,并发现可溶性Tim-3与膜结合Tim-3的负相关关系 | 样本量有限,未明确提及具体数量;未深入探讨Tim-3和Lag-3的功能机制 | 阐明免疫检查点Tim-3和Lag-3在母胎免疫调节中的时空动态变化 | 人类妊娠期外周血和蜕膜组织中的NK细胞和T细胞 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括正常妊娠和复发性流产患者的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 29 | 2026-06-23 |
Targeting a Myeloid-Regulatory B Cell Network Reverses Immune Paralysis in Periprosthetic Joint Infections
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76149
PMID:42325123
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示假体周围关节感染中免疫抑制网络,并发现靶向CXCR4阳性多形核髓系抑制细胞可逆转免疫麻痹 | 首次鉴定出高表达CXCR4的PMN-MDSC亚群与AHR和TIM1阳性调节性B细胞相互作用形成免疫抑制轴,并通过药物筛选发现阿仑膦酸钠可直接通过STAT3通路抑制该细胞亚群 | 未提及 | 探究假体周围关节感染中局部免疫抑制微环境的机制并开发临床可用的免疫调节策略 | 假体周围关节感染小鼠模型 | 机器学学习, 数字病理学 | 感染性疾病, 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠假体周围关节感染模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 30 | 2026-06-23 |
An Integrative Strategy Delineates Modular Metabolic Remodeling and Potential Therapeutic Targets Across Metabolic Diseases
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76250
PMID:42325124
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据构建跨代谢疾病的代谢图谱,揭示模块化代谢重塑并鉴定潜在治疗靶点 | 首次建立跨7种主要代谢疾病的单细胞代谢图谱,并开发整合分析策略将227条代谢通路组织为15个协同代谢模块,阐明模块特异性重塑的跨细胞类型调控回路 | 未明确提及,但可能包括数据来源异质性、功能验证不足等 | 探究不同代谢通路在代谢疾病中的临床相关性及机制 | 来自86名患者的562699个单细胞,涵盖七种主要代谢疾病 | 机器学习 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 86名患者的562699个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-06-23 |
Condition-Associated Pattern Extraction and Recovery From Multi-Condition Single-Cell RNA-seq Data With CAPER
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76186
PMID:42328733
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研究论文 | CAPER是一个矩阵分解框架,用于从多条件单细胞RNA-seq数据中提取并恢复与条件相关的生物学信号 | CAPER能够明确区分共同生物学状态与条件特异性变异,直接输出可解释且批次校正的表达矩阵,保留并分离目标信号,优于现有方法 | 文章未明确提及局限性 | 开发一种鲁棒且可解释的工具,从多条件单细胞RNA-seq数据中恢复生物学信号,支持疾病研究和功能基因组学发现 | 多条件单细胞RNA-seq数据中的生物学信号和条件特异性变异 | 机器学习 | 肺腺癌, 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解 | 基因表达数据 | 包括模拟数据及三个真实数据集:高信噪比的PBMC免疫刺激数据、混杂信噪比的LUAD肿瘤微环境数据、低信噪比的T1D复杂自身免疫疾病数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-06-23 |
Longitudinal Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Evolution of Micro- and Macro-states in Chronic Myeloid Leukemia
2026-Jun-22, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-4371
PMID:42328854
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研究论文 | 利用纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微状态和宏状态的演变 | 通过整合单细胞与批量转录组数据,运用状态转换理论,从理论层面解释了为何单细胞层面的离散疾病表型不清晰,而聚合的宏状态层面能清晰显现,为理解疾病演变提供了新框架 | 主要基于慢性髓系白血病数据验证,在其他癌症和复杂疾病中的通用性有待进一步验证 | 探索单细胞RNA测序与批量转录组数据中慢性髓系白血病的信息内容,澄清离散疾病表态如何从噪声单细胞数据中涌现 | 慢性髓系白血病患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 状态转换模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-06-23 |
Comparative transcriptional profiling of key macrophage and fibroblast subpopulations in rheumatoid arthritis-associated lung disease
2026-Jun-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70256
PMID:42328894
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研究论文 | 使用FLEX单细胞RNA测序比较类风湿关节炎相关肺疾病中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱 | 首次通过FLEX单细胞RNA测序技术对固定肺组织标本进行转录组分析,对比类风湿关节炎相关间质性肺疾病与类风湿关节炎肺结节中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的差异基因表达,并揭示与特发性肺纤维化的重叠纤维化程序 | 样本量较小(RA-ILD 9例,RA结节3例,非疾病对照4例),且仅限于肺组织标本,可能影响结果的普适性 | 比较类风湿关节炎相关肺疾病不同亚型中巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录谱差异 | 类风湿关节炎相关间质性肺疾病和类风湿关节炎肺结节患者的肺组织标本 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎相关肺病 | FLEX单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非疾病对照4例,RA-ILD 9例,RA结节3例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | FLEX单细胞RNA测序采用探针捕获法分析固定肺组织标本 |
| 34 | 2026-06-23 |
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-Jun-22, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag258
PMID:42329219
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综述 | 本文综述了单细胞和空间多组学技术揭示系统性硬化症皮肤分子异质性的研究,并探讨其对疾病分层和皮肤评估的意义 | 整合2021年至2025年间单细胞RNA测序和空间转录组学的研究成果,挑战了皮肤纤维化为统一过程的传统观点,提出不同细胞和空间程序可能贡献于临床上相似的皮肤受累模式 | 研究依赖于已发表文献,缺乏前瞻性队列验证;结论能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估取决于在更大规模临床特征明确的队列中的前瞻性验证 | 综合单细胞和空间多组学研究的发现,探讨分子异质性与临床表型的关系,以及其对皮肤评估、治疗反应异质性和患者亚组划分的意义 | 系统性硬化症患者的皮肤 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据,空间转录组数据 | 不适用 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞测序平台,10x Visium空间转录组平台 |
| 35 | 2026-06-23 |
Immune subtyping of colorectal adenoma identifies a subtype with activated adaptive immunity ahead of progressing to cancer
2026-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05492-1
PMID:42329305
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研究论文 | 通过免疫分型鉴定结直肠腺瘤中具有活化适应性免疫的亚型,该亚型在进展为癌症前已存在 | 首次对结直肠腺瘤进行基于免疫基因的分子亚型分析,结合单细胞转录组数据揭示腺瘤中早期出现的TIGIT活化和CD8 T细胞耗竭特征 | 未提及具体限制 | 通过免疫分型表征结直肠腺瘤的免疫微环境,并评估其与癌症进展、基因表达特征及功能通路的关联 | 多个队列的结直肠腺瘤样本的转录组数据及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个结直肠腺瘤队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-06-23 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals a prognostic neuro-mimicry signature in papillary thyroid carcinoma
2026-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05278-5
PMID:42329337
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研究论文 | 联合批量与单细胞RNA测序揭示甲状腺乳头状癌中一种预后相关的神经拟态特征 | 首次在甲状腺乳头状癌中通过整合批量与单细胞RNA测序数据,鉴定出一个由8个离子通道基因构成、可预测淋巴结转移的预后特征,并证实该特征源于恶性甲状腺细胞而非免疫细胞,揭示了肿瘤内在的神经拟态机制 | 该发现尚需实验验证,且数据仅来源于公共数据库(TCGA和GSE184362),缺乏独立外部队列的验证 | 探索甲状腺乳头状癌中离子通道基因的神经拟态作用及其临床预后意义 | 521例甲状腺乳头状癌患者的转录组数据及7个整合肿瘤样本中的65,744个单细胞 | 机器学习 | 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO逻辑回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 521例患者(TCGA队列),7个肿瘤样本(65,744个单细胞) | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA RNA-seq数据(Illumina平台),GSE184362单细胞RNA-seq数据 |
| 37 | 2026-06-23 |
Integrated bioinformatics, single-cell analysis, and experimental validation identify quercetin as a potential therapeutic candidate for intervertebral disc degeneration
2026-Jun-22, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05619-9
PMID:42329412
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research paper | 整合生物信息学、单细胞分析和实验验证,确定槲皮素为椎间盘退变的潜在治疗候选药物 | 首次通过整合差异表达基因分析、WGCNA、PPI网络、LASSO回归及单细胞RNA测序,鉴定出ZEB2、COL6A2、CCND1、RAP1A和GATA3五个关键枢纽基因,并利用分子对接和体外实验验证了槲皮素对这些基因表达的逆转作用 | 未在体内模型中验证槲皮素的治疗效果;单细胞分析基于公开数据集,可能无法完全代表体内微环境;分子对接仅提供初步计算证据,未进行结合亲和力的实验测定 | 探索椎间盘退变的分子机制并筛选潜在治疗化合物 | 椎间盘退变患者的髓核组织样本及LPS诱导的髓核细胞 | machine learning, digital pathology | 椎间盘退变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | WGCNA, LASSO回归, PPI网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE70362数据集包含椎间盘退变和对照髓核样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-06-23 |
Integrative single-cell profiling and explainable AI identify monocyte-metabolic signatures as diagnostic biomarkers and candidate therapeutic targets in tuberculosis
2026-Jun-22, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05005-2
PMID:42329418
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和可解释人工智能,发现并验证了结核病中单核细胞免疫代谢相关的6基因诊断标志物及潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与大规模共识机器学习框架(113种算法组合),筛选出反映单核细胞免疫代谢重编程的6基因标志物,并通过可解释性分析(SHAP)和临床ELISA验证其诊断价值,同时利用网络药理学预测天然化合物靶向治疗潜力 | 临床验证队列规模较小,且ELISA检测仅评估了蛋白质水平,未深入探讨标志物在不同结核病亚型(如潜伏感染、活动性结核)的区分能力 | 开发基于宿主免疫代谢失调的可靠、可解释的诊断标志物及候选治疗靶点,以改进结核病的快速诊断和宿主导向治疗 | 结核病患者的外周血单核细胞及转录组公共数据 | 机器学习, 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 分子对接 | glmBoost + 随机森林(RF)集成模型 | 基因表达数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个转录组公共队列及一个独立的初步临床队列(具体样本量未在摘要中明确说明) | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | NA |
| 39 | 2026-06-23 |
Investigating the shared genetic architecture between selective immunoglobulin A deficiency and autoimmune diseases
2026-Jun-22, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02850-5
PMID:42329450
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研究论文 | 系统分析选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病的共享遗传结构 | 通过跨性状全基因组关联研究荟萃分析,首次系统揭示IgAD与10种常见自身免疫性疾病间的多效性位点和共享遗传基础,并利用单细胞RNA测序鉴定受影响的细胞类型 | 仅基于大规模GWAS汇总统计数据,缺乏原始个体级数据验证;分析限于欧洲血统人群,可能不适用于其他人群 | 探究选择性免疫球蛋白A缺乏症与自身免疫性疾病之间的共享遗传结构及潜在机制 | 选择性免疫球蛋白A缺乏症和10种常见自身免疫性疾病 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 遗传数据、单细胞转录组数据 | 大规模GWAS汇总统计数据,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-06-23 |
Establishment and validation of the NEX-RiboTag system for profiling the excitatory neuronal translatome in the postnatal mouse forebrain
2026-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 建立并验证了 NEX-RiboTag 系统,用于分析出生后小鼠前脑中兴奋性神经元的翻译组 | 首次建立了 NEX-RiboTag 小鼠品系,实现了对皮质和海马兴奋性神经元中核糖体结合 mRNA 的靶向分析,填补了转录身份与细胞类型特异性翻译输出之间的空白 | 可能存在 Cre 重组酶活性或RiboTag 标记效率的潜在限制,且研究仅限于出生后早期阶段(1周龄) | 桥接转录组与翻译组之间的差距,探索兴奋性神经元特异性翻译调控 | 出生后小鼠前脑(皮质和海马)的兴奋性神经元 | 神经科学, RNA测序 | 不适用 | RNA-seq, RiboTag, Cre-loxP 系统 | 不适用 | RNA测序数据 | 出生后1周龄小鼠的皮质和海马组织样本 | 不适用 | RNA-seq | 不适用 | 不适用 |