单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 3961 - 3980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3961 | 2025-03-21 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
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研究论文 | 本研究探讨了SPRY1在皮肤老化中的作用，特别是其对巨噬细胞M1极化的影响，并探索其作为缓解皮肤老化和黑色素瘤治疗靶点的潜力 | 首次揭示了SPRY1在皮肤老化中的关键作用，特别是通过促进巨噬细胞M1极化加速皮肤老化，并发现其在黑色素瘤中的表达与患者生存率相关 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证，未来需要进一步探索其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤老化中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、基因转染、CCK-8实验、qRT-PCR、ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | GTEx和GEO数据库中的数据集，以及RAW264.7和NIH/3T3细胞系 |
| 3962 | 2025-03-21 |
Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112031
PMID:40104055
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了肥胖诱导的雌性小鼠胰岛β细胞扩增过程中的分子机制 | 揭示了Xbp1和Myc在缓解未折叠蛋白反应（UPR）和刺激β细胞增殖中的协调转录机制 | 研究仅限于雌性小鼠，未涉及雄性小鼠或其他物种 | 探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制，以寻找新的治疗靶点 | 雌性小鼠的胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 雌性KO小鼠的胰岛β细胞 |
| 3963 | 2025-03-21 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Mar-20, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
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研究论文 | 本研究探讨了TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 首次将TANC2基因与癫痫和发育性癫痫性脑病（DEE）关联起来，并通过果蝇模型和单细胞RNA测序验证了其功能 | 样本量较小，仅包括六例不相关的病例 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异的机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 遗传学 | 癫痫 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | 果蝇模型 | 基因序列数据、RNA表达数据 | 六例不相关的癫痫患者 |
| 3964 | 2025-03-21 |
NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma
2025-Mar-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025875
PMID:40106762
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了多发性骨髓瘤患者骨髓中CD4+ T细胞的细胞毒性作用及其与NKG2D的关系 | 发现了CD4+细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）在多发性骨髓瘤患者中的显著增加和克隆扩展，并揭示了其通过NKG2D介导的细胞毒性作用 | 研究局限于多发性骨髓瘤患者，未涉及其他类型的癌症 | 探讨CD4+ T细胞在多发性骨髓瘤中的抗肿瘤免疫作用 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞 | 免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | RNA序列数据 | 多发性骨髓瘤患者骨髓样本 |
| 3965 | 2025-03-21 |
Identification of NETs-related genes as diagnostic biomarkers in ischemic stroke using RNA sequencing and single-cell analysis
2025-Mar-19, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10117-z
PMID:40107980
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞分析，识别了与缺血性中风相关的NETs相关基因，并评估了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次结合RNA测序和单细胞RNA测序技术，系统地研究了NETs在缺血性中风中的作用，并识别了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明NETs在缺血性中风进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠脑组织样本 | 生物信息学 | 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠脑组织样本 |
| 3966 | 2025-03-21 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
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研究论文 | 本文研究了BubR1在心脏发育中的作用，揭示了其通过促进心脏生成调节因子的表达来调控心脏发育的机制 | 首次揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用，特别是其在心脏成熟和形态发生中的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨BubR1在心脏发育中的分子机制及其对先天性心脏缺陷的影响 | 小鼠胚胎心脏 | 发育生物学 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，CellChat分析 | NA | RNA测序数据 | 小鼠胚胎心脏样本 |
| 3967 | 2025-03-21 |
New insights into cancer immune checkpoints landscape from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-13, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189298
PMID:40088992
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review | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示癌症免疫检查点景观中的新见解，特别是在免疫检查点阻断治疗前后的免疫浸润模式 | 利用单细胞RNA测序技术高分辨率描绘了免疫检查点之间的功能相互作用，揭示了免疫检查点阻断治疗中肿瘤微环境的异质性 | 未提及具体的研究样本量或实验数据，可能缺乏定量分析 | 探讨免疫检查点阻断治疗在肿瘤免疫治疗中的效果及其失败的原因 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA sequencing data | NA |
| 3968 | 2025-03-21 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-Mar-08, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111028
PMID:40064358
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，识别出APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 | 首次将APOC1识别为胆管癌G0/G1期细胞的特征基因，并通过实验验证其通过抑制Wnt/β-catenin信号通路诱导G0/G1期阻滞的机制 | 未明确APOC1在胆管癌G0/G1期细胞中的具体分子机制 | 探索胆管癌G0/G1期细胞的生物标志物及其分子机制 | 胆管癌细胞 | 生物信息学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulkRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 |
| 3969 | 2025-03-21 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了促增殖信号对上皮细胞稳态的影响，揭示了EGFR-Ras和Hh信号通路在肿瘤发生中的独立作用 | 揭示了非相互作用的信号通路在转录水平上如何汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究主要基于果蝇滤泡细胞系，可能需要在哺乳动物系统中进一步验证 | 研究促增殖信号对上皮细胞稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞系 | 分子生物学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3970 | 2025-03-21 |
Role of cancer stem cell heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-28, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1286
PMID:40104739
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研究论文 | 本研究探讨了癌症干细胞异质性在肝内胆管癌（ICC）中的作用，通过单细胞RNA测序技术分析了不同细胞亚群的信号通路活动和细胞间通讯 | 利用单细胞RNA测序技术深入探索了ICC中癌症干细胞的异质性，揭示了不同亚群对肿瘤进展和患者预后的影响 | 研究依赖于公开的数据库数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 研究ICC中癌症干细胞异质性对预后的影响 | 肝内胆管癌（ICC）患者 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq数据集GSE142784和TCGA数据库的Bulk RNA-seq数据 |
| 3971 | 2025-03-21 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Feb-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5921338/v1
PMID:40060050
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析细胞类型组成的变化 | crumblr方法在细胞谱系层次结构的多个级别上进行统计测试，采用多变量方法提高检测能力 | NA | 开发一种统计方法来识别细胞类型频率的变化 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | RNA测序数据 | NA |
| 3972 | 2025-03-21 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639959
PMID:40060489
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研究论文 | 本文评估了小鼠大脑图谱中通过单细胞RNA测序和单核测序识别的细胞簇的可重复性 | 通过转录组范围的邻居投票方法，识别了2009对具有一致空间定位和协调基因表达的互配簇，这些簇在多个物种的数据集中也被观察到 | 下丘脑的异质性限制了簇的一致性，且使用标记基因区分紧密簇比区分大多数其他簇更具挑战性 | 评估小鼠大脑图谱中细胞簇的可重复性，以确定其生物学稳健性 | 小鼠大脑中的细胞簇 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 单核测序 | NA | RNA测序数据 | 超过400万个细胞，分为5000多个簇 |
| 3973 | 2025-03-21 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，开发了一种细胞类型无关的转录组特征模型，用于比较不同背景、模型系统和物种间的神经发育 | 提出了一种细胞类型无关的模型，能够准确预测细胞自主成熟度，并在不同细胞类型和数据集中捕捉发育动态 | 尽管模型在人类神经类器官和小鼠大脑中表现出良好的泛化能力，但其在其他物种或更广泛的应用场景中的有效性仍需进一步验证 | 开发一种统一的框架，用于比较不同背景、模型系统和物种间的神经发育 | 人类大脑发育数据集和小鼠大脑发育数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 |
| 3974 | 2025-03-21 |
Human Pancreatic Cancer Single-Cell Atlas Reveals Association of CXCL10+ Fibroblasts and Basal Subtype Tumor Cells
2025-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2183
PMID:39636224
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）构建了人类胰腺癌的单细胞图谱，揭示了CXCL10+成纤维细胞与基底亚型肿瘤细胞之间的关联 | 发现了CXCL10+癌症相关成纤维细胞与基底肿瘤细胞之间的新型富集和空间关联，并揭示了这些细胞类型在PDAC肿瘤微环境中的关系 | 研究主要依赖于公开的原始数据，可能受到数据质量和一致性的限制 | 开发基因组资源，以统计学严谨的方式识别新的潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST），多重免疫染色 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 229例患者样本，744例bulk RNA-seq样本，22例空间转录组样本，总计70万个细胞 |
| 3975 | 2025-03-21 |
Single-cell RNA sequencing of shoot apex reveals the mechanism of cyclin regulating cell division via auxin signaling pathway in Populus alba
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1555388
PMID:40104035
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了白杨顶端分生组织的细胞分裂和分化过程，揭示了细胞周期蛋白通过生长素信号通路调控细胞分裂的机制 | 首次在单细胞水平上揭示了白杨顶端分生组织中细胞分裂和分化的分子调控机制，特别是生长素信号通路在叶片组织发育中的作用 | 研究仅基于两个生物学重复，样本量较小，可能影响结果的普适性 | 研究白杨顶端分生组织中细胞分裂和分化的分子调控机制 | 白杨顶端分生组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 29,011个细胞，来自两个生物学重复 |
| 3976 | 2025-03-21 |
Multi-omics approach reveals the impact of prognosis model-related genes on the tumor microenvironment in medulloblastoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1477617
PMID:40104502
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了预后模型相关基因对髓母细胞瘤肿瘤微环境的影响 | 开发了一个与肿瘤微环境相关的风险评分模型（TMErisk），并利用单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间RNA分析验证了结果 | NA | 预测髓母细胞瘤患者的预后并阐明生物学机制 | 髓母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、空间RNA分析 | LASSO-COX模型、COX回归模型 | RNA测序数据 | 322个天坛样本和763个GSE85217样本 |
| 3977 | 2025-03-21 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-Dec-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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研究论文 | 本文探讨了造血干细胞（HSCs）的异质性和与年龄相关的血小板偏向性，及其对骨髓移植和血液疾病的影响 | 揭示了血小板偏向性造血干细胞（P-HSCs）的存在及其在衰老过程中的扩展，提供了跨物种血小板偏向性HSCs的进化保守性证据 | 当前方法学存在局限性，需要进一步研究以优化HSC疗法并改善血液疾病的临床结果 | 研究HSCs的异质性和血小板偏向性对骨髓移植和血液疾病的影响 | 造血干细胞（HSCs） | 血液学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序，分子条形码 | NA | NA | NA |
| 3978 | 2025-03-21 |
Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease
2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400332
PMID:39465979
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研究论文 | 本文探讨了在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性 | 使用可生物降解聚合物载体封装IL-4，并在口腔内局部递送，以靶向巨噬细胞，从而减少炎症性骨丢失并促进骨再生 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人体中验证其效果 | 评估在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性 | 鼠类模型中的牙周病 | 免疫学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 鼠类模型 |
| 3979 | 2025-03-21 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-Sep-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
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评论 | 本文讨论了内吞作用在造血干细胞（HSCs）命运中的关键调节作用，及其对造血干细胞和基因治疗的影响 | 揭示了MYCT1蛋白在HSCs维持中的新作用，特别是在调节内吞作用和环境感知方面 | 尽管在体外培养HSCs方面取得了显著进展，但仍未完全理解所有潜在机制及其在HSCs增殖时的变化 | 探讨内吞作用在HSCs命运中的调节作用，及其对细胞治疗和基因治疗应用的影响 | 造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HSPCs） | 再生医学 | 血液和免疫细胞相关疾病 | 敲低、过表达、单细胞RNA测序和移植实验 | NA | NA | NA |
| 3980 | 2025-03-21 |
In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer
2024-Sep-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2406325121
PMID:39298484
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研究论文 | 本文通过体内CRISPR筛选，识别了Mga作为三阴性乳腺癌免疫治疗的潜在靶点 | 通过七种同源肿瘤模型的迭代体内CRISPR筛选，识别了跨癌症类型的核心和上下文依赖性免疫逃逸途径，并发现Mga敲除显著增强抗肿瘤免疫并抑制肿瘤生长 | Mga在肿瘤免疫景观中的精确调控机制尚需进一步研究 | 探索肿瘤免疫逃逸机制，并寻找有效的抗癌治疗靶点 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | 癌症研究 | 乳腺癌 | CRISPR筛选、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 七种同源肿瘤模型 |