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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3961 - 3980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3961 | 2025-10-06 |
Refinement strategies for Tangram for reliable single-cell to spatial mapping
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf194
PMID:40662790
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研究论文 | 本文改进了Tangram空间映射工具，通过多种策略提高单细胞到空间映射的可靠性 | 提出了四种改进策略：在信息基因子集上训练模型、应用细胞过滤、引入多种正则化形式以及整合邻域信息，显著提高了映射一致性 | 研究主要基于小鼠数据集，在其他物种或组织类型中的适用性需要进一步验证 | 提高单细胞RNA测序与空间转录组学数据整合的可靠性和一致性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Tangram模型改进 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 真实和模拟的小鼠数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3962 | 2025-10-06 |
Predicting fine-grained cell types from histology images through cross-modal learning in spatial transcriptomics
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf201
PMID:40662792
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研究论文 | 提出一种跨模态统一表示学习框架CUCA，用于从组织学图像预测细粒度细胞类型 | 利用跨模态嵌入对齐范式协调形态学和分子模态的嵌入空间，弥合图像模式与分子表达特征之间的差距 | NA | 从组织学图像识别细粒度细胞类型，为肿瘤生物学研究提供见解 | 细胞类型识别和空间组织结构分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 跨模态表示学习 | 跨模态统一表示学习框架 | 组织学图像、空间转录组数据 | 三个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3963 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics deconvolution methods generalize well to spatial chromatin accessibility data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf268
PMID:40662813
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研究论文 | 本研究评估了空间转录组学反卷积方法在空间染色质可及性数据上的适用性 | 首次系统评估RNA反卷积方法在染色质可及性数据上的表现，并开发了跨模态模拟框架 | RNA反卷积方法在解析稀有细胞类型时表现略优于染色质可及性方法，表明仍需开发专门方法 | 验证空间转录组反卷积方法在空间染色质可及性数据上的通用性 | 空间染色质可及性数据和空间转录组数据 | 空间组学 | NA | 空间染色质可及性分析, 空间转录组学, 单细胞多组学 | Cell2location, RCTD | 空间染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间染色质可及性分析, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3964 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells: Bridging microenvironmental interactions and clinical therapy
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70406
PMID:40665579
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综述 | 本文系统总结了癌症干细胞（CSCs）的生物学特性、分子调控机制及其与肿瘤微环境的相互作用，并评估了靶向CSCs的临床治疗策略 | 有机整合了CSCs的基础机制与临床转化研究，提出了多组学引导的精准医疗和微环境重塑等解决方案 | NA | 探讨癌症干细胞在肿瘤发生发展中的作用及其临床治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 多组学分析、谱系追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3965 | 2025-10-06 |
The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy
2025-Jun-30, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01498-6
PMID:40588764
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研究论文 | 本研究探讨CXCL16/CXCR6轴在CAR-T细胞疗法相关神经毒性中的作用机制 | 首次发现CXCR6+细胞毒性T细胞在ICANS脑脊液中富集，并揭示CXCL16/CXCR6轴与神经毒性严重程度的相关性 | 样本量较小（n=11），且严重病例数量有限 | 阐明CAR-T细胞疗法中免疫效应细胞相关神经毒性综合征的发病机制 | 接受CAR-T细胞治疗并发生ICANS的患者外周血和脑脊液样本，以及尸检脉络丛和脑组织 | 单细胞生物学 | 神经毒性综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 多模态空间转录组学, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 11例ICANS患者（分级：1级3例，2级4例，3级1例，4级3例） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3966 | 2025-10-06 |
Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts Contribute to Microvascular Proliferation in Glioblastoma and are Correlated with Immunosuppression and Poor Outcome
2025-Jun-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0743
PMID:40131028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤中微血管增殖的细胞组成及其与免疫抑制的关联 | 首次在胶质瘤中鉴定出与微血管增殖相关的间充质干细胞和癌症相关成纤维细胞群体，并发现PDGFRB是驱动间充质干细胞向成熟血管/血管周围基质细胞分化的关键基因 | 样本量相对有限（16例患者），研究结果需要在更大队列中验证 | 探究胶质母细胞瘤中微血管增殖的细胞机制和生物学后果 | 胶质瘤患者的血管/血管周围基质细胞和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，RNA速率分析，信号网络分析，数字空间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例原发性胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3967 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析紫杉醇诱导的小鼠脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示紫杉醇诱导的内皮细胞衰老通过改变细胞连接组装和细胞外基质重塑相关基因表达导致血脑屏障功能障碍 | 研究仅基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何影响血脑屏障完整性的基因表达模式 | 紫杉醇处理的小鼠脑毛细血管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 化疗相关认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3968 | 2025-10-06 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了一种新型终末雪旺细胞亚型，并确定SPP1信号通路是神经肌肉接头动态的关键调节因子 | 研究仅限于特定神经损伤模型，未涉及其他病理条件 | 阐明雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的分子机制 | 肌肉驻留雪旺细胞和神经肌肉接头 | 单细胞生物学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 稳定神经支配与部分/完全去神经支配再神经支配模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3969 | 2025-10-06 |
Reactivation of CTLA4-expressing T cells accelerates resolution of lung fibrosis in a humanized mouse model
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181775
PMID:40100323
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，揭示了CTLA4阳性T细胞在肺纤维化消退过程中的关键作用 | 首次发现CTLA4在CD8+ T细胞上的表达与纤维化区域相邻，并证明靶向CTLA4的治疗可加速肺上皮再生和纤维化消退 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的直接转化仍需进一步验证 | 探究免疫检查点蛋白CTLA4在肺纤维化消退过程中的作用机制 | 人源化CTLA4敲入小鼠模型、人类特发性肺纤维化组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 人源化小鼠模型和人类肺纤维化组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3970 | 2025-10-06 |
[Single-cell analysis of immune-lineage features in T-cell large granular lymphocytic leukemia]
2025-May-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析T细胞大颗粒淋巴细胞白血病患者的免疫谱系特征 | 首次在单细胞水平揭示T-LGLL的免疫谱系特征，发现效应CD8+ T细胞异常扩增、Treg细胞减少及功能异常等关键免疫失衡特征 | 样本量较小（5例患者和3例健康对照），单中心研究 | 研究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病的免疫谱系改变及其致病机制 | T-LGLL患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5例T-LGLL患者（治疗前后配对样本）和3例健康对照 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 3971 | 2025-10-06 |
POPARI: Modeling multisample variation in spatial transcriptomics
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652741
PMID:40462963
|
研究论文 | 提出Popari概率图模型用于多样本空间转录组数据的因子分解分析 | 引入差异先验正则化空间一致性和空间下采样实现多分辨率层次分析 | 未明确说明模型计算复杂度和可扩展性限制 | 开发多样本空间转录组数据整合分析方法 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 概率图模型 | 空间基因表达数据 | 多个生物样本（小鼠大脑、胸腺、卵巢癌） | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS, Slide-TCR-seq, CosMx | NA |
| 3972 | 2025-10-06 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-May-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 本研究构建了首个小鼠精囊的单细胞转录组图谱，揭示了该组织的细胞组成和功能特征 | 首次创建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，系统定义了该组织的细胞类型和转录组特征 | 研究仅基于小鼠模型，结果向人类推演需谨慎；样本数量相对有限 | 解析精囊组织的细胞组成和功能，理解精液形成的分子基础 | 小鼠精囊组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23只不同年龄和饮食条件的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3973 | 2025-10-06 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
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综述 | 本文综述了空间多组学技术的基本原理及其在皮肤病学研究中的应用前景 | 介绍了能够同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质的空间多组学新技术，突破了传统空间转录组学的局限 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证和数据分析 | 探讨空间多组学技术在皮肤病学研究中的原理、优势和局限性 | 皮肤组织的空间分子特征 | 空间生物学 | 皮肤病 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、表观基因组、蛋白质组空间数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 3974 | 2025-10-06 |
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466
PMID:40090085
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研究论文 | 本研究在青少年系统性红斑狼疮中发现了一类高度活化的CD99-CD72+B细胞亚群，该细胞群通过表达高水平TLR7促进自身免疫进程 | 首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72+B细胞这一关键过渡细胞群体，揭示了其在自身免疫反应中的新作用机制 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步实验验证该细胞群体的具体功能机制 | 探究青少年系统性红斑狼疮中B细胞亚群的免疫病理机制 | 青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学整合分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3975 | 2025-10-06 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645566
PMID:40236001
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研究论文 | 本研究通过多模态分析识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的空间和分子决定因素 | 首次整合光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium原位转录组学和CODEX空间蛋白质组学，建立空间多组学框架分析胶质瘤TIL扩增能力 | 研究聚焦于高级别胶质瘤，结果在其他免疫排斥肿瘤中的普适性需进一步验证 | 识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的基因组和空间决定因素 | 高级别胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 光谱流式细胞术, TCR测序, 单细胞RNA测序, 原位转录组学, 空间蛋白质组学 | 多组学整合分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, T细胞受体数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Xenium | Xenium原位转录组学平台 |
| 3976 | 2025-10-06 |
Tracking HIV persistence across T cell lineages during early ART-treated HIV-1-infection using a reservoir-marking humanized mouse model
2025-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57368-7
PMID:40044684
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研究论文 | 开发HIV-1诱导谱系追踪系统，通过单细胞RNA测序追踪早期ART治疗期间HIV在不同T细胞谱系中的持久性 | 首创HIV-1诱导谱系追踪系统，可永久标记感染细胞并检测稀有潜伏感染细胞 | 基于人源化小鼠模型，可能与人类真实感染情况存在差异 | 研究HIV在ART治疗期间在不同T细胞谱系中的持久性机制 | HIV-1感染的人源化小鼠模型中的CD4 T细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型中的稀有潜伏感染细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3977 | 2025-10-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi筛选的iAssembloids系统，用于研究神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次将CRISPRi筛选技术应用于3D共培养的iPSC衍生神经元和胶质细胞系统，建立了可扩展的因果分子机制研究平台 | 基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内大脑环境的复杂性 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制，特别是对神经元存活和死亡的控制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选，单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据，功能筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3978 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析描绘了极早产儿出生后前两个月循环免疫细胞的发育轨迹 | 首次利用微量血液样本对极早产儿进行纵向单细胞多组学分析，揭示了其外周免疫发育的独特轨迹 | 样本量较小（仅10名极早产儿），需要更大规模研究验证 | 阐明极早产儿出生后前两个月外周免疫系统的发育特征 | 极早产儿、健康成人、早产和足月脐带血样本 | 单细胞组学 | 早产相关免疫缺陷 | 单细胞RNA测序、T和B细胞受体测序、磷酸化蛋白质质谱流式细胞术 | NA | 单细胞多组学数据 | 10名极早产儿，加上健康成人、早产和足月脐带血对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 单细胞BCR测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 3979 | 2025-10-06 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
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综述 | 本文更新并拓展了关于心脏病分子与细胞神经生物学的研究，重点关注心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经功能障碍，以及新型成像技术和空间转录组学在心脏自主神经疾病治疗靶点发现中的应用 | 文中强调了未解决的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏疾病的分子与细胞神经生物学机制 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 神经心脏病学 | 心脏病 | 空间转录组学、干细胞技术、新型成像技术 | NA | 分子与细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3980 | 2025-10-06 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡和生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路导致卵母细胞凋亡和生育力下降的具体分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究PFOA和PFOS混合物对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生育障碍 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |