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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 3961 - 3980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3961 | 2026-04-20 |
SOX4 is a transcriptional activator for CTHRC1 in lung fibroblast activation
2026-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150171
PMID:41997467
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研究论文 | 本研究揭示了SOX4作为CTHRC1的转录激活因子在肺成纤维细胞活化中的作用 | 首次发现SOX4直接结合并激活CTHRC1启动子，揭示了SOX4-CTHRC1调控轴在肺纤维化中的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和公共数据集，缺乏体内实验验证 | 探究肺纤维化中成纤维细胞活化的转录调控机制 | 肺成纤维细胞（如MRC5细胞系）及肺纤维化相关基因CTHRC1和SOX4 | 分子生物学 | 肺纤维化 | RNA-seq、单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因实验、突变分析、染色质免疫沉淀（ChIP） | NA | 基因表达数据、测序数据 | 公共数据集（GSE124685、GSE169500、GSE135893）及TGFβ1诱导的MRC5成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3962 | 2026-04-20 |
The immunodynamics of pulmonary fibrosis
2026-Apr-15, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2026.04.001
PMID:41999680
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综述 | 本文综述了肺纤维化中免疫系统的动态作用，提出了免疫动力学框架，并探讨了免疫靶向治疗的潜力 | 利用单细胞和空间转录组学重新定义了免疫系统在纤维化中的核心作用，提出了统一的免疫动力学框架来解释IPF和继发性纤维化ILD的发病机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，且免疫靶向治疗的临床转化仍面临挑战 | 阐明肺纤维化疾病中免疫系统的动态作用及治疗策略 | 间质性肺疾病（ILDs）导致的肺纤维化，特别是特发性肺纤维化（IPF） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3963 | 2026-04-20 |
Identification of a Novel Mitochondrial-Related Gene Signature for BMSCs in Osteoporosis Combining Single-Cell and Bulk Transcriptome Data
2026-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11099-y
PMID:40221950
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了骨质疏松症患者骨髓间充质干细胞中与线粒体相关的新型基因特征 | 结合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，首次在骨质疏松症BMSCs中鉴定出线粒体相关基因特征，并发现DUT作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集GSE147287和GSE35956，样本来源和数量可能有限，且功能验证主要在细胞水平进行 | 旨在识别骨质疏松症患者骨髓间充质干细胞中线粒体相关基因特征，探索其在疾病发展中的作用 | 健康个体和骨质疏松症患者的骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 电子显微镜扫描 | LASSO逻辑回归, 随机森林 | 转录组数据 | 基于公共数据集GSE147287（单细胞）和GSE35956（批量），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3964 | 2026-04-20 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Lung Tissues Reveals Metallothionein-Positive T Cells as a Novel Potential Marker of Susceptibility to Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509332
PMID:41684305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在人类肺组织中鉴定出一种新的T细胞亚群（MT-high T细胞），并发现其频率与慢性阻塞性肺疾病（COPD）的进展和易感性相关 | 首次在人类肺组织中通过单细胞RNA测序鉴定出以高表达金属硫蛋白基因为特征的新型T细胞亚群（MT-high T细胞），并揭示其在COPD进展中的动态变化及其作为疾病易感性生物标志物的潜力 | NA | 识别COPD的高风险人群生物标志物并探索疾病发病机制 | 人类肺组织及外周血样本 | 单细胞组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 来自从不吸烟的健康对照、COPD前期患者和COPD患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3965 | 2026-04-20 |
Score Matching for Differential Abundance Testing of Compositional High-Throughput Sequencing Data
2026-Apr, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70534
PMID:41944570
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的a-b幂交互模型，用于处理包含协变量信息的高通量测序数据，并开发了cosmoDA方法以降低相关特征在差异丰度测试中的假阳性率 | 扩展了a-b幂交互模型以纳入协变量信息，结合惩罚广义得分匹配开发了cosmoDA方法，能有效处理相关特征并减少假阳性检测 | NA | 开发一种针对高通量测序数据的差异丰度测试方法，以准确表征异质群体中的协变量依赖关系 | 稀疏组成型数据，特别是单细胞RNA测序和微生物扩增子数据 | 生物信息学 | NA | 高通量测序，单细胞RNA测序，微生物扩增子测序 | a-b幂交互模型，惩罚广义得分匹配 | 组成型高通量测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，微生物扩增子测序 | NA | NA |
| 3966 | 2026-04-20 |
Eosinophilic Biliary Cystic Neoplasm of the Liver: A Case Report of an Unrecognized Subtype of Intrahepatic Biliary Neoplasm
2026-Apr, Pathology international
IF:2.5Q2
DOI:10.1111/pin.70114
PMID:41992682
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病例报告 | 本文报告了一例肝脏嗜酸性胆管囊性肿瘤，这是一种先前未被识别的肝内胆管肿瘤亚型 | 描述了一种新的肝内胆管囊性肿瘤亚型，并通过单细胞空间转录组学等技术揭示了其与胆管系统的关联及KRAS突变特征 | 仅为一例个案报告，样本量小，需要更多病例验证 | 描述并定义一种新的肝脏肿瘤亚型 | 一名54岁日本女性的肝内多囊性肿瘤 | 数字病理学 | 肝脏肿瘤 | 全外显子组测序，RNA测序，单细胞空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 基因组数据，转录组数据，空间转录组数据，组织学图像 | 1例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞空间转录组学，全外显子组测序，RNA测序 | NA | NA |
| 3967 | 2026-04-20 |
Rexinoid NEt-3IB Promotes Resident Macrophage Gene Expression and Mitigates Desiccation-Induced Ocular Surface Disease
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.31
PMID:41979250
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研究论文 | 本研究评估了类视黄醇NEt-3IB对干燥应激诱导的干眼症的影响，以及其对单核细胞/巨噬细胞基因表达和细胞轨迹的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析NEt-3IB对结膜免疫细胞基因表达的影响，并揭示其通过促进驻留巨噬细胞相关基因表达来缓解干眼症的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验；治疗时间较短（5天），长期效果未知 | 评估NEt-3IB对干燥应激诱导的干眼症的治疗效果及其对免疫细胞基因表达的调控机制 | 小鼠眼部组织、结膜免疫细胞（单核细胞/巨噬细胞）、培养的单核细胞 | 单细胞转录组学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光染色、细胞轨迹分析 | scVelo、Monocle 3 | 单细胞转录组数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型和培养细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3968 | 2026-04-20 |
Advances in single-cell and spatial omics for studying symbiotic nitrogen fixation: comparative cellular and evolutionary perspectives
2026-Mar-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04024-y
PMID:41814406
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综述 | 本文综述了单细胞和空间组学技术在研究共生固氮中的应用进展，从细胞和进化角度进行比较分析 | 整合单细胞转录组、表观基因组及空间转录组数据，揭示共生固氮的保守与物种特异性调控网络，为工程化非豆科作物提供新视角 | NA | 探讨单细胞和空间组学技术如何推动共生固氮机制的研究，并比较不同物种间的细胞异质性和调控动态 | 豆科植物和非豆科植物的根瘤组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 表观基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3969 | 2026-04-20 |
Vps35 p. D620N causes Lrrk2 kinase hyperactivity, chronic microglial activation and inflammation
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710482
PMID:41846978
|
研究论文 | 本文研究了Vps35 p.D620N突变如何导致LRRK2激酶活性增强，引发慢性小胶质细胞激活和炎症，从而影响帕金森病的发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Vps35 p.D620N突变在小胶质细胞中引起的转录组变化，并阐明了其如何通过增强LRRK2激酶活性促进慢性炎症和突触重塑 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类帕金森病的复杂病理过程，且样本量有限 | 探究Vps35 p.D620N突变如何通过影响LRRK2激酶活性和小胶质细胞功能，促进帕金森病的神经退行性变 | 携带Vps35 p.D620N突变的敲入小鼠（VKI）的小胶质细胞 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量PCR | NA | RNA测序数据，图像数据，基因表达数据 | 6个月大的VKI小鼠脑部小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3970 | 2026-04-20 |
AKAP7 is a prognostic biomarker involved in immune infiltration of bladder urothelial carcinoma and correlated with ferroptosis
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04786-8
PMID:41806078
|
研究论文 | 本研究探讨了AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达水平、预后意义及其与免疫浸润和铁死亡的相关性 | 首次系统性地将AKAP7与膀胱尿路上皮癌的预后、免疫微环境特征及铁死亡过程联系起来，并验证了其作为生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床研究和实验验证来确认其机制 | 探索AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达模式、预后价值、免疫特征及其与铁死亡的关系 | 膀胱尿路上皮癌组织、细胞系及相关的公共数据库数据 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 基于TCGA、GEO等多个公共数据库的样本，并包含临床样本和细胞系验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3971 | 2026-04-18 |
Integrated multi-target pharmacology of ginseng in acute myeloid leukemia through single-cell sequencing, molecular docking, network pharmacology, and in vitro experiments
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04747-1
PMID:41806205
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3972 | 2026-04-20 |
Integrated multi-omics analysis identifies and validates endoplasmic reticulum stress and mitophagy-related biomarkers in MASLD
2026-Mar-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43311-3
PMID:41796234
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别并验证了内质网应激和线粒体自噬相关生物标志物在MASLD中的作用 | 首次整合GEO数据挖掘、机器学习、scRNA-seq分析和虚拟筛选，系统性地揭示了NR4A1作为内质网应激和线粒体自噬介导MASLD进展的关键靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，缺乏深入的体内功能机制研究和临床样本验证 | 阐明内质网应激和线粒体自噬在MASLD进展中的潜在机制，并识别针对这些通路的候选治疗药物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | GEO数据挖掘、scRNA-seq、分子对接、虚拟筛选 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及FFA处理的肝细胞、MASLD小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3973 | 2026-03-09 |
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43023-8
PMID:41794881
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3974 | 2026-04-20 |
ENS lineage potential is not intrinsically regionalized but is modulated by PTPRZ1 signaling
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709942
PMID:41846962
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能扰动，揭示了肠道神经系统（ENS）在发育过程中缺乏内在的区域化，而是通过微环境信号如PTPRZ1信号进行精细调控 | 发现ENS发育不依赖内在的前后轴区域化，而是由局部微环境信号（如PTN/MDK-PTPRZ1信号）调控，挑战了传统区域化模型 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎发育阶段（E13.5至E18.5），人类ENS发育的验证仅基于干细胞培养模型，可能未完全反映体内复杂性 | 探究肠道神经系统（ENS）在发育过程中是否经历区域化转录多样化，以及微环境信号如何调控其成熟 | 小鼠胚胎肠道组织（包括ENS、上皮和间充质）以及人多能干细胞衍生的ENS培养物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3975 | 2026-04-20 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag160
PMID:41996577
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGPD的深度学习框架，用于利用单细胞RNA-seq数据为靶向空间转录组学设计紧凑、非冗余的基因组合 | 引入了基于深度学习的框架scGPD，通过基因-基因相关性感知的门控机制从数据中提取信息特征，鼓励所选基因的多样性并消除冗余，克服了现有方法忽视基因间相关性的局限 | 未在摘要中明确提及 | 为靶向空间转录组学技术设计信息丰富的基因组合，以捕获组织内细胞和空间异质性的复杂性 | 基因组合设计 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3976 | 2026-04-20 |
Airway injury induces alveolar epithelial responses mediated by macrophages
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116881
PMID:41579370
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨了气道损伤如何通过巨噬细胞介导远端肺泡上皮细胞的响应 | 揭示了气道特异性损伤可诱导远端肺泡II型细胞的短暂增殖，并明确了肺泡巨噬细胞在这一过程中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且未详细探讨长期影响 | 探究气道损伤对远端肺泡和免疫反应的调控机制 | 小鼠模型中的气道特异性上皮损伤 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3977 | 2026-04-20 |
upsML: A high-accuracy machine learning classifier for predicting Plasmodium falciparum var gene upstream groups
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344557
PMID:41990100
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研究论文 | 本文开发了一个名为upsML的高精度机器学习分类器，用于预测恶性疟原虫var基因的上游分组 | upsML基于2,530个经过筛选的var基因训练，能基于不同部分基因区域的序列特征准确分配上游分组，在DBLα标签序列上达到83%的准确率，在全长PfEMP1序列上达到92%的准确率，显著优于现有工具 | NA | 开发一个高精度的机器学习分类器，以改进恶性疟原虫var基因上游分组的预测，从而更好地理解寄生虫生物学和临床结果 | 恶性疟原虫的var基因家族，特别是其上游分组（upsA、upsB、upsC、upsE） | 机器学习 | 疟疾 | RNA-seq | 支持向量机、随机森林、XGBoost、HMMER | 序列数据 | 2,530个经过筛选的var基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3978 | 2026-04-20 |
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09420-x
PMID:41449269
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了肺毛细血管内皮细胞的五个新亚群及其在生理和病理中的功能意义 | 首次识别出五个具有不同分子特征和功能的肺毛细血管内皮细胞新亚群，包括表达Scn7a和Clic4离子转运蛋白的亚群、有丝分裂活跃的'根'细胞以及表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮细胞 | 研究主要基于单细胞转录组学数据，可能未完全捕捉细胞的空间分布和动态相互作用，且缺氧模型可能无法完全模拟所有肺疾病的病理条件 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能作用 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3979 | 2026-04-20 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中年龄相关的免疫动态变化 | 首次结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，纵向追踪96名成年人两年的季节性流感疫苗接种，揭示了T细胞亚群中非线性的转录重编程和功能偏向 | 研究样本主要来自健康成年人，可能未涵盖特定疾病群体或更广泛的人口多样性 | 探究年龄如何影响免疫系统的动态变化和功能 | 超过300名25至90岁的健康成年人，重点关注外周血单核细胞和免疫细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，其中96名进行纵向追踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3980 | 2026-04-20 |
RUNX1T1-HDAC Reprogramming of the HOX Code Signaling Drives a Targetable Pan-Cancer Lineage Plasticity
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681000
PMID:41280130
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研究论文 | 本研究通过分析多组学数据，发现RUNX1T1-HDAC复合物通过重编程HOX代码信号驱动泛癌谱系可塑性，并揭示了其作为可药物靶点的潜力 | 首次将RUNX1T1鉴定为泛癌谱系可塑性的新型生物标志物，揭示了RUNX1T1-HDAC复合物调控HOX代码的机制，并证明HDAC抑制可选择性靶向可塑性细胞 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，需要更多体内实验和临床试验进一步证实其治疗潜力 | 探索癌症谱系可塑性的分子机制并寻找可靶向的生物标志物 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病（AML）的癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌, 肺癌, 急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析, AI建模 | AI-based modeling | 转录组数据 | 超过80,000个RNA-seq样本，涵盖114种癌症类型，包括大量临床前和临床队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |