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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3941 | 2025-02-28 |
Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111160
PMID:35921835
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研究论文 | 本文开发了针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的脂质纳米颗粒(LNP)-mRNA疫苗候选物,并测试了多路复用LNP-mRNA在动物模型中诱导有效免疫反应的能力 | 开发了针对多种冠状病毒的LNP-mRNA疫苗,并通过单细胞RNA测序揭示了疫苗接种后动物的全局系统性免疫库和转录组特征 | 研究仅限于动物模型,尚未进行人体试验 | 开发针对多种冠状病毒的多物种疫苗,并优化疫苗接种计划以提供广泛而强效的抗体免疫 | SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV | 疫苗开发 | 冠状病毒感染 | LNP-mRNA疫苗技术、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 动物模型 |
3942 | 2025-02-28 |
Variant-specific vaccination induces systems immune responses and potent in vivo protection against SARS-CoV-2
2022-05-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100634
PMID:35561673
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研究论文 | 本文研究了针对不同SARS-CoV-2变种的LNP-mRNA疫苗的免疫反应及其在动物模型中的保护效果 | 系统地研究了针对野生型、B.1.351和B.1.617变种的LNP-mRNA疫苗的免疫反应,并揭示了单细胞转录组学在免疫细胞群体和全局基因表达中的应用 | 研究仅限于动物模型,尚未在人体中进行验证 | 评估针对不同SARS-CoV-2变种的LNP-mRNA疫苗的免疫反应和保护效果 | 动物模型 | 免疫学 | COVID-19 | LNP-mRNA疫苗、单细胞转录组学、BCR-seq、TCR-seq | NA | 基因表达数据、免疫反应数据 | 动物模型 |
3943 | 2025-02-28 |
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104155
PMID:32619811
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研究论文 | 本文研究了IL-7受体α链(IL-7Rα或CD127)在人类效应记忆CD8+ T细胞中的异质性及其在高维分析中的特征 | 通过高维飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,揭示了IL-7Rα在效应记忆CD8 T细胞中的多样化但有序的表达模式,定义了细胞亚群的异质性 | NA | 探讨IL-7Rα是否可以作为定义人类效应记忆CD8 T细胞异质性的关键分子 | 人类效应记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | CyTOF, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 | NA |
3944 | 2025-02-28 |
New insight into GABAergic neurons in the hypothalamic feeding regulation
2018-Nov, The journal of physiological sciences : JPS
DOI:10.1007/s12576-018-0622-8
PMID:30003408
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综述 | 本文综述了下丘脑中GABA能神经元在摄食调节中的作用及其研究进展 | 介绍了三种先进技术(光遗传学、化学遗传学、体内钙成像和单细胞RNA测序)在研究GABA能神经元亚群及其在摄食调节中的作用中的应用 | NA | 探讨下丘脑中GABA能神经元在摄食调节中的作用 | 下丘脑中的GABA能神经元 | 神经科学 | NA | 光遗传学、化学遗传学、体内钙成像、单细胞RNA测序 | NA | 神经活动数据、转录组数据 | NA |
3945 | 2025-02-27 |
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102465
PMID:39995977
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研究论文 | 本文通过整合多组学数据,探讨了m6A修饰在T细胞耗竭(TEX)动态调控中的作用及其在癌症中的临床相关性 | 首次在泛癌水平上揭示了m6A修饰对TEX动态的调控作用,并基于m6A-TEX相互作用识别了三种泛癌亚型,每种亚型具有独特的分子特征、免疫表型和生存结果 | 研究主要基于多组学数据的整合分析,缺乏实验验证,且样本来源多样,可能存在异质性 | 探讨m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其在癌症中的临床相关性 | T细胞耗竭(TEX)及其与m6A修饰的相互作用 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据、单细胞RNA测序数据、泛癌数据集、免疫治疗数据集 | 多种细胞系、单细胞RNA测序数据、泛癌数据集和免疫治疗数据集 |
3946 | 2025-02-27 |
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101267
PMID:39996122
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析,识别了与原发性硬化性胆管炎(PSC)相关的胆道纤维化发展的基因特征 | 揭示了PSC特有的基因特征,这些特征与胆道纤维化的发展相关,可能有助于识别新的生物标志物和治疗靶点 | 样本量相对较小,且需要进一步的外部验证和机制研究 | 识别与PSC相关的胆道纤维化发展的基因特征 | 原发性硬化性胆管炎(PSC)、原发性胆汁性胆管炎(PBC)和代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝活检样本 | 数字病理学 | 肝病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 47例肝活检样本(PSC 16例,PBC 15例,MASLD 16例),外部验证集73例PSC肝活检样本 |
3947 | 2025-02-27 |
CTHRC1 expresses in cancer-associated fibroblasts and is associated with resistance to anti-androgen therapy in prostate cancer
2025-Feb-26, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01624-z
PMID:40009323
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研究论文 | 本研究探讨了CTHRC1在前列腺癌中的表达及其在抗雄激素治疗耐药性中的作用 | 首次揭示了CTHRC1在前列腺癌相关成纤维细胞中的表达,并发现其与抗雄激素治疗耐药性相关 | 研究数据主要来源于公开数据库,缺乏实验验证 | 探索CTHRC1在前列腺癌中的表达及其在预后和治疗中的潜在作用 | 前列腺癌患者及正常对照 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学染色 | CIBERSORT算法 | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 1999例前列腺癌患者和531例正常对照,以及来自7个前列腺原发肿瘤的62,995个细胞 |
3948 | 2025-02-27 |
Toll-Like Receptor 7 Promotes Periodontal Inflammation and Alveolar Bone Resorption Through the NF-κB Signaling Pathway
2025-Feb-25, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13394
PMID:40007244
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研究论文 | 本文研究了Toll样受体7(TLR7)在牙周炎中的作用及其潜在机制 | 揭示了TLR7在牙周炎中的新角色,并强调了TLR7-NF-κB轴在疾病发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步在人体中进行验证 | 探讨TLR7在牙周炎中的作用及其机制 | 牙周炎患者和健康个体的牙龈组织,小鼠模型和骨髓来源的巨噬细胞 | 生物医学 | 牙周炎 | 单细胞测序,TLR7抑制剂M5049,NF-κB抑制剂PDTC | 小鼠牙周炎模型 | 基因表达数据,炎症反应数据 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织样本,小鼠模型 |
3949 | 2025-02-27 |
Targeted delivery of CCL3 reprograms macrophage antigen presentation and enhances the efficacy of immune checkpoint blockade therapy in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010947
PMID:39988347
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研究论文 | 本研究探讨了CCL3在调节肝细胞癌(HCC)肿瘤免疫微环境(TIME)中的作用,并展示了其通过增强抗原呈递和免疫细胞招募来提高免疫检查点阻断疗法效果的潜力 | 首次揭示了CCL3在HCC中的免疫调节作用,特别是其在增强巨噬细胞抗原呈递和T细胞激活方面的机制,并展示了其与免疫检查点阻断疗法结合的潜力 | 研究主要基于临床前模型和体外实验,尚未进行大规模临床试验验证 | 研究CCL3在HCC肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗效果的增强作用 | 肝细胞癌(HCC)的肿瘤免疫微环境(TIME) | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多重免疫荧光、共培养系统、共聚焦成像、代谢物检测 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、代谢数据 | 人类HCC样本(来自The Cancer Genome Atlas数据库)及临床前HCC模型 |
3950 | 2025-02-27 |
SREBF1-based metabolic reprogramming in prostate cancer promotes tumor ferroptosis resistance
2025-Feb-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02354-7
PMID:39988626
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及其治疗潜力 | 通过单细胞测序和转录因子调控网络分析,首次揭示了SREBF1在前列腺癌代谢重编程和铁死亡抵抗中的关键作用,并验证了SREBF1抑制剂的治疗效果 | 研究主要基于实验室数据,尚未进行大规模临床试验验证 | 探讨前列腺癌中代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及其治疗潜力 | 正常前列腺组织和不同类型前列腺癌组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, hdWGCNA, bulk RNA分析 | NA | RNA测序数据 | 正常前列腺组织和不同类型前列腺癌组织样本 |
3951 | 2025-02-27 |
Chronic alcohol consumption enhances the differentiation capacity of hematopoietic stem and progenitor cells into osteoclast precursors
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636743
PMID:39975302
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研究论文 | 本文研究了长期饮酒(CAC)如何增强造血干细胞和祖细胞(HSPCs)向破骨细胞前体的分化能力 | 首次揭示了CAC通过改变HSPCs的功能、转录组和表观基因组,增强其向破骨细胞前体分化的能力 | 研究主要基于恒河猴模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨长期饮酒对造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化能力的影响 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及其分化的破骨细胞前体 | 生物医学 | 骨质疏松 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据、基因表达数据 | 恒河猴模型 |
3952 | 2025-02-27 |
paraCell: a novel software tool for the interactive analysis and visualization of standard and dual host-parasite single-cell RNA-seq data
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf091
PMID:39988320
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研究论文 | 本文介绍了一种名为paraCell的新型软件工具,用于交互式分析和可视化标准及双宿主-寄生虫单细胞RNA测序数据 | paraCell软件工具的创新之处在于其允许用户无需编程技能即可可视化和分析预加载的单细胞数据,且源代码免费提供以支持远程安装 | 尽管paraCell降低了分析单细胞数据的门槛,但其功能和性能可能受限于预加载数据的质量和多样性 | 开发一个易于使用的软件工具,以促进寄生虫学领域对单细胞转录组数据的广泛利用 | 单细胞RNA测序数据,特别是涉及寄生虫及其宿主相互作用的数据 | 生物信息学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括已发表的Plasmodium和Trypanosoma数据集,以及新生成的Toxoplasma-mouse和Theileria-cow scRNA-seq数据集 |
3953 | 2025-02-27 |
Sources of non-uniform coverage in short-read RNA-Seq data
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.634337
PMID:39975309
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研究论文 | 本文探讨了短读RNA-Seq数据中非均匀覆盖的来源,并进行了针对性实验以研究片段长度、PCR升温速率和核糖体耗竭的影响 | 本文通过实验和数据分析,挑战了先前关于RNA-Seq非均匀性来源的假设,提供了新的见解 | 研究结果与先前出版物或建议相矛盾,可能需要进一步验证 | 研究RNA-Seq数据中非均匀覆盖的来源,以改进实验协议和分析方法 | RNA-Seq数据中的非均匀覆盖现象 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 使用了不同样本质量、PCR循环数、逆转录酶和技术或生物学重复的现有数据集 |
3954 | 2025-02-27 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals specific transcription patterns, immune responses and early morphological alteration signaling
2025-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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研究论文 | 本研究通过人源化小鼠模型,利用空间转录组学分析,揭示了HIV和结核共感染早期的转录模式、免疫反应和形态学改变信号 | 首次在HIV和结核共感染的人源化小鼠模型中,使用空间转录组学技术揭示早期免疫细胞浸润和转录模式的变化 | 研究仅基于小鼠模型,结果可能无法完全反映人类感染情况 | 理解HIV和结核共感染早期免疫细胞浸润和转录模式的变化 | 人源化小鼠模型 | 数字病理学 | 结核病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人源化小鼠感染后三周的肺样本 |
3955 | 2025-02-27 |
Resolving Resident Colonic Muscularis Macrophage Diversity and Plasticity During Colitis
2025-01-06, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae155
PMID:39102823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,调查了正常结肠和右旋糖酐硫酸钠诱导的结肠炎中肠肌层固有层的免疫细胞群体,揭示了结肠炎期间结肠肌层巨噬细胞的多样性和可塑性 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了结肠炎期间结肠肌层巨噬细胞的多样性和可塑性,并验证了其在不同条件下的表型变化 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本的验证相对有限 | 研究结肠炎期间结肠肌层固有层免疫细胞的多样性和可塑性 | 结肠肌层固有层的免疫细胞,特别是巨噬细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、流式细胞术、细胞谱系追踪 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学图像、流式细胞术数据 | 动物模型(小鼠)和人类溃疡性结肠炎患者的样本 |
3956 | 2025-02-27 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of pulmonary fibrosis through single-cell sequencing and machine learning
2025-Jan-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06031-8
PMID:39748378
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和机器学习技术,揭示了肺纤维化的复杂细胞和分子机制,旨在提高诊断准确性并发现潜在的治疗靶点 | 通过单细胞测序和机器学习分析,发现了与肺纤维化相关的新的基因特征和免疫细胞特征,并开发了具有更高精度的诊断模型 | 研究主要基于肺纤维化患者的肺组织样本,样本来源和数量可能限制了结果的普适性 | 揭示肺纤维化的细胞和分子机制,提高诊断准确性并发现潜在的治疗靶点 | 肺纤维化患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 肺纤维化患者的肺组织样本 |
3957 | 2025-02-27 |
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-Dec-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgae369
PMID:38820087
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研究论文 | 本文通过单细胞分析皮下脂肪,揭示了与HIV感染者内脏脂肪量相关的纤维化细胞 | 首次在HIV感染者中,通过单细胞RNA测序技术,揭示了皮下脂肪中特定细胞类型和转录程序与内脏脂肪量的关系 | 需要进一步的纵向研究来确定因果关系和机制 | 研究HIV感染者中皮下脂肪的细胞类型组成和转录程序与内脏脂肪量的关系 | HIV感染者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 92名参与者进行了皮下脂肪活检用于批量RNA测序,43名参与者进行了单细胞RNA测序 |
3958 | 2025-02-27 |
An organotypic atlas of human vascular cells
2024-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03376-x
PMID:39566559
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研究论文 | 本研究整合了19个人体器官和组织的单细胞转录组数据,定义了约67,000个细胞中的42种血管细胞状态,揭示了血管细胞在分子水平上的多样性和器官特异性特征 | 首次系统地定义了人类血管细胞的器官特异性分子特征,并揭示了血管细胞间的分子交流途径 | 研究主要基于单细胞转录组数据,可能未完全捕捉到蛋白质水平和细胞功能的变化 | 揭示人类血管细胞在不同器官和组织中的分子特征和功能差异 | 人类血管细胞,包括内皮细胞和壁细胞 | 生物信息学 | 血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约67,000个细胞,来自62名捐赠者 |
3959 | 2025-02-27 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 本文通过整合多个小鼠单细胞或单核RNA测序数据集,旨在识别新的细胞类型、共享的标记基因,并达成对肠神经元亚型转录组定义的共识 | 通过数据整合生成肠神经元类型的共识视图,提高了稀有神经元类别的分辨率,为疾病状态下肠神经元的变化提供了新的理解 | 未来的研究需要将这些深度转录组数据与历史分类系统连接起来 | 识别新的细胞类型、共享的标记基因,并达成对肠神经元亚型转录组定义的共识 | 小鼠的肠神经系统 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠单细胞或单核RNA测序数据集 |
3960 | 2025-02-27 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了Lewis肺癌细胞系在小鼠原位移植模型中的早期肿瘤微环境变化 | 利用单细胞RNA测序技术,首次在Lewis肺癌细胞系中观察到Kras G12C突变细胞的分子动态变化,并揭示了肿瘤微环境中的早期基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类肺癌的复杂性 | 研究肺癌早期阶段的细胞和分子动态变化 | Lewis肺癌细胞系(LLC)及其在小鼠模型中的原位移植 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠原位移植模型 | RNA测序数据 | NA |