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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3941 - 3960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2025-10-06 |
MuSiC2: cell-type deconvolution for multi-condition bulk RNA-seq data
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac430
PMID:36208175
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研究论文 | 提出MuSiC2方法用于多条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积分析 | 扩展MuSiC方法，通过迭代估计程序解决批量RNA-seq数据与单细胞参考数据临床条件不匹配时的细胞类型比例估计偏差问题 | 需要至少一个与单细胞参考数据不同的临床条件，且依赖参考数据的质量 | 开发适用于多临床条件下批量RNA-seq数据的细胞类型反卷积方法 | 人类胰岛和视网膜组织的批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | 迭代估计算法 | 基因表达数据 | 两个批量RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3942 | 2025-10-06 |
Tempo: an unsupervised Bayesian algorithm for circadian phase inference in single-cell transcriptomics
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34185-w
PMID:36323668
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研究论文 | 提出一种名为Tempo的无监督贝叶斯算法，用于从单细胞转录组数据中推断昼夜节律相位 | 首次将领域知识融入贝叶斯变分推断框架，能够量化相位估计的不确定性 | 未明确说明算法在特定细胞类型或条件下的适用性限制 | 开发更准确的计算方法从单细胞RNA测序数据推断昼夜节律相位 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯变分推断 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3943 | 2025-10-06 |
A multi-use deep learning method for CITE-seq and single-cell RNA-seq data integration with cell surface protein prediction and imputation
2022-Nov, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-022-00545-w
PMID:36873621
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研究论文 | 提出一种名为sciPENN的多功能深度学习方法，用于整合CITE-seq和单细胞RNA-seq数据，并实现细胞表面蛋白预测和填补 | 开发支持多种功能的一体化深度学习框架，包括数据整合、蛋白表达预测与填补、不确定性量化及细胞类型标签转移 | NA | 解决CITE-seq和单细胞RNA-seq数据整合中的计算挑战，提高数据利用效率 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | 免疫相关疾病，流感，COVID-19 | CITE-seq，单细胞RNA-seq | 深度学习 | 单细胞RNA和蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3944 | 2025-10-06 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究TCDD暴露对斑马鱼精子发生的破坏机制 | 首次在环境相关浓度TCDD暴露下，利用单细胞RNA-seq技术解析斑马鱼睾丸中各细胞类型对病理学的不同贡献 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向人类推广需谨慎 | 探究TCDD暴露导致男性不育的环境暴露解释 | 斑马鱼睾丸组织中的各类生殖细胞 | 单细胞生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期暴露TCDD的成年斑马鱼睾丸组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 3945 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of lung endothelial cells identifies dynamic inflammatory and regenerative subpopulations
2022-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.158079
PMID:35511435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序识别肺内皮细胞在炎症损伤过程中的动态炎症和再生亚群 | 首次在肺微血管内皮中发现具有明确功能分工的免疫反应亚群(immuneEC)和血管发育亚群(devEC)，并证实Sox17过表达可抑制内皮细胞炎症激活 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型，在其他类型肺损伤中的普适性需进一步验证 | 探究肺内皮细胞亚群在炎症损伤过程中的动态变化和功能分工 | 肺血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 35,973个肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3946 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3947 | 2025-10-06 |
PLCG2 is associated with the inflammatory response and is induced by amyloid plaques in Alzheimer's disease
2022-02-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01022-0
PMID:35180881
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研究论文 | 本研究探讨了PLCG2在阿尔茨海默病炎症反应中的作用及其与淀粉样斑块的关联 | 首次在人类AD患者和5xFAD小鼠模型中系统验证PLCG2表达与淀粉样斑块密度的正相关性，并通过单细胞RNA测序揭示其与炎症反应信号通路的关联 | 研究主要基于相关性分析，PLCG2在AD中的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 阐明PLCG2在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 晚发性阿尔茨海默病患者、5xFAD小鼠模型、野生型和Plcg2失活小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | 差异表达分析, 共表达网络分析 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 1249例人类脑组织样本，小鼠模型若干 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3948 | 2025-10-06 |
Deep learning tackles single-cell analysis-a survey of deep learning for scRNA-seq analysis
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab531
PMID:34929734
|
综述 | 本文系统综述了深度学习在单细胞RNA测序数据分析中的应用 | 建立了变分自编码器、自编码器、生成对抗网络和监督深度学习模型的统一数学表示框架，并关联模型损失函数与数据处理步骤的具体目标 | 仅涵盖25种深度学习算法，未涉及所有现有方法 | 为单细胞RNA测序数据分析提供深度学习算法的系统综述和选择指南 | 单细胞RNA测序数据处理流程中的深度学习算法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 自编码器, 生成对抗网络, 监督深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3949 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals lasting changes in the lung cellular landscape into adulthood after neonatal hyperoxic exposure
2021-12, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2021.102091
PMID:34417156
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新生期高氧暴露对成年后肺细胞景观的持久性改变 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统揭示新生期高氧暴露导致成年期肺细胞组成持续改变，特别是五类II型细胞状态的独特特征和功能变化 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限；仅观察了两个时间点（pnd7和pnd60） | 探究早期高氧暴露对后期生命阶段肺细胞景观的长期影响及其与肺损伤的关系 | 新生小鼠肺组织细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过10,000个细胞，45个细胞簇，32种细胞状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3950 | 2025-10-06 |
Kdm6a deficiency restricted to mouse hematopoietic cells causes an age- and sex-dependent myelodysplastic syndrome-like phenotype
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255706
PMID:34780480
|
研究论文 | 本研究揭示了Kdm6a基因缺陷在小鼠造血细胞中导致年龄和性别依赖的骨髓增生异常综合征样表型 | 首次证明Kdm6a缺陷在造血细胞中会导致年龄和性别依赖的MDS样表型，并利用单细胞RNA-seq技术揭示了其对造血细胞命运决定基因的调控机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中验证；Kdm6a缺陷小鼠未发展为明显白血病 | 探究Kdm6a基因在正常造血过程中的功能及其在白血病发病机制中的作用 | 雌性Kdm6a条件性敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 白血病 | ChIP-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据，表观基因组学数据，单细胞转录组数据 | Kdm6a-WT和Kdm6a-KO小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 3951 | 2025-10-06 |
The cellular basis of distinct thirst modalities
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2821-8
PMID:33057193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了哺乳动物大脑中不同口渴模式的细胞基础 | 首次使用刺激-细胞类型映射方法识别了介导不同类型口渴的特异性神经元组合 | NA | 探索大脑中不同口渴模式的编码机制 | 哺乳动物大脑终板室周器官的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3952 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus RNA-Sequencing Profiling of Mouse Lung. Reduced Dissociation Bias and Improved Rare Cell-Type Detection Compared with Single-Cell RNA Sequencing
2020-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0095MA
PMID:32804550
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研究论文 | 本研究开发了适用于小鼠肺组织的单核RNA测序方案，并与单细胞RNA测序进行比较分析 | 首次建立了肺组织单核RNA测序方案，解决了传统单细胞测序中的解离偏差问题，提高了稀有细胞类型的检测能力 | 研究仅针对小鼠肺组织，尚未验证在其他物种或组织类型中的适用性 | 比较单核RNA测序与单细胞RNA测序在肺组织研究中的性能差异 | 小鼠肺组织细胞和细胞核 | 单细胞组学 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组测序数据 | 16,110个单核转录组和11,934个单细胞转录组 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 3953 | 2025-10-06 |
Tau Pathology Drives Dementia Risk-Associated Gene Networks toward Chronic Inflammatory States and Immunosuppression
2020-11-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108398
PMID:33207193
|
研究论文 | 通过系统功能基因组学分析揭示了tau病理驱动痴呆风险基因网络向慢性炎症状态和免疫抑制发展的机制 | 发现了小胶质细胞免疫通路的复杂时间轨迹，识别了从小鼠到人类保守的基因共表达模块NAct和NSupp | 研究主要基于死后脑组织样本，可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 理解神经免疫相关基因和通路在神经退行性疾病病理生理学中的作用 | 纯化的小胶质细胞和来自小鼠及人类AD、FTD、PSP疾病的脑组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 功能基因组学分析、化学遗传学、单细胞测序 | 基因共表达网络分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3954 | 2025-10-06 |
Secretory IgA dysfunction underlies poor prognosis in Fusobacterium-infected colorectal cancer
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2528428
PMID:40667611
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了具核梭杆菌通过破坏IgA浆细胞发育和分泌型IgA产生导致结直肠癌预后不良的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过破坏肿瘤相关巨噬细胞与IgA浆细胞间的通讯，损害黏膜免疫并增加细菌浸润 | 样本量相对有限（42例患者），且动物模型结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探究具核梭杆菌感染导致结直肠癌预后不良的免疫机制 | 结直肠癌患者组织样本和无菌小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42例结直肠癌患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3955 | 2025-10-06 |
RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250573
PMID:40298935
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研究论文 | 本研究揭示了RORγt eTACs在口服耐受和调节性T细胞诱导中的关键作用 | 首次发现RORγt eTACs是口服耐受的关键介导者，并确定其必需的分子特征包括MHCII和整合素β8表达 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的相关性需要进一步验证 | 阐明口服耐受的细胞机制和关键参与者 | RORγt谱系抗原呈递细胞，特别是RORγt eTACs | 免疫学 | 免疫耐受相关疾病 | 谱系追踪，单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3956 | 2025-10-06 |
Thymic Microenvironment Remodeling in Cancer Cachexia as a Determinant of Checkpoint Inhibitor Efficacy and Toxicity
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13874
PMID:40665793
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研究论文 | 本研究探讨癌症恶病质通过破坏胸腺微环境影响T细胞阴性选择，进而调节免疫检查点抑制剂疗效与毒性的机制 | 首次揭示癌症恶病质通过胸腺髓质成纤维细胞成熟障碍导致T细胞阴性选择受损，并发现血清自身抗体水平与ICI疗效的临床关联 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本量有限，需要更大规模验证 | 探究癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与免疫检查点抑制剂治疗的关联 | 肝癌恶病质小鼠模型和接受抗PD-1/L1抗体治疗的晚期癌症患者 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 单细胞TCR测序, 共培养实验 | 原位肝癌小鼠模型 | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 临床随访数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 3957 | 2025-10-06 |
ECM1 expression in chronic liver disease: Regulation by EGF/STAT1 and IFNγ/NRF2 signalling
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101423
PMID:40671832
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研究论文 | 本研究揭示了ECM1在慢性肝病中的调控机制，发现EGF/STAT1信号维持ECM1表达而IFNγ/NRF2信号抑制其表达 | 首次阐明EGF/EGFR/STAT1信号通路通过STAT1 S727磷酸化维持ECM1表达，以及IFNγ通过诱导STAT1 Y701磷酸化和NRF2核转位抑制ECM1的双重调控机制 | 样本量相对有限（小鼠模型2-6只，患者22例），需要更大规模研究验证 | 探究肝细胞中ECM1在病理生理条件下的调控机制 | AML12细胞、小鼠和人类原代肝细胞、小鼠和患者肝组织 | 分子生物学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 启动子分析, 功能测定 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 小鼠模型2-6只，Western饮食喂养小鼠8-10只，慢性肝病患者22例 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3958 | 2025-10-06 |
Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv6642
PMID:40668916
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研究论文 | 通过异时共生模型和单细胞RNA测序技术，揭示了AdipoR1在视网膜年轻化中的关键作用 | 首次将异时共生与单细胞RNA测序结合，系统鉴定AdipoR1-AMPK通路为视网膜年轻化的核心分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 识别视网膜衰老的分子驱动因素和抗衰老靶点 | 小鼠视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性视网膜病变 | 单细胞RNA测序，异时共生模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻、年老及异时共生配对小鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3959 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in human atherosclerotic plaques reveals a novel smooth muscle cell subtype that possesses multi differentiation potential and shapes the microenvironment
2025-Jul-16, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01735-7
PMID:40668312
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序在人动脉粥样硬化斑块中发现具有多向分化潜能的新型平滑肌细胞亚型 | 首次在人冠状动脉斑块中鉴定出独特的平滑肌细胞簇SMC_C5，该细胞亚型具有多向分化潜能并能塑造微环境 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证主要在ApoE小鼠模型中进行 | 研究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞亚型的异质性及其功能 | 人冠状动脉粥样硬化斑块和ApoE小鼠主动脉斑块中的平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | pySCENIC | 单细胞转录组数据 | 三个单细胞RNA测序数据集整合分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3960 | 2025-10-06 |
Rod-shaped microglia represent a morphologically distinct subpopulation of disease-associated microglia
2025-Jul-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03504-5
PMID:40671004
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研究论文 | 本研究在小鼠模型中鉴定了一种形态独特的杆状小胶质细胞亚群，并探讨其形成机制 | 首次发现杆状小胶质细胞是神经退行性疾病早期出现的独特活化亚群，其形成不依赖C1q介导的突触修剪机制 | 研究仅基于GCLC缺陷小鼠模型，尚未在其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞形态变化与基因表达谱的关联机制 | 谷胱甘肽缺陷诱导氧化应激的GCLC缺陷小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序, 通路富集分析, 分子分析 | NA | 基因表达数据, 形态学数据 | GCLC缺陷小鼠皮质组织 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |