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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 3941 - 3960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2026-01-23 |
Unstressed cells are alike, but stressed cells differ: Environmental and single-cell heterogeneity in yeast stress responses
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.12.642837
PMID:41542409
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，分析了酵母细胞在多种压力条件下的转录组异质性，揭示了压力响应中平均信号与单细胞水平差异之间的关键区别 | 首次在单细胞水平上系统比较了酵母压力响应中激活与抑制程序的预测能力，发现压力抑制程序（以核糖体相关基因为主）具有跨数据集的稳定预测性，而压力激活程序则高度条件特异性；同时揭示了压力细胞中经典压力程序与转座元件转录之间的互斥性细胞亚群行为 | 研究仅针对酵母模型系统，结果在更复杂生物体中的普适性有待验证；单细胞测序技术本身存在技术噪音和捕获效率限制 | 探究细胞压力响应的异质性本质，比较平均群体水平与单细胞水平在压力响应特征识别上的差异 | 酿酒酵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约13,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3942 | 2026-01-23 |
Advancing adoptive T cell therapy in ovarian cancer: barriers, innovations, and emerging platforms
2026-Jan-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013285
PMID:41513408
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综述 | 本文全面分析了卵巢癌中过继性T细胞疗法的现状、障碍、创新策略及新兴技术平台 | 系统整合了从传统TIL、TCR-T、CAR-T到新兴的双特异性T细胞衔接器分泌型T细胞、双靶向平台及合成抗原受体等多种疗法，并强调了空间转录组学、单细胞分析和机器学习等工具在优化疗法设计中的作用 | NA | 克服卵巢癌中过继性T细胞疗法的免疫障碍，加速开发更有效、持久和个性化的T细胞策略 | 卵巢癌及其他实体瘤 | NA | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞分析，机器学习 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 3943 | 2026-01-23 |
Fishing with Two Lines: A Hybrid Approach to Spatial Transcriptomic Discovery
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698201
PMID:41542551
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研究论文 | 本文开发了一种结合高灵敏度和广覆盖的空间转录组学双重化学方法 | 提出了一种创新的双重化学方法，将10X Genomics Xenium V1定制面板的高灵敏度与Prime 5K面板的广覆盖结合在同一组织切片上 | NA | 解决空间转录组学中基因检测数量与每个基因灵敏度之间的权衡问题 | 人类肺组织微阵列 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium V1, Prime 5K | 10X Genomics Xenium V1定制面板（最多480个基因）与Prime 5K面板（5001个基因） |
| 3944 | 2026-01-23 |
Revealing hidden regulatory dependencies: multi-perspective graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf733
PMID:41554051
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为ATFGRN的自适应拓扑-特征融合图神经网络框架，用于从单细胞转录组数据中准确推断基因调控网络 | 提出了一种多视角融合策略，整合了子图结构编码、表达引导和相似性结构三个互补视角的特征，通过注意力机制进行加权融合，实现了结构、表达和相似性信息的互补集成 | NA | 提高从复杂高维单细胞转录组数据中推断基因调控网络的准确性 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 图神经网络，图卷积网络，注意力机制 | 单细胞转录组数据，基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3945 | 2026-01-23 |
Skin fibroblasts in health and disease: From extracellular matrix remodeling to immune regulation
2026-Jan-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.002
PMID:41493297
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综述 | 本文综述了皮肤成纤维细胞在健康和疾病中的作用，从细胞外基质重塑到免疫调节的演变 | 重新定义成纤维细胞为动态免疫调节细胞，揭示其在炎症、纤维化和肿瘤进展中的关键作用，并利用单细胞和空间转录组学技术发现异质性亚群 | 关于皮肤成纤维细胞的谱系身份、功能可塑性及表型驱动基因调控网络的知识仍存在空白 | 探讨皮肤成纤维细胞在炎症性皮肤病中的异质性、可塑性和功能多样性 | 皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3946 | 2026-01-23 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1473
PMID:41521668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STAN的计算框架，用于从空间转录组学数据中推断空间感知的转录因子活性 | 提出了一个线性混合效应计算方法，整合了TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和组织学特征，以预测空间感知的、点特异性的TF活性 | 未在摘要中明确说明 | 系统性地推断转录因子活性及其在细胞身份中的作用，以增强空间转录组学数据的效用 | 淋巴结、背外侧前额叶皮层、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | mRNA表达数据, 空间坐标数据, 组织学特征数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3947 | 2026-01-23 |
Losartan Alleviates Chemical Burn-Induced Limbal Stem Cell Deficiency: Repurposing a Venerable Anti-Hypertension Drug
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.35
PMID:41537756
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研究论文 | 本研究探讨了抗高血压药物氯沙坦在减轻化学烧伤诱导的角膜缘干细胞缺乏症中的作用 | 首次发现氯沙坦能通过减少单核细胞/巨噬细胞来缓解角膜缘干细胞缺乏症，为该药物的新治疗用途提供了证据 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且长期效果和具体机制需进一步探索 | 评估氯沙坦作为治疗角膜缘干细胞缺乏症新疗法的潜力 | 氮芥诱导的角膜损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞计数数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics平台 | NA |
| 3948 | 2026-01-23 |
Dysregulation of argininosuccinate synthase 1, phosphoenolpyruvate carboxykinase 1, and carbonyl reductase 3: Key arginine-proline metabolic mediators in mesangioproliferative glomerulopathies
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149479
PMID:41352509
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和机器学习算法，鉴定了精氨酸-脯氨酸代谢通路中的关键基因ASS1、PCK1和CBR3，作为IgA肾病和狼疮性肾炎中系膜细胞增殖的核心调控因子，并验证了其诊断和治疗潜力 | 首次通过整合机器学习算法和单细胞RNA测序，系统性识别了精氨酸-脯氨酸代谢通路在系膜增殖性肾小球病中的关键调控基因，并建立了基于这些基因的诊断模型 | 研究主要基于转录组数据，功能验证多在细胞和小鼠模型中进行，缺乏大规模临床样本的直接验证 | 探究精氨酸-脯氨酸代谢通路在IgA肾病和狼疮性肾炎等系膜增殖性肾小球病中的调控机制，并识别关键诊断和治疗靶点 | 系膜细胞、小鼠模型（包括抗Thy1肾炎大鼠、BAFF转基因IgA肾病小鼠、MRL/lpr狼疮性肾炎小鼠）和人类系膜细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法（LASSO和SVM-RFE） | LASSO、SVM-RFE | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多个内部和外部数据集以及小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3949 | 2026-01-23 |
From chronic gastritis to gastric cancer: Mendelian randomisation and multi-omics interrogation of leukaemia inhibitory factor receptor (LIFR), hepatocyte growth factor (HGF), serine protease inhibitor E1 (SERPINE1) and interleukin-10 receptor subunit beta (IL10RB)
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149541
PMID:41380876
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研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化与多组学分析，揭示了从慢性胃炎到胃癌进展过程中的关键炎症因子与分子机制 | 首次整合孟德尔随机化、多组学数据（转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序）以及计算药物筛选，系统性地识别并验证了LIFR、HGF、SERPINE1和IL10RB在胃炎-胃癌转化中的核心作用，并提出了药物再利用策略 | 研究主要基于观察性数据和计算预测，虽然进行了实验验证，但具体的体内功能机制和临床转化效果仍需进一步研究 | 阐明驱动慢性胃炎进展为胃癌的特定炎症因子和分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 慢性胃炎和胃癌相关的基因组、转录组、蛋白质组数据以及患者样本 | 生物信息学与计算生物学 | 胃癌 | 孟德尔随机化、全基因组关联研究、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、定量逆转录PCR、Western印迹、免疫组织化学、基于结构的虚拟筛选、分子对接 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 来自癌症基因组图谱、基因表达综合数据库及独立队列的数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3950 | 2026-01-23 |
Apoferritin-conjugated melanin nanoparticles rescue photoreceptor degeneration via dual iron chelation and ROS scavenging in dry AMD therapy
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149586
PMID:41390041
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研究论文 | 本研究开发了一种仿生纳米颗粒AFn-MNP，通过结合铁螯合和ROS清除能力，有效治疗干性年龄相关性黄斑变性模型中的光感受器退化 | 首次将载铁蛋白与黑色素纳米颗粒结合，构建了具有双重功能（铁螯合和抗氧化）的纳米治疗剂，并利用单细胞转录组分析揭示了光感受器铁死亡在疾病进展中的关键作用 | 研究主要基于NaIO诱导的动物模型，尚未在人类患者中进行验证；长期安全性和疗效有待进一步评估 | 开发一种针对干性年龄相关性黄斑变性的新型纳米疗法，通过同时调节铁稳态和氧化应激来治疗视网膜退行性疾病 | 视网膜组织、光感受器细胞、NaIO诱导的干性年龄相关性黄斑变性模型小鼠 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3951 | 2026-01-23 |
Cancer-cell-secreted DDAH1 induces TGF-β1/Smad3 signaling pathway to promote fibrosis and aging in lung
2026-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-01024-8
PMID:41444413
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研究论文 | 本文揭示了癌细胞分泌的DDAH1蛋白通过诱导瓜氨酸积累，促进肺纤维化和衰老的机制 | 首次发现癌细胞分泌的DDAH1蛋白通过调控瓜氨酸水平激活TGF-β1/Smad3信号通路，促进肺纤维化和衰老 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；DDAH1抑制剂的具体临床应用潜力尚未完全阐明 | 探究癌症背景下肺衰老的分子机制及治疗靶点 | 癌细胞、肺成纤维细胞、遗传敲除小鼠 | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞测序、遗传敲除 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3952 | 2026-01-23 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
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研究论文 | 本研究探讨了外周血单个核细胞中线粒体活性氧产生与冠状动脉疾病之间的关联 | 首次结合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序技术，在BioHEART-CT队列中评估PBMC mROS作为CAD生物标志物的潜力 | 样本量较小（40名参与者），亚组分析结果不一致且缺乏普遍性，横断面设计无法确定因果关系 | 探索PBMC中mROS水平与CAD状态及心血管风险因素之间的关联 | 40名BioHEART-CT研究参与者（有或无CT定义的CAD）的外周血单个核细胞 | 心血管疾病研究 | 冠状动脉疾病 | MitoSOX流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | 40名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3953 | 2026-01-23 |
A multimodal framework to identify molecular mechanisms driving patient group-associated morphology through the integration of spatial transcriptomics and whole slide imaging
2026, NPJ artificial intelligence
DOI:10.1038/s44387-025-00050-6
PMID:41551846
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研究论文 | 提出一种整合空间转录组学和全切片成像的多模态AI框架，以识别与患者群体相关形态背后的分子机制 | 首次结合基础模型特征、多示例学习、无监督聚类和分子分析，在形态-分子机制-临床结局的完整轴向上提供可解释性见解 | 空间转录组数据可用性有限，方法在HER2+乳腺癌外的泛化能力未验证 | 识别驱动患者群体相关形态的分子机制，为精准医疗提供依据 | HER2阳性乳腺癌组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，全切片成像 | 基础模型，多示例学习 | 图像，转录组数据 | 未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3954 | 2026-01-23 |
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70181
PMID:41566770
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化、免疫逃逸特征及治疗脆弱性 | 识别了“Scissor细胞”（主要为肝细胞）作为潜在的恶性前体细胞，揭示了其获得免疫逃逸能力和不良预后的演化过程，并发现了驱动肝细胞恶性转化的关键信号通路（如MDK-SDC4和COL4A-SDC） | NA | 研究肝细胞癌的发生和进展过程中的多细胞生态系统及分子特征 | 肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3955 | 2026-01-23 |
Transcriptome-wide Mendelian randomization and single-cell analysis during CD4+ T cell activation deciphers immunotherapeutic targets for colorectal cancer
2025-Dec-29, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01236-6
PMID:41461936
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研究论文 | 本研究通过转录组范围孟德尔随机化与单细胞分析，揭示了CD4+ T细胞活化在结直肠癌进展中的关键作用，并识别出潜在的免疫治疗靶点 | 首次结合转录组范围孟德尔随机化、单细胞RNA测序与多组学验证，系统解析CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系，识别出PARP14和ORMDL3等关键免疫治疗靶点 | 研究主要基于遗传学与转录组数据，需进一步实验验证靶点的功能机制与临床转化潜力 | 识别结直肠癌免疫治疗的潜在靶点 | CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 孟德尔随机化模型, 单细胞转录组分析 | 遗传学数据, 转录组数据, 单细胞表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3956 | 2026-01-23 |
The Distinct Monocyte Subsets and Intercellular Communication in Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec-27, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01974-z
PMID:41454184
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了原发性干燥综合征患者中单核细胞亚群、亚群间通讯的异常变化及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS患者中利用scRNA-seq全面表征单核细胞亚群和亚群的异质性，识别出新的亚群变化和潜在生物标志物 | 样本量有限，未进行功能验证实验，且研究仅关注单核细胞，未全面评估其他免疫细胞类型 | 探究原发性干燥综合征患者单核细胞亚群和亚群的变异及其功能角色 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的单核细胞样本 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及pSS患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3957 | 2026-01-23 |
Intrinsic and non-cell autonomous roles for a neurodevelopmental syndrome-linked transcription factor
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.696256
PMID:41509263
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研究论文 | 本文揭示了转录因子UNC-3在运动神经元中的细胞自主和非细胞自主功能，及其与人类EBF3综合征的关联 | 首次发现UNC-3作为终端选择因子，不仅通过细胞自主方式调控神经元身份，还通过胆碱能神经传递介导非细胞自主效应，影响下游GABA运动神经元的转录、形态和连接 | 研究基于线虫模型，人类EBF3综合征的直接机制仍需进一步验证 | 探究转录因子在神经元身份和电路组装中的内在与外在调控作用 | 线虫的胆碱能和GABA运动神经元 | 神经发育生物学 | 神经发育综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3958 | 2026-01-23 |
FlashDeconv enables atlas-scale, multi-resolution spatial deconvolution via structure-preserving sketching
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696108
PMID:41509391
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FlashDeconv的框架，用于图谱规模的空间转录组学解卷积，通过结构保持的随机草图技术，在保持计算效率的同时保留稀有生物信号 | 采用杠杆得分重要性采样来优先处理转录组学上独特的标记，保留标准特征选择丢弃的稀有细胞类型信号，相比基于方差的方法能更准确地解卷积 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于特定数据质量或算法假设 | 开发一个可扩展的数学框架，用于图谱规模的空间转录组学解卷积，以快速进行患者分层和生物结构发现 | 人类卵巢癌队列数据，包括细胞共定位信号和Tuft细胞微环境 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学解卷积 | 结构保持随机草图框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3959 | 2026-01-23 |
In vivo human embryonic spinal cord atlas validates stem cell-derived human dorsal interneurons and reveals ASD spinal signatures
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696129
PMID:41509229
|
研究论文 | 本研究开发了一种改进的方法，通过神经中胚层祖细胞状态从人类胚胎干细胞生成脊髓背侧中间神经元，并构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱，用于验证干细胞来源的神经元并揭示与自闭症谱系障碍相关的脊髓特征 | 提出了一种通过生理中间体（神经中胚层祖细胞）生成人类脊髓背侧中间神经元的新方法，并首次构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱，揭示了dI4/dI5群体的显著扩张及其与自闭症谱系障碍的关联 | 未明确说明样本大小或实验验证的局限性，可能依赖于体外模型，缺乏体内功能验证 | 开发干细胞分化协议以生成脊髓背侧中间神经元，用于脊髓损伤后的感觉恢复，并探索脊髓在自闭症谱系障碍中的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs）、人类胚胎脊髓组织、脊髓背侧中间神经元（dI1-dI6） | 干细胞生物学与神经科学 | 脊髓损伤、自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA-Seq、干细胞定向分化 | NA | 单细胞RNA-Seq数据、基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3960 | 2026-01-23 |
Glycolysis maintains effector function of lung Th17 TRM cells in precision cut lung slices
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114051
PMID:41399496
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肺切片培养模型，揭示了糖酵解在维持肺CD4 Th17组织驻留记忆细胞效应功能中的关键作用 | 首次发现糖酵解是维持肺Th17 TRM细胞效应功能的关键代谢途径，并建立了肺切片培养模型作为研究TRM细胞功能的体外平台 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体样本中进一步验证；肺切片培养模型可能无法完全模拟体内微环境 | 探究维持肺组织驻留记忆Th17细胞功能的分子机制 | 肺CD4组织驻留记忆Th17细胞 | 免疫学 | 肺部感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（第30、90、184天）的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |