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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2026-01-16 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
|
综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用,并综述了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术如何革新我们对细胞间通讯的理解 | 整合了单细胞测序、空间转录组学与生物工程工具,提供了分析细胞接触介导基因表达变化的新视角 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或方法验证 | 解析细胞间接触如何调控细胞反应网络 | 多细胞生物中的细胞间相互作用 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3942 | 2026-01-16 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-09, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 本研究探讨了APOE ε4等位基因通过下调IL-7/IL-7R通路影响效应记忆T细胞,从而加剧阿尔茨海默病中海马萎缩的机制 | 首次揭示了APOE ε4等位基因与IL-7/IL-7R通路下调在效应记忆T细胞中的关联,并建立了血浆IL-7水平与海马萎缩程度的负相关关系 | 样本量较小(仅54名患者),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究APOE ε4等位基因影响外周炎症和神经炎症的潜在机制 | 晚发性阿尔茨海默病患者(包括APOE ε4携带者和非携带者) | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 54名患者(28名APOE ε4携带者,26名非携带者) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3943 | 2026-01-16 |
Discovering mechanisms of human genetic variation and controlling cell states at scale
2024-07, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.03.010
PMID:38658256
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评论 | 本文探讨了单细胞测序在揭示人类遗传变异机制和控制细胞状态方面的潜力 | 提出将单细胞测序用于大规模构建变异效应表型图谱,并将遗传变异解释方法应用于工程化治疗性细胞状态 | NA | 加速人类遗传变异机制发现并推动基因组医学发展 | 人类遗传变异和细胞状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3944 | 2026-01-16 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
|
综述 | 本文总结了单细胞系统转录组学在揭示发育和细胞类型进化分子机制中的应用 | 利用单细胞系统转录组学分析,揭示了发育过程中谱系和细胞类型间转录组年龄的异质性,并识别了驱动整体生物钟形模式的谱系和组织 | NA | 探讨单细胞系统转录组学在理解发育进化模式和细胞类型进化史中的作用 | 发育过程中的谱系、细胞类型和组织 | 计算生物学 | NA | 单细胞系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3945 | 2026-01-16 |
The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305605
PMID:38581131
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研究论文 | 本文发现金黄色葡萄球菌的转肽酶Sortase A能与核酸结合,并基于此开发了CellID技术用于单细胞RNA测序中的样本多重标记 | 首次揭示了Sortase A与核酸的未知相互作用,并利用这一特性开发了新的细胞标记技术CellID | 未详细探讨Sortase A与核酸结合的具体分子机制,且技术应用潜力尚未完全验证 | 探索Sortase A的非经典功能及其在生物技术中的应用 | 金黄色葡萄球菌Sortase A蛋白、哺乳动物细胞、核酸寡核苷酸 | 生物技术 | NA | CRISPR筛选、scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3946 | 2026-01-16 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本文揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下促进心肌细胞适应性生长和心脏功能维持的关键作用 | 首次明确了心脏驻留巨噬细胞来源的IGF-1在高血压诱导的心脏适应性生长中的绝对必要性,并识别了人类心肌病中保守的IGF-1表达巨噬细胞亚群 | 研究主要基于动物模型,人类数据仅通过单细胞转录组学识别相关巨噬细胞亚群,未进行功能验证 | 探究免疫细胞在高血压应激下心脏适应性生长中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3947 | 2026-01-15 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了结核病诱导的肌成纤维细胞作为肺病理驱动因素的关键作用 | 首次在结核病研究中结合单细胞RNA测序和空间转录组学,识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群作为疾病严重程度和细菌负荷的关联因素,并揭示了其与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究样本量有限,且部分发现依赖于非人灵长类动物模型,需进一步在更大规模人类队列中验证 | 探究结核病肺免疫病理的细胞驱动因素 | 结核病感染者和未感染者的肺组织 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 来自结核病感染者和未感染者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3948 | 2026-01-15 |
Microglial dynamics and ferroptosis induction in human iPSC-derived neuron-astrocyte-microglia tri-cultures
2026-Jan-14, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70182
PMID:41532473
|
研究论文 | 本研究利用人iPSC衍生的神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞三培养系统,探究了小胶质细胞动态、铁死亡诱导及其在阿尔茨海默病中的病理作用 | 首次在人类iPSC衍生的三培养模型中系统研究小胶质细胞动态和铁死亡,揭示了神经元和星形胶质细胞对小胶质细胞基因表达和功能的深刻影响 | 研究基于体外三培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境 | 探究神经元-胶质细胞相互作用及小胶质细胞在阿尔茨海默病病理机制中的作用 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 三培养模型(神经元-星形胶质细胞-小胶质细胞) | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及单培养、共培养和三培养多种设置 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3949 | 2026-01-15 |
Circulating Tumor Cells Predict Response to the DLL3-targeting Bispecific Antibody Tarlatamab
2026-Jan-14, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1483
PMID:41532856
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌活检样本,并利用循环肿瘤细胞(CTCs)的DLL3表达水平预测患者对tarlatamab双特异性抗体的临床反应 | 首次将循环肿瘤细胞(CTCs)的DLL3表达作为生物标志物,用于预测小细胞肺癌患者对DLL3靶向双特异性抗体tarlatamab的治疗反应,并展示了其在监测获得性耐药机制中的应用 | 研究样本量较小(仅20名患者的前瞻性队列),且未涉及其他癌症类型或更大规模的验证 | 开发预测小细胞肺癌患者对tarlatamab治疗反应的生物标志物,并探索获得性耐药机制 | 小细胞肺癌患者及其循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 20名患者的前瞻性队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3950 | 2026-01-15 |
Machine learning and multi-omics integration identifies immunological predictors and mechanistic insights in autoimmune encephalitis
2026-Jan-14, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02180-8
PMID:41533076
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研究论文 | 本研究利用免疫指标和机器学习算法开发了自身免疫性脑炎的预后预测模型,并通过多组学方法探讨了核磷蛋白1在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次整合了临床免疫指标、多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、单细胞RNA测序、空间转录组学和表型全基因组关联研究,构建了可解释的预后预测模型并提出了新的潜在治疗靶点 | PAIA治疗的证据仅来自单个患者,NPM1作为治疗靶点的安全性仍需进一步验证,PheWAS仅为初步安全性评估 | 开发自身免疫性脑炎的预后预测模型并探索疾病发病机制 | 抗体阳性自身免疫性脑炎患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表型全基因组关联研究 | RF, XGBoost, LGBM | 临床免疫指标数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 未明确患者数量,包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3951 | 2026-01-15 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜的纳米诱饵,用于协同免疫治疗哮喘 | 利用M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵高效捕获多种2型细胞因子,并通过D-甘露糖修饰增强细胞因子清除,实现协同免疫抑制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发一种针对哮喘的纳米技术免疫疗法 | 哮喘(特别是嗜酸性粒细胞性哮喘) | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3952 | 2026-01-15 |
Neoadjuvant Therapy-Induced Remodeling in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Multimodal Spatial Analysis and Prognosis
2026-Jan-13, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70320
PMID:41531168
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研究论文 | 本研究通过整合空间病理组学和转录组学,分析了新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的系统性重塑作用及其预后意义 | 首次采用多模态空间分析方法,系统揭示了新辅助治疗对胰腺癌肿瘤微环境的全面重塑,包括成纤维细胞重编程、基质纤维化和免疫空间重组,并发现纤维化程度与患者生存期相关 | 样本量相对较小(13例未治疗和23例治疗后病例),部分免疫指标(如B细胞密度)仅显示有利趋势而未达统计学显著性 | 评估新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的改变及其临床预后价值 | 胰腺导管腺癌患者组织样本(包括未治疗和接受新辅助治疗后的病例) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学,单细胞空间分析,空间病理组学 | NA | 空间转录组数据,病理图像数据 | 36例胰腺导管腺癌患者(13例未治疗,23例治疗后),并使用独立单细胞空间数据集进行验证 | NA | 空间转录组学,单细胞空间分析 | NA | NA |
| 3953 | 2026-01-15 |
In-Tumor CRISPR-Cas9 Knockout Screening and Novel Therapy Development for Malignant Transformation of Ovarian Teratoma
2026-Jan-13, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70315
PMID:41531187
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9基因敲除筛选,结合空间转录组学分析,鉴定出SOD1是卵巢成熟性囊性畸胎瘤恶性转化的关键治疗靶点,并验证了其抑制剂LCS-1的抗肿瘤效果 | 首次在卵巢成熟性囊性畸胎瘤恶性转化中应用全基因组CRISPR-Cas9敲除筛选,并结合空间转录组学数据验证靶点,提出了氧化还原调控作为该罕见耐药卵巢癌亚型的新治疗策略 | 研究主要基于单一细胞系和患者来源异种移植模型,临床样本量有限,需要进一步扩大样本验证 | 鉴定卵巢成熟性囊性畸胎瘤恶性转化的治疗靶点并开发新型疗法 | 卵巢成熟性囊性畸胎瘤恶性转化细胞系及患者肿瘤组织 | 功能基因组学 | 卵巢癌 | CRISPR-Cas9基因敲除筛选,空间转录组学,siRNA敲低,小分子抑制剂 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 1个细胞系,3例患者肿瘤样本,患者来源异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3954 | 2026-01-15 |
Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.003
PMID:41529665
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研究论文 | 本研究通过单细胞整合与多模态分析,揭示了结直肠癌中中性粒细胞的表型、空间组织及其在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 构建了包含427万单细胞的大规模图谱,结合空间转录组学和蛋白质谱数据,首次识别出具有抗原呈递特性的中性粒细胞亚群,并揭示了KRAS依赖的中性粒细胞促肿瘤极化及IL-1信号介导的中性粒细胞-成纤维细胞相互作用 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成、表型及空间相互作用,以理解其对治疗反应的影响 | 结直肠癌患者样本中的单细胞,包括中性粒细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 1,670例患者样本(含4.27百万单细胞),补充了266例患者的单细胞谱,以及3.7百万细胞的空间转录组和0.7百万细胞的蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3955 | 2026-01-15 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single-cell RNA sequencing signatures of treatment-naive samples across the pediatric gastrointestinal tract
2026-Jan-09, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在未接受治疗的儿童克罗恩病患者中,识别了跨胃肠道多个区域的疾病亚型 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果的稳健性,并首次在未治疗儿科队列中应用张量分解技术来识别疾病亚型 | 研究样本仅限于未接受治疗的儿童患者,且炎症对细胞比例的影响因供体和组织异质性而较弱 | 研究克罗恩病的发病机制,识别疾病亚型以推动个性化医疗 | 未接受治疗的儿童克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 一个未治疗儿科克罗恩病队列的多个胃肠道区域活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3956 | 2026-01-15 |
A co-evolutionary perspective on humans and Mycobacterium tuberculosis in the era of systems biology
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108175
PMID:41499279
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综述 | 本文从系统生物学的角度探讨了人类与结核分枝杆菌的共进化关系,强调了宿主-病原体相互作用的复杂性 | 提出单一免疫机制研究阻碍进展,倡导采用系统生物学方法(如单细胞和空间转录组学)来全面理解结核病的多路径发病机制 | 未具体说明如何在实际研究中整合这些新兴方法以克服现有分析的缺陷 | 理解人类与结核分枝杆菌在共进化背景下的宿主-病原体相互作用,以推动结核病防控 | 人类与结核分枝杆菌(Mtb)的共进化关系及免疫学过程 | 系统生物学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3957 | 2026-01-15 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
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研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制m6A阅读器YTHDC2诱导巨噬细胞衰老,从而在肺癌中形成促肿瘤微环境的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老及促肿瘤微环境形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究香烟烟雾如何通过调控YTHDC2影响巨噬细胞功能及肺癌微环境 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3958 | 2026-01-15 |
Single-cell transcriptome analysis reveals macrophage-specific apolipoprotein C1 as a key regulator of polarization and progression in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70066
PMID:41294154
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了载脂蛋白C1(APOC1)在调控三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统解析了三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性,并鉴定出APOC1作为调控巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化的关键分子,其通过激活糖酵解通路发挥作用 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序数据分析,缺乏体内动物模型的直接验证;APOC1调控糖酵解的具体下游分子机制尚未完全阐明 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其促进肿瘤进展的分子机制 | 三阴性乳腺癌组织中的巨噬细胞(特别是脂质相关巨噬细胞LA-TAMs) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3959 | 2026-01-15 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-Jan, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
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研究论文 | 本文利用成像空间转录组学数据,绘制了人类扁桃体的转录图谱,并比较了其与单细胞RNA测序在细胞组成分析中的优势 | 开发了一个多尺度分析流程,专注于空间数据的组织、相互作用和功能特性,揭示了扁桃体的空间结构和免疫过程 | 数据仍存在分析挑战和标准化不足的问题 | 研究免疫反应在原生组织环境中的空间转录组学应用,并展示其在细胞组成分析中的优势 | 人类扁桃体组织 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 | 约200万个细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3960 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制,并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子,并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制,同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化效果仍需进一步验证;耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制,并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |