单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31129 篇文献，本页显示第 3901 - 3920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3901 | 2025-06-24 |
Comprehensive single-cell chromatin and transcriptomic profiling of peripheral immune cells in nonsegmental vitiligo
2025-Jun-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf041
PMID:39888372
|
research paper | 该研究通过单细胞多组学方法分析了非节段性白癜风患者外周血单个核细胞的转录组和染色质可及性，揭示了系统性免疫失调的机制 | 首次对非节段性白癜风患者外周血单个核细胞进行单细胞多组学研究，整合了转录组和染色质可及性数据，揭示了系统性免疫失调的新机制 | 样本量相对较小（NSV患者11例，健康对照5例），虽然通过流式细胞术在扩展队列中进行了验证，但可能影响结果的普遍性 | 研究非节段性白癜风患者外周免疫细胞的系统性免疫失调机制 | 非节段性白癜风患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | digital pathology | autoimmune disease | scRNAseq, scATACseq, spectral flow cytometry | NA | single-cell transcriptomic data, chromatin accessibility data | 初始队列：NSV患者11例，健康对照5例；验证队列：NSV患者16例，健康对照9例 |
| 3902 | 2025-06-24 |
Colorectal cancer cell line-derived organoid model with stem cell properties captures the regrowing state of residual cancer cells after neoadjuvant chemotherapy
2025-Jun-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02567-w
PMID:40537472
|
research paper | 该研究建立了一种具有干细胞特性的结直肠癌细胞系衍生的类器官模型，用于模拟新辅助化疗后残留癌细胞的再生状态 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了非循环细胞中的不同状态和动态变化，并识别了高表达蛋白质翻译相关基因RPL17和EEF1G的亚群 | 研究仅基于患者来源的细胞系建立的类器官模型，可能无法完全反映临床实际情况 | 探索针对耐受药物的残留癌细胞的独特治疗靶点 | 结直肠癌细胞系衍生的类器官模型 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell RNA sequencing | organoid model | RNA-seq data | 患者来源的细胞系 |
| 3903 | 2025-06-24 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Jun-20, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
|
研究论文 | 本研究探讨了NAT10在胰腺导管腺癌（PDAC）中的肿瘤进展和免疫微环境调控作用及其机制 | 首次揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3激活FAK/ERK通路调控PDAC肿瘤进展和免疫微环境的机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性和肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）组织和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 乙酰化RNA免疫沉淀、定量PCR、RNA免疫沉淀、Western blotting、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、流式细胞术 | 小鼠皮下肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、免疫细胞表型数据 | PDAC组织和细胞系，小鼠模型 |
| 3904 | 2025-06-24 |
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59479-7
PMID:40541962
|
research paper | 提出了一种数学框架，通过遗传谱系追踪和种群大小数据推断癌症耐药性动态，无需直接测量耐药表型 | 开发了一个无需直接测量耐药表型的数学框架，能够准确推断耐药性动态 | 未提及具体局限性 | 理解癌症耐药性机制 | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | digital pathology | colorectal cancer | scRNA-seq, scDNA-seq | mathematical framework | genetic lineage tracing, population size data | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 |
| 3905 | 2025-06-24 |
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07787-7
PMID:40541964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的免疫异质性，并探讨了ISCU-p53轴在调控巨噬细胞极化及免疫治疗反应中的作用 | 首次发现ISCU通过p53依赖性方式促进M2巨噬细胞极化，并揭示了其在调节肿瘤微环境免疫抑制中的新机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的体内外实验验证 | 探索ESCC肿瘤微环境中免疫异质性的分子机制，并寻找改善免疫治疗效果的潜在靶点 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解（PR）、疾病稳定（SD）患者及未接受术前治疗的手术患者的肿瘤样本 |
| 3906 | 2025-06-24 |
The critical role of PDGFRa + Sca1 + fibroblasts in angiogenesis and vascular repair in the corpus cavernosum
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04434-y
PMID:40542354
|
research paper | 该研究探讨了PDGFRa + Sca1 + 成纤维细胞在阴茎海绵体血管生成和修复中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，识别并验证了PDGFRa + Sca1 + 成纤维细胞在血管生成和内皮细胞/平滑肌细胞分化中的功能 | 研究仅基于动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探索成纤维细胞在勃起功能障碍发病机制中的作用 | 糖尿病诱导和神经损伤诱导的勃起功能障碍动物模型 | digital pathology | erectile dysfunction | scRNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 未明确说明样本数量（使用动物模型） |
| 3907 | 2025-06-24 |
Human induced neural progenitor cells generated from three-dimensional aggregate-based culture significantly improve post-stroke recovery in tMCAO mice
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04433-z
PMID:40542444
|
研究论文 | 开发了一种基于3D聚集体培养的高效诱导神经祖细胞(iNPCs)生产方法，并验证其在改善中风后恢复中的治疗潜力 | 开发了可扩展、稳定且高效的3D聚集体培养方法，避免了有害的细胞解离和重铺过程，并首次通过单细胞RNA测序探索了iNPC亚群的多效性治疗潜力 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发更高效的iNPC生产方法并验证其在缺血性中风治疗中的潜力 | 诱导多能干细胞(iPSC)来源的神经祖细胞(iNPCs)和tMCAO小鼠模型 | 再生医学 | 缺血性脑卒中 | 3D聚集体培养、单细胞RNA测序 | tMCAO小鼠模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 3个iPSC细胞系产生的iNPCs |
| 3908 | 2025-06-24 |
Integrating multi-omics data to optimize immunotherapy in endometrial cancer: a comprehensive study
2025-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02978-2
PMID:40540226
|
research paper | 该研究通过整合多组学数据，探索影响子宫内膜癌患者免疫治疗反应的因素，并优化免疫治疗策略 | 结合多组学数据和多种计算框架，识别了与免疫治疗反应相关的基因组变异和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的作用 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 优化子宫内膜癌的免疫治疗策略 | 子宫内膜癌患者 | digital pathology | endometrial cancer | multi-omics data analysis, scRNA-seq, somatic mutation and CNV analysis | TIDE, EaSIeR, ImmunoPhenoScore, ESTIMATE, TIMER, EPIC, Scissor | multi-omics data, bulk and single-cell RNA sequencing data | 来自公开数据库的子宫内膜癌患者数据 |
| 3909 | 2025-06-24 |
High glucose burden disrupts the glucose responsiveness of human pancreatic beta cells encapsulated in alginate fibers during Long-Term culture
2025-Jun-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149639
PMID:40544971
|
research paper | 研究高葡萄糖负荷下人类胰腺β细胞在藻酸盐纤维中长期培养时葡萄糖响应性的破坏机制 | 使用藻酸盐封装技术长期培养人类胰岛细胞，并通过RNA测序和单细胞RNA测序鉴定与β细胞功能障碍相关的候选基因 | 研究仅基于体外培养模型，可能无法完全反映体内情况 | 探究高葡萄糖负荷对人类胰腺β细胞葡萄糖响应性的影响及其分子机制 | 人类胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 体外培养模型 | 基因表达数据 | 两个不同批次的人类胰岛细胞培养样本 |
| 3910 | 2025-06-24 |
Gap junction protein beta 5 interacts with Gαi3 to promote Akt activation and cervical cancer cell growth
2025-Jun-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07768-w
PMID:40537499
|
研究论文 | 本研究探讨了间隙连接蛋白β5（GJB5）在宫颈癌中的表达及其功能意义，揭示了其通过Gαi3促进Akt激活和癌细胞生长的机制 | 首次发现GJB5与Gαi3的相互作用，并阐明其在Akt-mTOR信号通路激活中的关键作用 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化仍需进一步验证 | 寻找宫颈癌的新治疗靶点 | 宫颈癌细胞和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | shRNA、CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据、蛋白质相互作用数据 | TCGA数据库中的宫颈癌组织样本、原代人类宫颈癌细胞、异种移植模型 |
| 3911 | 2025-06-24 |
scExtract: leveraging large language models for fully automated single-cell RNA-seq data annotation and prior-informed multi-dataset integration
2025-Jun-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03639-x
PMID:40537825
|
研究论文 | 介绍了一个名为scExtract的框架，利用大型语言模型自动化单细胞RNA测序数据的分析，包括预处理、注释和整合 | 利用大型语言模型自动化单细胞RNA测序数据分析，并引入了scanorama-prior和cellhint-prior方法，整合先验注释信息以改进批次校正 | NA | 自动化单细胞RNA测序数据的分析，提高数据注释和整合的效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 大型语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | 14个数据集，共440,000个细胞 |
| 3912 | 2025-06-24 |
Sequence Diversity and Encoded Enzymatic Differences of Monocistronic L1 ORF2 mRNA Variants in the Aged Normal and Alzheimer's Disease Brain
2025-Jun-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2298-24.2025
PMID:40368603
|
research paper | 该研究通过酶功能测定、靶向PacBio HiFi长读长测序和定量空间转录组学，评估了31例阿尔茨海默病（AD）和非疾病（ND）大脑皮层样本中的内源性逆转录酶（RT）活性和L1 mRNA多样性 | 研究发现大脑中存在大量单顺反子ORF2 mRNA序列变异，其编码的RT和EN活性范围广泛，支持了这些变异在人类大脑中的内源性功能能力 | 研究样本量相对较小（31例），且主要关注大脑皮层，可能无法全面反映其他脑区的状况 | 探究正常衰老和阿尔茨海默病大脑中单顺反子L1 ORF2 mRNA变异的序列多样性及其编码的酶活性差异 | 31例阿尔茨海默病和非疾病人类大脑皮层样本 | 分子生物学 | 阿尔茨海默病 | PacBio HiFi长读长测序、定量空间转录组学、酶功能测定 | NA | RNA序列数据、酶活性数据 | 31例人类大脑样本（包括AD和ND） |
| 3913 | 2025-06-24 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Jun-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96152
PMID:40531183
|
研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 揭示了特定气味体验能选择性‘放大’特定嗅觉感觉神经元亚型，表明持续的神经元发生部分具有适应性功能 | 研究仅在小鼠中进行，未涉及其他哺乳动物 | 探究嗅觉刺激如何及为何加速某些嗅觉感觉神经元亚型的神经发生速率 | 小鼠的嗅觉感觉神经元（OSNs） | 神经科学 | NA | scRNA-seq和亚型特异性OSN出生日期测定 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 3914 | 2025-06-24 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657944
PMID:40501930
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了母体暴露于环境相关Fox River多氯联苯混合物对雌性后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了母体PCB暴露如何通过内质网应激介导的途径，特异性影响雌性后代肝脏中不同细胞类型的转录组重编程 | 研究仅关注了雌性后代且仅在出生后第28天进行观察，未探讨性别差异和更长期的影响 | 探究母体PCB暴露对后代肝脏发育的细胞特异性影响机制 | 围产期暴露于PCB的雌性小鼠的肝脏组织 | 毒理学 | 代谢紊乱 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第28天的雌性小鼠肝脏组织 |
| 3915 | 2025-06-24 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657738
PMID:40502179
|
research paper | 该研究通过整合新的固定细胞数据集与已发表的活细胞数据，更新了Hydractinia symbiolongicarpus的体细胞单细胞图谱，揭示了细胞类型和发育过程的新见解 | 发现了新的假定免疫细胞群体、先前未描述的神经亚型、两个空间上不同的腺细胞群体、一个茎部特异性细胞类型，以及完整的刺细胞发育轨迹 | 之前的图谱在细胞数量和转录组深度上有限，且细胞类型分配主要基于推测 | 推进对Hydractinia symbiolongicarpus细胞多样性和动态的理解 | Hydractinia symbiolongicarpus的喂养多足体和茎部组织 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过47,000个细胞 |
| 3916 | 2025-06-24 |
New Anti-Fibrotic Strategies for Keloids: Insights From Single-Cell Multi-Omics
2025-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13818
PMID:39902627
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究瘢痕疙瘩的细胞异质性和分子机制，发现两种成纤维细胞亚群在纤维化过程中的不同作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定瘢痕疙瘩中POSTN阳性间充质成纤维细胞和IGFBP2阳性成纤维细胞的差异及其在纤维化中的相反作用 | 样本量较小（仅3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本），需要更大规模的研究验证 | 探索瘢痕疙瘩的发病机制并开发新型抗纤维化治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 单细胞多组学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学分析、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 3个瘢痕疙瘩组织和3个正常皮肤样本 |
| 3917 | 2025-06-24 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多层次异质性中的应用 | 利用scRNA-seq和ST技术系统性地研究了皮肤免疫功能的分子和细胞特征，揭示了细胞类型在维持稳态和疾病中的相互作用 | NA | 探讨皮肤免疫系统的多层次异质性及其在疾病中的作用 | 皮肤免疫细胞及其空间组织 | 生物医学 | 皮肤疾病 | scRNA-seq, ST | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
| 3918 | 2025-06-24 |
Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08945-9
PMID:40307543
|
研究论文 | 该研究探讨了通过抑制基质机械感知来抑制心脏纤维化的新策略 | 发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械传感器，可通过药物抑制模拟基质软化效果，并与TGFβ抑制协同抑制纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，人类临床应用的可行性尚需验证 | 探索治疗心血管纤维化的新方法 | 心脏成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型和工程化心脏组织 | 基因表达数据 | 公共人类和小鼠单细胞测序数据集 |
| 3919 | 2025-06-24 |
Low-dose interleukin-2 induces clonal expansion of BACH2-repressed effector regulatory T cells following acute coronary syndrome
2025-Jun, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00652-y
PMID:40461772
|
研究论文 | 研究低剂量白细胞介素-2（IL-2）在急性冠状动脉综合征患者中诱导BACH2抑制的效应调节性T细胞克隆扩增的机制 | 结合单细胞转录组学和T细胞受体分析，揭示IL-2在急性冠状动脉综合征患者中克隆扩增效应T细胞的作用，并发现BACH2作为T效应程序的抑制因子 | 研究未涉及IL-2治疗对其他免疫细胞类型的影响，且样本量有限 | 探索IL-2在心血管疾病中的免疫调节作用及其治疗潜力 | 急性冠状动脉综合征患者的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、T细胞受体分析 | NA | 转录组数据、T细胞受体序列 | 急性冠状动脉综合征患者样本 |
| 3920 | 2025-06-24 |
scExploreR: a flexible platform for democratized analysis of multimodal single-cell data by non-programmers
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656649
PMID:40501593
|
research paper | 介绍了一个名为scExploreR的灵活平台，旨在为非程序员提供多模式单细胞数据的民主化分析 | scExploreR作为一个打包的R Shiny应用，支持本地运行或服务器部署，提供广泛的绘图定制选项，并能无缝处理多模式数据 | 虽然scExploreR为非程序员提供了分析单细胞数据的工具，但对于复杂的分析任务，编程经验可能仍是必要的 | 开发一个平台，使非程序员能够直接探索和分析单细胞数据，弥合生物学和计算科学之间的沟通鸿沟 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | R Shiny | 单细胞数据 | NA |