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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3881 | 2025-05-29 |
Targeting Ferroptosis Alleviates Pulmonary Arterial Hypertension, Insights from Transcriptomic and Experimental Analyses
2025-May-28, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500001
PMID:40432432
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡在肺动脉高压(PAH)发展中的作用及其分子机制,并通过转录组和实验分析验证了靶向铁死亡对PAH的治疗潜力 | 首次揭示了铁死亡在PAH内皮细胞损伤和血管重塑中的关键作用,并发现HIF1α信号在铁死亡诱导中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 | 探究铁死亡在PAH发病机制中的作用并开发潜在治疗策略 | 肺动脉高压(PAH)患者和小鼠模型 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | PAH小鼠模型(缺氧+SU5416诱导) | 基因表达数据、组织学数据 | 未明确说明患者样本量,使用小鼠模型进行实验 |
3882 | 2025-05-29 |
Single-Cell Analysis Reveals that Vitamin C Inhibits Bone Metastasis of Renal Cancer via Cell Cycle Arrest and Microenvironment Remodeling
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501011
PMID:40433925
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了维生素C通过细胞周期阻滞和微环境重塑抑制肾癌骨转移的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了维生素C在骨转移微环境中的抗肿瘤作用,并提出了维生素C与CXCR2拮抗剂联合治疗的新策略 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 | 探索维生素C抑制肾癌骨转移的分子机制及其治疗潜力 | 肾癌细胞及其骨转移微环境 | 肿瘤学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,使用纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球体来源的肾癌细胞 |
3883 | 2025-05-29 |
PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413474
PMID:40433916
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了PROS1-MERTK轴在甲状腺微小乳头状癌(PTMC)进展中的关键作用 | 首次揭示了PROS1-MERTK信号通路通过旁分泌和自分泌机制加速PTMC进展,并鉴定出NFYB和FOXP2作为PROS1转录的激活剂 | 样本量较小(19个手术组织标本),且仅针对PTMC进行研究 | 探索甲状腺微小乳头状癌(PTMC)进展的分子机制和生物标志物 | 15名患者的19个手术组织标本,包括癌旁组织、非进展性PTMC、进展性PTMC和进展性PTC | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 19个手术组织标本(来自15名患者) |
3884 | 2025-05-29 |
Single-cell targeted transcriptomics reveals subset-specific immune signatures differentiating asymptomatic and cardiac patients with chronic Chagas disease
2025-May-28, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf269
PMID:40434116
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研究论文 | 通过单细胞靶向转录组学揭示了慢性查加斯病无症状患者和心脏病患者亚群特异性免疫特征 | 首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术,揭示了慢性查加斯病不同临床形式患者的免疫细胞亚群特异性基因表达模式 | 研究仅基于外周血单个核细胞(PBMCs),未涉及其他组织或更广泛的样本 | 揭示慢性查加斯病不同临床形式(无症状和心脏病)患者的免疫特征差异 | 慢性查加斯病患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 查加斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自无症状(IND)和心脏病(CCC)患者的外周血单个核细胞样本 |
3885 | 2025-05-29 |
Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging
2025-May-28, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70119
PMID:40434135
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研究论文 | 研究昼夜节律基因BMAL1在甲状腺衰老过程中对细胞衰老的调控作用 | 揭示了BMAL1基因下调通过抑制NFKBIA表达加速甲状腺细胞衰老和损害激素合成的新机制 | NA | 探究甲状腺衰老的分子和功能特征及其与甲状腺激素合成的关系 | 人类甲状腺组织和小鼠模型 | 分子生物学 | 甲状腺疾病 | scRNA-seq, 转录组测序 | 甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻、中年和老年组的人类甲状腺组织 |
3886 | 2025-05-29 |
Epithelial cell dynamics: Key drivers of type 2 inflammation in eosinophilic chronic rhinosinusitis
2025-May-26, Auris, nasus, larynx
DOI:10.1016/j.anl.2025.05.009
PMID:40424830
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research paper | 本文探讨了鼻窦黏膜上皮细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎(ECRS)中作为2型炎症关键驱动因素的作用 | 强调了上皮细胞在ECRS发病机制中的关键作用,而非传统认为的免疫细胞,并探讨了针对IL-4/IL-13和IL-5信号通路的新型生物制剂的潜力 | ECRS的发病机制在患者群体中存在异质性,这使得开发通用疗法变得复杂 | 探索上皮细胞亚群在维持组织修复和慢性炎症平衡中的作用,以开发针对性干预措施 | 嗜酸性慢性鼻窦炎(ECRS)患者的上皮细胞和免疫细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学和空间转录组学技术 | NA | NA | NA |
3887 | 2025-05-29 |
[New technologies serve as accelerators for breakthroughs in modern acupuncture research]
2025-May-25, Zhen ci yan jiu = Acupuncture research
DOI:10.13702/j.1000-0607.20250380
PMID:40390610
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综述 | 本文系统回顾了现代针灸研究的历史,强调了早期电生理和生化技术对针灸客观效应的验证,以及自20世纪50年代以来研究对针灸镇痛机制、经络现象、穴位-内脏器官关联和穴位功效模式的阐明 | 强调了当代技术从系统、有机方法到细胞、分子和遗传方法在推动现代针灸研究中的作用,并展望了单细胞测序、空间转录组学、神经影像学、人工智能和医工交叉等新兴技术在针灸研究中的潜在应用 | 未具体说明当前研究的局限性 | 探讨现代针灸研究的发展历程及未来技术应用方向 | 针灸-艾灸的客观效应、镇痛机制、经络现象、穴位-内脏器官关联和穴位功效模式 | 医学工程交叉 | NA | 电生理、生化技术、单细胞测序、空间转录组学、神经影像学、人工智能 | NA | NA | NA |
3888 | 2025-05-29 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-May-08, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
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研究论文 | 本研究探讨了CTNNB1外显子3突变在子宫内膜样子宫内膜癌(EECs)中β-连环蛋白(β-catenin)蛋白不同定位对下游基因表达的影响 | 首次揭示了β-连环蛋白在细胞核内或膜/细胞质中的不同定位会导致EECs中产生不同的转录谱,并发现了一个新的治疗靶点TROP2 | 研究仅关注CTNNB1外显子3突变的EECs,未涉及其他突变类型或其他类型子宫内膜癌 | 探究β-连环蛋白不同亚细胞定位对EECs转录谱的影响 | 携带CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌(EECs) | 肿瘤分子生物学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,但研究了肿瘤内具有核和非核β-连环蛋白定位的不同区域 |
3889 | 2025-05-29 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2025-May, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
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research paper | 本研究揭示了6p22.2区域与中国汉族人群1型糖尿病(T1D)风险的关系,并确定了该区域内的因果变异及靶基因 | 发现了功能性变异rs9379874通过调节BTN3A1表达影响T细胞功能,为T1D的基因组风险图谱提供了新见解 | 未发现rs4320356变异与胰岛功能或自身免疫显著相关 | 揭示6p22.2风险区域与T1D亚群及相关临床特征的关联,并确定该区域的因果变异和靶基因 | 中国汉族人群中的T1D患者和健康对照 | 基因组学 | 1型糖尿病 | GWAS、双荧光素酶报告基因检测、eQTL分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、临床数据 | 2608例T1D患者和4814例健康对照 |
3890 | 2025-05-29 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析了22名口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本,探讨了肿瘤基质细胞在肿瘤微环境中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次揭示了免疫化疗应答者中SELP高内皮小静脉和APOD肌成纤维癌相关成纤维细胞的显著上调,以及STMN1毛细血管内皮细胞的下降,这些变化特异于免疫化疗组 | 样本量较小(仅22名患者),且仅针对口腔鳞状细胞癌 | 探讨肿瘤基质细胞在肿瘤微环境中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 22名口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22名口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤样本 |
3891 | 2025-05-29 |
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03733-z
PMID:39725707
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review | 本文综述了新生儿出血后脑积水(PHH)的分子病理生理学及新兴治疗方法 | 探讨了神经炎症通路、免疫介质及调控基因在PHH中的作用,并评估了基因组学、表观基因组学和蛋白质组学技术在识别关键分子靶点中的应用 | 新兴疗法如间充质干细胞干预在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未解决 | 研究PHH的病理生理学机制并探索针对性治疗方法 | 新生儿出血后脑积水(PHH)及其相关分子机制 | 神经科学 | 新生儿疾病 | 全基因组/外显子测序、蛋白质组学、表观遗传学、单细胞转录组学 | NA | 分子数据 | NA |
3892 | 2025-05-29 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
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research paper | 该研究探讨了小肠组织中组织驻留记忆CD8 T细胞(T细胞)的多样性及其空间时间印记机制 | 揭示了小肠不同组织微环境如何驱动T细胞的表型异质性,并开发了新的计算方法和基因扰动策略来研究T细胞的分化 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的空间转录组学,可能不完全反映人体内的全部复杂性 | 探究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源及其在小肠中的空间分布 | 组织驻留记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 空间转录组学、光学编码基因扰动策略 | NA | 转录组数据、空间分布数据 | 人类样本和小鼠模型 |
3893 | 2025-05-29 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
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research paper | 该研究通过单核测序和空间转录组学技术,构建了一个全面的人类下丘脑空间细胞转录图谱'HYPOMAP' | 首次结合单核测序和空间转录组学技术,对人类下丘脑进行全面的转录组分析,并发现了一些与BMI相关的基因 | 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有细胞类型和功能的复杂性 | 构建人类下丘脑的空间细胞转录图谱,并探索其与代谢等疾病的关系 | 人类下丘脑细胞 | 生物信息学 | 代谢疾病 | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 433,369个人类下丘脑细胞 |
3894 | 2025-05-29 |
Annexin A's Life in Pan-Cancer: Especially in Glioma Immune Cells
2025-Feb-26, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08827-9
PMID:40011350
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research paper | 该研究通过整合多组学数据和单细胞测序分析,全面评估了ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达模式和功能影响,特别关注胶质母细胞瘤 | 研究发现ANXA2和ANXA4主要由GBM中的M2巨噬细胞表达,并揭示了它们与胶质瘤中巨噬细胞和CD4+静止记忆T细胞存在的强相关性 | 研究中使用的分析工具之间存在差异,强调了使用多种方法准确识别差异表达基因的必要性 | 研究ANXA家族在癌症中的预后意义,特别是在胶质瘤免疫细胞中的作用 | ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达和功能,特别关注胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 多组学数据整合、单细胞测序分析 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集 |
3895 | 2025-05-29 |
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53666-8
PMID:39487129
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研究论文 | 提出了一种名为HiDDEN的机器学习方法,用于在病例对照单细胞转录组数据中检测与疾病相关的细胞群体 | HiDDEN方法能够精确地反映每个细胞的扰动状态,解决了传统方法在受影响细胞子集较小或扰动强度较弱时无法准确识别的问题 | 论文未明确提及具体局限性 | 开发一种计算方法,用于在单细胞RNA-seq研究中准确识别受疾病影响的细胞子集及其标记物 | 病例对照单细胞转录组数据 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤前体条件、脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集、人类多发性骨髓瘤前体条件数据集、小鼠脱髓鞘模型数据集 |
3896 | 2025-05-29 |
A New Graph Autoencoder-Based Multi-Level Kernel Subspace Fusion Framework for Single-Cell Type Identification
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3459960
PMID:39264790
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研究论文 | 提出了一种基于图自动编码器的多级核子空间融合框架scGAMF,用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | scGAMF框架首次将深度特征嵌入和核空间分析统一到一个框架中,通过多级核空间融合策略充分挖掘细胞间的深层潜在关系 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率问题 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的聚类准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图自动编码器(GAEs) | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本量,仅提到在真实数据集上进行了广泛验证 |
3897 | 2025-05-29 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了前列腺素E2(PGE2)通过EP2/EP4信号通路在人类肿瘤微环境中诱导免疫抑制的机制 | 揭示了PGE2-EP2/EP4信号通过下调c-Myc和PGC-1,进而影响氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成,从而损害免疫细胞的功能和抗肿瘤活性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的直接证据有限 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中的免疫抑制作用及其分子机制 | 肿瘤浸润的免疫细胞(包括CD8 T细胞和巨噬细胞) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类癌症样本和雌性小鼠的同基因肿瘤模型 |
3898 | 2025-05-29 |
Using Multi-Encoder Semi-Implicit Graph Variational Autoencoder to Analyze Single-Cell RNA Sequencing Data
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3458170
PMID:39255084
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研究论文 | 提出了一种基于变分图自编码器和图注意力网络的新框架MSVGAE,用于分析单细胞RNA测序数据 | 引入多编码器学习不同尺度的特征并控制非信息特征,通过添加不同噪声促进图结构信息和分布不确定性的传播 | NA | 更好地分析高维度、高稀疏性的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 变分图自编码器(MSVGAE), 图注意力网络 | 基因表达数据 | 24个模拟数据集和8个真实数据集 |
3899 | 2025-05-28 |
Synergistic effects of mTOR inhibitors with VEGFR3 inhibitors on the interaction between TSC2-mutated cells and lymphatic endothelial cells
2025-Jun, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2760-4
PMID:39862344
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research paper | 本研究探讨了mTOR抑制剂与VEGFR3抑制剂对TSC2突变细胞与淋巴管内皮细胞之间相互作用的协同效应 | 发现雷帕霉素与VEGFR3抑制剂的联合使用不仅增强了雷帕霉素的效果,还抑制了淋巴管相关表现,为LAM及其他TSC2突变疾病的治疗提供了新策略 | 研究仅通过体外实验和小鼠异种移植模型验证,尚未进行临床试验 | 探索LAM细胞与淋巴管内皮细胞的相互作用及雷帕霉素对此的影响,以寻找LAM治疗的新靶点 | TSC2缺失细胞与淋巴管内皮细胞(LECs) | 肿瘤学 | 淋巴管平滑肌瘤病(LAM) | 单细胞测序、异种移植模型 | NA | 细胞培养数据、测序数据 | NA |
3900 | 2025-05-28 |
Mechanistic insights into Hippo-YAP pathway activation for enhanced DFU healing
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.01067.2024
PMID:40261295
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序,全面探讨了TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在调节巨噬细胞M2极化及其在糖尿病足溃疡(DFU)伤口愈合中的关键作用 | 揭示了TFAP2A在DFU中的新型免疫调节作用,并提供了治疗慢性糖尿病伤口的有前景的靶点 | NA | 探讨TFAP2A-LIFR-Hippo-YAP信号轴在糖尿病足溃疡愈合中的作用机制 | 巨噬细胞M2极化及其在糖尿病足溃疡(DFU)伤口愈合中的作用 | 生物医学研究 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |