单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3881 - 3900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3881 | 2025-10-06 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2024-Nov-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.18.24317499
PMID:39606364
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强了阿尔茨海默病相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮质层特异性和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 研究依赖于深度学习工具CelEry推断的空间位置信息，可能存在推断误差 | 提升阿尔茨海默病相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析效能 | 436例死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单核RNA测序，深度学习 | 线性混合回归模型，CelEry深度学习工具 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约150万个细胞，来自436个死后大脑样本 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 3882 | 2025-10-06 |
Characterizing Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Wounds Through Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Nov-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12112538
PMID:39595104
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在糖尿病伤口成纤维细胞异质性研究中的应用与进展 | 系统总结了单细胞测序技术如何改变成纤维细胞分析策略，并强调通过该技术探索不同成纤维细胞亚群及其谱系的研究机遇 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据和研究样本 | 探讨糖尿病伤口愈合机制及成纤维细胞异质性 | 糖尿病伤口中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病伤口 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3883 | 2025-10-06 |
Proinflammatory immune cells disrupt angiogenesis and promote germinal matrix hemorrhage in prenatal human brain
2024-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01769-2
PMID:39349662
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研究论文 | 本研究揭示了先天免疫细胞在胚胎大脑特定区域血管生成中的作用及其异常激活导致生发基质出血的机制 | 首次发现小胶质细胞与新生血管的年龄依赖性相互作用，并鉴定出GMH患者中激活的中性粒细胞和单核细胞通过产生促炎因子破坏血管完整性 | 主要基于小鼠模型和人类样本的关联分析，因果关系需要进一步验证 | 探究生发基质出血的发病机制和免疫细胞在其中的作用 | 胚胎期小鼠和人类大脑组织、早产儿免疫细胞 | 神经发育生物学 | 生发基质出血 | 单细胞转录组测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 对照早产儿和GMH患儿的CD45免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3884 | 2025-10-06 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
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研究论文 | 本研究探讨囊性纤维化相关糖尿病中胰岛GLP-1受体表达降低及细胞特异性转录程序紊乱的机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组化揭示CFRD中GLP-1信号通路异常及胰岛细胞特异性基因表达失调 | 样本量有限，未涉及GLP-1R表达降低的具体分子机制 | 探究囊性纤维化相关糖尿病的胰腺病理机制 | 人类胰腺组织（CFRD患者与非CF/非糖尿病对照组） | 空间转录组学 | 囊性纤维化相关糖尿病 | 免疫组织化学，空间转录组学，基因集富集分析 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 人类胰腺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3885 | 2025-10-06 |
Inferring super-resolution tissue architecture by integrating spatial transcriptomics with histology
2024-Sep, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02019-9
PMID:38168986
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研究论文 | 提出一种整合空间转录组学与组织学图像的超分辨率基因表达预测方法 | 基于分层图像特征提取的iStar方法，能够将基因表达分辨率提升至近单细胞水平 | NA | 通过整合空间转录组学和组织学图像实现超分辨率组织架构推断 | 组织样本中的空间基因表达 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，组织学成像 | 分层图像特征提取 | 空间转录组数据，高分辨率组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3886 | 2025-10-06 |
The glycolytic reaction PGAM unexpectedly restrains Th17 pathogenicity and Th17-dependent autoimmunity
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.18.607992
PMID:39229227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢通量分析发现糖酵解酶PGAM意外地抑制Th17细胞的致病性 | 首次揭示糖酵解途径中的PGAM反应对Th17细胞致病性具有负向调控作用，与传统认知相反 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，在人体中的验证尚需进一步研究 | 探究糖酵解反应在Th17细胞致病性调控中的作用机制 | T辅助17细胞(Th17细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,代谢通量分析 | Compass算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3887 | 2025-10-06 |
Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02235-4
PMID:38528186
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研究论文 | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中基于标记基因进行细胞类型注释的能力 | 首次将大型语言模型GPT-4应用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释任务 | NA | 开发自动化细胞类型注释方法以减少人工标注的工作量和专业知识需求 | 数百种组织和细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | GPT-4 | 基因表达数据 | 数百种组织和细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3888 | 2025-10-06 |
Loss of Inpp5d has disease-relevant and sex-specific effects on glial transcriptomes
2024-08, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13901
PMID:38923164
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Inpp5d基因缺失对野生型小鼠大脑转录组的性别特异性影响 | 首次在无病理状态下揭示Inpp5d缺失对大脑转录组的基线影响，并发现性别特异性效应和基因共表达模块的崩溃 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究Inpp5d基因在神经退行性疾病中的功能机制 | 野生型小鼠大脑细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型小鼠大脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3889 | 2025-10-06 |
Transcriptional analysis of primary ciliary dyskinesia airway cells reveals a dedicated cilia glutathione pathway
2024-Jul-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.180198
PMID:39042459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、蛋白质组学和先进显微镜技术，揭示了原发性纤毛运动障碍(PCD)患者气道细胞中独特的谷胱甘肽代谢通路 | 发现了纤毛中专门的GSTA2通路对纤毛正常运动至关重要，并证明该通路可能成为治疗靶点 | 样本量相对有限，需要进一步验证GSTA2通路在更大PCD患者群体中的普遍性 | 探究PCD基因变异对多纤毛细胞的分子影响机制 | PCD患者、杂合子母亲和健康个体的原代培养上皮细胞，以及PCD患者来源的诱导多能干细胞 | 单细胞生物学 | 原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 先进显微镜, 免疫金标记 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 显微镜图像 | PCD患者、杂合子母亲和健康个体的原代上皮细胞，以及PCD患者来源的iPS细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3890 | 2025-10-06 |
Understanding the Foreign Body Response via Single-Cell Meta-Analysis
2024-Jul-18, Biology
DOI:10.3390/biology13070540
PMID:39056733
|
荟萃分析 | 通过整合多个单细胞RNA测序数据集，系统分析异物反应中的细胞亚群特征和信号通路 | 首次对现有所有异物反应小鼠研究的单细胞RNA测序数据进行荟萃分析，识别跨模型和解剖位置的共同基因特征 | 仅基于小鼠研究数据，人类临床样本验证尚需进一步研究 | 识别异物反应中细胞特异性基因特征，为医疗植入物患者提供潜在治疗靶点 | 异物反应小鼠模型中的成纤维细胞和巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 异物反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 所有可用异物反应小鼠研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3891 | 2025-10-06 |
Cell Simulation as Cell Segmentation
2024-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591218
PMID:38712065
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研究论文 | 本研究采用从头细胞模拟方法改进单细胞空间转录组学中的细胞分割精度 | 将从头细胞模拟方法应用于细胞分割，能够快速推断形态学上合理的细胞边界并保持细胞类型异质性 | NA | 提高单细胞空间转录组学中细胞分割的准确性和计算效率 | 肾细胞癌患者样本中的肿瘤浸润免疫细胞（中性粒细胞和T细胞） | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | 从头细胞模拟 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3892 | 2025-10-06 |
Glycolysis in hepatic stellate cells coordinates fibrogenic extracellular vesicle release spatially to amplify liver fibrosis
2024-06-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn5228
PMID:38941469
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研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞糖酵解通过空间特异性方式协调纤维化细胞外囊泡释放以放大肝纤维化的机制 | 首次阐明肝星状细胞糖酵解通过组蛋白修饰调控Rab31表达，在肝小叶中央区特异性促进纤维化细胞外囊泡释放的空间协调机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究肝星状细胞糖酵解如何通过空间特异性途径协调肝纤维化放大 | 肝星状细胞(HSCs)及其分泌的细胞外囊泡(EVs) | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 遗传学抑制, 组蛋白修饰分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3893 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic-informed deconvolution of bulk data identifies immune checkpoint blockade resistance in urothelial cancer
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109928
PMID:38812546
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研究论文 | 开发了一种名为ProM的单细胞转录组信息反卷积方法，用于从批量数据中识别膀胱尿路上皮癌免疫检查点阻断耐药性 | 提出ProM方法能够同时检测主要和次要细胞类型，在配对的单细胞和批量RNA测序数据评估中优于现有方法 | 未明确说明样本量的具体限制或方法在其他癌症类型中的适用性 | 开发计算反卷积方法以整合单细胞和批量RNA测序数据，获得临床相关见解 | 人类膀胱尿路上皮癌样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 计算反卷积 | ProM反卷积算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3894 | 2025-10-06 |
GoT-Splice protocol for multi-omics profiling of gene expression, cell-surface proteins, mutational status, and RNA splicing in human cells
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102966
PMID:38512867
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GoT-Splice的多组学分析协议，用于同时分析人类细胞的基因表达、细胞表面蛋白、突变状态和RNA剪接 | 将Genotyping of Transcriptomes (GoT)与增强的长读长单细胞转录组和细胞表面蛋白质组分析相结合，克服了传统方法在区分野生型和突变细胞以及从短读长数据重建剪接信号方面的局限性 | NA | 开发一种能够准确研究RNA剪接因子突变的多组学分析方案 | 人类细胞 | 单细胞多组学 | NA | 长读长测序, 单细胞转录组测序, 细胞表面蛋白质组分析, 基因分型 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 突变数据, RNA剪接数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 长读长测序 | NA | NA |
| 3895 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术绘制小鼠卵巢排卵过程的时空图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵过程的精确时间窗口，并识别排卵依赖性细胞状态的基因标记 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及其他物种 | 解析排卵过程中卵巢细胞类型的时空动态变化 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 配对小鼠卵巢样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3896 | 2025-10-06 |
Effects of SPI1-mediated transcriptome remodeling on Alzheimer's disease-related phenotypes in mouse models of Aβ amyloidosis
2024-May-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48484-x
PMID:38734693
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研究论文 | 本研究通过调控SPI1表达水平探究其对阿尔茨海默病相关病理表型的影响 | 首次在Aβ淀粉样变性小鼠模型中系统验证SPI1下调与过表达对AD病理的相反作用，并揭示其通过免疫反应和补体系统等通路发挥作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究SPI1表达水平调控对阿尔茨海默病发病机制的影响 | Spi1基因敲除和过表达的小鼠模型 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | 靶向转录组学，单细胞转录组学 | 基因敲除模型，基因过表达模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3897 | 2025-10-06 |
Characterization of the responses of brain macrophages to focused ultrasound-mediated blood-brain barrier opening
2024-May, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01107-0
PMID:37857722
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了聚焦超声开放血脑屏障后脑巨噬细胞的免疫重塑机制 | 首次在单细胞水平系统表征聚焦超声开放血脑屏障后小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的动态响应 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响机制 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3898 | 2025-10-06 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320524
PMID:38385291
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术绘制人类颈动脉粥样硬化的高维细胞图谱 | 首次结合转录组和表位测序技术系统鉴定动脉粥样硬化病变中的25种细胞群体，发现新型平滑肌细胞来源的泡沫细胞亚群 | 样本量相对有限（n=21），仅针对颈动脉病变进行研究 | 全面解析人类颈动脉粥样硬化的细胞组成和临床病理关联 | 人类颈动脉粥样硬化病变组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,细胞转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据,表位数据 | 21例颈动脉病变样本（13例有症状） | 10x Genomics | 单细胞多组学,单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 细胞转录组和表位索引测序技术 |
| 3899 | 2025-10-06 |
Single-cell epigenomic dysregulation of Systemic Sclerosis fibroblasts via CREB1/EGR1 axis in self-assembled human skin equivalents
2024-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.22.586316
PMID:38585776
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研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析系统性硬化症3D皮肤模型中的成纤维细胞亚群 | 首次在自组装人类皮肤等效物中通过单细胞多组学分析揭示CREB1/EGR1轴在系统性硬化症成纤维细胞表观遗传失调中的作用 | 研究基于体外3D皮肤模型，可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究系统性硬化症皮肤纤维化的单细胞表观遗传机制 | 系统性硬化症患者和健康对照的自体成纤维细胞、巨噬细胞和血浆构建的3D皮肤组织 | 单细胞多组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 3D皮肤等效物模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 系统性硬化症患者和健康对照捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3900 | 2025-10-06 |
Inositol phosphatase INPP4B sustains ILC1s and intratumoral NK cells through an AKT-driven pathway
2024-Mar-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230124
PMID:38197946
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现INPP4B是组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的标志性特征，并揭示其通过AKT通路维持这些细胞稳态和抗肿瘤功能 | 首次鉴定INPP4B作为组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的新型调节因子，揭示其通过AKT驱动的生存通路发挥作用 | 研究主要关注稳态和肿瘤环境，其他病理状态下INPP4B的功能尚未探索 | 探究INPP4B在先天淋巴细胞亚群特别是ILC1和NK细胞中的功能作用 | 先天淋巴细胞（ILC）、自然杀伤细胞（NK）、1型先天淋巴细胞（ILC1） | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |