单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3861 - 3880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3861 | 2025-10-06 |
scRDAN: a robust domain adaptation network for cell type annotation across single-cell RNA sequencing data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf344
PMID:40671175
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研究论文 | 提出一种用于跨单细胞RNA测序数据的细胞类型注释的鲁棒域自适应网络scRDAN | 结合去噪域自适应模块、细粒度判别模块和鲁棒性增强模块，通过特征重构和对抗学习解决噪声和批次效应问题 | NA | 开发能够有效处理单细胞RNA测序数据中噪声和批次效应的细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 域自适应网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3862 | 2025-10-06 |
scRECL: representative ensembles with contrastive learning for scRNA-seq data clustering analysis
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf346
PMID:40671174
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研究论文 | 提出一种名为scRECL的对比集成学习方法用于单细胞RNA测序数据聚类分析 | 结合对比学习和集成学习方法，通过Siamese神经网络和多重图代表性元素选择来提高聚类鲁棒性 | NA | 开发鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Siamese神经网络, 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3863 | 2025-10-06 |
Anomaly detection in spatial transcriptomics via spatially localized density comparison
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf242
PMID:40662796
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研究论文 | 提出了一种名为Sardine的空间转录组学异常检测方法，用于识别不同条件下组织切片中空间局部化的表达变化 | 通过空间局部化密度估计来比较不同条件下细胞状态在相同空间位置的概率，能够更准确地识别空间局部化改变 | 论文未明确说明方法的计算复杂度或在大规模数据集上的性能限制 | 开发空间转录组数据分析方法，检测不同条件下组织中的空间局部化表达变化 | 小鼠大脑皮层损伤响应前后的组织样本和接受电疗的小鼠脊髓组织样本 | 空间转录组学 | 神经系统损伤 | 空间转录组测序 | 密度估计算法 | 空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |
| 3864 | 2025-10-06 |
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70070
PMID:40669469
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示组蛋白伴侣HIRA在胚胎期黑色素细胞发育与成年期黑色素干细胞维持之间的关键联系 | 首次证实HIRA在胚胎期的功能缺陷会通过表观遗传机制影响成年组织干细胞的长期维持 | 研究仅限于小鼠色素系统模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育与成年组织干细胞维持之间的分子联系 | 小鼠黑色素细胞谱系（黑色素母细胞和黑色素干细胞） | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 3865 | 2025-10-06 |
Itaconate suppresses neonatal intestinal inflammation via metabolic reprogramming of M1 macrophage
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70419
PMID:40673634
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研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过代谢重编程调节巨噬细胞分化在新生儿坏死性小肠结肠炎中的保护作用 | 首次发现衣康酸通过挽救线粒体功能和上调氧化磷酸化来抑制M1巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证有限 | 探究衣康酸在坏死性小肠结肠炎中对巨噬细胞代谢重编程的调节作用 | 坏死性小肠结肠炎新生儿临床样本和ACOD1基因敲除小鼠模型 | 免疫代谢 | 坏死性小肠结肠炎 | 免疫荧光染色,液相色谱-质谱联用,单细胞测序 | NA | 图像,代谢组数据,单细胞测序数据 | 临床NEC样本和ACOD1-/-、ACOD1fl/flLysMcre小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3866 | 2025-10-06 |
PPARγ controls ESCRT-dependent fibroblast-like synoviocyte exosome biogenesis and alleviates chondrocyte osteoarthritis mediated by exosomal ANXA1
2025-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.06.008
PMID:40678612
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研究论文 | 本研究揭示运动通过上调PPARγ调控ESCRT依赖性成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并通过外泌体ANXA1蛋白缓解骨关节炎 | 首次发现PPARγ通过ESCRT通路调控成纤维样滑膜细胞外泌体生成，并鉴定ANXA1为关键治疗性外泌体货物蛋白 | NA | 探索运动疗法缓解骨关节炎的分子机制及外泌体介导的细胞间通讯 | 成纤维样滑膜细胞和软骨细胞 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序, 定量蛋白质组学, 数据非依赖性采集 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3867 | 2025-10-06 |
Mesenchymal stem/stromal cell therapy improves immune recovery in a feline model of severe coronavirus infection
2025-Jun-25, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szaf025
PMID:40659357
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研究论文 | 评估同种异体间充质干细胞联合抗病毒治疗在猫传染性腹膜炎中的安全性和有效性 | 首次在自然发生的猫冠状病毒感染模型中证明MSC疗法能促进免疫恢复，揭示PDGF-bb在淋巴细胞恢复中的潜在作用 | 研究结束时仍存在残余细胞因子升高，样本量未明确说明 | 评估MSC疗法改善严重冠状病毒感染免疫恢复的效果 | 患有渗出性猫传染性腹膜炎的猫 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序，血清细胞因子分析，主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，血液学数据，细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3868 | 2025-10-06 |
Regulatory network analysis of Dclk1 gene expression reveals a tuft cell-ILC2 axis that inhibits pancreatic tumor progression
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115734
PMID:40408246
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示Dclk1基因在胰腺肿瘤中的双相调控机制及保护性簇细胞-ILC2轴 | 首次明确Dclk1+细胞在胰腺肿瘤中的异质性，发现ADM样细胞与簇样细胞的相反作用，并揭示SPIB转录因子和ILC2-CAF旁分泌环路的关键调控机制 | 研究基于小鼠模型，人类胰腺肿瘤中的适用性需进一步验证 | 解析Dclk1基因在胰腺肿瘤进展中的调控网络与细胞功能 | Dclk1报告基因小鼠模型中的胰腺细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3869 | 2025-10-06 |
Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171364
PMID:40327401
|
研究论文 | 本研究探讨了Trp53和Pten肿瘤抑制因子在Sox2介导的非小细胞肺癌中的协同作用机制 | 首次在Sox2高表达背景下揭示Trp53和Pten缺失对肺癌亚型分化、粘蛋白组成和免疫微环境重塑的协同调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 阐明肿瘤抑制因子在Sox2介导的肺癌进展中的分子机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型和细胞系 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3870 | 2025-10-06 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
|
综述 | 本文探讨空间多组学技术在理解神经系统复杂相互作用中的应用与前景 | 提出整合代谢组学、转录组学和蛋白质组学的空间多组学方法，突破传统单组学研究的局限 | 样本制备优化、分子完整性维持和多组学数据整合仍存在挑战 | 通过空间多组学技术增强对神经系统细胞相互作用的理解 | 大脑中的动态生物过程和细胞间相互作用 | 空间多组学 | 阿尔茨海默病,自闭症谱系障碍 | 质谱成像,空间转录组学,空间蛋白质组学,多模态成像 | NA | 空间分子数据,成像数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学,多组学整合 | NA | NA |
| 3871 | 2025-10-06 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析CAR信号传导，揭示了驱动体内持久性的关键因素 | 首次系统性地将多样化的CAR信号输入与转录输出进行单细胞水平映射，识别出与体内持久性相关的独特强直信号特征 | 识别出的强直信号特征在实体瘤中无效，研究结果可能不适用于所有肿瘤类型 | 解码CAR信号传导设计原则，为优化下一代细胞内信号域架构提供指导 | 工程化表达嵌合抗原受体的T细胞 | 单细胞分析 | 液体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3872 | 2025-10-06 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-May-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的基因调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示甘蔗花叶病毒早期系统侵染过程中病毒积累与宿主基因表达的共变异模式 | 研究仅关注早期系统侵染阶段（症状显现前），未涉及后期感染过程 | 探究甘蔗花叶病毒早期系统侵染玉米的分子机制和宿主-病毒相互作用 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SCMV感染的玉米叶片细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3873 | 2025-10-06 |
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado6847
PMID:40267183
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研究论文 | 本研究通过SM/J小鼠模型揭示了遗传背景和衰老对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的神经免疫机制 | 首次在野生型环境中建立自发性椎间盘突出的小鼠模型，并系统揭示了神经免疫调节和细胞外基质改变在病理过程中的作用 | 研究仅限于SM/J小鼠品系，结果在其他遗传背景中的普适性需要进一步验证 | 探究遗传和年龄因素对椎间盘突出易感性及疼痛行为的神经免疫机制 | SM/J近交系小鼠的腰椎间盘、背根神经节、脊髓和外周血单核细胞 | 神经免疫学 | 椎间盘突出 | 单细胞RNA测序, 飞行时间细胞计数, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | SM/J近交系小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3874 | 2025-10-06 |
Accessing genetically defined cell types in the superior colliculus with transgenic mouse lines
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112194
PMID:40212591
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研究论文 | 本研究利用转基因小鼠品系表征上丘中特定神经元类型，验证分子图谱与形态学分类之间的相关性 | 首次基于单细胞转录组图谱系统评估转基因小鼠品系在上丘特定神经元类型靶向中的适用性 | 仅评估了10个转基因小鼠品系，可能未覆盖所有上丘神经元类型 | 研究上丘神经元亚型的功能特性 | 转基因小鼠的上丘神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学，转基因技术 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | 10个转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3875 | 2025-10-06 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了肺移植受者基线免疫状态异常及其对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答受损的机制 | 首次通过多组学整合分析揭示肺移植受者基线免疫状态与COVID-19重症相似的免疫特征，并直接关联到疫苗应答受损 | 样本量有限，未探讨不同免疫抑制方案对疫苗应答的影响 | 探究肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答减弱的免疫学机制 | 肺移植受者与健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，细胞因子数据，抗体数据 | 肺移植受者与健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3876 | 2025-10-06 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645306
PMID:40196571
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研究论文 | 比较三种不同细胞核分离方法对脑组织单核RNA测序数据质量的影响 | 首次系统评估不同细胞核分离方法对snRNA-seq数据质量的影响，揭示方法依赖性差异 | 研究仅针对脑组织，未涵盖其他组织类型 | 评估不同细胞核分离方法对单核RNA测序数据质量的影响 | 脑组织细胞核 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 3877 | 2025-10-06 |
SUV39H1 maintains cancer stem cell chromatin state and properties in glioblastoma
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186344
PMID:40059829
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现SUV39H1通过超级增强子介导的激活在胶质母细胞瘤干细胞中特异性高表达，并证明其通过调控染色质可及性维持肿瘤干细胞特性 | NA | 探究SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全细胞RNA测序,ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 3878 | 2025-10-06 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
|
研究论文 | 系统评估单细胞多模态数据整合方法在构建全面人类肾脏参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，首次系统评估了单细胞多模态数据整合策略在复杂组织中的应用效果 | 研究主要聚焦于肾脏皮层组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 建立稳健的多模态参考图谱生成框架，推进单细胞分析技术发展 | 人类肾脏皮层组织中的细胞核/细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | 机器学习 | 单细胞多模态数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 3879 | 2025-10-06 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了通过多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中微胶质细胞反应的文献 | 整合多种组学技术（转录组学、表观基因组学、空间转录组学等）系统分析AD小鼠模型中微胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，人类组织研究数据有限，机制仍不明确 | 阐明微胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用和分子机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的微胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量组织转录组学 | NA | NA |
| 3880 | 2025-10-06 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
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综述 | 本文从国际视角探讨系统性硬化症研究的未来发展方向 | 整合单细胞RNA测序、空间生物学、人工智能等前沿技术，提出全球合作研究框架 | 未提供具体研究数据，主要基于现有研究进展的展望性分析 | 推动系统性硬化症的机制理解和个性化治疗发展 | 系统性硬化症患者群体 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、新一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |