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当前共找到 34375 篇文献，本页显示第 3841 - 3860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3841 | 2025-10-05 |
Data-driven inference of Boolean networks from transcriptomes to predict cellular differentiation and reprogramming
2025-Sep-26, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00569-z
PMID:41006334
|
研究论文 | 提出一种从转录组数据自动推断布尔网络的方法，用于预测细胞分化和重编程 | 开发了整合转录组数据和先验知识自动生成布尔网络集合的通用方法，能够处理模型不确定性并预测稳健的重编程靶点 | 方法依赖于转录组数据的质量和对基础基因调控网络的先验知识 | 构建能够再现细胞定性行为的布尔网络模型，用于预测细胞分化和重编程 | 造血系统细胞分化和骨髓基质细胞向脂肪细胞/成骨细胞分化 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | 布尔网络 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3842 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of molecular mechanisms in prostate cancer via single-cell RNA sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15682-6
PMID:41006377
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析研究前列腺癌的分子机制 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq与hdWGCNA方法，在更高分辨率下分析前列腺癌肿瘤微环境，识别出6个关键基因 | 需要进一步的临床验证 | 探索前列腺癌进展的分子机制，发现潜在治疗靶点 | 前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Cox回归, LASSO回归, 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 9,809个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3843 | 2025-10-05 |
Hypersonic levitation and spinning: paving the way for enhanced single-cell analysis via contactless tissue dissociation
2025-Sep-26, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-025-00497-0
PMID:41006575
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型非接触式组织解离技术——高超声悬浮旋转技术，用于改进单细胞分析 | 开发了基于三声谐振器探针的高超声悬浮旋转技术，实现非接触式组织解离，通过微尺度'液体射流'施加精确流体动力 | NA | 开发高效、温和的组织解离方法以改进单细胞分析 | 人类肾癌组织 | 单细胞分析 | 肾癌 | 高超声悬浮旋转技术 | NA | 流式细胞术、原代细胞培养、免疫荧光、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3844 | 2025-10-05 |
Comprehensive characterization of lysosome-dependent cell death reveals prognostic significance and immune landscape in colon adenocarcinoma
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18267-5
PMID:41006689
|
研究论文 | 本研究全面表征了溶酶体依赖性细胞死亡在结肠腺癌中的预后意义和免疫景观 | 首次系统分析LDCD相关基因在结肠腺癌中的表达特征，建立五基因预后标志物，并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要更多前瞻性研究验证 | 探索溶酶体依赖性细胞死亡相关基因在结肠腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 结肠腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，LASSO回归，Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 3845 | 2025-10-05 |
Single-cell mapping of TMZ-resistant glioma reveals CXCL2/3-CXCR2-associated neutrophil communication
2025-Sep-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152706
PMID:41016335
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示TMZ耐药胶质瘤中CXCL2/3-CXCR2信号轴介导的肿瘤-中性粒细胞通讯机制 | 首次发现耐药胶质瘤干细胞通过CXCL2/3-CXCR2化学趋化轴与中性粒细胞建立特异性通讯回路 | 基于已发表数据的二次分析，需进一步实验验证具体分子机制 | 探究胶质母细胞瘤中TMZ耐药性与肿瘤微环境的关联机制 | 胶质瘤细胞、免疫细胞（小胶质细胞/巨噬细胞、中性粒细胞） | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat细胞通讯分析 | 转录组数据 | 基于大型单细胞RNA-seq数据集的二次分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3846 | 2025-10-05 |
Integrated Multiomics Analysis Identifies CDO1 as a Novel Therapeutic Target for Osteoarthritis
2025-Sep-25, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别CDO1作为骨关节炎的新型治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析识别CDO1作为骨关节炎的因果风险基因，并通过体内实验验证其治疗潜力 | 研究仅在大鼠模型中进行功能验证，尚未在人类临床试验中得到证实 | 识别骨关节炎进展中的关键基因和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,WGCNA,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 7个公共OA数据集和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3847 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction in the aging mammalian brain
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116165
PMID:40833855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间转录组学技术，揭示了热量限制对衰老小鼠大脑的细胞和分子影响 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术，在时空维度上系统解析热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究热量限制延缓大脑衰老的细胞种群和分子通路机制 | 小鼠大脑细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 36只小鼠大脑的超过50万个细胞，12个大脑切片 | EasySci, IRISeq | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | EasySci单核转录组, IRISeq空间转录组 | 无成像IRISeq空间转录组技术 |
| 3848 | 2025-10-05 |
gwSPADE: gene frequency-weighted reference-free deconvolution in spatial transcriptomics
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf966
PMID:41002029
|
研究论文 | 提出一种名为gwSPADE的基因频率加权无参考空间转录组解卷积方法 | 开发了无需外部单细胞参考数据的空间转录组解卷积方法，采用基因频率加权方案和主题模型 | NA | 解决空间转录组数据中细胞类型组成的准确解卷积问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 主题模型 | 基因计数矩阵 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 3849 | 2025-10-05 |
Single-cell-scale spatial transcriptome of the developing and adult mouse ovary
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676655
PMID:41000831
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组技术构建了小鼠卵巢发育和成年期的单细胞尺度空间转录组图谱 | 首次在保持卵巢原生细胞结构的前提下，通过10X Genomics Visium HD空间转录组技术实现了近单细胞分辨率的空间基因表达分析 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究卵巢发育过程中的空间模式调控机制 | 发育中和成年小鼠卵巢 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8个关键胎儿期和出生后时间点的小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10X Genomics Visium HD空间转录组学平台 |
| 3850 | 2025-10-05 |
Downregulation of heat shock protein 90 alpha family class A member 1 inhibits necroptosis in cardiac microvascular endothelial cells and alleviates sepsis-induced cardiomyopathy
2025-Sep-16, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114757
PMID:40967330
|
研究论文 | 本研究探讨HSP90AA1下调通过抑制心脏微血管内皮细胞坏死性凋亡缓解脓毒症诱导心肌病的机制 | 首次在单细胞水平揭示HSP90aa1+毛细血管内皮细胞在脓毒症心肌病中的异质性，并阐明HSP90AA1通过NF-κB信号通路调控坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未探讨其他潜在信号通路的参与 | 探究Hsp90AA1对小鼠心脏微血管内皮细胞功能和坏死性凋亡的影响及其在脓毒症诱导心肌病中的作用机制 | 小鼠心脏微血管内皮细胞和脓毒症诱导心肌病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blot, 免疫荧光, ELISA, 经胸超声心动图 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3851 | 2025-10-05 |
Global Pangenome Analysis Highlights the Critical Role of Structural Variants in Cattle Improvement and Identifies a Unique Event as a Novel Enhancer in IGFBP7+ Cells
2025-Sep-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf205
PMID:40828965
|
研究论文 | 本研究通过泛基因组图谱平台分析全球2409头牛的SNP和SV变异，揭示结构变异在牛群改良和适应性进化中的关键作用 | 首次在牛基因组中发现约40.14%的结构变异未被邻近SNP标记，并鉴定出一个作为IGFBP7基因增强子的独特结构变异 | 研究主要基于82个品种的2409个个体，可能未覆盖所有牛种遗传多样性 | 探究结构变异在全球牛群种群结构和表型形成中的作用 | 来自82个品种的2409头全球牛个体 | 基因组学 | NA | 泛基因组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 2409个个体，82个品种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3852 | 2025-10-05 |
Mouse-Specific Single cell cytokine activity prediction and Estimation (MouSSE)
2025-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013475
PMID:40971965
|
研究论文 | 提出了一种名为MouSSE的新方法，用于在小鼠单细胞RNA测序和空间转录组数据中预测和估计细胞因子活性 | 开发了专门针对小鼠数据的细胞因子活性估计方法，使用经过修改的方差调整马氏距离技术，支持正负基因权重 | 方法主要针对小鼠数据，在人类数据中的适用性可能需要进一步验证 | 开发准确的小鼠单细胞水平细胞因子活性估计方法 | 小鼠单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病、癌症、感染反应 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、基因集评分方法 | VAM（方差调整马氏距离）技术 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3853 | 2025-10-05 |
Safety and Anti-Inflammatory Effects of Engineered Extracellular Vesicles (ILB-202) for NF-κB Inhibition: A Double-Blind, Randomized, Placebo-Controlled Phase 1 Trial
2025-Sep, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70141
PMID:41002119
|
研究论文 | 评估工程化细胞外囊泡ILB-202在健康志愿者中的安全性、耐受性和初步药效学效应的I期临床试验 | 首次使用装载超抑制因子IκBα的工程化细胞外囊泡进行NF-κB靶向治疗的人体临床试验 | 单中心研究、样本量较小(18名志愿者)、仅评估短期效果 | 评估ILB-202在人体中的安全性和抗炎作用 | 18名健康志愿者 | NA | 炎症性疾病、自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、实验室参数、单细胞RNA测序数据 | 18名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3854 | 2025-10-05 |
Tensor-cell2cell v2 unravels coordinated dynamics of protein- and metabolite-mediated cell-cell communication
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.11.02.514917
PMID:40950142
|
研究论文 | 介绍Tensor-cell2cell v2计算工具，用于联合分析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯动态变化 | 首次通过耦合张量分量分析同时分析蛋白质和代谢物介导的细胞通讯，保留各模态通讯评分的独立性和数据结构 | NA | 开发能够解析多种配体类型协调动态的细胞通讯分析工具 | 脑类器官发育过程中的细胞通讯 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学，耦合张量分量分析 | 张量分解模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3855 | 2025-10-05 |
An Intrinsic-hoc Framework for Heterogeneous Cellular Senescence Elucidation Using Deep Graph Representation Learning and Experimental Validation
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662364
PMID:40631080
|
研究论文 | 提出一种基于深度图表示学习的框架DeepSAS，用于从单细胞RNA-seq数据中解析衰老细胞的异质性 | 开发了首个结合深度图表示学习和实验验证的本征框架，能够稳健地识别衰老细胞类型及其相关基因 | NA | 解析衰老细胞的异质性及其相关基因，增进对衰老和年龄相关疾病的理解 | 健康眼部细胞图谱和特发性肺纤维化数据集中的衰老细胞 | 机器学习 | 年龄相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度图表示学习 | 单细胞RNA-seq数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组学验证平台 |
| 3856 | 2025-10-05 |
cp_measure: API-first feature extraction for image-based profiling workflows
2025-Jul-01, ArXiv
PMID:41019218
|
研究论文 | 开发了一个名为cp_measure的Python库，用于从生物图像中提取特征以支持基于图像的细胞分析工作流 | 将CellProfiler的核心测量功能提取为模块化、API优先的工具，实现程序化特征提取 | NA | 开发适用于机器学习工作流的自动化、可重复图像分析工具 | 生物图像中的细胞和其他实体 | 计算机视觉 | NA | 图像分析，特征提取 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学，3D成像 | NA | NA |
| 3857 | 2025-10-05 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前庭毛细胞动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子特征 | 首次发现前庭动纤毛同时具有初级纤毛和运动纤毛的分子特征，并证实其具有自主运动能力 | 动纤毛的具体结构和功能机制仍需进一步研究 | 阐明前庭毛细胞动纤毛的分子特征和功能特性 | 前庭毛细胞和耳蜗毛细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫染色，活体成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 成年前庭和耳蜗毛细胞，斑马鱼和人类前庭毛细胞，牛蛙和小鼠壶腹嵴毛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3858 | 2025-10-05 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
|
研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微观和宏观状态的演化过程 | 建立理论框架解释离散疾病表型在单细胞尺度隐藏而在聚合宏观水平显现的机制 | NA | 探索单细胞与批量转录组学中癌症特异性信息内容，解析疾病定义状态如何从嘈杂单细胞数据中产生 | 慢性髓系白血病(CML)进展过程 | 单细胞组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 状态转换理论 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3859 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction on mammalian brain aging
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652093
PMID:40654944
|
研究论文 | 通过时空分析揭示热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 首次整合单细胞核基因组学与空间转录组学技术，在区域特异性和细胞类型特异性分辨率下系统解析热量限制的抗衰老机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；样本量相对有限（36个大脑） | 阐明热量限制对大脑衰老的分子和细胞作用机制 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据 | 36个小鼠大脑（超过500,000个细胞），12个脑切片 | NA | 单细胞核基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3860 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型，早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |