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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3841 | 2025-10-06 |
Network inference with Granger causality ensembles on single-cell transcriptomics
2022-02-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110333
PMID:35139376
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研究论文 | 提出一种基于Granger因果关系集成学习的单细胞转录组基因调控网络推断算法SINGE | 使用基于核的Granger因果关系回归处理不规则伪时间序列,并通过集成回归分析聚合预测结果 | 对个别调控因子表现不佳,且对无信息量的伪时间序列敏感 | 从有序单细胞基因表达数据推断基因调控网络 | 小鼠胚胎干细胞分化过程中的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Granger因果关系回归,集成学习 | 单细胞基因表达数据 | 两个小鼠胚胎干细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3842 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了子宫蜕膜中MAIT细胞的独特转录编程特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了子宫蜕膜与匹配外周血MAIT细胞的转录组差异,并证实了蜕膜APCs表达MR1分子 | 样本来源仅限于子宫蜕膜组织,未涉及其他妊娠相关组织;功能验证主要基于体外刺激实验 | 探究妊娠期子宫蜕膜中MAIT细胞的转录编程特征和功能特性 | 子宫蜕膜基底層和壁層的单核细胞及匹配的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 多组学分析,流式细胞术,CITE-seq,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 子宫蜕膜组织和匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,表位测序 | NA | CITE-seq结合单细胞RNA测序基因表达分析 |
3843 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147703
PMID:34003797
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞测序技术,揭示了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞相互作用的时空分布特征 | 首次优化了空间转录组学与单核测序数据的协调分析,将30种主要细胞类型定位到人类肾切除标本中,并在两种小鼠AKI模型中发现了免疫细胞浸润的空间特异性机制 | 研究仅基于人类肾切除标本和两种小鼠AKI模型,需要进一步验证其在其他肾脏疾病中的普适性 | 探索急性肾损伤中细胞类型空间分布特征及免疫细胞浸润机制 | 人类肾切除标本、小鼠缺血/再灌注损伤模型、盲肠结扎穿刺模型 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞测序, CODEX免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 人类肾切除标本1例,两种小鼠AKI模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
3844 | 2025-10-06 |
CRABP2 promotes peritoneal metastasis in CRC through TGF-β/Smad-mediated EMT signaling and invadopodia formation
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111927
PMID:40505846
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研究论文 | 本研究探讨CRABP2通过TGF-β/Smad介导的上皮间质转化信号和侵袭伪足形成促进结直肠癌腹膜转移的机制 | 首次揭示CRABP2作为腹膜转移相关基因通过调控侵袭伪足形成和EMT信号通路促进结直肠癌转移的新机制 | CRABP2在腹膜转移中的具体调控网络仍需进一步验证 | 阐明CRABP2在结直肠癌腹膜转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞和患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3845 | 2025-10-06 |
Identification of lactylation-related hub genes as novel therapeutic and diagnostic targets for thoracic aortic dissection
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111944
PMID:40527360
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研究论文 | 本研究通过鉴定乳酸化相关枢纽基因,探索其在胸主动脉夹层中的治疗和诊断价值 | 首次系统研究乳酸化修饰在胸主动脉夹层中的作用,发现12个乳酸化相关枢纽基因并验证LDHA抑制剂的有效性 | 研究主要基于数据库分析和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索乳酸化修饰在胸主动脉夹层发病机制中的作用并寻找新的治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者组织样本和BAPN诱导的小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ROC分析, WGCNA | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 人类主动脉组织和BAPN诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3846 | 2025-10-06 |
Rab27a+CAF exosomal miR-9-5p promotes osteosarcoma progression via CREBRF/MAPK signaling pathway
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111964
PMID:40581265
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研究论文 | 本研究揭示了Rab27a+癌相关成纤维细胞通过外泌体miR-9-5p抑制CREBRF并激活MAPK信号通路促进骨肉瘤进展的新机制 | 首次发现Rab27a+CAF来源的外泌体miR-9-5p通过CREBRF/MAPK信号轴调控骨肉瘤恶性进展和化疗耐药 | 研究主要聚焦于miR-9-5p/CREBRF/MAPK轴,可能存在其他未被探索的调控机制 | 探究癌相关成纤维细胞外泌体miRNA在骨肉瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者血清和组织样本、骨肉瘤细胞系、小鼠皮下移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 小RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR、双荧光素酶报告基因检测、CCK8、Edu染色、细胞周期分析、细胞凋亡检测 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、功能实验数据 | 骨肉瘤患者血清和组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序,小RNA测序 | NA | NA |
3847 | 2025-10-06 |
Amorphous calcium zinc phosphate promotes macrophage-driven alveolar bone regeneration via modulation of energy metabolism and mitochondrial homeostasis
2025-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.053
PMID:40677756
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研究论文 | 本研究开发了无定形钙锌磷酸盐纳米颗粒并通过调节巨噬细胞能量代谢促进牙槽骨再生 | 首次发现ACZP材料通过抑制IP3R/MCU通路、调节内质网-线粒体耦联和能量代谢方式(糖酵解向氧化磷酸化转换)来增强巨噬细胞的抗炎表型极化 | 研究仅在新西兰白兔模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 探索钙磷酸盐材料促进骨形成的免疫调节机制并开发新型骨再生材料 | 巨噬细胞和新西兰白兔的牙槽骨缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 牙槽骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新西兰白兔牙槽骨缺损模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3848 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cells promote salivary adenoid cystic carcinoma stem-like reprogramming via IGF2/IGF1R induced histone H3 lysine 18 lactylation
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217847
PMID:40466903
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关雪旺细胞通过IGF2/IGF1R信号轴诱导组蛋白H3K18乳酸化修饰,促进唾液腺腺样囊性癌干细胞样重编程的分子机制 | 首次发现TA-SCs通过旁分泌IGF2信号提升组蛋白乳酸化水平,并阐明IGF2/IGF1R-H3K18la轴在SACC干细胞样重编程中的关键作用 | TA-SCs重编程的具体分子通路细节仍需进一步探索,临床转化潜力有待验证 | 探究肿瘤相关雪旺细胞在唾液腺腺样囊性癌进展和干细胞样重编程中的功能机制 | 唾液腺腺样囊性癌肿瘤微环境中的雪旺细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤微环境研究 | 唾液腺腺样囊性癌 | 组织透明化三维成像, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 图像数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3849 | 2025-10-06 |
Dynamic evolution of venetoclax resistance in acute myeloid leukemia unveiled by longitudinal single-cell RNA-seq
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217853
PMID:40482912
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示急性髓系白血病中venetoclax耐药的动态演化过程 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘venetoclax治疗期间骨髓微环境重塑的动态过程,发现两种关键耐药机制并建立预后预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 研究急性髓系白血病患者对venetoclax治疗的耐药机制和骨髓微环境动态变化 | 接受DAV方案治疗的急性髓系白血病患者骨髓标本 | 单细胞测序分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | AML患者治疗前后配对骨髓标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3850 | 2025-10-06 |
Characterizing chromosome instability reveals its association with lipid-associated macrophages and clonal evolution of lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217874
PMID:40516322
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 首次发现染色体不稳定性通过易错DNA双链断裂修复途径与脂质相关巨噬细胞形成新型关联,促进淋巴结转移 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 探究染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用及机制 | 食管鳞癌患者组织样本、类器官模型及淋巴结转移灶 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 基因组测序, 空间蛋白质分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 食管鳞癌临床标本及类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3851 | 2025-10-06 |
The role of tumor microenvironment and immune cell crosstalk in triple-negative breast cancer (TNBC): Emerging therapeutic opportunities
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217865
PMID:40516902
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综述 | 本综述整合了三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞相互作用的研究现状,探讨新兴治疗机遇 | 系统阐述TME中T细胞异质性、Tregs免疫抑制机制、MUC1-C/CXCL9调控作用及空间分析在预测复发中的价值 | 未涉及具体临床实验数据验证,主要基于现有研究文献整合分析 | 探索三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞互作的机制及治疗靶点 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境组成成分及免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
3852 | 2025-10-06 |
Targeting the cholinergic-astrocyte axis: A novel strategy for brain metastasis prevention in lung adenocarcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217870
PMID:40516905
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研究论文 | 本研究揭示了胆碱能代谢-星形胶质细胞轴在肺腺癌脑转移中的作用机制,并提出多奈哌齐作为预防脑转移的潜在治疗策略 | 首次发现胆碱能代谢激活是肺腺癌脑转移的特征性标志,并阐明乙酰胆碱酯酶通过免疫抑制和血脑屏障破坏的双重促转移机制 | 样本量相对有限,需要更大规模临床试验验证多奈哌齐的预防效果 | 探索肺腺癌脑转移的发病机制并开发预防策略 | 肺腺癌患者肿瘤组织和脑转移灶 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,组织芯片,体外实验 | NA | 基因表达数据,组织样本 | 875例RNA测序病例,280例组织芯片验证,26个脑转移灶和8个正常脑组织单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
3853 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant PD-1 blockade induces the autophagy of immune cells: a new target for synergistic therapy of recurrent glioblastoma
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102119
PMID:40678806
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析新辅助PD-1阻断诱导复发性胶质母细胞瘤免疫细胞自噬的机制,并探索协同治疗策略 | 首次揭示新辅助PD-1阻断通过诱导淋巴样细胞自活化,发现L+M细胞作为关键免疫组分,并鉴定利巴韦林作为潜在协同治疗药物 | 自噬在特定免疫细胞亚群中的具体作用机制尚未完全阐明,药物靶向效果需要进一步实验验证 | 探索新辅助PD-1阻断对复发性胶质母细胞瘤免疫细胞自噬的影响及协同治疗靶点 | 复发性胶质母细胞瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3854 | 2025-10-06 |
Chemokine CCL12 in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice
2025-Aug-06, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究探讨了趋化因子CCL12在三叉神经节中对CFA诱导的小鼠机械性痛觉过敏的作用机制 | 首次揭示CCL12通过促进巨噬细胞浸润和促炎因子IL-6、TNF-α产生介导口面部痛觉过敏的新机制 | 研究仅关注三叉神经节水平,未涉及更高级中枢神经系统的调控机制 | 探究CCL12在慢性炎症性疼痛中的作用机制 | 小鼠三叉神经节中的CCL12趋化因子及其受体CCR2 | 神经科学 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 病毒干扰技术 | NA | 基因表达数据, 行为学数据, 免疫组化数据 | CFA诱导的口面部疼痛小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3855 | 2025-10-06 |
Subtypes of tumor-associated neutrophils and their roles in cancer immunotherapy
2025-Aug, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104763
PMID:40334802
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综述 | 总结肿瘤相关中性粒细胞亚型在癌症免疫治疗中的变化及作用 | 首次系统梳理TAN亚型在免疫治疗背景下的功能异质性,并建立促肿瘤与抗肿瘤亚群的分类框架 | 缺乏统一分类系统,现有研究仍处于初步阶段 | 阐明肿瘤相关中性粒细胞亚型在癌症免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关中性粒细胞及其亚型 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3856 | 2025-10-06 |
Piezo1 regulates fibrocartilage stem cell in cartilage growth and osteoarthritis
2025-Aug, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.04.013
PMID:40345612
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研究论文 | 本研究探讨了机械敏感性离子通道Piezo1在颞下颌关节软骨生长和骨关节炎中的作用机制 | 首次在人类颞下颌关节中发现Piezo1高表达,并通过条件性基因敲除揭示其在纤维软骨干细胞分化和骨关节炎发展中的双重作用 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限;病理模型为手术诱导,与自然发病过程可能存在差异 | 阐明Piezo1机械敏感性离子通道在颞下颌关节发育和骨关节炎发病机制中的作用 | 人类颞下颌关节样本、Gli1-CreERT2; Piezo1fl/fl条件性基因敲除小鼠 | 骨科学、发育生物学 | 骨关节炎、颞下颌关节疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、组织学分析、免疫组织化学 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据、组织学图像数据 | 人类颞下颌关节样本(未明确数量)、基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3857 | 2025-10-06 |
Macrophage heterogeneity in autoimmune diseases
2025-Aug, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2025.104993
PMID:40516246
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术全面探讨自身免疫性疾病中巨噬细胞的异质性及其治疗靶点 | 突破传统M1/M2二分法,利用单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在自身免疫疾病中的高度异质性 | NA | 探索自身免疫疾病中巨噬细胞的异质性及其治疗靶点 | 自身免疫疾病中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3858 | 2025-10-06 |
Timp2-modified gelatinhydroxyphenylpropionic acid hydrogels reverse enhanced scleral recovery and suppress myopia development in mice
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101942
PMID:40677403
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研究论文 | 本研究开发了一种Timp2修饰的巩膜干细胞-明胶羟基苯丙酸水凝胶复合物,用于治疗形觉剥夺性近视 | 首次将Timp2修饰的巩膜干细胞与Gtn-HPA水凝胶结合,通过单细胞RNA测序鉴定Timp2在近视进展中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 开发新型近视治疗方法,促进巩膜恢复并抑制近视发展 | 形觉剥夺性近视小鼠模型、人巩膜成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 近视 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3859 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of mature hepatocytes reveals an IRF1-driven restriction of HDV infection
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101429
PMID:40677689
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成熟肝细胞,发现IRF1是限制HDV感染的关键因子 | 首次在单细胞水平揭示IRF1通过阻断HDV感染早期阶段发挥抗病毒作用,并发现IRF1能抑制细胞分裂介导的病毒传播 | 使用干细胞来源的肝样细胞作为模型,可能存在分化不完全或异质性问题 | 研究成熟肝细胞对HDV感染的天然免疫应答机制 | 干细胞来源的肝样细胞和肝癌细胞系 | 单细胞生物学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照和HDV感染的肝样细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3860 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas and genome-wide Mendelian randomization reveal chemokine involvement in diverse immune cells in type 2 diabetes
2025-Jul-20, International journal of obesity (2005)
DOI:10.1038/s41366-025-01846-x
PMID:40684027
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱和全基因组孟德尔随机化分析揭示了趋化因子在2型糖尿病多种免疫细胞中的参与机制 | 首次整合孟德尔随机化、动物模型验证和单细胞RNA测序技术系统解析趋化因子在T2D免疫病理中的因果作用 | 研究主要基于外周血单核细胞,未涉及组织特异性免疫反应;动物模型可能无法完全模拟人类T2D复杂性 | 阐明趋化因子在2型糖尿病免疫失调中的因果作用和分子机制 | 2型糖尿病患者、链脲佐菌素诱导的小鼠T2D模型、外周血单核细胞 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 血清学数据 | 未明确样本数量(涉及GWAS数据、小鼠模型和PBMC样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |