单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3841	2025-03-02	Secreted clusterin inhibits tumorigenesis by modulating tumor cells and macrophages in human meningioma 2024-07-05, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noae034 PMID:38416702	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了分泌型clusterin（CLU）在抑制脑膜瘤发生和恶性转化中的作用及其机制	首次发现CLU通过诱导线粒体损伤和触发1型干扰素通路抑制脑膜瘤的发生和恶性转化，并揭示了其在调节肿瘤细胞和微环境中的双重作用	研究主要基于动物模型和细胞实验，临床样本数量有限，需进一步扩大临床验证	探索脑膜瘤恶性转化的潜在治疗靶点和肿瘤抑制因子	脑膜瘤样本（包括正常脑膜、良性肿瘤、高级别原位肿瘤和肺转移瘤）	肿瘤生物学	脑膜瘤	单细胞转录组分析	动物模型和细胞实验	转录组数据	18个样本（包括正常脑膜、良性肿瘤、高级别原位肿瘤和肺转移瘤）
3842	2025-03-02	Tumor and immune cell types interact to produce heterogeneous phenotypes of pediatric high-grade glioma 2024-03-04, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noad207 PMID:37934854	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了儿童高级别胶质瘤（PHGG）的肿瘤和免疫细胞类型，揭示了其异质性及其对肿瘤特性的影响	首次在单细胞水平上构建了PHGG的转录组数据集，并识别了主要的肿瘤细胞类型及其基因表达特征	样本量较小（19个PHGG样本），可能限制了结果的普遍性	探究儿童高级别胶质瘤的肿瘤和免疫细胞类型及其相互作用，以理解其异质性和治疗反应差异	儿童高级别胶质瘤（PHGG）的肿瘤和免疫细胞	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），多通道免疫荧光染色（IF）	NA	RNA测序数据，免疫荧光图像	19个PHGG样本
3843	2025-03-02	Myeloid-specific ablation of Basp1 ameliorates diet-induced NASH in mice by attenuating pro-inflammatory signaling 2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000000537 PMID:37505219	研究论文	本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了Basp1在NASH中的关键作用，并发现其在髓系细胞中的特异性失活可以减轻NASH的病理严重程度	首次发现Basp1在NASH中的关键调控作用，并通过髓系特异性失活Basp1减轻NASH病理	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨髓系细胞在NASH中的转录组重编程及其对疾病进展的贡献	小鼠和人类的NASH肝脏中的髓系细胞	生物医学	非酒精性脂肪性肝炎（NASH）	批量RNA测序和单细胞RNA测序（sc-RNA seq）	NA	RNA测序数据	小鼠模型和人类NASH肝脏样本
3844	2025-03-02	Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma 2024-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.16.575895 PMID:38293110	研究论文	本文研究了铜在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的代谢重塑作用及其对肿瘤生长和进展的促进作用	揭示了铜通过调控线粒体呼吸链复合物、谷胱甘肽代谢和NRF2靶基因的表达，协调生物能量产生与氧化还原保护，促进ccRCC的进展	未明确铜积累与ccRCC进展的具体分子机制，且未涉及铜靶向治疗的临床验证	探讨铜在ccRCC代谢重塑和肿瘤进展中的作用	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）	肿瘤代谢	肾癌	scRNA-seq, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
3845	2025-03-02	Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis 2023-08-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-40206-z PMID:37563130	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾巴再生过程中的成纤维细胞和吞噬细胞群体，揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控的软骨形成机制	首次在蜥蜴尾巴再生过程中识别出与软骨形成相关的成纤维细胞和吞噬细胞群体，并揭示了吞噬细胞诱导的成纤维细胞基因激活层级	研究仅限于蜥蜴尾巴再生模型，未涉及其他物种或组织类型的再生机制	探索蜥蜴尾巴再生过程中成纤维细胞和吞噬细胞在软骨形成中的作用机制	蜥蜴尾巴再生过程中的成纤维细胞和吞噬细胞	单细胞分析	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	蜥蜴尾巴再生过程中的细胞群体
3846	2025-03-02	Chemotherapy Coupled to Macrophage Inhibition Induces T-cell and B-cell Infiltration and Durable Regression in Triple-Negative Breast Cancer 2022-06-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3714 PMID:35442423	研究论文	本文通过临床前同基因p53缺失小鼠模型，开发了一种结合低剂量环磷酰胺和TAMs药理学抑制的治疗方案，用于治疗三阴性乳腺癌	创新点在于结合低剂量环磷酰胺和TAMs抑制剂的治疗方案，有效治疗多种高度侵袭性的TNBC小鼠乳腺肿瘤和肺转移模型，并通过单细胞RNA测序和高维成像技术揭示了治疗后的免疫反应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	开发并验证一种结合低剂量环磷酰胺和TAMs抑制剂的治疗方案，用于治疗三阴性乳腺癌	三阴性乳腺癌（TNBC）小鼠模型	肿瘤免疫学	乳腺癌	单细胞RNA测序，高维成像技术	NA	RNA测序数据，成像数据	多种高度侵袭性的TNBC小鼠乳腺肿瘤和肺转移模型
3847	2025-03-02	Oncostatin M expression induced by bacterial triggers drives airway inflammatory and mucus secretion in severe asthma 2022-01-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abf8188 PMID:35020406	研究论文	本文探讨了细菌触发的Oncostatin M（OSM）表达在严重哮喘中驱动气道炎症和黏液分泌的分子机制	揭示了细菌脂多糖（LPS）诱导OSM表达，并证明OSM在严重哮喘中的关键作用，为抑制OSM以预防细菌相关的哮喘进展提供了理论依据	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人类临床试验中验证OSM抑制的效果	研究细菌感染如何通过OSM驱动严重哮喘的病理生理特征	严重哮喘患者的气道活检样本、人类肺组织、上皮细胞和间充质细胞	NA	哮喘	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据、细胞实验数据	人类肺活检样本、小鼠巨噬细胞
3848	2025-03-02	In Vivo Developmental Trajectories of Human Podocyte Inform In Vitro Differentiation of Pluripotent Stem Cell-Derived Podocytes 2019-07-01, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2019.06.001 PMID:31265809	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了人类胎儿肾脏中足细胞的发育轨迹，并探讨了多能干细胞衍生的足细胞在体外分化中的应用	揭示了人类足细胞发育的内在调控机制，并展示了器官样衍生的足细胞在疾病建模和肾脏功能恢复中的潜力	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	理解足细胞的发育和功能，以创建相关的体外足细胞模型	人类胎儿肾脏中的足细胞	生物医学	慢性肾病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	人类胎儿肾脏样本
3849	2025-03-01	Single-cell immunopathology of recurrent acute generalized exanthematous pustulosis associated with vancomycin 2025-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global DOI:10.1016/j.jacig.2025.100426 PMID:40008097	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了一位由万古霉素引发的复发性急性泛发性发疹性脓疱病（AGEP）患者的免疫病理机制和遗传风险因素	首次在AGEP患者中应用单细胞测序技术，揭示了TH17样效应细胞在AGEP皮肤炎症中的关键作用，并探讨了HLA-A∗32:01等遗传风险因素	研究仅基于单一病例，样本量有限，结果可能需要更大规模的研究验证	探讨AGEP的免疫病理机制和遗传风险因素	一位复发性AGEP患者	数字病理	皮肤疾病	单细胞测序	NA	基因和蛋白质表达数据	1位患者，3个时间点的皮肤活检样本
3850	2025-03-01	Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287 PMID:39837060	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了乳腺癌脑转移中巨噬细胞在脑微环境重塑中的必要性	首次在小鼠模型中进行乳腺癌脑转移的单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞亚群在中枢神经系统中的变化及其在免疫逃逸和营养供应中的作用	研究样本量较小，仅分析了三个脑手术标本和小鼠模型的数据	全面研究脑肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制及关键分子	乳腺癌脑转移的脑手术标本和小鼠模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	三个脑手术标本和小鼠模型
3851	2025-03-01	Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286 PMID:39842212	研究论文	本文通过生物信息学分析和实验验证了ANXA1在胶质瘤中的不利预后作用	首次通过单细胞测序技术揭示了ANXA1在胶质母细胞瘤细胞中的高表达及其在免疫细胞中的富集情况	ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性需要进一步研究	探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响	胶质瘤患者和胶质瘤细胞	数字病理学	胶质瘤	实时定量PCR、Western blotting、单细胞测序	NA	基因表达数据、实验数据	两个队列的胶质瘤患者样本
3852	2025-03-01	CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291 PMID:39864342	研究论文	本文探讨了CD47作为肿瘤细胞来源的外泌体标志物，在调节肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应中的作用	研究发现CD47是肿瘤来源外泌体的标志物，能够区分免疫热和免疫冷肿瘤，并反映免疫治疗反应	研究主要基于转录组和单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证	识别能够区分免疫热和免疫冷肿瘤并反映免疫治疗反应的肿瘤来源外泌体标志物	卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者	肿瘤免疫学	卵巢癌、乳腺癌	转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	大量转录组和单细胞RNA测序数据集，包括卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者
3853	2025-03-01	Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270 PMID:39884220	研究论文	本研究利用单细胞测序技术解析了胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，重点研究了β-羟基丁酰化（Kbhb）相关基因及其对肿瘤微环境的影响	首次在单细胞水平上鉴定了胃癌中与β-羟基丁酰化相关的基因，并揭示了这些基因在免疫浸润和肿瘤微环境重塑中的关键作用	研究主要基于TCGA数据集，样本来源和多样性可能有限，且未进行实验验证	解析胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，探索β-羟基丁酰化相关基因的预后价值和治疗潜力	胃癌患者	数字病理学	胃癌	单细胞测序	风险评分模型	单细胞基因表达数据	189,700个单细胞样本
3854	2025-03-01	Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis of clock circadian regulator with prognostic and immune microenvironment in thyroid cancer 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102299 PMID:39892222	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了时钟昼夜节律调节器（CLOCK）在甲状腺癌进展及其免疫微环境中的作用	首次结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了CLOCK在甲状腺癌中的过表达及其对肿瘤生长和免疫微环境的影响	研究主要依赖于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索CLOCK在甲状腺癌中的作用及其潜在机制	甲状腺癌	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	LASSO回归, Kaplan-Meier生存估计	RNA测序数据	小鼠模型和人类样本
3855	2025-03-01	Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy 2025-Mar-01, Pancreas IF:1.7Q3 DOI:10.1097/MPA.0000000000002439 PMID:39999315	研究论文	研究通过瘤内注射细胞毒性药物加半抗原对胰腺癌原发部位治疗后，前哨淋巴结（SLNs）的细胞和基因组变化	揭示了靶向治疗如何调节淋巴结微环境以增强局部免疫反应，并可能提高全身抗肿瘤效果	未提及具体样本量，可能影响结果的普遍性	定义前哨淋巴结的转移和远隔效应的机制	胰腺癌患者的前哨淋巴结	癌症免疫治疗	胰腺癌	scRNA-seq	NA	基因组数据	NA
3856	2025-03-01	Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways 2025-Mar, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70247 PMID:40000392	研究论文	本研究探讨了Zfp36在心脏肥大中的调节作用，特别是通过Ythdc2/SLC7A11/GSH铁死亡途径的调节机制	首次证明了Zfp36通过抑制心肌细胞中的铁死亡来减轻心脏肥大，为针对铁死亡的治疗策略提供了新靶点	NA	研究Zfp36在心脏肥大中的调节功能及其在铁死亡中的作用机制	心肌细胞和心肌组织	生物医学	心血管疾病	单细胞测序分析	NA	基因表达数据	NA
3857	2025-03-01	Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma 2025-Feb-28, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70012 PMID:40018995	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据的整合分析，探索了肝细胞癌（HCC）的异质性和复发特征，揭示了复发HCC中恶性细胞和免疫细胞的变化，并提出了MIF-(CD74+CXCR4)信号通路作为关键机制	开发了一个复发肿瘤细胞相关风险评分（RTRS），能够独立预测总体生存时间和无复发生存时间，且比传统临床变量具有更高的准确性	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制	探索肝细胞癌的异质性和复发特征，识别关键治疗靶点，设计有效的抗癌疗法	肝细胞癌（HCC）的原发和早期复发样本	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，RT-qPCR	机器学习	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
3858	2025-03-01	Transcriptome Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in Human PDAC 2025-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415196 PMID:40019403	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序分析，全面描绘了人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组景观	识别了包括新发现的CAF亚型在内的九种不同的CAF亚型，并揭示了CAF亚型之间的分化可塑性及其与临床不良结果的关联	NA	研究胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组特征及其动态转换	人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
3859	2025-03-01	The bone marrow NK cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy 2025-Feb-28, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024026455 PMID:40019438	研究论文	本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验，探讨了多发性骨髓瘤（MM）患者诊断时和治疗期间骨髓中自然杀伤（NK）细胞的变化	揭示了诊断时CD16+细胞毒性NK细胞比例降低与达雷妥尤单抗治疗下细胞因子产生减少和NK细胞脱颗粒能力下降的相关性，并发现CD16+骨髓NK细胞比例低的患者在接受达雷妥尤单抗治疗后达到MRD阴性的可能性降低	研究结果主要基于CASSIOPEIA试验的数据，可能不适用于其他治疗方案或患者群体	探讨骨髓NK细胞在多发性骨髓瘤患者接受达雷妥尤单抗治疗中的预测作用	多发性骨髓瘤患者	免疫治疗	多发性骨髓瘤	单细胞转录组学、流式细胞术、功能实验	NA	细胞数据	CASSIOPEIA试验中的多发性骨髓瘤患者
3860	2025-03-01	Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder 2025-Feb-28, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01550-z PMID:40019596	研究论文	本研究通过网络药理学和单细胞RNA测序数据探讨了参苓白术散对肺腺癌的免疫治疗作用	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，揭示了参苓白术散通过调节巨噬细胞相关基因增强免疫功能的机制	研究机制尚不完全明确，需进一步临床研究验证	探讨参苓白术散对肺腺癌的免疫调节作用及其机制	肺腺癌患者及其免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	机器学习	RNA测序数据	未明确提及样本数量