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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3821 | 2026-04-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNF-α promotes glioblastoma proliferation and migration via CP-mediated KLF10 upregulation
2026-Apr-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01859-3
PMID:41963569
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3822 | 2026-04-12 |
Tumor-infiltrating platelets recruit neutrophils to promote tumor growth through the 5-HIAA-GPR35-ERK1/2 axis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-10, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0498
PMID:41962042
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研究论文 | 本文揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润血小板通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2轴招募中性粒细胞促进肿瘤生长的机制 | 首次发现血小板来源的5-HIAA通过GPR35受体激活ERK1/2通路,从而招募中性粒细胞促进肝癌生长 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限 | 探究肝细胞癌中肿瘤相关中性粒细胞与血小板相互作用的分子机制 | 肝细胞癌患者样本、Hepa1-6小鼠模型、血小板、中性粒细胞、肝癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 多重免疫组化、Transwell迁移实验、代谢组学分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | 图像数据、测序数据、实验数据 | 患者来源的HCC样本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3823 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Apr-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3824 | 2026-04-12 |
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-47700-6
PMID:41963494
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研究论文 | 本研究为普通章鱼免疫细胞(血细胞)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一套优化的细胞制备方案 | 首次为章鱼免疫细胞建立了scRNA-seq的方法学框架,开发了海洋抗凝集溶液(MAS)以维持细胞活性和结构完整性,并验证了其与10x Genomics平台的兼容性 | 研究聚焦于方法学优化,初步测序深度较浅,对免疫细胞多样性和功能的详细分析有待后续研究 | 优化章鱼免疫细胞的制备流程,以实现高质量的单细胞RNA测序,从而深入理解章鱼免疫系统 | 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞(WBH) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及章鱼血细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics化学(用于GEM生成、逆转录和cDNA文库构建) |
| 3825 | 2026-04-12 |
Cellular heterogeneity in hypertrophic burn scars in response to carbon dioxide laser therapy
2026-Apr-10, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01521-w
PMID:41963536
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析烧伤后增生性疤痕在二氧化碳激光治疗前后的细胞异质性,揭示了治疗反应差异的分子机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术探究二氧化碳激光治疗增生性疤痕的细胞机制,并识别出与良好治疗反应相关的再生性成纤维细胞亚群 | 样本量较小,且疤痕年龄分组基于6年阈值可能不够精确 | 探究二氧化碳激光治疗减轻增生性疤痕的细胞机制 | 烧伤幸存者的增生性疤痕组织 | 数字病理学 | 烧伤疤痕 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 烧伤幸存者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3826 | 2026-04-12 |
Super-enhancer-driven recruitment of C/EBPβ by SULT1B1 is implicated in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression
2026-Apr-10, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02121-0
PMID:41964026
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研究论文 | 本研究揭示了超级增强子驱动的H3K27ac/C/EBPβ/SULT1B1调控轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)进展中的关键作用 | 首次在MASLD中鉴定出SULT1B1作为核心超级增强子相关基因,并阐明C/EBPβ通过H3K27ac修饰促进其转录的分子机制,同时通过单细胞分析将该调控轴定位于肝细胞 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证相对有限,且JQ1介导的超级增强子抑制在体内的长期疗效和安全性尚未评估 | 阐明超级增强子在MASLD发病机制中的调控作用 | 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 | 表观遗传学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | ChIP-Seq, RNA-Seq, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 组蛋白修饰分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据, 表观基因组学数据 | 高脂饮食诱导的大鼠模型、MASLD患者样本、人及大鼠肝细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 3827 | 2026-04-12 |
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Apr-09, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2026.100564
PMID:41508611
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研究论文 | 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架,并应用于人类细胞图谱数据集 | 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,并揭示现有数据集中祖先代表性的不平衡问题 | 评估主要基于模拟数据和现有数据集,未涵盖所有可能的祖先群体和测序技术 | 评估和改进单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法,以促进遗传多样性研究和减少分析偏差 | 单细胞转录组测序数据中的遗传多态性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE等群体遗传学工具 | 测序reads中的遗传变异数据 | 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3828 | 2026-04-12 |
CIPHER-seq enables intracellular multimodal profiling of cytokine responses in single immune cells
2026-Apr-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44946-y
PMID:41951681
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIPHER-seq的新方法,用于在单个免疫细胞中同时量化细胞内蛋白质和转录组,以解决单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的不足 | 开发了CIPHER-seq技术,首次实现了在单细胞水平上同时分析细胞内蛋白质和转录组,提供了五层分析能力,并在免疫细胞回收方面与商业协议相匹配,同时显著减少了线粒体应激信号 | NA | 开发一种能够同时量化细胞内蛋白质和转录组的技术,以改善单细胞RNA测序在预测蛋白质丰度方面的局限性 | 刺激后的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞内蛋白质分析 | NA | RNA序列数据,蛋白质丰度数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 3829 | 2026-04-12 |
An Artificial Intelligence Optimized Hepatic Differentiation Unveils NR5A2 and AP-1 Transcriptional Regulation in Hepatic Maturation
2026-Apr-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111435
PMID:41962865
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的AI工具,利用肝祖细胞的相差图像优化肝细胞分化,揭示了NR5A2和AP-1转录因子在肝细胞成熟中的关键调控作用 | 首次结合AI算法和计算基因组学优化肝细胞分化协议,无需免疫染色或谱系追踪即可提高成功率,并发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的新调控机制 | 未明确说明AI工具的具体算法细节或在不同细胞系中的普适性验证 | 优化人类多能干细胞向肝细胞样细胞的分化协议,并研究肝细胞分化的基因调控机制 | 人类多能干细胞(hPSCs)、肝祖细胞(HPCs)和肝细胞样细胞(HLCs) | 机器学习 | 肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、表观基因组学 | 机器学习模型(具体未指定) | 图像(相差图像)、转录组数据、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3830 | 2026-04-12 |
Structure-preserving multivariate hypothesis testing for mass spectrometry imaging and single-cell data
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag137
PMID:41863333
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研究论文 | 本文介绍了一种名为block-SAM的结构保持多变量假设检验方法,用于处理质谱成像和单细胞RNA测序数据,以减少假阳性发现 | 提出block-SAM方法,考虑像素或细胞的嵌套样本结构,避免传统方法因忽略此结构而导致的样本量膨胀和假阳性增加问题 | 未明确讨论方法在极端数据分布或小样本情况下的性能,且主要针对特定数据类型(MSI和scRNA-seq) | 开发一种统计方法,以更准确地识别质谱成像和单细胞RNA测序数据中的差异特征,同时保留空间或细胞分辨率 | 质谱成像数据和单细胞RNA测序数据,包括肾脏、肺、卵巢肿瘤的DESI-MSI数据以及转移性肾细胞癌的scRNA-seq数据 | 生物信息学 | 肾癌、肺癌、卵巢癌 | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | block-SAM(一种多变量假设检验方法) | 图像数据(质谱成像)、基因表达数据(单细胞RNA测序) | 未明确指定具体样本数量,但涉及多个肿瘤数据集和患者比较 | NA | 质谱成像(DESI-MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 3831 | 2026-04-12 |
AutoGERN: single-cell RNA-seq gene regulatory network inference via explicit link modeling and adaptive architectures
2026-Apr-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag143
PMID:41871930
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研究论文 | 本文提出了AutoGERN,一种专为单细胞RNA测序数据设计的图神经网络框架,用于推断基因调控网络 | AutoGERN通过显式建模调控信息在消息传递空间中的表达,学习链接嵌入,并采用自适应架构搜索以适应不同数据集分布 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个能够从单细胞RNA测序数据中准确推断基因调控网络的图神经网络框架 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3832 | 2026-04-12 |
UBTF-HSP90A-MIF stress circuit drives lenvatinib resistance and immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.002
PMID:41946392
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞癌中UBTF/HSP90A/MIF调控环路介导乐伐替尼耐药和免疫排斥的分子机制 | 首次阐明UBTF/HSP90A/MIF应激环路在肝细胞癌乐伐替尼耐药和免疫微环境重塑中的核心作用,并验证MIF作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于临床前模型,临床验证队列样本量有限,需进一步大规模临床试验验证 | 阐明肝细胞癌中乐伐替尼-PD-1联合治疗的适应性耐药和免疫排斥机制 | 肝细胞癌细胞系、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及临床患者队列 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、启动子下拉实验、染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测、邻近连接分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据、临床数据 | 配对乐伐替尼敏感和耐药HCC模型、患者来源类器官、异种移植模型、免疫活性小鼠模型及独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3833 | 2026-04-12 |
TMBIM6 enhances dopaminergic neuron survival by modulating the IRE1a pathway in Parkinson's disease
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08391-5
PMID:41932887
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研究论文 | 本研究探讨了TMBIM6通过调节IRE1a通路在帕金森病中增强多巴胺能神经元存活的作用机制 | 首次揭示了TMBIM6在帕金森病中通过直接结合并抑制IRE1a来调节内质网应激反应,从而保护多巴胺能神经元,并证明了TMBIM6/IRE1a轴作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于细胞和动物模型,人类样本数据有限,且未详细探讨TMBIM6在其他神经退行性疾病中的普遍性 | 探究TMBIM6在帕金森病多巴胺能神经元存活中的作用及其分子机制 | 多巴胺能神经元、帕金森病细胞模型、果蝇和小鼠动物模型、人类死后脑组织样本 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq、基因敲低、过表达、AAV介导的基因传递、药理学抑制 | NA | RNA-seq数据、蛋白质水平数据、行为学数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及细胞模型、动物模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3834 | 2026-04-12 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2026-Apr-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
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综述 | 本文综述了基因组学和生物信息学技术在帕金森病研究中的应用进展 | 系统总结了近三十年来基因组学技术(从风险基因鉴定到单细胞转录组学)如何革新对帕金森病分子机制的理解,并强调了细胞类型特异性失调的新发现 | 作为一篇综述文章,未提出新的原始数据或实验验证,主要基于已有研究进行归纳总结 | 探讨如何运用神经基因组学和生物信息学解析帕金森病的复杂本质,以发现新的治疗靶点 | 帕金森病的遗传位点、分子通路、细胞类型特异性失调(特别是多巴胺能神经元以外的细胞) | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 大规模人类群体或模式生物队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3835 | 2026-04-12 |
PPAR-γ suppresses macrophage senescence and allergic airway inflammation through controlling lipid metabolic pathways
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106226
PMID:41864062
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞衰老在过敏性气道炎症中的致病作用,并确立了PPAR-γ作为调控巨噬细胞衰老和稳态的关键因子 | 首次通过单细胞RNA测序在过敏性哮喘模型中鉴定单核吞噬细胞的衰老特征,并利用巨噬细胞谱系特异性PPAR-γ条件敲除模型及脂质体靶向递送技术,阐明了PPAR-γ通过调控脂质代谢通路抑制巨噬细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证;靶向递送系统的长期安全性和疗效有待评估 | 探究PPAR-γ在过敏性气道炎症中通过调控巨噬细胞衰老的作用机制 | 过敏性哮喘小鼠模型、巨噬细胞(特别是肺泡巨噬细胞) | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质结合与转录组学整合分析 | 条件敲除小鼠模型(PpargΔCD11c) | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3836 | 2026-04-12 |
Generation of spatially patterned human neural tube-like structures using microfluidic gradient devices
2026-Apr, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01266-1
PMID:41062703
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研究论文 | 本研究介绍了一种利用微流控梯度装置生成具有空间模式的人源神经管样结构的方法 | 开发了一种新型微流控梯度装置,能够在受控化学梯度下生成管状或球状的人多能干细胞集落,模拟神经管形成和区域模式化过程 | 需要研究人员具备聚二甲基硅氧烷软光刻和细胞培养经验,实验周期较长(8-41天),且神经结构类型和发育阶段影响完成时间 | 研究人类神经管形成和区域模式化,开发人类神经发育和疾病研究的模型系统 | 人多能干细胞 | 生物医学工程 | NA | 微流控技术、软光刻技术、免疫荧光染色、单细胞测序 | 微流控神经管样结构模型、微流控前脑样结构模型 | 图像数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3837 | 2026-04-12 |
Hh and EGFR-Ras signaling promote distinct steps of tumor progression in the Drosophila follicle epithelium
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70844-y
PMID:41876551
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与遗传学、成像分析,探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在果蝇滤泡干细胞谱系稳态中的作用 | 首次揭示Hedgehog信号同时维持未分化状态并通过激活Zfh1诱导分化,EGFR-Ras过激活通过Pointed和E2f1引起细胞周期缺陷,双通路共激活导致肿瘤样生长 | 研究基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证 | 探究EGFR-Ras和Hedgehog信号通路在组织稳态和肿瘤发生中的作用机制 | 果蝇滤泡上皮干细胞谱系 | 发育生物学与肿瘤生物学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA-seq, 遗传学分析, 成像分析 | 果蝇遗传模型 | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3838 | 2026-04-12 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-Mar-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
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研究论文 | 本研究利用人脑切片模型探究了CAR-T细胞在胶质母细胞瘤微环境中的免疫抑制机制 | 首次在保留复杂肿瘤微环境的人脑切片模型中,结合单细胞测序和空间转录组学技术,系统分析了CAR-T细胞与胶质母细胞瘤生态系统的相互作用 | 研究基于体外脑切片模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的动态变化 | 探究胶质母细胞瘤微环境中CAR-T细胞快速失效的机制 | NKG2D CAR-T细胞与胶质母细胞瘤微环境中的免疫细胞及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | PIC-seq, 空间转录组学, 基因调控网络重建 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3839 | 2026-04-12 |
Expression of CD25 in human lung mast cells and its regulation by IL-33
2026-Mar-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.003
PMID:41825599
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研究论文 | 本研究探讨了IL-33对人类肺肥大细胞中CD25表达的调控作用 | 首次揭示了IL-33在正常成熟组织驻留肥大细胞中调控CD25表达的机制,并利用单细胞RNA测序数据识别了IL2RA+肥大细胞亚群 | 研究主要基于体外实验和公开数据集,体内功能验证可能有限 | 研究IL-33对肺肥大细胞CD25表达的调控及其在免疫反应中的作用 | 纯化的人类肺肥大细胞 | 免疫学 | 肺部炎症 | RNA测序,实时定量PCR,流式细胞术,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3840 | 2026-04-11 |
Unraveling new characteristics of γδ T cells using scRNA-seq in TCR KO chicken
2026-Mar-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12741-8
PMID:41807936
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |