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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3801 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals Hippo signaling as a driver of fibrosis in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169225
PMID:38051587
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示Hippo信号通路在化脓性汗腺炎纤维化中的驱动作用 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫染色技术,系统揭示了慢性HS的发病机制和细胞相互作用网络 | NA | 阐明化脓性汗腺炎的发病机制和纤维化形成过程 | 化脓性汗腺炎患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3802 | 2025-10-06 |
Myeloid and lymphoid expression of C9orf72 regulates IL-17A signaling in mice
2024-01-31, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg7895
PMID:38295187
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研究论文 | 本研究通过基因敲除技术揭示了C9orf72在髓系和淋巴系细胞中调控IL-17A信号通路的作用机制 | 首次发现C9orf72通过调控CD80分子运输抑制IL-17A信号通路,为ALS/FTD相关神经炎症提供了新治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究C9orf72基因在免疫细胞中对IL-17A信号通路的调控作用及其在神经炎症中的机制 | 基因敲除小鼠的造血祖细胞、脊髓、大脑皮层和脾脏组织 | 分子免疫学 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶痴呆 | 条件性基因突变、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 多组织来源的鼠类和人类样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3803 | 2025-10-06 |
Integrative genotyping of cancer and immune phenotypes by long-read sequencing
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44137-7
PMID:38167262
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研究论文 | 开发了一种名为nanoranger的长读长测序工作流程和分析流程,用于整合基因分型癌症和免疫表型 | 开发了灵活的长读长测序方法,可从单细胞cDNA文库中检测细胞谱系定义特征,克服了短读长测序的限制 | 需要进一步验证其在其他癌症类型中的应用效果 | 改进单细胞肿瘤和免疫细胞共进化的追踪方法 | 急性髓系白血病(AML)亚克隆和骨髓浸润免疫细胞 | 单细胞测序 | 急性髓系白血病 | 长读长测序,单细胞转录组学 | NA | 单细胞cDNA测序数据 | 数千个骨髓浸润免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,长读长测序 | NA | nanoranger工作流程 |
3804 | 2025-10-06 |
Digital spatial profiling of segmental outflow regions in trabecular meshwork reveals a role for ADAM15
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298802
PMID:38394161
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学方法识别与房水流出高低区域相关的基因 | 首次使用数字空间分析技术识别小梁网中与节段性房水流出相关的特定基因 | 研究样本来源于器官培养的人类前房段,可能无法完全反映体内情况 | 识别影响房水流出的关键基因 | 人类小梁网组织 | 空间转录组学 | 眼科疾病 | 空间转录组学,免疫标记 | NA | 空间转录组数据,图像数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx数字空间分析平台 |
3805 | 2025-10-06 |
The bone marrow of mouse-rat chimeras contains progenitors of multiple pulmonary cell lineages
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1394098
PMID:38694819
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研究论文 | 本研究通过创建小鼠-大鼠嵌合体,开发了一种富含呼吸系统祖细胞的骨髓移植方法,用于改善辐射性肺损伤后的肺组织修复 | 首次利用种间嵌合体技术创建富含呼吸系统祖细胞的骨髓移植源,发现这些细胞能够贡献于肺内多种细胞谱系 | 研究基于动物模型,临床应用前景需要进一步验证 | 开发能够改善辐射性肺损伤后肺组织修复的新型骨髓移植方法 | 小鼠-大鼠嵌合体骨髓细胞和辐射性肺损伤小鼠模型 | 单细胞生物学 | 辐射性肺损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,图像数据 | 嵌合体骨髓细胞移植的致死辐射小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3806 | 2025-10-06 |
Regulation of Bacteroides acidifaciens by the aryl hydrocarbon receptor in IL-22-producing immune cells has sex-dependent consequential impact on colitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1444045
PMID:39229279
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研究论文 | 本研究揭示了芳香烃受体在IL-22产生免疫细胞中通过调控拟杆菌属影响结肠炎的性别特异性机制 | 首次发现AhR在Rorc表达细胞中的缺失会导致性别依赖性的拟杆菌属调控失调,并证明Bacteroides acidifaciens仅在雌性小鼠中加剧结肠炎 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类中验证;性别差异的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明芳香烃受体通过IL-22信号通路调控肠道微生物影响结肠炎的细胞和性别特异性机制 | 野生型、AhR ΔRorc和同窝对照小鼠的结肠细胞和肠道微生物 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA微生物组分析 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | 多组基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 微生物组分析 | NA | NA |
3807 | 2025-10-06 |
Approaches for Benchmarking Single-Cell Gene Regulatory Network Methods
2024, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322241287120
PMID:39502448
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综述 | 本文系统探讨了单细胞基因调控网络方法的基准测试框架 | 首次全面讨论单细胞基因调控网络方法的基准测试方法,提出替代性基准数据集和性能评估指标 | 未开发新的计算方法,主要聚焦于基准测试框架的讨论 | 建立单细胞基因调控网络方法的基准测试标准 | 单细胞基因调控网络计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3808 | 2025-10-06 |
Dendritic cell effector mechanisms and tumor immune microenvironment infiltration define TLR8 modulation and PD-1 blockade
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440530
PMID:39697344
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌患者中TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗的免疫机制 | 首次在人类头颈鳞状细胞癌中利用同一病灶纵向采样揭示TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗的协同作用机制 | 样本量较小(仅三个患者),需要更大规模研究验证 | 解析TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗在头颈鳞状细胞癌中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞测序分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织染色图像 | 头颈鳞状细胞癌患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3809 | 2025-10-06 |
A Self-Renewing Biomimetic Skeletal Muscle Construct Engineered using Induced Myogenic Progenitor Cells
2024-Jan, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202300571
PMID:40677964
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研究论文 | 本研究开发了一种使用诱导肌源性祖细胞构建的具有自我更新能力的仿生骨骼肌结构 | 首次利用诱导肌源性祖细胞构建包含自更新干细胞和排列整齐肌管的仿生肌肉结构,能够模拟体内骨骼肌修复过程 | NA | 开发能够模拟骨骼肌再生和对齐的体外系统,用于基础研究和再生医学 | 诱导肌源性祖细胞和人类成肌细胞 | 组织工程 | 肌肉疾病 | 静电纺丝、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3810 | 2025-10-06 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Dec-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了凋亡细胞识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 发现Axl和Timd4两种胞葬受体通过不同机制调控组织修复,其中Axl信号对伤口修复必需但对胞葬作用非必需 | 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据有限 | 探究凋亡细胞识别和清除机制如何调控组织修复 | 小鼠皮肤伤口和人类糖尿病足伤口 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3811 | 2025-10-06 |
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.07.016
PMID:37562753
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研究论文 | 本研究揭示了补体C1q通过CSF1R+传统2型树突状细胞在气源性过敏原致敏中的关键作用 | 首次发现C1q特异性富集于肺CSF1R+cDC2s细胞,并证明C1q-LRP1轴在过敏原识别和哮喘发病中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明CSF1R+cDC2s识别吸入过敏原的分子机制 | 小鼠肺树突状细胞和人类支气管肺泡灌洗样本 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型,过敏原激发试验 | NA | 基因表达数据,蛋白质检测数据 | 小鼠模型和人类BAL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3812 | 2025-10-06 |
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05476-w
PMID:37726653
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研究论文 | 提出了一种名为DeTREM的改进方法,用于校正单核RNA测序数据在脑组织细胞类型反卷积分析中的偏差 | 在MuSiC方法基础上引入偏差校正机制,专门针对单核RNA测序与bulk RNA测序之间的技术差异进行补偿 | 主要针对脑组织数据,在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 提高使用单核RNA测序参考数据时脑组织细胞类型反卷积的准确性 | 人类脑组织bulk RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单核RNA测序, bulk RNA测序 | DeTREM(基于MuSiC的改进算法) | 基因表达数据 | 模拟和真实人类脑组织数据集 | NA | single-nuclei RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
3813 | 2025-10-06 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T antitumor immunity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01571-5
PMID:37500885
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研究论文 | 通过融合CTLA-4胞质尾区增强CAR-T细胞的抗肿瘤免疫活性 | 利用CTLA-4胞质尾区的内吞特性重新编程CAR功能,显著提升CAR-T细胞在体内的抗肿瘤效果 | 研究主要聚焦于白血病模型,尚未验证在其他肿瘤类型中的适用性 | 改善CAR-T细胞疗法在肿瘤治疗中的疗效和持久性 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T) | 免疫工程 | 白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | CAR-T细胞工程模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3814 | 2025-10-06 |
Disease-associated astrocytes and microglia markers are upregulated in mice fed high fat diet
2023-08-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39890-0
PMID:37558676
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研究论文 | 本研究通过分析高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的基因表达数据,揭示了肥胖、糖尿病与阿尔茨海默症之间的新联系 | 首次发现C4b基因在高脂饮食和阿尔茨海默症中共同上调,并证明其在星形胶质细胞中特异性表达,可能作为肥胖或糖尿病患者早期阿尔茨海默症的潜在标志物 | 研究主要基于小鼠模型和已有数据库,需要进一步人类样本验证 | 探索高脂饮食与阿尔茨海默症发病机制之间的分子联系 | 高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默症 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
3815 | 2025-10-06 |
An Atlas of the Developing Drosophila Visual System Glia and Subcellular mRNA Localization of Transcripts in Single Cells
2023-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.06.552169
PMID:37609218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了果蝇视觉系统胶质细胞发育图谱,并鉴定了亚细胞mRNA定位模式 | 首次在发育中的果蝇视觉系统中全面注释胶质细胞类型,并开发计算方法识别细胞体和细胞突触中特异性定位的mRNA | 研究仅限于果蝇视觉系统胶质细胞,未涉及其他神经系统区域 | 理解胶质细胞的发育轨迹和功能多样性 | 果蝇视觉系统胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞mRNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据 | 发育过程中从幼虫到成虫阶段的果蝇视觉系统胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3816 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Subclusters with Inflammatory Fibroblast Responses in Localized Scleroderma
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24129796
PMID:37372943
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别局限性硬皮病中具有炎症性成纤维细胞反应的亚群 | 首次在局限性硬皮病中鉴定出12个成纤维细胞亚群,发现独特的CXCL2/IRF1炎症亚群和具有CXCL9/10/11表达的肌成纤维细胞样亚群 | 样本量有限(14例患者),主要依赖皮肤组织分析 | 探究局限性硬皮病的成纤维细胞异质性和炎症反应机制 | 局限性硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例局限性硬皮病患者(儿童和成人)和14例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3817 | 2025-10-06 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用促进过敏性肺部炎症消退的机制 | 首次发现CCL26-CXCR1通路在嗜酸性过敏性肺部炎症消退中的关键作用,并阐明其通过诱导C1q分泌促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、生物物理和免疫学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发前后BAL样本、小鼠过敏性肺部炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3818 | 2025-10-06 |
A single-cell gene expression atlas of human follicular aspirates: Identification of leukocyte subpopulations and their paracrine factors
2023-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201746RR
PMID:36934419
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类卵泡抽吸物基因表达图谱,鉴定白细胞亚群及其旁分泌因子 | 首次在人类排卵期卵泡中系统鉴定10个白细胞亚群,并揭示其通过分泌因子调控颗粒细胞功能的机制 | 样本量较小(仅4名IVF患者),需要在更大群体中验证 | 研究人类排卵期卵泡中白细胞亚群及其与卵泡细胞的相互作用机制 | 人类卵泡抽吸物中的细胞群体 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析 | 单细胞转录组数据 | 4名IVF患者的卵泡抽吸物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3819 | 2025-10-06 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析磷酸化蛋白质、染色质可及性和基因表达 | 首次实现了在单细胞水平整合磷酸化蛋白质、染色质可及性和转录组的多模态分析,通过简化的抗体偶联方法创建大型定制抗体panel | NA | 开发能够同时分析细胞信号状态与其他分子模态的集成单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞多组学分析 | 桥接整合 | 单细胞多模态数据 | 细胞系、iPSCs和脑类器官样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 整合scATAC-seq和scRNA-seq数据集的多模态分析平台 |
3820 | 2025-10-06 |
CPA-Perturb-seq: Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2023-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527751
PMID:36798324
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研究论文 | 开发了CPA-Perturb-seq方法,通过多重单细胞扰动筛选研究多聚腺苷酸化调控机制 | 首次将多重扰动筛选与3'单细胞RNA测序结合,开发了APARENT-Perturb深度学习模型解析调控代码 | 仅研究了42个已知CPA调控因子,可能遗漏其他重要调控因子 | 理解多聚腺苷酸化调控蛋白如何控制polyA位点选择 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化调控机制 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,深度学习 | 多任务深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42个CPA调控因子的多重扰动筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |