单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 3801 - 3820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3801 | 2025-02-08 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并表征了三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群 | 首次在三阴性犬乳腺癌中识别出免疫抑制亚群，并揭示了其通过抗炎和M2样巨噬细胞等机制促进免疫逃逸的潜在途径 | 研究依赖于已发布的单细胞RNA测序数据集，样本量较小（30只犬），可能限制了结果的普适性 | 识别和表征三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群，以揭示其免疫逃逸机制 | 三阴性犬乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只犬的样本 |
| 3802 | 2025-02-08 |
A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619
PMID:39906744
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研究论文 | 本研究评估了新一代BTK抑制剂zanubrutinib在SARS-CoV-2感染并伴有呼吸窘迫的住院患者中的疗效和免疫生物标志物 | 首次在COVID-19呼吸窘迫患者中评估zanubrutinib的疗效，并进行了单细胞转录组分析以研究其对免疫反应的影响 | zanubrutinib在临床恢复方面未显示出优于安慰剂的效果，可能与大多数患者同时使用类固醇和抗病毒治疗有关 | 评估zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫患者中的疗效及其对免疫反应的影响 | SARS-CoV-2感染并伴有呼吸窘迫的住院患者 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 临床数据和生物标志物数据 | 63名患者（队列1：30名zanubrutinib，33名安慰剂；队列2：4名zanubrutinib） |
| 3803 | 2025-02-08 |
Immune regulatory genes impact the hot/cold tumor microenvironment, affecting cancer treatment and patient outcomes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382842
PMID:39911580
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研究论文 | 本研究通过分析33种不同类型癌症的免疫组成，区分了热肿瘤和冷肿瘤，并识别了调节肿瘤微环境的关键基因，提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的潜在药物 | 开发了一个框架来区分不同癌症类型中的临床显著免疫亚型，并识别了将冷肿瘤转化为热肿瘤的潜在药物 | 尚未就热/冷肿瘤的临床相关定义达成共识，且免疫基因对热/冷肿瘤形成的影响仍知之甚少 | 研究免疫调节基因对热/冷肿瘤微环境的影响，以提高癌症治疗效果和患者预后 | 33种不同类型癌症的肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | CIBERSORT算法、单细胞RNA测序、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、免疫组化数据 | 33种不同类型癌症的肿瘤样本 |
| 3804 | 2025-02-08 |
Idiopathic subglottic stenosis arises at the epithelial interface of host and pathogen
2023-May-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2945067/v1
PMID:37292825
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了特发性声门下狭窄（iSGS）的发病机制，揭示了上皮细胞变化与微生物群位移、免疫激活和局部纤维化之间的关系 | 首次利用单细胞RNA测序技术对iSGS患者的近端气道瘢痕进行无偏倚的细胞亚群表征，并详细描述了其分子表型，揭示了上皮细胞变化与微生物群位移、免疫激活和局部纤维化之间的关系 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛限制了iSGS发病机制的实质性机制研究 | 研究特发性声门下狭窄（iSGS）的发病机制 | 特发性声门下狭窄（iSGS）患者的近端气道瘢痕组织 | 生物医学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 国际iSGS患者队列的致病性黏膜样本 |
| 3805 | 2025-02-08 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both tendon fibrosis and regeneration following acute injury
2023-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
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研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，识别了一种源自腱外膜的双向祖细胞群，该细胞群在急性肌腱损伤后既参与腱周纤维化，也参与肌腱的再生愈合 | 首次识别出一种源自腱外膜的双向祖细胞群，并揭示了其在肌腱损伤愈合过程中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩展 | 探索肌腱损伤愈合过程中细胞群的作用，以改善肌腱愈合的治疗方法 | 小鼠和人类的腱外膜细胞及腱周纤维化组织 | 生物医学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类腱周纤维化组织样本 |
| 3806 | 2025-02-07 |
scRecover: Discriminating True and False Zeros in Single-Cell RNA-Seq Data for Imputation
2025-Feb-28, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10334
PMID:39912305
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研究论文 | 本文介绍了一种新的统计框架scRecover，用于区分单细胞RNA测序数据中的真实零值和假零值，并仅对假零值进行插补 | 提出了一种新的统计框架，能够有效区分单细胞RNA测序数据中的真实零值和假零值，并开发了新的插补工具scRecover | NA | 提高单细胞RNA测序数据中零值的区分和插补准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项模型，Good和Toulmin模型的修改版 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3807 | 2025-02-07 |
Emerging technologies of single-cell multi-omics
2025-Feb-06, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282557
PMID:39911109
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术的最新进展，包括其原理、历史发展以及不断扩展的多组学工具 | 单细胞多组学技术能够直接测量每个细胞的个体信号，显著增强了揭示细胞异质性的能力 | NA | 为研究者选择最适合其研究需求的单细胞多组学平台提供指导 | 正常和恶性造血系统中的遗传克隆性和转录异质性 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 3808 | 2025-02-07 |
The use of deidentified organ donor testes for research
2025-Feb-06, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70008
PMID:39912553
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综述 | 本文讨论了使用去识别化的人类睾丸捐赠组织进行基础科学研究的情况 | 强调了使用去识别化的人类睾丸捐赠组织进行研究的价值，特别是在人类睾丸发育和功能研究中的独特优势 | 使用去识别化的人类睾丸捐赠组织可能面临伦理和获取难度的问题 | 探讨人类睾丸发育和功能，以改进不育症的治疗和诊断 | 去识别化的人类睾丸捐赠组织 | 生殖医学 | 不育症 | 单细胞转录组和表观基因组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 3809 | 2025-02-07 |
An inducible mouse model of OI type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C > T mutation
2025-Feb-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
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研究论文 | 本文开发了一种可诱导的小鼠模型，用于研究由Ifitm5 c.-14C>T突变引起的V型成骨不全症的病理机制 | 开发了一种新的可诱导小鼠模型，能够在不同发育阶段通过Cre表达来探索MALEP-IFITM5蛋白的致病效应 | 尽管模型解决了胚胎致死性问题，但仍需进一步研究以全面理解MALEP-IFITM5的分子机制 | 探索V型成骨不全症的病理机制，特别是由Ifitm5 c.-14C>T突变引起的异常成骨 | 可诱导的Ifitm5flox c.-14C>T小鼠模型 | 分子生物学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多种Cre表达的小鼠模型 |
| 3810 | 2025-02-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Feb-05, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
|
研究论文 | 本文研究了染色体18q缺失如何影响人类胚胎干细胞（hESCs）向视网膜祖细胞分化的能力，并探讨了TGFβ信号通路在此过程中的作用 | 首次揭示了18q缺失通过影响TGFβ信号通路，导致hESCs在前后神经外胚层命运决定中的异常 | 研究仅限于实验室条件下的hESCs，未涉及体内环境或临床样本 | 探究染色体异常对hESCs分化能力的影响，特别是18q缺失对神经外胚层命运决定的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具有复杂核型的hESCs细胞系 |
| 3811 | 2025-02-07 |
SCovid v2.0: a comprehensive resource to decipher the molecular characteristics across tissues in COVID-19 and other human coronaviruses
2025-Feb-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01933-24
PMID:39714149
|
研究论文 | SCovid v2.0是一个更新的数据库，旨在通过转录组测序帮助研究人员揭示2019冠状病毒病（COVID-19）在不同组织中的分子特征 | SCovid v2.0相较于其前身，增加了全面的数据、实用的功能，并重建了分析流程，包括更多的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，以及与其他人类冠状病毒的比较分析 | NA | 揭示COVID-19在不同组织中的分子特征，并进行与其他人类冠状病毒的比较分析 | COVID-19及其他人类冠状病毒的分子特征 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3,544,360个细胞来自45个单细胞RNA测序数据集，涵盖15个组织的789个样本；1,688个样本来自12个组织的62个COVID-19批量RNA测序数据；7个与其他人类冠状病毒相关的批量RNA测序数据集 |
| 3812 | 2025-02-07 |
Immune microenvironment spatial landscapes of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03889-3
PMID:39901202
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中三级淋巴结构（TLS）对免疫微环境的影响及其预后价值 | 通过多光谱荧光成像和单细胞转录组分析，揭示了TLS在胃癌免疫微环境中的空间分布和细胞间相互作用 | 样本量相对较小，特别是单细胞转录组分析仅涉及12个样本 | 研究胃癌中TLS对免疫微环境的影响及其预后价值 | 59名接受免疫治疗的胃癌患者和110名胃癌患者的免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 胃癌 | 多光谱荧光成像、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | NA | 图像、转录组数据 | 59名接受免疫治疗的胃癌患者和110名胃癌患者的免疫细胞浸润情况，单细胞转录组分析涉及12个样本 |
| 3813 | 2025-02-06 |
O-GlcNAcylation attenuates ischemia-reperfusion-induced pulmonary epithelial cell ferroptosis via the Nrf2/G6PDH pathway
2025-Feb-04, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02126-w
PMID:39901237
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAcylation通过Nrf2/G6PDH通路减少肺上皮细胞铁死亡的作用 | 揭示了O-GlcNAcylation通过Nrf2/G6PDH通路减少铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床应用的直接证据尚需进一步验证 | 探索O-GlcNAcylation在减少肺缺血再灌注损伤引起的铁死亡中的作用 | 肺上皮细胞 | 生物医学 | 肺损伤 | 单细胞测序、蛋白质组学分析、染色质免疫沉淀（ChIP）实验、双荧光素酶报告实验 | Ogt1条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征（ALI/ARDS）患者的肺上皮细胞、Ogt1条件性敲除小鼠、缺氧/复氧（H/R）损伤诱导的TC-1细胞 |
| 3814 | 2025-02-07 |
Cotton2035: From genomics research to optimized breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.010
PMID:39844464
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研究论文 | 本文探讨了从棉花基因组学研究到优化育种的进展，强调了基因组信息存储和表达的时空调控机制的重要性 | 提出了棉花ENCODE项目，旨在系统解码棉花基因组中的功能元件和调控网络，并强调了单细胞测序和高分辨率时空组学技术的重要性 | 未具体提及研究的局限性 | 实现从棉花基因组学到育种的转化（G2B），以优化棉花育种策略 | 棉花（Gossypium）的野生和栽培品种 | 基因组学 | NA | 单细胞测序、高分辨率时空组学、基因组编辑工具、人工智能 | NA | 基因组数据、多组学数据 | 多种棉花种群的重测序数据 |
| 3815 | 2025-02-07 |
Single-cell sequencing provides clues about the developmental genetic basis of evolutionary adaptations in syngnathid fishes
2025-Feb-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97764
PMID:39898521
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了海马、海龙和海马鱼等鱼类进化适应性的发育遗传基础 | 首次创建了海湾海马鱼胚胎的单细胞RNA测序图谱，揭示了其头部形状、无齿、皮肤盔甲和雄性怀孕等特征的发育遗传机制 | 研究仅限于海湾海马鱼，未来需要跨多个物种和发育阶段的研究来全面理解这些鱼类的进化创新 | 探索海马、海龙和海马鱼等鱼类进化适应性的发育遗传基础 | 海湾海马鱼胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 海湾海马鱼胚胎 |
| 3816 | 2025-02-07 |
Development of a prognostic model based on four genes related to exhausted CD8+ T cell in triple-negative breast cancer patients: a comprehensive analysis integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-Feb-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01812-z
PMID:39899181
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研究论文 | 本研究旨在开发基于与耗竭CD8+ T细胞相关的四个基因的三阴性乳腺癌（TNBC）预后模型，并探讨其临床和免疫相关性 | 通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，筛选出与TNBC患者生存显著相关的四个基因，构建了一个新的预后模型 | 研究主要依赖于公开数据集，缺乏独立的外部验证队列 | 开发一个基于耗竭CD8+ T细胞相关基因的TNBC预后模型，并评估其临床和免疫相关性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | TCGA队列和外部队列的TNBC患者数据 |
| 3817 | 2025-02-07 |
Optimized gene transduction in human lung organoids: A high-efficiency method for advanced research applications
2025-Feb-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07461-w
PMID:39900972
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的人类肺类器官基因转导方法，提高了转导效率，为肺研究和疾病模型研究提供了有力工具 | 通过物理破坏类器官增加表面积，并结合旋转接种法施加剪切力，显著提高了慢病毒载体在人类iPSC来源肺类器官中的转导效率 | NA | 优化人类iPSC来源肺类器官的基因转导方法，以研究肺发育和疾病模型中的特定细胞和分子机制 | 人类iPSC来源的肺类器官 | 生物医学工程 | NA | 慢病毒载体转导、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因和蛋白质表达数据 | NA |
| 3818 | 2025-02-07 |
SELP+ TEC:CD8+ T cell crosstalk associates with improved radiotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Feb-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02244-7
PMID:39901166
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研究论文 | 本研究探讨了P-选择素（SELP）在宫颈癌（CC）肿瘤内皮细胞中的表达及其与放疗效果的关系 | 首次揭示了SELP在肿瘤内皮细胞中的表达与CD8 T细胞通过ACKR1-CCL5轴的相互作用，从而增强放疗效果 | 研究样本量有限，且机制研究仍需进一步验证 | 探讨SELP在宫颈癌中的表达及其对放疗效果的影响 | 205名接受放疗的宫颈癌患者的肿瘤组织样本，42,159个细胞的单细胞RNA测序数据，以及187名接受放疗的患者的批量RNA测序数据 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 205名宫颈癌患者的肿瘤组织样本，42,159个细胞的单细胞RNA测序数据，187名患者的批量RNA测序数据 |
| 3819 | 2025-02-07 |
EMT-driven plasticity prospectively increases cell-cell variability to promote therapeutic adaptation in breast cancer
2025-Feb-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03637-w
PMID:39901189
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研究论文 | 本文研究了上皮-间质转化（EMT）驱动的细胞可塑性在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗适应中的作用 | 首次揭示了EMT驱动的可塑性如何增加细胞间表型多样性，并在化疗前产生罕见的预适应状态 | 研究仅基于体外模型，未涉及体内环境 | 探讨EMT驱动的可塑性在TNBC治疗适应中的作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个TNBC体外模型 |
| 3820 | 2025-02-07 |
Oxygen-dependent alternative mRNA splicing and a cone-specific motor protein revealed by single-cell RNA sequencing in hypoxic retinas
2025-Feb, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110190
PMID:39638278
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了缺氧条件下小鼠视网膜中特定细胞类型的反应，揭示了氧依赖的mRNA选择性剪接和锥体特异性运动蛋白Kif4的表达 | 首次在缺氧视网膜中发现了锥体特异性运动蛋白Kif4的强烈诱导表达，并揭示了RNA结合蛋白Rbm3和Cirbp在缺氧条件下的异构体转换 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类视网膜的缺氧反应 | 理解特定视网膜细胞类型在缺氧条件下的反应机制 | 小鼠视网膜细胞 | 单细胞RNA测序 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠视网膜细胞 |