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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3781 | 2025-10-06 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用促进过敏性肺部炎症消退的机制 | 首次发现CCL26-CXCR1通路在嗜酸性过敏性肺部炎症消退中的关键作用,并阐明其通过诱导C1q分泌促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、生物物理和免疫学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发前后BAL样本、小鼠过敏性肺部炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3782 | 2025-10-06 |
A single-cell gene expression atlas of human follicular aspirates: Identification of leukocyte subpopulations and their paracrine factors
2023-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201746RR
PMID:36934419
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类卵泡抽吸物基因表达图谱,鉴定白细胞亚群及其旁分泌因子 | 首次在人类排卵期卵泡中系统鉴定10个白细胞亚群,并揭示其通过分泌因子调控颗粒细胞功能的机制 | 样本量较小(仅4名IVF患者),需要在更大群体中验证 | 研究人类排卵期卵泡中白细胞亚群及其与卵泡细胞的相互作用机制 | 人类卵泡抽吸物中的细胞群体 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析 | 单细胞转录组数据 | 4名IVF患者的卵泡抽吸物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3783 | 2025-10-06 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析磷酸化蛋白质、染色质可及性和基因表达 | 首次实现了在单细胞水平整合磷酸化蛋白质、染色质可及性和转录组的多模态分析,通过简化的抗体偶联方法创建大型定制抗体panel | NA | 开发能够同时分析细胞信号状态与其他分子模态的集成单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞多组学分析 | 桥接整合 | 单细胞多模态数据 | 细胞系、iPSCs和脑类器官样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 整合scATAC-seq和scRNA-seq数据集的多模态分析平台 |
3784 | 2025-10-06 |
CPA-Perturb-seq: Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2023-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527751
PMID:36798324
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研究论文 | 开发了CPA-Perturb-seq方法,通过多重单细胞扰动筛选研究多聚腺苷酸化调控机制 | 首次将多重扰动筛选与3'单细胞RNA测序结合,开发了APARENT-Perturb深度学习模型解析调控代码 | 仅研究了42个已知CPA调控因子,可能遗漏其他重要调控因子 | 理解多聚腺苷酸化调控蛋白如何控制polyA位点选择 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化调控机制 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,深度学习 | 多任务深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42个CPA调控因子的多重扰动筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |
3785 | 2025-10-06 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
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研究论文 | 本研究发现在胶质母细胞瘤中免疫检查点抑制剂会诱发脑水肿,而血管紧张素受体阻滞剂氯沙坦可预防此类水肿并改善生存率 | 首次揭示免疫检查点抑制剂引起脑水肿的机制,并发现氯沙坦可作为替代皮质类固醇的有效治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤失败的原因及解决方案 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及部分患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,活体成像,CD8 T细胞阻断研究 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3786 | 2025-10-06 |
Neonatal hyperoxia induces activated pulmonary cellular states and sex-dependent transcriptomic changes in a model of experimental bronchopulmonary dysplasia
2023-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00252.2022
PMID:36537711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究高氧暴露对新生小鼠肺发育的影响及其性别依赖性分子机制 | 首次发现高氧诱导产生损伤相关短暂祖细胞(DATPs)和新型AT1细胞亚群,并揭示性别特异性肺再生反应差异 | 动物模型研究结果需在人类临床样本中进一步验证 | 探究高氧暴露在支气管肺发育不良中的性别依赖性分子和细胞编程机制 | 新生小鼠肺组织及人类新生儿肺细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3787 | 2025-10-06 |
Aging compromises human islet beta cell function and identity by decreasing transcription factor activity and inducing ER stress
2022-Oct-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo3932
PMID:36197983
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了衰老导致人类胰岛β细胞功能衰退和身份特征改变的分子机制 | 首次系统揭示衰老过程中β细胞转录因子网络重组、内质网应激激活与细胞功能衰退的关联机制 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证因果关系 | 探究衰老对人类胰岛β细胞功能和分子特征的影响 | 非糖尿病供体的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 转录因子调控网络分析, 高分辨率共聚焦显微镜, 胰岛素分泌检测 | NA | 单细胞转录组数据, 显微镜图像, 生理功能数据 | 覆盖人类大部分生命周期的非糖尿病供体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3788 | 2025-10-06 |
Temporal transcriptomic analysis using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation in severe COVID-19
2022-04-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.157255
PMID:35175937
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研究论文 | 开发了TrendCatcher R软件包用于识别和可视化时间序列转录组数据中的动态基因表达模式和生物过程 | 开发了新的开源工具TrendCatcher,能够识别动态差异表达基因的不同时间模式并可视化生物学通路的时间进程 | NA | 开发时间序列转录组数据分析工具并应用于COVID-19研究 | COVID-19患者外周血转录组数据 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型, 断点搜索策略 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
3789 | 2025-10-06 |
Network inference with Granger causality ensembles on single-cell transcriptomics
2022-02-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110333
PMID:35139376
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研究论文 | 提出一种基于Granger因果关系集成学习的单细胞转录组基因调控网络推断算法SINGE | 使用基于核的Granger因果关系回归处理不规则伪时间序列,并通过集成回归分析聚合预测结果 | 对个别调控因子表现不佳,且对无信息量的伪时间序列敏感 | 从有序单细胞基因表达数据推断基因调控网络 | 小鼠胚胎干细胞分化过程中的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Granger因果关系回归,集成学习 | 单细胞基因表达数据 | 两个小鼠胚胎干细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3790 | 2025-10-06 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了子宫蜕膜中MAIT细胞的独特转录编程特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了子宫蜕膜与匹配外周血MAIT细胞的转录组差异,并证实了蜕膜APCs表达MR1分子 | 样本来源仅限于子宫蜕膜组织,未涉及其他妊娠相关组织;功能验证主要基于体外刺激实验 | 探究妊娠期子宫蜕膜中MAIT细胞的转录编程特征和功能特性 | 子宫蜕膜基底層和壁層的单核细胞及匹配的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 多组学分析,流式细胞术,CITE-seq,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 子宫蜕膜组织和匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,表位测序 | NA | CITE-seq结合单细胞RNA测序基因表达分析 |
3791 | 2025-10-06 |
Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury
2021-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147703
PMID:34003797
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞测序技术,揭示了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞相互作用的时空分布特征 | 首次优化了空间转录组学与单核测序数据的协调分析,将30种主要细胞类型定位到人类肾切除标本中,并在两种小鼠AKI模型中发现了免疫细胞浸润的空间特异性机制 | 研究仅基于人类肾切除标本和两种小鼠AKI模型,需要进一步验证其在其他肾脏疾病中的普适性 | 探索急性肾损伤中细胞类型空间分布特征及免疫细胞浸润机制 | 人类肾切除标本、小鼠缺血/再灌注损伤模型、盲肠结扎穿刺模型 | 空间转录组学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞测序, CODEX免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 人类肾切除标本1例,两种小鼠AKI模型 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
3792 | 2025-10-06 |
CRABP2 promotes peritoneal metastasis in CRC through TGF-β/Smad-mediated EMT signaling and invadopodia formation
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111927
PMID:40505846
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研究论文 | 本研究探讨CRABP2通过TGF-β/Smad介导的上皮间质转化信号和侵袭伪足形成促进结直肠癌腹膜转移的机制 | 首次揭示CRABP2作为腹膜转移相关基因通过调控侵袭伪足形成和EMT信号通路促进结直肠癌转移的新机制 | CRABP2在腹膜转移中的具体调控网络仍需进一步验证 | 阐明CRABP2在结直肠癌腹膜转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞和患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3793 | 2025-10-06 |
Identification of lactylation-related hub genes as novel therapeutic and diagnostic targets for thoracic aortic dissection
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111944
PMID:40527360
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研究论文 | 本研究通过鉴定乳酸化相关枢纽基因,探索其在胸主动脉夹层中的治疗和诊断价值 | 首次系统研究乳酸化修饰在胸主动脉夹层中的作用,发现12个乳酸化相关枢纽基因并验证LDHA抑制剂的有效性 | 研究主要基于数据库分析和动物模型,需要进一步临床验证 | 探索乳酸化修饰在胸主动脉夹层发病机制中的作用并寻找新的治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者组织样本和BAPN诱导的小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ROC分析, WGCNA | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 人类主动脉组织和BAPN诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3794 | 2025-10-06 |
Rab27a+CAF exosomal miR-9-5p promotes osteosarcoma progression via CREBRF/MAPK signaling pathway
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111964
PMID:40581265
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研究论文 | 本研究揭示了Rab27a+癌相关成纤维细胞通过外泌体miR-9-5p抑制CREBRF并激活MAPK信号通路促进骨肉瘤进展的新机制 | 首次发现Rab27a+CAF来源的外泌体miR-9-5p通过CREBRF/MAPK信号轴调控骨肉瘤恶性进展和化疗耐药 | 研究主要聚焦于miR-9-5p/CREBRF/MAPK轴,可能存在其他未被探索的调控机制 | 探究癌相关成纤维细胞外泌体miRNA在骨肉瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者血清和组织样本、骨肉瘤细胞系、小鼠皮下移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 小RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR、双荧光素酶报告基因检测、CCK8、Edu染色、细胞周期分析、细胞凋亡检测 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、功能实验数据 | 骨肉瘤患者血清和组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序,小RNA测序 | NA | NA |
3795 | 2025-10-06 |
Amorphous calcium zinc phosphate promotes macrophage-driven alveolar bone regeneration via modulation of energy metabolism and mitochondrial homeostasis
2025-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.053
PMID:40677756
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研究论文 | 本研究开发了无定形钙锌磷酸盐纳米颗粒并通过调节巨噬细胞能量代谢促进牙槽骨再生 | 首次发现ACZP材料通过抑制IP3R/MCU通路、调节内质网-线粒体耦联和能量代谢方式(糖酵解向氧化磷酸化转换)来增强巨噬细胞的抗炎表型极化 | 研究仅在新西兰白兔模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 探索钙磷酸盐材料促进骨形成的免疫调节机制并开发新型骨再生材料 | 巨噬细胞和新西兰白兔的牙槽骨缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 牙槽骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新西兰白兔牙槽骨缺损模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3796 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cells promote salivary adenoid cystic carcinoma stem-like reprogramming via IGF2/IGF1R induced histone H3 lysine 18 lactylation
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217847
PMID:40466903
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关雪旺细胞通过IGF2/IGF1R信号轴诱导组蛋白H3K18乳酸化修饰,促进唾液腺腺样囊性癌干细胞样重编程的分子机制 | 首次发现TA-SCs通过旁分泌IGF2信号提升组蛋白乳酸化水平,并阐明IGF2/IGF1R-H3K18la轴在SACC干细胞样重编程中的关键作用 | TA-SCs重编程的具体分子通路细节仍需进一步探索,临床转化潜力有待验证 | 探究肿瘤相关雪旺细胞在唾液腺腺样囊性癌进展和干细胞样重编程中的功能机制 | 唾液腺腺样囊性癌肿瘤微环境中的雪旺细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤微环境研究 | 唾液腺腺样囊性癌 | 组织透明化三维成像, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 图像数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3797 | 2025-10-06 |
Dynamic evolution of venetoclax resistance in acute myeloid leukemia unveiled by longitudinal single-cell RNA-seq
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217853
PMID:40482912
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示急性髓系白血病中venetoclax耐药的动态演化过程 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘venetoclax治疗期间骨髓微环境重塑的动态过程,发现两种关键耐药机制并建立预后预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 研究急性髓系白血病患者对venetoclax治疗的耐药机制和骨髓微环境动态变化 | 接受DAV方案治疗的急性髓系白血病患者骨髓标本 | 单细胞测序分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | AML患者治疗前后配对骨髓标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3798 | 2025-10-06 |
Characterizing chromosome instability reveals its association with lipid-associated macrophages and clonal evolution of lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217874
PMID:40516322
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 首次发现染色体不稳定性通过易错DNA双链断裂修复途径与脂质相关巨噬细胞形成新型关联,促进淋巴结转移 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 探究染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用及机制 | 食管鳞癌患者组织样本、类器官模型及淋巴结转移灶 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 基因组测序, 空间蛋白质分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 食管鳞癌临床标本及类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3799 | 2025-10-06 |
The role of tumor microenvironment and immune cell crosstalk in triple-negative breast cancer (TNBC): Emerging therapeutic opportunities
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217865
PMID:40516902
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综述 | 本综述整合了三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞相互作用的研究现状,探讨新兴治疗机遇 | 系统阐述TME中T细胞异质性、Tregs免疫抑制机制、MUC1-C/CXCL9调控作用及空间分析在预测复发中的价值 | 未涉及具体临床实验数据验证,主要基于现有研究文献整合分析 | 探索三阴性乳腺癌肿瘤微环境与免疫细胞互作的机制及治疗靶点 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境组成成分及免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
3800 | 2025-10-06 |
Targeting the cholinergic-astrocyte axis: A novel strategy for brain metastasis prevention in lung adenocarcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217870
PMID:40516905
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研究论文 | 本研究揭示了胆碱能代谢-星形胶质细胞轴在肺腺癌脑转移中的作用机制,并提出多奈哌齐作为预防脑转移的潜在治疗策略 | 首次发现胆碱能代谢激活是肺腺癌脑转移的特征性标志,并阐明乙酰胆碱酯酶通过免疫抑制和血脑屏障破坏的双重促转移机制 | 样本量相对有限,需要更大规模临床试验验证多奈哌齐的预防效果 | 探索肺腺癌脑转移的发病机制并开发预防策略 | 肺腺癌患者肿瘤组织和脑转移灶 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,组织芯片,体外实验 | NA | 基因表达数据,组织样本 | 875例RNA测序病例,280例组织芯片验证,26个脑转移灶和8个正常脑组织单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |