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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 3781 - 3800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3781 | 2025-10-06 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨CXCR4在牙周炎中调控中性粒细胞动态的关键作用 | 首次系统揭示CXCR4通过调控中性粒细胞动态参与牙周炎发病的新机制 | 研究样本量有限，具体分子机制仍需进一步验证 | 鉴定牙周炎关键免疫相关致病基因并分析免疫细胞浸润特征 | 牙周组织转录组数据、临床样本和牙周炎小鼠模型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,蛋白互作网络分析 | LASSO回归模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3782 | 2025-10-06 |
GeneSurfer Enables Transcriptome-wide Exploration and Functional Annotation of Gene Co-expression Modules in 3D Spatial Transcriptomics Data
2024-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602230
PMID:39005368
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研究论文 | 介绍GeneSurfer交互式工具，用于探索3D空间转录组数据中的基因共表达模块 | 开发首个用于大规模数据集局部基因共表达探索性分析的交互式界面，支持转录组范围的基因过滤、聚类和功能注释 | NA | 开发工具探索3D空间转录组数据中的局部基因共表达模式 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3783 | 2025-10-06 |
Integration analysis of cell division cycle-associated family genes revealed potential mechanisms of gliomagenesis and constructed an artificial intelligence-driven prognostic signature
2024-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111168
PMID:38599441
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研究论文 | 本研究通过整合分析细胞分裂周期相关基因家族，揭示了胶质瘤发生的潜在机制并构建了人工智能驱动的预后特征 | 首次系统研究CDCA基因家族在胶质瘤中的作用，结合多组学分析和机器学习算法构建预后模型 | NA | 阐明CDCA基因家族成员在胶质瘤中的功能和作用机制 | 胶质瘤患者和胶质瘤细胞 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序，生物信息学分析 | 无监督聚类算法，十种机器学习算法 | 多组学数据 | 八个胶质瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | NA |
| 3784 | 2025-10-06 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究通过发现MAP3K1基因的新型隐性变异与人类非综合征性耳聋DFNB128的关联，并利用小鼠模型验证其功能 | 首次发现MAP3K1基因隐性变异导致人类非综合征性耳聋，并通过计算模型预测其结构改变与表型的关系 | 研究仅基于一个近亲巴基斯坦家系，样本量有限 | 鉴定导致罕见形式耳聋的新致病基因 | 巴基斯坦近亲家系中的耳聋患者和小鼠耳蜗细胞 | 遗传学 | 耳聋 | 微阵列芯片, 外显子组测序, 单细胞转录组测序 | 计算结构建模 | 基因组数据, 转录组数据 | 一个巴基斯坦家系中的两个同胞群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3785 | 2025-10-06 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示癌细胞对羟氯喹耐药的自噬无关转录机制 | 发现羟氯喹耐药主要通过转录可塑性而非自噬途径实现，识别了糖酵解、外泌作用和染色体凝聚/分离等新耐药机制 | 研究仅使用OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞两种细胞系，样本规模有限 | 探究癌细胞对羟氯喹耐药的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌,结直肠癌 | 全基因组筛选,正向遗传筛选,反向遗传筛选,CRISPR-Cas9,RNA-seq,外显子组测序,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 两种癌细胞系，经过15次药物脉冲追踪处理 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 3786 | 2025-10-06 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 开发了一种名为niche-DE的空间转录组数据分析方法，用于识别细胞类型特异性空间生态位相关基因 | 首次提出针对细胞-细胞相互作用驱动的局部基因表达变化的分析方法，并开发了配套的niche-LR方法揭示配体-受体信号机制 | NA | 识别空间转录组数据中由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 适用于低分辨率点阵空间转录组数据以及单细胞或亚细胞分辨率数据 |
| 3787 | 2025-10-06 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠模型中肾淋巴管内皮细胞的基因表达变化 | 首次在高血压模型中系统揭示肾淋巴管内皮细胞的转录组多样性增加和炎症反应特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 评估高血压条件下肾淋巴管内皮细胞的具体变化 | 小鼠肾组织中的CD31+和podoplanin+细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种高血压小鼠模型（血管紧张素II诱导型和盐敏感型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3788 | 2025-10-06 |
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573568
PMID:38234829
|
研究论文 | 开发了用于单细胞转座子元件位点水平分析的工具Stellarscope，并构建了人类PBMC中转座子元件表达的图谱 | 开发了能够将多重比对reads重新分配到特定基因组位点的工具，首次在单细胞水平系统构建了人类转座子元件表达图谱 | NA | 研究转座子元件在人类细胞身份识别中的作用 | 人类外周血单个核细胞(PBMC) | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3789 | 2025-10-06 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示神经发育程序在脑蛛网膜囊肿发病机制中的作用 | 首次采用系统水平的多组学方法整合三重外显子组测序、单细胞RNA测序和自然语言处理数据研究脑蛛网膜囊肿 | 研究结果为初步发现，需要在适当临床背景下进一步验证 | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制 | 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类大脑和小鼠脑膜组织 | 自然语言处理 | 脑蛛网膜囊肿 | 外显子组测序,单细胞RNA测序,自然语言处理 | 无监督聚类 | 基因组数据,转录组数据,医疗记录文本 | 617个患者-父母三重样本,152,898个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 3790 | 2025-10-06 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 | 首次使用基于贴片的scRNA-Seq对稀有再生神经元进行深度测序，发现抗氧化反应和线粒体生物合成在再生中的关键作用，并开发了再生分类器 | 仅对数百个表型鉴定的CST神经元进行测序，样本规模有限 | 探究皮质脊髓神经元再生能力的异质性机制 | 皮质脊髓神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，条件性基因敲除 | 监督分类方法(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的CST神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于贴片的单细胞RNA测序 |
| 3791 | 2025-10-06 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究通过人类扁桃体离体模型探索HIV-1感染在淋巴组织中诱导的特定转录组变化 | 首次在人类扁桃体离体模型中揭示HIV-1感染的CD4+ T细胞氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞的NLRP3炎症小体通路激活 | 研究基于离体模型，可能无法完全反映体内复杂环境；样本来源有限 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其与慢性炎症的关系 | 健康人类供体的扁桃体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康人类供体的扁桃体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3792 | 2025-10-06 |
Generation of human islet cell type-specific identity genesets
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29588-8
PMID:35440614
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学元分析构建人类胰岛细胞类型特异性基因集 | 开发了比现有基因集更能准确定义胰岛细胞身份的新型基因集，并展示了其在追踪细胞身份变化和揭示遗传机制方面的有效性 | NA | 开发可靠工具评估胰岛细胞身份，为基于细胞的糖尿病治疗提供支持 | 人类α细胞、β细胞、γ细胞和δ细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3793 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates type II interferon and chromatin remodeling pathways in immunosuppression of prostate cancer
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2029298
PMID:35127252
|
研究论文 | 本研究揭示MUC1-C蛋白通过整合II型干扰素通路和染色质重塑机制促进前列腺癌免疫抑制 | 首次发现MUC1-C通过调控ARID1A/BAF和NuRD复合物协调II型干扰素通路与染色质重塑的机制关联 | 研究主要基于细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明MUC1-C在前列腺癌免疫抑制中的分子机制 | 去势抵抗性前列腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3794 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates activation of the IFN-γ pathway with suppression of the tumor immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002115
PMID:33495298
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研究论文 | 本研究揭示MUC1-C通过激活IFN-γ通路诱导免疫抑制并导致三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境中CD8+ T细胞耗竭的机制 | 首次发现MUC1-C是TNBC转录组的主调控因子，通过STAT1和IRF1驱动基因表达，并整合免疫抑制性IFN-γ通路激活与肿瘤免疫微环境改变 | 机制研究主要基于细胞系和数据库分析，需要更多体内实验验证；人类TNBC样本的直接实验证据有限 | 探究MUC1-C在三阴性乳腺癌免疫逃避中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库、TNBC单细胞RNA-seq数据集 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | shRNA基因沉默、转录组分析、基因集富集分析、qRT-PCR、免疫印迹、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个TNBC细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库样本、单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3795 | 2025-10-06 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
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研究论文 | 通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点，揭示新的风险基因和调控机制 | 首次通过整合GWAS元分析、表观基因组学和单细胞转录组学方法，识别了8个新的听力困难风险位点，并发现耳蜗上皮细胞在听力损伤中的重要作用 | 研究主要基于英国生物银行的自报听力数据，且动物实验使用小鼠模型，结果向人类转化需进一步验证 | 探索年龄相关性听力损伤的遗传基础和分子机制 | 成人听力困难相关的基因组风险位点和耳蜗细胞 | 基因组学 | 年龄相关性听力损伤 | GWAS元分析, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 最多330,759名英国生物银行参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3796 | 2025-10-06 |
Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma
2020-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0694-x
PMID:31873309
|
研究论文 | 通过免疫分析识别CD73作为胶质母细胞瘤的联合治疗靶点 | 发现胶质母细胞瘤中存在独特的CD73巨噬细胞群体，并证明靶向CD73可增强免疫检查点疗法的抗肿瘤免疫反应 | 研究样本量相对有限（94例患者），且动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证 | 探索肿瘤特异性免疫调节靶点以改善免疫检查点治疗效果 | 94例代表五种不同癌症类型的患者，包括胶质母细胞瘤、前列腺癌和结直肠癌 | 免疫肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,质谱流式细胞数据 | 94例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3797 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics of Pancreatic Cancer Precursors Demonstrates Epithelial and Microenvironmental Heterogeneity as an Early Event in Neoplastic Progression
2019-Apr-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-18-1955
PMID:30385653
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析胰腺癌前病变的异质性特征 | 首次在单细胞水平揭示胰腺癌前病变中上皮细胞和肿瘤微环境的异质性变化 | 样本量较小（仅6个样本），仅包含手术切除标本 | 阐明胰腺导管腺癌前病变向浸润性癌进展过程中的分子变化 | 胰腺导管腺癌前病变（IPMNs）和胰腺导管腺癌组织 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5,403个细胞，来自2个低级别IPMN、2个高级别IPMN和2个PDAC样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 3798 | 2025-10-06 |
HL-BscPF: Hybrid learning facilitates brain cell auto-identification in multiple pathologies
2025-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123751
PMID:40414555
|
研究论文 | 提出混合学习框架HL-BscPF用于脑细胞自动分类和疾病相关通路分析 | 整合ItClust和TOSICA模型，结合自编码器降维和transformer架构提升预测精度 | 未明确说明样本量的具体数值和数据集来源限制 | 开发自动化细胞类型分类方法并揭示脑疾病相关通路 | 脑单细胞转录组数据，涵盖衰老、阿尔茨海默病、术后认知功能障碍和中风等神经病理状态 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, transformer, 混合学习 | 单细胞转录组数据 | 四个脑特异性单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3799 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell sequencing for the development of a GJA4-based precision immuno-prognostic model in melanoma
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102450
PMID:40639089
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据开发了基于GJA4的黑色素瘤精准免疫预后模型 | 首次发现GJA4是肿瘤相关内皮细胞终末亚群的关键标志基因，并构建了基于GJA4的精准预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索肿瘤相关内皮细胞与肿瘤的相互作用机制，开发黑色素瘤精准预后模型 | 黑色素瘤患者、肿瘤相关内皮细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 微阵列 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的黑色素瘤和胶质瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 3800 | 2025-10-06 |
Novel multi-omics analysis revealing metabolic heterogeneity of breast cancer cell and subsequent development of associated prognostic signature
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102444
PMID:40639090
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示乳腺癌细胞的代谢异质性，并开发了相关的预后特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据系统分析乳腺癌代谢异质性，构建了基于代谢特征的预后模型，并验证了PDCD1的致癌作用 | 研究样本量有限，需要在更大规模队列中验证代谢特征的预测效能 | 探究乳腺癌代谢异质性及其与肿瘤微环境的相互作用，开发预后预测工具 | 乳腺癌细胞和患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA,机器学习 | 加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | 多个队列的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |