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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 3781 - 3800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3781 | 2026-01-25 |
An integrative multi-cohort transcriptomic study reveals cell cycle- and adhesion-related hub genes as diagnostic biomarkers for pulmonary arterial hypertension
2026-Jan-13, Advances in biological regulation
DOI:10.1016/j.jbior.2026.101145
PMID:41576688
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，筛选并验证了与肺动脉高压（PAH）相关的枢纽基因，揭示了CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1作为稳健的多基因标志物 | 整合多队列转录组数据与单细胞测序数据集，结合实验验证，首次将CDK1、TPX2、IGF1和VCAM1确立为PAH的稳健多基因诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型，缺乏大规模临床样本的直接验证，且分子机制尚未完全阐明 | 筛选和验证肺动脉高压（PAH）的诊断生物标志物 | 肺动脉高压（PAH）患者和尼古丁诱导的PAH小鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 转录组分析、RT-qPCR、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 四个GEO数据集（GSE117261、GSE24988、GSE53408、GSE113439）和两个单细胞测序数据集（GSE33463、GSE228644），以及尼古丁诱导的PAH小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3782 | 2026-01-25 |
Single-cell RNA analysis reveals unexpected hemocyte plasticity and immune cell specialization in a Drosophila overgrowth model
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698745
PMID:41542540
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇过生长模型中的血细胞，揭示了血细胞的可塑性和免疫细胞的特化 | 发现了13种先前未知的血浆细胞亚型，并识别出表达Jonah家族丝氨酸蛋白酶的高表达基质重塑血浆细胞群体 | 研究基于果蝇模型，结果可能不完全适用于其他生物或人类疾病 | 探究先天免疫细胞如何适应慢性凋亡信号，并解析肿瘤样过生长中的免疫景观 | 果蝇幼虫中的循环和固着血细胞，特别是血浆细胞 | 单细胞转录组学 | 肿瘤样过生长 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 近50,000个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3783 | 2026-01-25 |
Harnessing machine learning-driven multiomics integration: deciphering programmed cell death networks for prognostication and immunotherapy prediction in lung adenocarcinoma
2026-Jan-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10125-4
PMID:41501264
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研究论文 | 本研究通过整合14种程序性细胞死亡（PCD）模式，利用101种机器学习算法组合构建了一个包含7个基因的PCD特征，用于预测肺腺癌（LUAD）患者的预后和免疫治疗效果 | 首次整合多种PCD模式，并应用101种机器学习算法组合构建PCD特征，结合多组学数据（包括bulk RNA-seq和scRNA-seq）和mIHC验证，揭示了PCD特征与免疫治疗反应的关系，并识别出NAPSA作为新的免疫治疗预测标志物 | 研究主要基于回顾性数据集（如TCGA和GEO），样本量有限（如mIHC验证仅涉及38例患者），且机器学习模型组合虽多但可能未完全覆盖所有潜在算法，需要进一步前瞻性研究验证 | 通过多组学整合和机器学习，解析PCD网络以预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肺腺癌（LUAD）患者，包括来自TCGA、GEO数据库的样本以及接受抗PD-1治疗的38例患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 多重免疫组化（mIHC）, 免疫组化（IHC） | 101种机器学习算法组合 | 基因表达数据（RNA-seq）, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据（mIHC/IHC） | 多个数据集（TCGA和GEO）的样本，以及38例接受抗PD-1治疗的LUAD患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3784 | 2026-01-25 |
Integrated in vivo combinatorial functional genomics and spatial transcriptomics of tumours to decode genotype-to-phenotype relationships
2026-Jan, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01437-1
PMID:40721510
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研究论文 | 本研究开发了PERTURB-CAST和CHOCOLAT-G2P方法，结合空间转录组学与体内功能基因组学，以解析肿瘤中基因型与表型的关系 | 开发了PERTURB-CAST方法，利用RNA模板连接探针和商业10X Visium平台，首次在同一组织切片中整合扰动映射与全转录组表型分析；并提出了CHOCOLAT-G2P框架，用于研究模拟肿瘤异质性的高阶组合扰动 | NA | 解码肿瘤中基因型到表型的关系，并研究组合扰动在组织水平上的表型效应 | 自发性镶嵌性肝肿瘤 | 空间转录组学 | 肝肿瘤 | 空间转录组学，RNA模板连接探针 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 商业10X Visium空间转录组学平台 |
| 3785 | 2026-01-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟，揭示了多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和潜在治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟，系统解析多发性骨髓瘤微环境中的细胞互作和信号通路，并识别新的小分子治疗策略 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能有限，影响结果的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用，以发现治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接模拟 | Seurat, GSVA, 两样本孟德尔随机化 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3786 | 2025-09-09 |
Comments on "Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study"
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003382
PMID:40919925
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3787 | 2026-01-25 |
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003453
PMID:40932351
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了左右半结肠癌免疫微环境的差异，并鉴定出一个与预后不良相关的CASC15+KLK6+上皮亚群 | 首次在单细胞水平系统比较左右半结肠癌的免疫微环境差异，并发现了一个具有高拷贝数变异和恶性通路活性的特异性上皮亚群，其与T细胞、肥大细胞的相互作用通过MIF和CD99信号通路驱动免疫抑制 | 样本量较小（单细胞测序仅6例），验证队列规模有限（70例），且未进行功能性实验验证信号通路的具体机制 | 探究左右半结肠癌免疫微环境的差异及其对临床行为的潜在影响 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat | 单细胞转录组数据，图像数据 | 单细胞测序：3例左半结肠癌和3例右半结肠癌；验证队列：70例患者（30例左半结肠癌，40例右半结肠癌） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3788 | 2026-01-25 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003459
PMID:40932376
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌免疫治疗耐药期间T细胞亚群的调控程序 | 首次在转移性dMMR结直肠癌患者中系统比较了耐药与敏感组的单细胞转录组差异，并识别出TSTR和γδ T细胞的转录网络失调是耐药的核心机制 | 研究主要基于单细胞测序数据的生物信息学分析，缺乏体内外功能实验验证；临床样本量相对有限（190例） | 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 | 转移性DNA错配修复缺陷（dMMR）结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床组织样本 | 190例结直肠癌患者及其配对癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3789 | 2026-01-25 |
Polyethylene terephthalate microplastics exposure enhances the risk of ulcerative colitis: insights from multiomics integration, machine learning, and molecular docking reveal intestinal toxicity mechanisms
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003476
PMID:40981471
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研究论文 | 本研究通过多组学整合、机器学习和分子对接揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯微塑料暴露增加溃疡性结肠炎风险的肠道毒性机制 | 首次整合多组学数据、机器学习算法和分子对接技术，系统性识别了PET-MPs诱导UC的关键靶点基因，并构建了高精度的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据和动物模型，缺乏直接的人类临床验证，且PET-MPs暴露剂量和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 | 探究PET微塑料暴露与溃疡性结肠炎风险增加的分子机制 | PET微塑料、溃疡性结肠炎相关基因靶点、动物模型肠道组织 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 多组学整合、机器学习、分子对接、单细胞测序分析、Western blot | 多种机器学习算法（包括SHAP分析） | 基因表达数据、蛋白质表达数据、分子对接模拟数据 | 未明确具体样本数量，但使用了公共数据库数据和动物模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3790 | 2026-01-25 |
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003561
PMID:41208796
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研究论文 | 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴介导的线粒体生物合成抑制铁死亡，从而缓解主动脉夹层的治疗效果和机制 | 首次揭示了硒代蛋氨酸通过激活PGC-1α/NRF2/TFAM轴抑制铁死亡，从而减轻主动脉夹层的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床转化仍需进一步验证 | 探索硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其潜在分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型和血小板衍生生长因子-BB诱导的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞测序、转录组分析、小干扰RNA敲低技术 | 小鼠模型、细胞模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，涉及小鼠模型和患者VSMCs | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 3791 | 2026-01-25 |
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417721
PMID:41355579
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研究论文 | 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官模拟POLG相关神经退行性疾病，并评估了二甲双胍在恢复线粒体功能和神经发生方面的治疗潜力 | 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中，通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性，并证明二甲双胍能恢复神经元身份、线粒体功能和代谢通路 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；治疗剂量和时间窗口需进一步优化；未涉及长期疗效和潜在副作用评估 | 探究二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生损伤的治疗作用及机制 | POLG患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）皮质类器官 | 神经科学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA-seq，功能测定（线粒体膜电位、质量、氧化应激），钙测量，非靶向代谢组学 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据，功能测定数据，代谢组数据 | 患者来源的iPSC皮质类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3792 | 2026-01-08 |
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02204-5
PMID:41495461
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3793 | 2026-01-25 |
Integrated analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing data reveals potential biomarkers and immune infiltrates associated with N7-methylguanosine in osteoarthritis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003571
PMID:41056007
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞RNA测序数据，揭示了与骨关节炎中N7-甲基鸟苷修饰相关的潜在生物标志物和免疫浸润特征 | 首次在骨关节炎中系统研究m7G修饰的作用，识别了四个关键m7G调节因子作为新型生物标志物，并探索了其与免疫浸润和软骨退化的关系 | 需要进一步实验来阐明骨关节炎的分子机制 | 识别与骨关节炎中m7G修饰相关的基因，并研究其诊断价值和免疫浸润特征 | 骨关节炎患者样本（106个OA样本） | 生物信息学 | 骨关节炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 无监督聚类分析 | RNA测序数据 | 106个骨关节炎样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3794 | 2026-01-25 |
Decoding the triglyceride-glucose index in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: integrative insights from Mendelian randomization, cross-tissue transcriptomics, and spatial multi-omics
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003576
PMID:41056021
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、跨组织转录组学和空间多组学方法，揭示了甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的因果机制和分子驱动因素 | 首次采用多组学框架结合孟德尔随机化、转录组范围关联研究和空间转录组学，系统解析了TyG指数与MASLD之间的因果关系及组织特异性表达模式 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；空间转录组学数据来源于小鼠胚胎期，与人类成年期疾病状态存在差异 | 阐明甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展中的因果作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者及小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 空间转录组学, 单细胞测序 | IVW, GSMR, JTI-PrediXcan, SMulTiXcan, FOCUS, FUSION, PoPS | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 基于UK Biobank的192个全基因组显著单核苷酸多态性 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 3795 | 2026-01-25 |
SPP1 in notochord cells modulates intervertebral disc degeneration through CD44 recognition by macrophages based on single-cell transcriptome analysis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003454
PMID:41065569
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研究论文 | 本研究通过改进大鼠椎间盘压力模型，结合单细胞转录组分析，探讨了机械应力如何通过SPP1-CD44信号通路影响椎间盘退变 | 改进了大鼠椎间盘压力模型，并首次在单细胞水平揭示了机械应力下脊索细胞群的变化及SPP1-CD44信号通路在椎间盘退变中的作用 | 研究主要基于大鼠模型，人类数据验证部分依赖于公共数据库，缺乏直接的人类样本实验验证 | 探究机械应力导致椎间盘退变的分子机制 | 大鼠椎间盘组织及脊索细胞 | 单细胞转录组学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 手术组与假手术组大鼠椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3796 | 2026-01-25 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2025-Dec-20, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2025.12.950
PMID:41429336
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化的作用 | 首次在BO中应用空间转录组学技术，揭示了MMT在疾病发展中的贡献以及基因表达从炎症到纤维化的动态转变 | 样本量较小（3例BO患者，2例对照），且为回顾性研究 | 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎的发病机制 | 接受肺移植的BO患者的肺组织样本（n=3）以及肺癌患者的对照肺组织（n=2） | 空间转录组学 | 闭塞性细支气管炎 | 免疫荧光染色，空间转录组学 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据，图像数据 | 5例患者（3例BO，2例肺癌对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3797 | 2026-01-25 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 本研究提出了一种名为PASTA的空间通路表达插补方法，通过整合细胞类型和空间邻近性信息，提高空间转录组学数据中未测量基因表达的预测准确性 | PASTA方法首次将通路信息整合到空间基因表达插补过程中，利用细胞类型和空间邻近性假设，提升了预测的稳健性和生物学相关性 | NA | 开发一种计算方法来预测空间转录组学数据中未测量的基因表达，以克服靶向原位技术基因测量数量有限的障碍 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | PASTA（通路导向的空间基因插补方法） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3798 | 2026-01-25 |
Characterization of T cell markers in endometrial carcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04289-y
PMID:41402657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别T细胞标志基因，并基于此构建了一个八基因预测模型，用于预测子宫内膜癌患者的预后及免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序数据与大量临床样本数据，构建了基于T细胞标志基因的子宫内膜癌预后预测模型，并验证了其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 需要进一步验证模型的临床适用性 | 开发子宫内膜癌的预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 544例子宫内膜癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3799 | 2026-01-25 |
Single-cell transcriptomic profiling of eosinophils and airway immune cells in childhood asthma
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.034
PMID:40684957
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研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法，提高了儿童哮喘患者鼻灌洗样本中粒细胞（特别是嗜酸性粒细胞）的捕获效率，并揭示了不同哮喘表型下的细胞转录差异和亚群特征 | 采用10× Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程，实现了粒细胞恢复的16倍以上提升，首次在组织样本中高效捕获嗜酸性粒细胞和中性粒细胞，并识别出与哮喘表型相关的独特亚群 | 研究仅基于鼻灌洗样本，可能无法完全代表下呼吸道或全身性炎症状态；样本量相对有限，且未涵盖所有哮喘亚型或健康对照组 | 优化单细胞RNA测序技术以改善粒细胞（尤其是嗜酸性粒细胞）在组织样本中的捕获，并探索儿童哮喘的免疫细胞异质性和炎症机制 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本中的嗜酸性粒细胞、中性粒细胞及其他免疫细胞和上皮细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 定制化数据处理流程（包括高级计算技术） | 单细胞转录组数据 | 儿童哮喘患者的鼻灌洗样本（具体数量未在摘要中明确说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics Flex | 10× Genomics Flex平台结合定制化样本处理（如固定化以保持细胞质量） |
| 3800 | 2026-01-25 |
Spatially resolved transcriptomics of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf016
PMID:39847441
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术分析良性和恶性外周神经鞘瘤，揭示其空间和生物学异质性 | 首次将空间转录组学应用于外周神经鞘瘤，构建了空间细胞分化图谱，并整合了组织学特征和单细胞数据 | 作为一项试点研究，样本量有限，未来需要更大规模验证 | 确定外周神经鞘瘤的空间和生物学异质性，以改善其分类和诊断 | 福尔马林固定石蜡包埋的患病外周神经组织样本 | 数字病理学 | 外周神经鞘瘤 | 空间转录组学 | 空间聚类和加权相关网络分析 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |