单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 38102 篇文献,本页显示第 3781 - 3800 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3781 2026-02-11
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了PURE-seq技术,整合FACS和PIP-seq,用于超稀有细胞的单细胞基因组学研究 PURE-seq技术通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,最小化处理步骤并减少细胞损失,实现了对超稀有细胞(如稀有度1/1,000,000)的高效捕获和测序 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及技术适用范围或样本类型限制 开发一种简单且高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中成本高和稀有细胞群体稀释的问题 超稀有细胞,包括转移性黑色素瘤患者血液中的循环肿瘤细胞,以及年轻、中年和老年小鼠的造血干细胞和祖细胞 单细胞基因组学 黑色素瘤 单细胞转录组学,FACS分选,PIP-seq NA 单细胞基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但提到1小时分选可捕获数十个目标细胞 NA 单细胞RNA-seq PURE-seq PURE-seq整合FACS和PIP-seq,用于直接分选和测序超稀有细胞
3782 2026-02-11
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
研究论文 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和机器学习模型,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习方法,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用公开数据集,需要进一步实验验证 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间调控机制 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及人类数据集GSE243981 数字病理学 肝病 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 基因表达数据, 空间转录组数据 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠肝组织 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx空间转录组学平台
3783 2026-02-11
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
共识 本文介绍了中国多发性骨髓瘤遗传学检测共识(2026版)的更新内容,旨在规范检测流程、统一高风险遗传学异常的解读与报告,并讨论将新兴分子标志物纳入风险分层 基于最新证据对2019年共识进行修订,重点关注检测工作流程的优化、高风险遗传学异常解读与报告的标准化,并探讨将新兴分子标志物(如全基因组测序和单细胞测序发现的标志物)整合到风险分层框架中 共识性文件主要基于现有证据和专家意见,可能未涵盖所有最新技术或临床场景,且其实施效果需在实际临床应用中进一步验证 制定和更新中国多发性骨髓瘤遗传学检测的标准化共识,以促进精准医疗并改善高风险患者的识别与管理 多发性骨髓瘤患者及其遗传学异常 临床医学与遗传学 多发性骨髓瘤 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 NA 遗传学数据 NA NA NA NA NA
3784 2026-02-11
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为TrajLens的可视化分析系统,用于构建跨样本的细胞发育轨迹 首次提出基于GNN的模型来预测跨样本细胞发育轨迹,并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视化分析系统 未在摘要中明确说明 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 GNN 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3785 2026-02-11
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文探讨了使用大型语言模型分析领域文献中可视化使用情况的潜力,并以单细胞转录组学中的高维数据可视化为案例进行研究 提出了结合图像处理、传统NLP方法和LLM的人机协同工作流程,用于大规模分析领域文献中的可视化使用情况,并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 研究仅针对单细胞转录组学领域的高维数据可视化,分析结果可能无法直接推广到其他领域 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定使用之间差距方面的潜力 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 自然语言处理 NA 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 LLM 文本、图像 1,203篇论文,包含2,056个高维可视化 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3786 2026-02-11
Unveiling Endothelial Cell Expression Profiles in FEVR: Identification of Key Genes Associated With Pathological Neovascularisation in a FZD4M105V Mouse Model
2026 Jan-Feb, Clinical & experimental ophthalmology
研究论文 本研究通过建立FZD4M105V小鼠模型,揭示了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中内皮细胞的表达谱,并鉴定了与病理性新生血管相关的关键基因 首次利用CRISPR/Cas9技术构建FZD4M105V小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了病理性内皮细胞簇和尖端细胞的独特转录谱,鉴定了四个新的候选生物标志物 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全覆盖所有内皮细胞亚群 阐明家族性渗出性玻璃体视网膜病变中病理性新生血管的分子机制 FZD4M105V突变小鼠的视网膜内皮细胞 数字病理学 视网膜血管疾病 CRISPR/Cas9基因编辑、流式细胞分选、单细胞RNA测序 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和单细胞测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3787 2026-02-11
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025-Dec-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)与炎症性肠病(IBD)患者胃肠道中MRGPRX2阳性肥大细胞的增加及其与疾病活动的关联 首次在HαT和IBD背景下,通过多平台方法(空间转录组学、质谱流式细胞术)系统揭示了胃肠道肥大细胞丰度增加、活化标志物(CD203c、LAMP-1、SIGLEC8)上调以及MRGPRX2表达增强的现象 样本量相对较小(空间转录组学n=8,质谱流式细胞术n=14),且研究主要基于观察性关联,尚未明确MRGPRX2介导的肥大细胞活化在HαT相关胃肠道症状中的直接因果机制 探究HαT是否通过改变肥大细胞受体MRGPRX2的表达及活化状态,影响IBD的胃肠道病理过程 HαT患者、非HαT的IBD患者以及健康对照者的胃肠道组织样本 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 共分析873份样本(854份生物库IBD样本用于基因分型,8份结肠组织用于空间转录组学,14份小肠活检用于质谱流式细胞术) NA 空间转录组学, 质谱流式细胞术 NA NA
3788 2026-02-11
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-12, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究构建了一个基于NOTCH相关基因的预后风险模型(NOTCH评分),用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存、免疫浸润和治疗反应 首次整合NOTCH信号通路相关基因构建预后模型,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗反应及药物敏感性的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在单细胞和蛋白水平的验证样本量有限 开发头颈部鳞状细胞癌的预后预测工具并探索其与肿瘤微环境及治疗反应的关联 头颈部鳞状细胞癌患者 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3789 2026-02-11
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾病进展中的关键调控作用 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾病进展中的作用机制 生物信息学和临床队列的样本量有限 识别慢性肾病的新型诊断生物标志物和治疗靶点 慢性肾病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 生物信息学 慢性肾病 单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 64名慢性肾病患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3790 2026-02-11
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性,并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源,并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中得到验证 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症,以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 小鼠Müller胶质细胞(原代和永生化细胞系)、小鼠视网膜组织 神经科学 青光眼 RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 NA 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3791 2026-02-11
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3792 2026-02-11
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞组学 免疫衰老 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习程序 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3793 2026-02-11
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 老年疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3794 2026-02-11
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用大规模单细胞转录组图谱揭示了阿尔茨海默病中显著的性别依赖性分子特征 首次通过大规模单细胞转录组学系统揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子景观,识别了性别特异性的基因表达模式、通路改变和细胞间通讯变化 研究仅基于人类前额叶皮层样本,可能无法完全反映其他脑区或疾病阶段的性别差异 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据 单细胞转录组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大规模样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3795 2026-02-11
PURE-seq identifies Egr1 as a Potential Master Regulator in Murine Aging by Sequencing Long-Term Hematopoietic Stem Cells
2024-Aug-13, Research square
研究论文 本文开发了PURE-seq技术,用于高效富集和测序稀有细胞,并应用于小鼠长期造血干细胞的研究,识别出Egr1作为衰老背景下造血过程的潜在主调控因子 开发了PURE-seq技术,通过直接FACS加载细胞到PIP-seq反应中,减少处理步骤和细胞损失,实现了对稀有细胞(如1/1,000,000稀有度)的可扩展测序 NA 开发一种可扩展的稀有细胞测序方法,并研究小鼠长期造血干细胞在造血衰老中的转录组变化 小鼠长期造血干细胞 单细胞转录组学 衰老相关疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3796 2026-02-11
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了中性粒细胞在艰难梭菌感染(CDI)中加剧肠道上皮细胞损伤的作用,并首次通过单细胞转录组学图谱识别了OLFM4+中性粒细胞的致病角色 首次建立了CDI后骨髓、血液和结肠中性粒细胞的转录组学图谱,并发现OLFM4作为关键标志物与感染严重程度相关 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限,且OLFM4的具体作用机制尚未完全阐明 探究中性粒细胞在CDI中的功能角色及其对肠道上皮损伤的影响 中性粒细胞(特别是OLFM4+亚型)、肠道上皮细胞、CDI感染的小鼠模型和人类样本 数字病理学 肠道感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据、蛋白质表达数据 包括小鼠模型和人类样本,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3797 2026-02-10
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
研究论文 本研究通过整合单细胞多组学数据和机器学习方法,识别了四个内皮细胞相关生物标志物(ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST),这些标志物连接了动脉粥样硬化进展与免疫微环境失调 首次结合高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和机器学习(LASSO回归、SVM-RFE)从单细胞数据中筛选内皮细胞特异性诊断标志物,并探索其与免疫细胞浸润的关联及潜在治疗药物的结合能力 研究基于生物信息学分析,缺乏体内或体外实验验证;样本来源和数量未明确说明;药物结合预测仅通过分子对接模拟,需实验验证 识别动脉粥样硬化的内皮细胞相关诊断生物标志物,并阐明其与免疫微环境失调的关联 动脉粥样硬化患者的内皮细胞及免疫微环境 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、差异表达分析、LASSO回归、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、CIBERSORT算法、分子对接模拟 LASSO回归、SVM-RFE 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3798 2026-02-10
Cutting-Edge Technologies to Decode Tumor Microenvironment in Multiple Myeloma
2026-Mar, Hematological oncology IF:3.3Q2
综述 本文综述了利用单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术和先进成像等技术解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境的最新进展 整合了多种前沿技术来高分辨率映射肿瘤微环境,并强调人工智能在数据整合和预测中的应用,以推动精准医疗 技术复杂性高、资源需求大且缺乏稳健的标准化,限制了其立即的临床应用 解析多发性骨髓瘤的肿瘤微环境以推动精准医疗发展 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术、先进成像、机器学习 机器学习 单细胞数据、批量数据、空间数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、质谱流式细胞术 NA NA
3799 2026-02-10
PTEN variant and genetic backgrounds combine to modify cerebellar neuronal differentiation in autism spectrum disorder
2026-Feb-09, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本研究利用人源iPSC系和小脑类器官模型,探究PTEN基因变异及其遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑神经元的分化 首次在人类小脑类器官模型中,结合等基因iPSC系和单细胞RNA测序,揭示了PTEN p.Ile135Leu变异在不同遗传背景下对小脑细胞类型特异性分化和浦肯野细胞电活动的差异影响 研究主要关注分化22周前的早期发育阶段,未涵盖小脑成熟的后期过程;类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的细胞相互作用和环路形成 探究PTEN基因变异与遗传背景如何共同影响自闭症谱系障碍中小脑的分化、发育和神经元网络活动 携带PTEN p.Ile135Leu变异或PTEN敲除的等基因人诱导多能干细胞系及其衍生的小脑类器官 发育神经生物学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序,小脑类器官培养,电生理记录 类器官模型 基因表达数据,电生理数据 未明确说明具体样本数量,但使用了等基因iPSC系(包括对照、PTEN变异、PTEN敲除及PTEN校正的患者来源系) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3800 2026-02-10
scACAN: An Adaptive Learning Framework Aggregating Local Graph Structure Context for Rare Cell Type Identification
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scACAN的自适应图构建框架,用于增强单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别能力 scACAN通过聚合局部图结构上下文信息设计正样本选择策略,结合自适应采样和基于聚类结果的迭代优化,有效提升了主要和稀有细胞类型的识别性能 NA 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型分布不均和稀有细胞群体识别困难的问题 单细胞RNA测序数据中的细胞类型,特别是稀有细胞亚群 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自适应图构建框架 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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