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当前共找到 33948 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-12-10 |
Decoding heart failure subtypes with neural networks via differential explanation analysis
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf581
PMID:41222558
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络和可解释AI的新方法，用于识别心力衰竭亚型特异性基因，以解码心力衰竭亚型 | 提出了一种基于自定义神经网络重要性评分的新方法，用于识别差异解释基因，优于传统方法，能更有效地揭示心力衰竭亚型特异性通路 | 方法可能依赖于神经网络模型的特定架构和参数，且在实际应用中需验证其泛化能力 | 解码心力衰竭亚型，通过识别差异基因签名来理解分子机制 | 单细胞转录组数据中的细胞，特别是与心力衰竭相关的细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2025-12-10 |
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-Oct-16, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
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研究论文 | 本研究建立了一种非人灵长类动物模型，用于模拟眼动脉栓塞及超选择性眼动脉内介入溶栓治疗，以评估透明质酸填充剂注射后视网膜缺血再灌注的疗效 | 首次在非人灵长类动物中建立眼动脉栓塞模型，并应用单细胞RNA测序技术分析视网膜细胞在缺血再灌注过程中的分子变化 | 研究样本量较小，且模型可能无法完全模拟人类临床情况的复杂性 | 评估眼动脉内溶栓治疗对透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞后视觉功能改善的有效性，并建立临床相关的视网膜缺血再灌注模型 | 恒河猴（非人灵长类动物） | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、数字减影血管造影、眼底荧光血管造影、视网膜电图、组织学染色、透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据、影像数据、电生理数据、组织学数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个时间点（立即、1、4、24小时）的干预 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-12-10 |
Computer Vision Methods for Spatial Transcriptomics: A Survey
2025-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.13.682148
PMID:41280008
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综述 | 本文首次系统性地综述了计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用，涵盖架构、学习范式、任务和数据集，并追踪其技术演变 | 首次系统性地综述计算机视觉方法在空间转录组学中的应用，强调其超越传统生物信息学、整合形态学与分子状态、以及解决ST技术限制（如高成本、临床适用性有限、2D分析限制）的新视角 | 作为一篇综述文章，未直接进行实验研究，因此不涉及具体模型或数据的局限性；但文中讨论了ST技术本身的限制（如高成本、2D分析） | 综述计算机视觉AI模型在空间转录组学分析中的应用，探索其如何利用组织学图像增强空间转录组数据分析，并推动基础研究和临床实践 | 空间转录组学数据及相关计算机视觉AI模型 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像（组织学图像）和空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2025-12-10 |
Islet-intrinsic sex differences in inflammatory signaling contribute to autoimmune diabetes susceptibility
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680429
PMID:41279069
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛内在的性别差异在炎症信号传导中的作用，以解释1型糖尿病（T1D）的性别偏向易感性 | 揭示了男性胰岛对促炎细胞因子反应更强烈，而雌激素（E2）能抑制炎症信号并降低β细胞免疫原性，为性别偏向的T1D易感性提供了机制性见解 | 研究主要基于体外实验和NOD小鼠模型，人类样本的临床验证有限，且未全面探索其他性激素或长期效应 | 探究性别特异性胰岛炎症反应如何影响1型糖尿病的易感性差异 | 人类胰岛、小鼠β细胞、非肥胖糖尿病（NOD）小鼠 | NA | 1型糖尿病 | 转录组学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛来自男性和女性供体，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-12-10 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7766748/v1
PMID:41282081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动的造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次发现镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞转录重编程，并揭示其对G-CSF的意外反应性 | 未明确I型干扰素信号激活的具体上游触发因素，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究镰状细胞贫血中病理性髓系生成和炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-12-10 |
distQTL: Distribution Quantitative Trait Loci Identification by Population-Scale Single-Cell Data
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647121
PMID:40291679
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研究论文 | 本文提出了一种名为distQTL的新方法，利用群体规模单细胞RNA测序数据识别分布数量性状位点，以更精细地研究遗传变异对基因表达的影响 | 采用Fréchet回归方法，将完整的经验分布作为响应对象，而非传统的简单汇总统计量（如均值），从而在单细胞水平上更准确地识别eQTLs | 方法主要应用于外周血单核细胞数据，可能在其他细胞类型或组织中的适用性有待验证 | 开发一种新方法来识别分布数量性状位点，以克服传统批量eQTL方法在细胞异质性方面的局限 | 来自982名捐赠者的外周血单核细胞的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 982名捐赠者的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-12-10 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2025-Sep-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织学分析，揭示了人类动静脉瘘（AVF）创建后静脉壁的细胞和分子变化，特别是成熟失败的相关机制 | 首次创建了人类静脉在动静脉瘘创建前后的单细胞转录组图谱，识别了成熟失败AVF中持续的炎症反应和过度愈合特征，并发现巨噬细胞来源的骨桥蛋白是关键旁分泌信号 | 样本量相对有限（20例患者用于单细胞测序），且研究主要关注静脉壁变化，未全面评估全身或血流动力学因素 | 探究动静脉瘘成熟失败的生物学机制，以改善血液透析患者的AVF成熟结果 | 人类静脉组织样本，包括预接入静脉、早期切除样本、成熟AVF和失败AVF | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 23例患者用于组织学活检，20例患者用于单细胞RNA测序（共70,281个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2025-12-10 |
Hematopoietic EphA4 Deficiency Alters Microglial Heterogeneity and Improves Chronic Spatial Memory After Brain Injury
2025-Aug-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7265717/v1
PMID:40909780
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研究论文 | 本研究通过构建造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠模型，探究了外周免疫细胞来源的EphA4信号在创伤性脑损伤后对小胶质细胞动态及长期功能恢复的调控作用 | 首次揭示了外周免疫细胞来源的EphA4信号通过调节小胶质细胞异质性，负向调控脑损伤后的长期神经免疫重塑与功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类中的适用性有待验证；单细胞测序仅针对90天后的海马组织，未能覆盖更完整的时空动态 | 探究外周免疫细胞来源的EphA4信号在创伤性脑损伤后对小胶质细胞动态及功能恢复的影响 | 造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠 | 神经免疫学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，骨髓嵌合小鼠模型，受控皮质撞击损伤模型 | 动物模型（小鼠） | 单细胞转录组数据，行为学数据，形态学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2025-12-10 |
Deciphering Precursor Cell Dynamics in Esophageal Preneoplasia via Genetic Barcoding and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.637920
PMID:40060545
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术与单细胞RNA测序，追踪食管癌前病变细胞的谱系，揭示了高可塑性祖细胞样群体及其在肿瘤早期发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合用于食管癌前病变细胞谱系追踪，并开发了新的评分系统来映射高可塑性细胞 | NA | 阐明食管癌前病变细胞的起源、轨迹及其在早期肿瘤发生中的动态 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 遗传条形码，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 370 | 2025-12-10 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
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综述 | 本文系统综述了2017年至2024年间水稻单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用，重点关注其在解析水稻对环境胁迫响应中的作用 | 首次针对水稻的scRNA-seq研究进行系统性综述，填补了该领域在全面回顾方面的空白，并整合了ATCT-seq、snRNA-seq和Stereo-seq等最新转录组技术进展 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，依赖现有文献的总结，可能无法涵盖所有相关研究或技术细节 | 系统概述scRNA-seq在水稻研究中的应用，特别是其在理解水稻对不同环境胁迫响应机制中的作用，以促进作物改良策略 | 水稻（Oryza sativa）及其组织（根、叶、小花、种子），以及其在低氮、高盐、缺铁和褐飞虱抗性等胁迫条件下的响应 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATCT-seq、snRNA-seq、Stereo-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2025-12-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies accumulation of Fcgr2b+ virtual memory like CD8 T cells with cytotoxic and inflammatory potential in aged mouse white adipose tissue
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661935
PMID:40631318
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，识别了老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 比较了生理衰老与高脂饮食诱导的肥胖，首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞，并揭示了其细胞毒性和炎症功能 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量相对较小，可能影响统计效力 | 比较衰老与肥胖状态下白色脂肪组织的炎症机制，识别独特的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织（gWAT）基质血管组分（SVF） | 单细胞组学 | 肥胖相关炎症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 年轻小鼠（正常或高脂饮食）和老年小鼠（正常饮食）的白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-12-10 |
Strain-Specific Tropism and Transcriptional Responses of Enterovirus D68 Infection in Human Spinal Cord Organoids
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661907
PMID:40666885
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞RNA测序揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）在神经元和胶质细胞中的特异性嗜性差异 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫环境和组织架构 | 探究EV-D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞机制和宿主反应 | 人类脊髓类器官（hSCOs） | 单细胞组学 | 神经系统感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用诱导多能干细胞衍生的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-12-10 |
Spatial Transcriptomics Analysis Uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje Cells Underlying Alcohol-induced Cerebellar Vulnerability in Mice
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.19.660571
PMID:40667236
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研究论文 | 本研究通过生成小脑Purkinje细胞特异性MANF敲除小鼠模型，结合空间转录组学分析，揭示了MANF缺失如何以性别特异性方式增加酒精诱导的ER应激和小脑脆弱性 | 首次利用空间转录组学和高通量原位分析技术，在MANF敲除小鼠中揭示了性别特异性的转录组景观变化及ER应激相关基因表达，阐明了MANF在保护Purkinje细胞免受酒精神经毒性中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；性别差异的分子机制尚未完全阐明；样本量可能有限，需进一步验证 | 探究MANF是否通过调节ER应激来保护小脑Purkinje细胞免受酒精诱导的神经毒性，并分析其性别特异性效应 | 小脑Purkinje细胞特异性MANF敲除小鼠，包括雄性和雌性个体 | 空间转录组学 | 酒精诱导的神经退行性疾病 | 空间转录组学，高通量原位分析 | MANF敲除小鼠模型 | 转录组数据，行为学数据，组织学数据 | MANF敲除小鼠（雄性和雌性），具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 374 | 2025-12-10 |
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.01.651492
PMID:40654906
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研究论文 | 本研究探讨了Meis1和Meis2转录因子在小鼠出生后晚期视网膜祖细胞中过表达对时间模式化和神经发生的影响 | 首次在晚期视网膜祖细胞中系统研究Meis1和Meis2过表达对时间身份和神经发生能力的影响，揭示了这两个因子在调控神经发生进程中的不同作用 | 过表达Meis因子未能完全重编程晚期祖细胞，且未诱导早期出生细胞类型，表明存在其他关键调控因子 | 探究Meis转录因子在晚期视网膜祖细胞中对时间模式和神经发生的调控作用 | 出生后小鼠的视网膜祖细胞 | 发育生物学 | NA | 电穿孔转染、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2025-12-10 |
scSwinTNet: A Cell Type Annotation Method for Large-Scale Single-Cell RNA-Seq Data Based on Shifted Window Attention
2025-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3487174
PMID:39466872
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研究论文 | 本文提出了一种基于移位窗口注意力机制的大规模单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法scSwinTNet | scSwinTNet是首个使用预训练的移位窗口注意力模型来注释单细胞RNA测序数据中细胞类型的模型，无需先验知识即可准确注释 | NA | 开发一种自动化、高精度的细胞类型注释工具，以应对单细胞数据量的指数增长并减少数据偏差影响 | 人类和小鼠组织中的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于移位窗口的自注意力模型 | 基因表达数据 | 399,760个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2025-12-10 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序，系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何影响人类小胶质细胞的炎症反应 | 首次结合CRISPRi高通量筛选与单细胞RNA测序，在hiPSC衍生的小胶质细胞中系统鉴定AD遗传风险因子对炎症反应的调控作用，并揭示了这些变异在功能上汇聚于调节小胶质细胞状态 | 研究主要依赖体外细胞模型和病毒模拟物刺激，可能无法完全模拟体内复杂的AD病理环境 | 探究阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选，单细胞RNA测序，CROP-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行CRISPRi筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
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研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto方法，用于长读长测序数据的转录本定量分析，并展示了其在ONT数据上的应用和改进 | 开发了lr-kallisto方法，将kallisto的短读长RNA-seq定量技术适配到长读长测序平台，并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未提及具体样本量或数据集的局限性，可能依赖于特定长读长平台（如ONT） | 实现长读长测序数据中转录本异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录本异构体 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序，外显子捕获 | kallisto模型适配 | RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序数据，结合外显子捕获技术 |
| 378 | 2025-12-10 |
PI3 as a Common Hub Gene Linking Atopic Dermatitis and Ulcerative Colitis Through Immune Cell Recruitment Mechanisms
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527507
PMID:40901026
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了特应性皮炎和溃疡性结肠炎之间的共同枢纽基因PI3及其在免疫细胞招募机制中的作用 | 首次将PI3确定为连接AD和UC的枢纽基因，并揭示了其通过CCL和CXCL趋化因子招募M1巨噬细胞、CD4 T细胞和中性粒细胞的共同免疫机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本量有限且可能受批次效应影响 | 识别AD和UC之间的共同枢纽基因和免疫学特征，阐明两种疾病的共享发病机制 | 特应性皮炎和溃疡性结肠炎患者组织样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎,溃疡性结肠炎 | RNA-seq,单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GSE121212和GSE75214数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2025-12-10 |
Cannabidiol Reprograms Glucose Metabolism in Colorectal Adenocarcinoma by Targeting HIF-1α/LDHA Pathway
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X25500958
PMID:41219135
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研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过靶向HIF-1α/LDHA通路，重编程结直肠腺癌葡萄糖代谢的抗肿瘤机制 | 首次揭示大麻二酚通过抑制HIF-1α/LDHA通路来靶向肿瘤代谢重编程，并发现其与糖酵解抑制剂2-DG具有协同作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组学分析，缺乏体内动物模型的全面验证 | 探究大麻二酚在结直肠腺癌中的抗肿瘤作用机制，特别是其对肿瘤代谢重编程的影响 | 结直肠腺癌细胞系及组织样本 | 肿瘤代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、网络药理学、蛋白质组学、代谢测定 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-12-10 |
Strain-specific tropism and transcriptional responses of enterovirus D68 infection in human spinal cord organoids
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1698639
PMID:41347238
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株在神经元和胶质细胞中的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞分辨率揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）的细胞嗜性差异及其宿主转录响应，为急性弛缓性脊髓炎的发病机制提供了新见解 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的脊髓微环境；样本规模有限，且仅分析了两种病毒株 | 探究肠道病毒D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞嗜性和感染动力学机制 | 源自诱导多能干细胞的人类脊髓类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及健康及感染两种EV-D68毒株（B2和B3）的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |