单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28447 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-06-01 |
An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation
2025-May-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.024
PMID:40220755
|
research paper | 该研究通过单核RNA测序技术构建了拟南芥的单核转录组图谱，揭示了叶片衰老和养分分配的细胞类型特异性协调机制 | 首次构建了拟南芥跨20个组织的百万级单核转录组图谱，开发了单细胞分辨率叶片衰老量化指标，系统性解析了碳氮分配模式 | 研究主要基于拟南芥模型，结论在其它植物中的普适性有待验证 | 解析植物叶片衰老和养分分配的细胞类型特异性调控机制 | 拟南芥20个组织的1,000,000+细胞核 | 植物分子生物学 | NA | scRNA-seq（单细胞RNA测序）, 加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过100万个细胞核，覆盖20个组织多个发育阶段 |
| 362 | 2025-06-01 |
Targeting SPP1+ macrophages via the SPP1-CD44 axis reveals a key mechanism of immune suppression and tumor progression in ovarian cancer
2025-May-29, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114906
PMID:40446696
|
研究论文 | 该研究通过整合分析卵巢癌单细胞测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴驱动免疫抑制和T细胞耗竭的关键机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞亚群通过SPP1-CD44轴促进T细胞耗竭，并证实阻断该轴可恢复CD8 T细胞功能，同时鉴定尼洛替尼作为潜在SPP1抑制剂 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要更多体内实验验证临床转化潜力 | 探究卵巢癌肿瘤微环境中TAMs介导免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 单细胞测序数据 | 6个HGSOC单细胞测序数据集 |
| 363 | 2025-06-01 |
Unraveling the mechanisms of irAEs in endometrial cancer immunotherapy: insights from FAERS and scRNA-seq data
2025-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02723-3
PMID:40436981
|
研究论文 | 本研究整合FAERS数据库和单细胞转录组数据，探讨子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的潜在机制 | 首次整合FAERS数据库与单细胞转录组数据，揭示PD-1抑制剂可能通过CXCR4和CXCR6通路的代偿性激活导致免疫相关不良事件 | 需要进一步的临床研究和机制研究验证这些发现 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略并减轻不良事件 | 子宫内膜癌患者及免疫检查点抑制剂相关不良事件 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | scRNA-seq, FAERS数据库分析 | Weibull建模 | 单细胞转录组数据, 药物不良事件报告数据 | FAERS数据库中2,202例免疫检查点抑制剂相关报告及单细胞分析数据 |
| 364 | 2025-06-01 |
Deciphering the cellular and molecular landscape of cervical cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-28, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00948-z
PMID:40437003
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面描述了宫颈癌发展过程中肿瘤微环境的细胞和分子特征 | 首次整合scRNA-seq和stRNA-seq技术，揭示了SPP1+巨噬细胞在宫颈癌进展中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号轴与免疫细胞的相互作用 | 样本量可能有限，且未涉及治疗干预后的动态变化 | 解析宫颈癌从HPV感染到恶性肿瘤进展过程中的细胞和分子机制 | 正常宫颈组织、HPV感染的正常宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变(HSIL)和浸润性宫颈癌样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, stRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包含正常、HPV感染、HSIL和浸润性癌的多阶段样本(具体数量未明确说明) |
| 365 | 2025-06-01 |
Natural killer cells adopt an activated and decidual-like phenotype after autologous hematopoietic stem cell transplantation in children with cancer
2025-May-28, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00911-w
PMID:40437214
|
研究论文 | 研究儿童癌症患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞的活化和蜕膜样表型变化 | 首次描述了儿童患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞出现的短暂蜕膜样表型及其与细胞因子和临床结果的关系 | 样本量较小（13名儿童患者），且使用了成人健康供体的数据进行对比 | 了解自体造血干细胞移植后免疫系统重建过程中自然杀伤细胞的动态功能 | 儿童癌症患者（3-11岁）和成人健康供体（25-62岁）的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 癌症 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据、RNA测序数据、血浆细胞因子数据 | 13名儿童患者（男8，女5）和8名成人健康供体（男5，女3） |
| 366 | 2025-06-01 |
ITIH4 attenuates acute lung injury by Fe-containing particulate matter in mice via Hippo pathway in type II alveolar epithelial cells
2025-May-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03256-z
PMID:40437524
|
research paper | 本研究探讨了重组ITIH4（rITIH4）对暴露于含铁颗粒物（PM）的小鼠急性肺损伤的保护作用及其通过Hippo通路的机制 | 首次揭示了ITIH4通过调节AECII中的Hippo通路减轻含铁颗粒物引起的急性肺损伤 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究ITIH4对含铁颗粒物引起的急性肺损伤的保护作用及机制 | C57BL/6JNarl和B6.Sftpc-CreERT2;Ai14(RCL-tdT)-D小鼠 | 呼吸病学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、电感耦合等离子体质谱（ICP-MS） | 小鼠急性肺损伤模型 | 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞计数数据 | 未明确说明具体数量的小鼠样本 |
| 367 | 2025-06-01 |
AAV-mediated silencing of Sox4 leads to long-term amelioration of liver phenotypes in mouse models of Alagille syndrome
2025-May-28, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.04.033
PMID:40446945
|
research paper | 该研究通过AAV介导的Sox4沉默，在小鼠模型中长期改善Alagille综合征的肝脏表型 | 首次证明AAV介导的Sox4沉默可作为Alagille综合征肝病的潜在治疗方法 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 寻找增强胆道发育的治疗靶点，以解决Alagille综合征等胆管缺乏疾病的未满足需求 | Alagille综合征小鼠模型及人类肝脏组织 | 基因治疗 | Alagille综合征 | AAV8载体介导的基因沉默、scRNA-Seq、RNAscope | 小鼠模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 小鼠模型及人类肝脏组织样本 |
| 368 | 2025-06-01 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
|
research paper | 本文探讨了耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性，及其对治疗的挑战和临床意义 | 提出了耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性的概念，并探讨了这些现象对治疗和临床结果的影响 | 这些机制的临床意义尚不明确，且缺乏与治疗失败相关的数据 | 理解耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药性的机制及其影响，开发检测方法和缓解策略 | 耳念珠菌 | 微生物学 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 369 | 2025-06-01 |
Chaperonin containing TCP1 subunit 5 as a novel pan-cancer prognostic biomarker for tumor stemness and immunotherapy response: insights from multi-omics data, integrated machine learning, and experimental validation
2025-May-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04071-7
PMID:40423850
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据和机器学习方法，揭示了CCT5在泛癌中的预后价值和免疫治疗反应预测作用 | 首次全面评估CCT5在33种癌症类型中的表达模式，并开发了基于CCT5的免疫治疗反应预测模型CCT5.Sig | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限 | 探究CCT5在泛癌进展中的作用及其作为免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 33种癌症类型的肿瘤组织和1394例接受免疫检查点阻断治疗的患者样本 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学）和机器学习 | 机器学习模型（具体算法未明确说明） | 多组学数据（转录组、单细胞转录组、空间转录组） | 33种癌症类型的肿瘤组织和1394例免疫治疗患者样本 |
| 370 | 2025-06-01 |
Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing
2025-May-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101170
PMID:40424181
|
研究论文 | 通过单核和单细胞RNA测序比较分析胎盘组织和滋养层类器官中的合体滋养层细胞 | 首次使用单核RNA测序技术捕获合体滋养层细胞群体，并揭示了三种核亚型，同时鉴定了类器官培养条件下合体滋养层细胞的不同表达模式 | 研究未涉及RYBP敲除对胎盘发育其他方面的影响 | 探究合体滋养层细胞的分化和核异质性 | 胎盘组织和滋养层类器官中的合体滋养层细胞 | 单细胞组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，涉及早孕期、足月胎盘组织及两种培养条件下的滋养层类器官 |
| 371 | 2025-06-01 |
Longitudinal scRNA-seq of retinal organoids derived from Stargardt disease patient with ABCA4 mutation
2025-May-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05079-5
PMID:40425564
|
research paper | 利用携带ABCA4基因突变的Stargardt病患者来源的iPSCs生成视网膜类器官，并通过单细胞RNA测序研究其发育阶段的转录组学特征 | 首次使用中国STGD患者常见变异的iPSCs生成视网膜类器官，填补了小鼠模型因缺乏黄斑而无法完美模拟STGD特征的知识空白 | 研究仅针对中国STGD患者中常见的ABCA4变异，可能无法涵盖所有突变类型 | 研究ABCA4基因突变导致的Stargardt病发病机制 | 携带ABCA4突变的患者来源iPSCs生成的视网膜类器官 | digital pathology | Stargardt病 | scRNA-seq, iPSCs技术 | 视网膜类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 多个发育阶段（40、90、150、200和260天）的视网膜类器官样本 |
| 372 | 2025-06-01 |
Single cell RNA sequencing reveals the role of local renin-angiotensin system in regulating ovarian physiological cycle and promoting PCOS
2025-May-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02531-8
PMID:40425574
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢局部肾素-血管紧张素系统（RAS）在调节卵巢生理周期及促进多囊卵巢综合征（PCOS）中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了卵巢局部RAS在发情周期中的动态变化，并提供了AngII与IRS1/PI3K/AKT通路交互作用导致胰岛素抵抗（IR）可能是PCOS潜在机制的初步证据 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究卵巢局部RAS在生理周期调节及PCOS发病机制中的作用 | 小鼠卵巢细胞 | 单细胞组学 | 多囊卵巢综合征（PCOS） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | PCOS小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量，但涉及小鼠卵巢多个细胞簇 |
| 373 | 2025-06-01 |
Deep exploration of logical models of cell differentiation in human preimplantation embryos
2025-May-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00537-7
PMID:40425601
|
研究论文 | 该研究开发了一个名为SCIBORG的计算工具包，通过整合单细胞转录组数据和先验知识网络，推断基因调控的布尔网络，以探索人类胚胎植入前细胞分化的逻辑模型 | 开发了SCIBORG工具包，利用逻辑编程处理单细胞数据的高维搜索空间，并学习两个不同发育阶段的布尔网络家族，揭示了滋养外胚层成熟的关键基因 | 缺乏某些生物系统的可行扰动数据，限制了动态模型的验证或生成 | 探索人类胚胎植入前细胞分化的逻辑模型，特别是滋养外胚层的成熟过程 | 人类胚胎滋养外胚层（TE）及其成熟过程 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 布尔网络（BN） | 单细胞转录组数据 | NA |
| 374 | 2025-06-01 |
Novel ribosome biogenesis-related biomarkers and therapeutic targets identified in psoriasis
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03833-8
PMID:40425712
|
研究论文 | 该研究通过转录组和单细胞RNA测序数据，鉴定了与银屑病发病机制相关的核糖体生物发生相关生物标志物，并探索了潜在的治疗靶点 | 首次将核糖体生物发生（RiboSis）与银屑病发病机制联系起来，并鉴定了11个候选生物标志物，其中MPHOSPH6和ISG20通过外部数据集验证和分子对接预测为潜在治疗靶点 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步的实验验证 | 探索核糖体生物发生与银屑病发病机制的关系，并寻找潜在的治疗靶点 | 银屑病患者转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA-seq, scRNA-seq, 差异表达分析(DEG), 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析, 分子对接 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的批量转录组和单细胞RNA测序数据集 |
| 375 | 2025-05-29 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02747-9
PMID:40425739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2025-06-01 |
A robust multi-scale clustering framework for single-cell RNA-seq data analysis
2025-May-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03603-6
PMID:40425750
|
research paper | 提出了一种名为scMSCF的鲁棒多尺度聚类框架，用于单细胞RNA-seq数据分析，以提高细胞类型识别的准确性 | 结合多维PCA降维、K-means聚类和加权集成元聚类方法，并通过自注意力驱动的Transformer模型优化聚类性能 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA-seq数据高维度、稀疏性和噪声带来的聚类挑战 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Transformer | 基因表达数据 | 八个单细胞RNA测序数据集 |
| 377 | 2025-06-01 |
Optimized culturing yields high success rates and preserves molecular heterogeneity, enabling personalized screening for high-grade gliomas
2025-May-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00946-1
PMID:40425813
|
research paper | 该研究开发了一种优化的培养方法，用于建立高级别胶质瘤（HGG）的体外模型，以提高培养成功率和保留肿瘤的分子异质性 | 结合单细胞来源（SCD）和部分解离的3D来源（3DD）组织片段，使用超声抽吸和3DD手术样本，实现了96%的培养成功率，并保留了肿瘤的分子特征 | 研究样本量相对较小（114例HGG标本），且未明确说明长期培养的稳定性 | 开发一种可靠的方法来建立高级别胶质瘤（HGG）的体外模型，以支持个性化药物筛选 | 高级别胶质瘤（HGG）患者来源的细胞培养物 | 肿瘤学 | 高级别胶质瘤 | 单细胞测序、拷贝数分析 | 体外细胞培养模型 | 基因组和转录组数据 | 114例HGG标本，其中18例用于抗癌药物筛选 |
| 378 | 2025-06-01 |
Ligustrazine nano-drug delivery system ameliorates doxorubicin-mediated myocardial injury via piezo-type mechanosensitive ion channel component 1-prohibitin 2-mediated mitochondrial quality surveillance
2025-May-27, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03420-z
PMID:40426179
|
研究论文 | 研究探讨了川芎嗪纳米给药系统通过调节PIEZO1-TMBIM6-PHB2Ser91/Ser176磷酸化轴改善阿霉素诱导的心肌损伤和线粒体功能障碍 | 首次利用四骨架核酸分子作为川芎嗪载体，并通过基因修饰动物模型和单细胞测序分析揭示了PIEZO1-TMBIM6-PHB2信号轴在心肌保护中的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床验证 | 开发新型纳米给药系统以减轻阿霉素诱导的心肌病 | 阿霉素诱导的心肌病小鼠模型和基因修饰细胞系统 | 纳米医学 | 心血管疾病 | 纳米药物递送技术、单细胞测序、分子生物学技术 | 基因修饰小鼠模型 | 测序数据、分子生物学数据 | 未明确说明样本数量，使用基因修饰小鼠模型和细胞系统 |
| 379 | 2025-06-01 |
Semaglultide targets Spp1+ microglia/macrophage to attenuate neuroinflammation following perioperative stroke
2025-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03465-9
PMID:40426210
|
研究论文 | 本文研究了semaglutide如何通过靶向Spp1+小胶质细胞/巨噬细胞来减轻围手术期卒中后的神经炎症 | 发现了一种新的保护性Spp1Mac/MG亚群，并证明semaglutide可以上调这一亚群，从而减轻神经炎症 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探索semaglutide在围手术期缺血性卒中(PIS)中的神经保护机制 | 围手术期缺血性卒中(PIS)小鼠模型中的Spp1+小胶质细胞/巨噬细胞 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、高参数流式细胞术、RNA测序 | 小鼠围手术期缺血性卒中(PIS)模型 | RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像数据 | PIS小鼠模型 |
| 380 | 2025-06-01 |
scE2EGAE: enhancing single-cell RNA-Seq data analysis through an end-to-end cell-graph-learnable graph autoencoder with differentiable edge sampling
2025-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00616-z
PMID:40426257
|
research paper | 提出了一种名为scE2EGAE的端到端可学习图自编码器，用于增强单细胞RNA测序数据分析 | 通过可微分边缘采样学习细胞间关系图，避免了传统固定图构建方法的信息丢失问题 | 仅在8个公共scRNA-Seq数据集上进行了验证，需要更多数据集验证泛化能力 | 改进单细胞RNA测序数据的分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | bioinformatics | NA | scRNA-Seq | graph autoencoder (GAE) with GNN | gene expression data | 8个公共scRNA-Seq数据集 |