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当前共找到 38549 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-04-17 |
Oncolytic HSV-1-Mediated JAG1 Blockade Induces Glioma Senescence-Associated Secretory Phenotype to Increase Macrophage Activation and Cetuximab-Mediated Senolysis
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1402
PMID:41411618
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研究论文 | 本研究开发了一种拮抗JAG1的溶瘤HSV-1病毒（OD-0J1），并揭示了其通过诱导胶质瘤细胞衰老、改变肿瘤微环境中的巨噬细胞表型，并与西妥昔单抗联合增强抗肿瘤疗效的机制 | 首次将溶瘤病毒与JAG1阻断策略结合，并发现诱导的细胞衰老表型可被西妥昔单抗靶向清除，为联合治疗提供了新思路 | 研究主要在临床前动物模型中进行，其人体有效性和安全性尚需进一步验证 | 探究JAG1介导的信号在胶质瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中的作用，并开发新的联合治疗策略 | 胶质瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、溶瘤HSV-1病毒工程改造体 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、激酶组分析、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、细胞表型数据 | 无胸腺裸鼠和人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2026-04-17 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术，揭示了宫颈癌中代谢与免疫相互作用的分子机制，并探索了苦参碱的潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术，系统性地构建了宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络，并探索了天然产物苦参碱的多靶点抗肿瘤机制 | 苦参碱的具体作用机制尚未完全明确，体外实验和分子对接结果仅为初步验证，需要进一步的体内实验和临床研究证实 | 阐明宫颈癌的分子机制，评估苦参碱干预的潜力，为宫颈癌治疗提供新的研究方向和治疗靶点 | 宫颈癌组织、TCGA数据库中的宫颈癌数据、苦参碱 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、空间转录组、生物信息学分析、分子对接、体外实验 | CIBERSORT算法、ESTIMATE算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 363 | 2026-04-17 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证，识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，并揭示了蒜素（allicin）的治疗机制 | 整合了多组学数据、机器学习算法（随机森林和LASSO）、单细胞RNA测序分析以及反向药物筛选，首次系统性地识别了CXCL10、ISG15和IFI27作为银屑病和银屑病关节炎的共有免疫治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟和实验验证了蒜素通过抑制NF-κB信号通路调控这些靶点的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证部分可能受样本量和体外实验模型的限制，蒜素在体内的药效和安全性仍需进一步临床研究证实 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，预测潜在治疗药物，并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物蒜素及其活性成分蒜素 | 生物信息学, 机器学习 | 银屑病, 银屑病关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2026-04-17 |
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09921-z
PMID:41501470
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研究论文 | 本研究揭示了TRPV1痛觉感受器与上皮簇细胞之间的神经-上皮回路在启动2型炎症和肠道免疫中的关键作用 | 首次发现TRPV1痛觉感受器通过化学感觉上皮簇细胞启动级联组织反应，驱动2型炎症，揭示了神经-上皮簇细胞回路作为2型免疫和组织适应的上游决定因素 | NA | 探究不同类型感觉输入（上皮、神经元和免疫细胞）如何协调和整合以驱动2型炎症和肠道免疫 | TRPV1痛觉感受器、上皮簇细胞、肠道上皮细胞、蠕虫感染模型 | NA | 蠕虫感染、过敏炎症 | 空间转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2026-04-17 |
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013610
PMID:41871169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了HDAC抑制剂诱导EB病毒裂解异质性在B淋巴母细胞中的作用，定义了流产性和难治性状态 | 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EB病毒裂解异质性的机制，并识别了NF-κB下游基因和CD137/CD137L信号轴在阻止成功裂解再激活中的关键作用 | 研究仅基于四种EBV阳性细胞系，且裂解再激活仅在少数细胞中成功，可能限制了结果的普适性 | 探究HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤细胞裂解再激活的影响，并识别宿主因子在阻止成功裂解中的作用 | 四种EBV阳性细胞系：P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 | 单细胞测序 | EBV相关恶性肿瘤（包括伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌和胃癌） | 单细胞RNA测序，Cas9-RNP功能验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四种EBV阳性细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 366 | 2026-04-17 |
Multimodal bioinformatic analyses of genome-scale expression beyond gene-centric differential expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag152
PMID:41978384
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综述 | 本文综述了基因组规模基因表达分析的概念和方法学进展，超越传统的病例对照比较和基因中心差异表达分析 | 强调使用转录组和多模态组学数据阐明基因表达多样机制，包括基因共表达和调控网络推断、上下文特异性网络模型及机器学习方法 | 作为综述文章，未进行原始研究，主要总结现有进展，未提出具体实验验证 | 提高对先进网络分析的认识并鼓励其应用，以探索基因表达调控的多因素性质 | 基因组规模基因表达数据，包括转录组和多模态组学数据 | 生物信息学 | NA | 转录组学、多模态组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习方法、网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 367 | 2026-04-17 |
BCRInsight: an antibody language model to decode biological signals from BCR sequences
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag154
PMID:41978383
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研究论文 | 本文介绍了BCRInsight，一种基于Transformer架构和表型感知对比学习的抗体特异性预训练语言模型，用于从B细胞受体序列中解码生物信号 | BCRInsight整合了Transformer架构与表型感知对比学习，通过自监督学习从8000万个人类BCR序列中学习生物上下文表示，实现了在多个下游任务中的最先进性能，并展示了基于注意力的结构可解释性 | 未明确提及具体限制，但暗示单细胞测序的可扩展性和成本仍是主要障碍，且传统生物信息学方法难以建模抗体序列中的高阶非线性语义依赖 | 解码B细胞受体序列中嵌入的复杂序列语义，以阐明免疫动态并加速抗体发现 | 人类B细胞受体序列，包括健康、肿瘤和病毒感染状态下的单细胞免疫队列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | Transformer | 序列数据 | 8000万个人类BCR序列 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2026-04-17 |
Analysis of microsatellite instability intensity in single-cell resolution with scMnT reveals tumor heterogeneity in colorectal cancer
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag156
PMID:41978385
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scMnT的生物信息学方法，用于在单细胞分辨率下识别微卫星不稳定（MSI）细胞并量化MSI强度，揭示了结直肠癌中MSI强度的异质性及其与免疫治疗反应的相关性 | 首次在单细胞水平上量化MSI强度，突破了传统二元分类的局限，揭示了MSI在肿瘤内的异质性连续谱 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性，尚未在更大规模或更多癌种中进行验证 | 开发单细胞水平的MSI强度量化方法，探究MSI异质性在结直肠癌中的临床意义 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生物信息学分析方法（scMnT） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2026-04-17 |
GDSim: accurate simulation for single-cell transcriptomes based on the guided diffusion model
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag163
PMID:41978379
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研究论文 | 本文提出了一种基于引导扩散模型的新型深度生成网络GDSim，用于准确模拟单细胞转录组数据 | 首次利用标签引导的扩散模型来捕获scRNA-seq数据中复杂的基因表达依赖关系，生成的模拟数据能紧密反映原始数据的真实分布 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据不足的问题，为下游分析提供高质量的模拟数据 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成网络，扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 370 | 2026-04-17 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Scope-X技术，一种结合组织膨胀与测序的空间转录组学方法，实现了亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组分析 | 通过组织物理膨胀技术，将Seq-Scope的空间分辨率提升至亚微米级，突破了传统测序空间转录组学的光学分辨率限制，并首次在单细胞水平解析核质区室转录组差异 | 文中未明确说明技术应用的样本类型限制、通量限制或数据处理的复杂性 | 开发超高分辨率空间多组学技术，用于研究细胞结构、功能和疾病机制 | 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏以及人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及多种组织类型（肝、脑、结肠、脾、扁桃体） | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope的改进平台，整合组织膨胀技术，支持亚微米级分辨率的全转录组和数百种抗体标记的蛋白质组分析 |
| 371 | 2026-04-17 |
transFusion: a novel comprehensive platform for integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag059
PMID:41645434
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研究论文 | 本文介绍了一个名为transFusion的新型网络平台，专门用于整合分析单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组学数据 | transFusion平台提供了12项关键功能，包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别与可视化以及空间多模态梯度变异模式分析，实现了对多模态数据的最全面有效整合 | 平台主要针对10× Visium数据，可能不适用于其他空间转录组技术，且需要进一步验证在更广泛数据集上的适用性 | 开发一个能够有效整合多模态数据并最大化空间信息利用的端到端分析平台，以解决当前空间转录组学分析中的挑战 | 单细胞RNA测序数据和10× Visium空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10× Visium空间转录组技术 |
| 372 | 2026-04-17 |
Engineering and evaluation of precision-glycosylated clickable albumin nanoplatform for targeting the tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.123973
PMID:41355949
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研究论文 | 本文开发了一种精确糖基化的可点击白蛋白纳米平台（CAN-DGIT），用于靶向肿瘤微环境，并结合空间转录组学评估纳米颗粒与TME的相互作用 | 通过精确控制糖基化程度和类型，实现了白蛋白纳米颗粒的可编程生物分布和细胞类型靶向，并创新性地整合PET成像与空间转录组学进行机制映射 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验；糖基化类型和靶向机制的普适性需进一步验证 | 开发一种精确糖基化的纳米药物递送平台，以选择性靶向肿瘤微环境并评估其相互作用 | 白蛋白纳米颗粒、糖基化配体（甘露糖、半乳糖、葡萄糖）、4T1肿瘤小鼠模型 | 纳米医学 | 肿瘤 | 点击化学、MALDI-TOF质谱、UV-vis光谱、PET成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 健康小鼠和4T1肿瘤小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 373 | 2026-04-17 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
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综述 | 本章探讨了人工智能（AI）在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用，重点关注AI如何通过自动化预处理、降维、细胞分类和聚类等方法处理这些复杂数据集 | 系统性地综述了AI（特别是机器学习和深度学习）在单细胞和空间转录组学中的核心作用，包括整合多组学层、识别空间模式和推断细胞轨迹，并强调了卷积神经网络、图神经网络和变分自编码器等具体方法的应用 | 面临可扩展性、模型可解释性和数据标准一致性等挑战，同时临床应用中存在伦理问题 | 旨在展示AI如何推进单细胞和空间转录组学数据分析，以更深入地理解生物系统 | 单细胞转录组学和空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | CNN, GNN, VAE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 374 | 2026-04-17 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
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研究论文 | 本文介绍了PAGER 3.0知识生态系统，这是一个用于多组学数据基因集、网络、通路和互作分析的AI驱动平台 | PAGER 3.0提供了扩展的、经过整理的PAGs（通路、注释基因列表和基因特征）集合，具备本体感知的知识导航、加权富集分析和基于结构化网络的优先排序工具 | 未在摘要中明确说明 | 解决将大规模分子特征集转化为机制性见解的转化生物信息学核心挑战 | 多组学数据，特别是白血病单细胞转录组学数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2026-04-17 |
Identification and validation of SUMOylation-related key genes for osteoarthritis through integration of single-cell, bulk RNA sequencing and animal model experiments
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1779874
PMID:41987786
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和动物模型实验，识别并验证了与骨关节炎相关的SUMOylation关键基因 | 首次结合单细胞测序、批量测序和动物模型，系统识别了骨关节炎中SUMOylation相关的关键基因和细胞类型 | 样本量相对较小，动物模型仅使用大鼠，且未深入探讨关键基因的具体作用机制 | 检测和验证骨关节炎中SUMOylation相关基因的关键作用 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，差异表达分析，PPI网络，机器学习，ROC曲线，免疫浸润分析，药物预测 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 三个公共数据集（GSE51588, GSE55235, GSE152805）和大鼠模型（三个OA和三个假手术样本） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2026-04-17 |
Hypoxic microenvironment in cancer: role in metabolic reprogramming
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1771365
PMID:41988136
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综述 | 本文综述了肿瘤缺氧微环境如何通过代谢重编程驱动肿瘤进展和治疗抵抗 | 系统整合了单细胞多组学、空间转录组学等新兴技术证据，并讨论了靶向缺氧信号、血管生成通路和代谢酶等创新治疗策略 | NA | 阐明缺氧诱导的代谢重编程机制及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用，并探讨利用缺氧相关代谢依赖性的精准肿瘤学策略 | 实体瘤及其缺氧微环境中的恶性细胞和基质细胞（包括癌症相关成纤维细胞、内皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞） | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学，空间转录组学，代谢成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 377 | 2026-04-17 |
From forest floor to doctor's office: the immunological journey of Borrelia burgdorferi through vertebrate hosts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811554
PMID:41988178
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综述 | 本文综述了伯氏疏螺旋体在脊椎动物宿主中的免疫生物学进展，重点关注其通过免疫调节建立持续性感染的机制 | 采用阶段结构化框架整合了2020年后活体成像、单细胞转录组学、空间分析和系统免疫学等新技术带来的新见解 | NA | 理解伯氏疏螺旋体如何通过免疫调节在脊椎动物宿主中建立持续性感染，并为诊断、疫苗和治疗提供信息 | 伯氏疏螺旋体及其在脊椎动物宿主中的感染过程 | 自然语言处理 | 莱姆病 | 活体成像、单细胞转录组学、空间分析、系统免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2026-04-17 |
The mechanism of PKM2/HIF-1α axis polarizing TAMs by upregulating glucose-serine metabolism to promote melanoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740155
PMID:41988200
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2026-04-17 |
Histopathology and spatial transcriptomics jointly map myofiber-specific pathological programs in mTORC1-driven myopathy
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692123
PMID:41573854
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研究论文 | 本研究结合组织病理学和空间转录组学技术，在mTORC1过度激活的啮齿动物模型中，以单肌纤维分辨率揭示了肌纤维类型特异性的病理程序 | 首次将高分辨率Seq-Scope空间转录组学技术与组织病理学相结合，在单肌纤维水平上解析mTORC1驱动肌病的分子机制 | 研究基于啮齿动物模型，结果可能不完全适用于人类疾病；仅分析了两种特定肌肉（EDL和SOL），未涵盖所有肌肉类型 | 探究mTORC1过度激活如何通过不同代谢和结构途径破坏肌肉稳态，并将组织病理表型与分子状态直接关联 | mTORC1过度激活的啮齿动物模型中的骨骼肌组织，特别是趾长伸肌（EDL）和比目鱼肌（SOL） | 空间转录组学 | 肌病 | 空间转录组学，组织病理学分析 | NA | 空间转录组数据，组织病理图像 | 啮齿动物模型中的EDL和SOL肌肉组织样本 | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope | 高分辨率Seq-Scope技术 |
| 380 | 2026-04-17 |
ABCA4-mutant human retinal organoids sequencing reveals organoids application in inherited retinal diseases
2025-Dec, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110677
PMID:41038369
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了由ABCA4突变引起的Stargardt病（STGD）患者与健康对照来源的视网膜类器官（ROs），验证了ROs作为遗传性视网膜疾病（IRDs）疾病模型的潜力 | 首次利用人类视网膜类器官（ROs）结合单细胞RNA测序技术，验证了其在模拟晚期发病的遗传性视网膜疾病（如Stargardt病）中的分子特征捕获能力，特别是在早期发育阶段就能揭示患者与对照样本之间的分子差异 | 研究仅涉及2名STGD患者样本，样本量较小；且ROs模拟晚期发病疾病特性的能力仍需进一步验证 | 验证人类视网膜类器官（ROs）作为由ABCA4突变引起的Stargardt病（STGD）的疾病模型，并探索其在遗传性视网膜疾病（IRDs）研究中的应用潜力 | 来自2名STGD患者和健康对照的干细胞衍生的人类视网膜类器官（ROs） | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2名STGD患者及健康对照的视网膜类器官样本，在两个发育阶段进行比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |