单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
361	2025-05-03	Circadian regulation of lung repair and regeneration 2023-08-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.164720 PMID:37463053	研究论文	探讨生物钟对肺修复和再生的调控作用及其机制	首次揭示了生物钟通过不同途径调控肺再生，并提出将生物钟维度纳入肺修复治疗的新思路	未明确生物钟调控肺再生的具体分子机制	研究生物钟在肺修复和再生中的作用	肺器官样体、气管细胞、肺泡上皮细胞	生物医学	呼吸道感染	单细胞RNA测序、器官样体培养	生物钟紊乱模型	基因表达数据、临床数据	UK Biobank数据库样本及实验模型
362	2025-05-03	Cryobanking of Human Distal Lung Epithelial Cells for Preservation of Their Phenotypic and Functional Characteristics 2022-12, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2021-0507MA PMID:36036918	研究论文	本文详细介绍了一种用于冷冻保存小鼠或人类肺组织上皮细胞以保持其表型和功能特性的方法	提出了一种新的冷冻保存方法，能够长期保存远端肺组织的上皮细胞，适用于下游肺细胞功能和分子表型分析	未提及该方法是否适用于其他类型的肺细胞或组织	开发一种有效的冷冻保存方法，以保持远端肺组织上皮细胞的表型和功能特性	人类和小鼠的远端肺组织上皮细胞	细胞生物学	NA	流式细胞术、上皮类器官形成效率分析、单细胞转录组分析	NA	单细胞转录组数据、流式细胞数据	未明确提及具体样本数量，但涉及人类和小鼠的远端肺组织
363	2025-05-02	RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction 2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20250573 PMID:40298935	research paper	该研究揭示了RORγt eTACs在口服耐受和Treg诱导中的关键作用	首次证实RORγt eTACs是口服耐受诱导的必要细胞群体，并发现其独特的Itgb8表达特征	研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需验证	阐明口服耐受的细胞机制和关键调控细胞	RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、树突状细胞和R-eTACs）	免疫学	自身免疫疾病	谱系追踪、单细胞测序	小鼠基因敲除模型	基因表达数据、细胞表型数据	未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型
364	2025-05-02	Taurine ameliorates liver fibrosis by repressing Fpr2-regulated macrophage M1 polarization 2025-Jun-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2025.177614 PMID:40216178	研究论文	本研究探讨了牛磺酸通过抑制Fpr2调控的巨噬细胞M1极化来改善肝纤维化的机制	揭示了牛磺酸通过SLC6A6转运体和Fpr2/NF-κBp65通路调控巨噬细胞极化状态的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	阐明牛磺酸在肝纤维化中的保护作用机制	人类纤维化肝组织样本和两种不同的小鼠肝纤维化模型	肝脏病理学	肝纤维化	氨基酸代谢组学、基因表达微阵列分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	SLC6A6野生型和敲除小鼠模型	基因表达数据、单细胞转录组数据	人类纤维化肝组织样本和两种小鼠模型
365	2025-05-02	Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Unveils Efferocytosis Patterns and ceRNA Network in Ischemic Stroke 2025-Jun, Translational stroke research IF:3.8Q2 DOI:10.1007/s12975-024-01255-8 PMID:38678526	研究论文	本研究通过整合大量RNA和单细胞测序数据，揭示了缺血性中风中的细胞凋亡清除模式和ceRNA网络	首次整合大量RNA和单细胞测序数据，识别出与细胞凋亡清除相关的关键基因和转录因子，并验证了miR-125b-5p作为缺血性中风的治疗靶点	研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，未涉及人类临床试验	探讨缺血性中风后炎症和细胞凋亡清除的分子机制及其对脑损伤和恢复的影响	缺血性中风患者和小鼠模型的基因表达数据	生物信息学	缺血性中风	RNA测序、单细胞测序、GSEA、GO、KEGG分析	LASSO、ceRNA网络	基因表达数据	多个GEO数据集（GSE137482-3m、GSE137482-18m、GSE30655、GSE174574、GSE56267、GSE122709、GSE215212、GSE231431）和小鼠MCAO模型
366	2025-05-02	Single-Cell Transcriptomics Revealed White Matter Repair Following Subarachnoid Hemorrhage 2025-Jun, Translational stroke research IF:3.8Q2 DOI:10.1007/s12975-024-01265-6 PMID:38861152	研究论文	通过单细胞转录组学揭示蛛网膜下腔出血后白质修复的机制	首次在SAH模型小鼠中识别出修复性小胶质细胞在白质富集区域的浸润和克隆扩增，并发现小胶质细胞相关多效蛋白（PTN）通过mTOR信号通路调控少突胶质前体细胞（OPCs）	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本	探究蛛网膜下腔出血后急性期和亚急性期脑细胞亚群在白质损伤修复中的作用	SAH模型小鼠的脑细胞亚群	神经科学	蛛网膜下腔出血	单细胞RNA测序、基因集富集分析、CellChat软件包分析、磁共振成像、免疫荧光双染色、Western blot	SAH小鼠模型	单细胞转录组数据、影像数据、蛋白质数据	SAH模型小鼠的脑组织样本
367	2025-05-02	Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease 2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany) DOI:10.1007/s00467-024-06611-2 PMID:39805995	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本，揭示了该疾病在细胞水平上的基因表达变化	首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术，揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达下调特征	研究仅基于单个病例样本，结果需要更大样本验证	阐明辅酶Q10肾病在单个细胞水平的基因表达变异	5岁男性辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检组织	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	1例患儿肾脏活检样本
368	2025-05-02	Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung 2025-May-01, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027884 PMID:40014797	research paper	该研究揭示了成人肺中存在功能性造血祖细胞，这些细胞具有增殖和移植能力，并在免疫、巨核细胞/血小板和红细胞相关通路中表现出更高的基线激活	首次在成人肺中鉴定出功能性造血祖细胞，并发现其基因特征与骨髓中的造血祖细胞不同，具有独特的免疫和造血相关通路激活	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类肺中造血祖细胞的实际功能和在人体内的作用仍需进一步验证	探索成人肺中是否存在功能性造血祖细胞及其特征	成人肺中的造血祖细胞	NA	NA	空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
369	2025-05-02	Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension 2025-May, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1 DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010 PMID:39965671	research paper	通过单细胞转录组分析揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）中浆细胞的不同群体	识别了CTEPH中浆细胞的改变表型和分化模式，发现了新的浆细胞亚群（AHNAK和IGLC3）	样本量相对较小（5例CTEPH患者和6例正常肺动脉），且仅关注了浆细胞	研究CTEPH中浆细胞的表型和分化模式	CTEPH患者的肺动脉组织和血清免疫球蛋白	单细胞转录组学	慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和蛋白电泳	NA	RNA测序数据和蛋白质数据	5例CTEPH患者和6例正常肺动脉组织，273例CTEPH患者、259例IPAH患者和251例健康对照的血清样本
370	2025-05-02	Micro-region transcriptomics profiling of cerebral organoids using a capillary-based microdissection system 2025-May-01, Analytical methods : advancing methods and applications IF:2.7Q1 DOI:10.1039/d5ay00277j PMID:40211824	研究论文	本文介绍了一种基于毛细管的组织微切割系统（CMS），用于高效获取培养的脑类器官中的微区域（mROIs）进行mRNA测序（CMS-seq），以研究空间转录组学	开发了一种新型的毛细管组织微切割系统（CMS），能够高效获取脑类器官中的微区域（mROIs）进行mRNA测序，并构建了mROIs的细胞类型空间注释图	未提及样本量是否足够大，以及该方法在其他类型组织中的适用性	研究脑类器官中细胞命运的空间转录组学	培养的脑类器官中的微区域（mROIs）	空间转录组学	NA	mRNA测序（CMS-seq），基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析	NA	mRNA测序数据	未明确提及具体样本量，但涉及20天和60天的脑类器官样本
371	2025-05-02	Microglia-driven inflammation induces progressive tauopathies and synucleinopathies 2025-May-01, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-025-01450-z PMID:40307569	research paper	该研究探讨了小胶质细胞驱动的炎症如何引发和传播神经退行性疾病中的蛋白质病变	首次证明小胶质细胞驱动的炎症可以独立触发神经退行性疾病的全部病理特征，并且这些病理变化可以扩散到更大的脑区	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究小胶质细胞驱动的炎症在神经退行性疾病中的作用	小胶质细胞、tau蛋白、α-突触核蛋白	神经科学	阿尔茨海默病、帕金森病	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据、行为数据	未明确说明小鼠数量
372	2025-05-02	Progressive accumulation of circulating CD27-CD28- effector/memory CD8+ T cells in patients with lung cancer blunts responses to immune checkpoint inhibitor therapy 2025-May-01, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-025-01448-7 PMID:40307573	research paper	该研究揭示了肺癌患者外周血CD8 T细胞亚群的改变及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响	首次系统性地描述了肺癌患者外周血CD8 T细胞亚群的组成变化及其与免疫治疗反应的关系	研究样本量有限(224例)，且机制研究不够深入	探究肺癌如何系统性影响CD8 T细胞区室及其临床意义	肺癌患者的CD8 T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	224名肺癌患者
373	2025-05-02	A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair 2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.5c00667 PMID:40117501	研究论文	本研究介绍了一种通过可见光光催化/水解反应产生氢气的纳米平台，用于动态炎症管理，促进伤口修复	开发了一种新型的氢气生成纳米平台，实现了可控的氢气释放，并揭示了氢气在免疫代谢调控中的具体机制	未提及具体的临床前或临床试验结果，可能缺乏实际应用验证	探索氢气在动态炎症管理和伤口修复中的免疫代谢调控机制	炎症管理、伤口修复	纳米医学	慢性伤口	可见光光催化、水解反应、bulk-RNA测序、单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
374	2025-05-02	Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor 2025-Apr-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf116 PMID:40305521	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
375	2025-05-02	Lactylation-Driven NUPR1 Promotes Immunosuppression of Tumor-Infiltrating Macrophages in Hepatocellular Carcinoma 2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413095 PMID:40305758	研究论文	本研究探讨了核蛋白1（NUPR1）在肝细胞癌（HCC）肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的免疫抑制作用及其对免疫治疗结果的影响	首次揭示了NUPR1通过抑制ERK和JNK信号通路促进M2巨噬细胞极化，并通过组蛋白乳酸化上调NUPR1表达，形成免疫抑制反馈环	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证NUPR1靶向治疗的效果	探究NUPR1在HCC免疫抑制微环境中的作用机制及其作为免疫治疗生物标志物和靶点的潜力	肝细胞癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外和体内功能实验	NA	基因表达数据、功能实验数据	NA
376	2025-05-02	Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants 2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504459 PMID:40305768	研究论文	研究揭示了碳纳米溶胶通过水通道蛋白介导促进植物生长的单细胞转录组机制	首次在单细胞水平上解析了碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制，并发现水通道蛋白在此过程中的关键作用	研究仅针对烟草根部细胞，未涉及其他植物组织或物种	探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制	烟草根部细胞	植物分子生物学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	7,897个细胞（代表13种不同细胞类型）
377	2025-05-02	Tumor-infiltrating mast cells as potential chemoimmunotherapy enhancer in triple-negative breast cancer 2025-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011899 PMID:40306958	research paper	探讨肿瘤浸润性肥大细胞（TIMCs）在三阴性乳腺癌（TNBC）中作为化疗免疫治疗增强剂的潜力	揭示了TIMCs通过富集和激活多种免疫细胞群发挥抗肿瘤作用，为TIMCs靶向治疗与化疗免疫治疗联合应用提供了新思路	未明确提及研究的具体局限性	研究TIMCs在三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境（TIME）中的作用及其对化疗免疫治疗的影响	三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤浸润性肥大细胞（TIMCs）	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	整合了小鼠和人类的单细胞测序数据（具体样本量未提及）
378	2025-05-02	KLRG1 identifies regulatory T cells with mitochondrial alterations that accumulate with aging 2025-Apr-30, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00855-9 PMID:40307497	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术识别出与衰老相关的T细胞亚群，并开发了一种流式细胞术面板用于系统分析小鼠中的这些细胞	发现了一种表达KLRG1的调节性T细胞亚群，该亚群在衰老过程中积累并表现出线粒体改变和促炎表型	研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限	探索衰老过程中T细胞亚群的变化及其在炎症和衰老中的作用	小鼠和人类的CD4 T细胞亚群	免疫学	衰老相关疾病	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	NA
379	2025-05-02	Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis 2025-Apr-30, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08945-9 PMID:40307543	研究论文	研究通过抑制基质机械感知和TGFβ信号通路，探索治疗心血管纤维化的新策略	发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械传感器，联合抑制SRC和TGFβ信号通路可协同抑制纤维化基因程序	研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，尚未在人体临床试验中验证	探索抑制基质机械感知和TGFβ信号通路对心血管纤维化的治疗效果	心脏成纤维细胞和小鼠心脏纤维化模型	心血管疾病	心血管疾病	单细胞测序、药物抑制实验	小鼠模型和工程化心脏组织	基因表达数据、生理功能数据	公共人类和小鼠单细胞测序数据集的荟萃分析
380	2025-05-02	Single-cell transcriptomics reveal how root tissues adapt to soil stress 2025-Apr-30, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08941-z PMID:40307555	研究论文	通过单细胞转录组学和空间转录组学方法，研究水稻根部细胞如何适应不同的土壤条件	揭示了根部细胞在单细胞尺度上如何响应和适应不同土壤条件的分子机制	研究仅针对水稻根部，可能不适用于其他植物	探究根部组织如何在单细胞水平上适应不同土壤条件	水稻根部细胞	植物生物学	NA	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	转录组数据	NA