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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-06-09
Supervised deep learning with gene functional annotation for cell classification
2026-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种整合基因功能注释与单细胞RNA测序数据的深度监督学习方法用于细胞分类 提出了SDAN方法,首次将基因功能注释信息(如蛋白质-蛋白质相互作用)通过图神经网络整合到基因表达谱中,以识别具有功能一致性的基因集 未提及 开发一种能同时实现准确结果分类和明确基因功能关系分配的方法 单细胞RNA测序数据集的细胞分类及与严重COVID-19、痴呆症和癌症免疫疗法反应相关的基因集 机器学习 COVID-19, 痴呆症, 癌症 单细胞RNA测序, 图神经网络 图神经网络 基因表达数据 三个真实数据集,涉及严重COVID-19、痴呆症和癌症免疫疗法反应 NA 单细胞RNA测序 NA NA
362 2026-06-09
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出CeSpGRN方法,从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络 现有方法推断群体或细胞类型水平的基因调控网络,而CeSpGRN利用核加权高斯copula图形模型,在目标函数中整合单细胞分辨率区域信息或多个组学或空间位置信息,以推断细胞特异性网络 NA 从单细胞RNA-seq、配对的scRNA-seq和scATAC-seq或空间转录组学数据推断细胞特异性基因调控网络 模拟数据集和真实数据集中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 核加权高斯copula图形模型 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 模拟数据集和真实数据集 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
363 2026-06-09
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-Jun, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 探讨MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活对NMOSD疾病发作和利妥昔单抗耐药复发的影响 首次发现MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在 monocytes 中被激活,并与利妥昔单抗难治性NMOSD的炎症因子释放相关 样本量较小,尤其是单细胞测序只有2例患者,可能影响结果普适性 阐明利妥昔单抗治疗后仍有复发突破的NMOSD患者中MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的调控机制 NMOSD患者外周血单个核细胞(PBMCs)和血清 数字病理学 视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD) qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告实验, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 NMOSD onset病例: PBMCs n=10, 血清 n=23; 利妥昔单抗治疗病例: 缓解 n=26, 难治复发 n=13; 健康对照 n=15; 单细胞测序: 2例难治复发, 2例缓解, 2例健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞RNA测序使用具体平台未在摘要中说明
364 2026-06-09
Single‑cell Transcriptomic Profiling of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Reveals Lineage Heterogeneity and Dysregulated Osteoblast Genes in Osteoporosis Versus Osteoarthritis
2026-Jun-01, Current gene therapy IF:3.8Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示骨质疏松症与骨关节炎患者骨髓间充质干细胞的谱系异质性和成骨细胞基因失调 首次在单细胞水平上系统比较骨质疏松症与骨关节炎患者骨髓间充质干细胞的细胞亚型组成差异,并鉴定出与疾病进展相关的软骨细胞和成骨细胞动态发育及转录调控机制 仅基于公共数据库数据集GSE147287,且大鼠模型验证中样本量有限,结果需进一步在更大规模临床样本中验证 揭示骨质疏松症和骨关节炎中骨髓间充质干细胞的细胞谱系异质性及其分子机制差异 骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞 单细胞转录组学 骨质疏松症,骨关节炎 单细胞RNA测序 Seurat, Monocle 2, GENIE3 单细胞转录组数据 骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
365 2026-06-09
Comprehensive Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Unveil the Dynamic Landscape of Betel Nut-Associated Oral Mucosal Carcinogenesis and Its Tumor Microenvironment
2026-Jun, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,全面解析了槟榔相关口腔黏膜癌变过程中的肿瘤微环境动态和细胞异质性 首次利用单细胞和空间转录组学技术系统描绘槟榔相关口腔黏膜癌变的动态图谱,鉴定了关键恶性上皮亚群LAMC2 EpiC6及其与CAFs的互作机制 样本量有限(6例患者),且缺乏功能验证实验 阐明槟榔咀嚼导致口腔鳞状细胞癌的肿瘤微环境动态和细胞异质性机制 6例口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 口腔癌(口腔鳞状细胞癌) 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 6例口腔鳞状细胞癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序平台,10x Visium空间转录组平台
366 2026-06-09
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Uncover Immune Dynamics and Cellular Heterogeneity in Benign Prostatic Hyperplasia and Prostate Cancer Transition
2026-Jun, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示良性前列腺增生与前列腺癌转化过程中的免疫动态和细胞异质性 首次利用单细胞和空间转录组学联合分析,描绘了从良性增生到恶性肿瘤的管腔上皮细胞连续转化图谱,并揭示了伴随的免疫抑制微环境动态变化 未提及明显的局限性 探索良性前列腺增生与前列腺癌在免疫状态和恶性进展中的关联,为早期诊断和免疫治疗提供依据 正常、良性前列腺增生和前列腺癌组织样本 数字病理学 前列腺癌, 良性前列腺增生 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
367 2026-06-09
Hydroxytyrosol confers resilience against the depressive, anxiogenic and cognition-disruptive effects of chronic stress
2026-Jun, Neurobiology of stress IF:4.3Q1
研究论文 该研究通过慢性不可预测束缚应激大鼠模型,探讨羟基酪醇对慢性应激引起的抑郁、焦虑和认知障碍的保护作用及其神经保护机制 首次在雌雄大鼠模型中系统评估生物技术生产的羟基酪醇对慢性应激的多维度保护作用,并结合单细胞RNA测序揭示其通过维持神经元转录稳态来抵抗应激的分子机制 未明确提及局限性 研究羟基酪醇对慢性应激诱导的抑郁、焦虑和认知障碍的保护作用及其潜在机制 雌性和雄性大鼠 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 雌性和雄性大鼠,具体样本量未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
368 2026-06-09
Landscape of Immune Remodeling and NAP1L1-Driven Epithelial Reprogramming in Gastric Cancer Metastasis
2026-Jun, Chronic diseases and translational medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析胃癌转移过程中免疫微环境重塑和NAP1L1驱动的上皮细胞重编程 首次系统描绘胃癌从原发灶到转移灶的免疫和上皮细胞动态图谱,并鉴定NAP1L1作为调控上皮细胞重编程和转移进展的新因子 仅基于公共单细胞数据进行分析,缺乏体内外实验验证;样本中淋巴结转移样本量较少 解析胃癌转移过程中肿瘤细胞和免疫微环境的细胞及分子机制 胃癌患者的正常组织、原发肿瘤和转移病灶的细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 131个样本(27例正常胃组织、48例原发肿瘤、56例转移病灶) NA 单细胞RNA测序 NA NA
369 2026-06-09
HBV-driven expansion of CXCR6+-exhausted T cells and CXCL16+ macrophage interaction: Implications for immunotherapy in HCC
2026-Jun-01, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 该研究揭示了HBV阳性肝细胞癌患者对免疫治疗反应更佳的原因,主要与新型PD-1+CXCR6+CD8+T细胞亚群的富集及其与CXCL16+巨噬细胞的相互作用有关 首次发现并鉴定了一种新型耗竭CD8+T细胞亚群PD-1+CXCR6+CD8+T细胞,并阐明其与CXCL16+巨噬细胞的相互作用是HBV-HCC患者免疫治疗反应增强的关键机制 NA 探究乙型肝炎病毒如何影响HBV阳性肝细胞癌患者的免疫治疗反应,并揭示其潜在的免疫机制 528名接受免疫治疗的肝细胞癌患者、HCC小鼠模型 NA 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织微阵列、过继T细胞转移、抗PD-1治疗 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织微阵列数据 528名肝细胞癌患者,包含不同肝炎感染类型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
370 2026-06-09
Multi-omics analysis identifies a major histocompatibility complex class II-associated antigen-presenting cancer-associated fibroblast-like state linked to the nuclear factor erythroid 2-related factor 2-karyopherin subunit beta 1 axis in nonsmall cell lung cancer
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 通过多组学分析鉴定非小细胞肺癌中与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态及其免疫特性 首次发现非小细胞肺癌中存在一种与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态,并阐明其对抗PD-1治疗反应的影响 未明确说明局限性 定义非小细胞肺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态的转录特征、空间分布和免疫相关特性,并评估其与NRF2-KPNB1轴的关系 非小细胞肺癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 从非小细胞肺癌患者获取的原代癌症相关成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
371 2026-06-09
Species-specific roles of cellular communication network proteins in cartilage development: A comparative study using in vitro chondrogenic models
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 通过比较鸡、小鼠和人软骨发育模型,构建以CCN蛋白为中心的调控网络,揭示其物种特异性作用 首次系统比较不同物种软骨发育中CCN蛋白的调控网络,发现CCN1/2为核心保守枢纽,并揭示物种特异性环境感知机制 未说明 阐明CCN蛋白在软骨发育中的物种特异性作用及其调控网络 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养、人间充质干细胞软骨分化模型 计算生物学 NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 共表达网络, 蛋白质-蛋白质相互作用网络 转录组数据 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养样本、人间充质干细胞软骨分化样本、人iPSC软骨分化单细胞数据集 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
372 2026-06-09
Identification of diagnostic biomarkers for neonatal necrotizing enterocolitis via machine learning screening and single-cell virtual gene knockout validation
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
research paper 通过机器学习筛选和单细胞虚拟基因敲除验证,识别新生儿坏死性小肠结肠炎的诊断生物标志物 整合113种机器学习算法组合筛选诊断基因,并首次使用单细胞虚拟基因敲除(scTenifoldKnk)和Geneformer组合扰动分析验证生物标志物,揭示铁死亡作为潜在病理汇聚点 研究主要基于公开数据集和动物模型,缺乏大规模前瞻性临床队列验证 识别新生儿坏死性小肠结肠炎的早期诊断生物标志物并探索其分子机制 新生儿坏死性小肠结肠炎患者和对照组的肠道样本、小鼠NEC模型及肠上皮细胞系 machine learning neonatal necrotizing enterocolitis RNA-seq,单细胞RNA测序,qRT-PCR RF + XGBoost 基因表达数据,单细胞转录组数据 36例NEC患者和34例对照(公共数据集),11,308个肠道细胞(单细胞测序),以及小鼠模型和细胞系 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
373 2026-06-09
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 描述了一种靶向CD20和CD37的首创双功能抗体PSB202在复发或难治性B细胞恶性肿瘤中的I期临床试验,该抗体通过重塑免疫微环境发挥抗肿瘤作用 首次开发靶向CD20和CD37的双功能抗体,无需T细胞参与即可耗竭恶性B细胞,可能减轻CD3相关毒性同时促进细胞毒性免疫激活 该研究为I期试验,样本量较小(15例患者),且未达到最大耐受剂量 评估双特异性抗体PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和疗效 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 数字病理学 B细胞非霍奇金淋巴瘤 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 15例经过大量预治疗的患者,中位年龄67.7岁(范围54-78岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
374 2026-06-09
Single-cell transcriptomics reveals glycolytic heterogeneity and identifies STC2 as a key regulator of metabolic reprogramming in osteosarcoma
2026-May-21, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤中糖酵解异质性并确定STC2为代谢重编程的关键调控因子 通过整合单细胞RNA测序与hdWGCNA,首次在单细胞水平描绘骨肉瘤的代谢图谱,并发现STC2作为糖酵解相关肿瘤进展的关键调控因子,其靶向治疗可有效逆转代谢重编程 文中未明确提及研究局限性 解析骨肉瘤中糖酵解相关的细胞亚群和调控网络,探索治疗新靶点 骨肉瘤细胞(包括MG-63和U2OS细胞系)以及12个骨肉瘤样本的单细胞转录组数据 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、大容量转录组学、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、Seahorse细胞外通量分析 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据 12个骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
375 2026-06-09
BARseq3: a modular system for integrating spatial multi-omics and cellular barcoding in single cells
2026-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 BARseq3是一个模块化系统,用于在单细胞中整合空间多组学和细胞条形码技术 提出了BARseq3模块化系统,将细胞条形码与高空间分辨率转录组和翻译组相结合,支持多种固定样本、免疫染色和物种,且易于扩展以包含其他空间检测方法 现有方法在支持的模式、灵活性和效率方面受限,BARseq3虽然解决了这些问题,但可能仍存在技术复杂度和可及性方面的限制 开发一种灵活高效的模块化系统,用于在组织单细胞中整合空间多组学与细胞条形码技术 单细胞和组织中的分子特征,包括转录组和翻译组 数字病理学 NA 空间转录组学, 细胞条形码 NA 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
376 2026-06-09
Efficacy and Safety of Tunlametinib in Adults with Inoperable Neurofibromatosis Type 1-Associated Plexiform Neurofibromas: Phase IIa Trial and Biomarker Research
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 一项IIa期试验评估Tunlametinib在成人不可手术的神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤中的疗效和安全性,并探索相关生物标志物 首次在成人PN患者中评估MEK抑制剂Tunlametinib的疗效与安全性,并结合单细胞转录组分析揭示微环境异质性与治疗反应差异的关联 样本量小(仅15例),单臂开放标签设计可能引入偏倚,缺乏对照组,且单细胞分析仅基于少数患者(1例快速应答者和2例缓慢应答者) 评估Tunlametinib对成人不可手术的丛状神经纤维瘤的疗效和安全性,并探索临床变量和单细胞转录组特征以解释应答异质性 成人不可手术且放射学上可测量的丛状神经纤维瘤患者 机器学习 神经纤维瘤病1型 单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞转录组数据 15名成人患者(10男5女,中位年龄27岁),其中3例预处理活检用于单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 NA 预处理活检标本进行单细胞RNA测序以分析肿瘤微环境
377 2026-06-09
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出ICePop框架,通过元细胞分辨率整合GWAS与单细胞转录组数据,识别疾病相关细胞状态 首次在元细胞水平实现疾病-细胞类型关联,兼具细胞类型级方法的统计功效和单细胞级方法的异质性检测能力 未提及具体局限性,但可能依赖单细胞数据质量和GWAS汇总统计精度 开发新方法解决GWAS信号向特定细胞状态转化的挑战 81种人类疾病/性状与120种细胞类型 机器学习 溃疡性结肠炎,自闭症谱系障碍,肺部疾病,血细胞计数相关疾病,免疫疾病 GWAS,单细胞RNA测序 元细胞模型 基因表达数据,遗传关联数据 Tabula Muris数据集,涵盖81种性状和120种细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
378 2026-06-09
Discovery and Evaluation of Biomarkers for Triple-Negative Breast Cancer Subtypes Uncovers Patient Stratification and Targeted Therapeutic Strategies
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序发现基底标志物用于三阴性乳腺癌亚型分类,并鉴定达沙替尼作为潜在靶向治疗策略 首次利用单细胞RNA测序定义的基底身份基因对三阴性乳腺癌进行精确亚型划分,并发现TAGLN作为达沙替尼疗效的预测性生物标志物 未提及具体局限性 识别三阴性乳腺癌亚型的生物标志物,改进患者分层并发现靶向治疗方案 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、免疫组化、高通量药物筛选 NA 基因表达数据 两个独立三阴性乳腺癌队列及患者来源异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
379 2026-06-09
SOCS2 inhibits neutrophil N1 polarization to attenuate cardiomyocyte PANoptosis through HSPA8 ubiquitination in atrial fibrillation
2026-May-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了SOCS2通过HSPA8泛素化抑制中性粒细胞N1极化,从而减轻房颤中心肌细胞PANoptosis的机制 首次阐明SOCS2通过泛素化HSPA8调控中性粒细胞N1极化,进而影响心肌细胞PANoptosis在房颤中的作用 未提及具体局限性 探究房颤中免疫细胞(特别是中性粒细胞N1极化)对心肌细胞PANoptosis的调控机制及SOCS2的作用 房颤患者与非房颤对照者心房组织中的免疫细胞及中性粒细胞、心肌细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、泛素化分析 NA 基因表达数据 房颤患者与非房颤对照者心房组织(具体样本量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA 数据库GSE224959中的单细胞RNA测序数据
380 2026-06-09
Inhibition of the p38/JNK MAPK pathway mediated by circadian rhythm genes: Study of the mechanism of Linggan Wuwei Jiangxin decoction in the treatment of COPD
2026-May-10, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 探索苓甘五味姜辛汤通过调节生物钟基因抑制p38/JNK MAPK通路治疗慢性阻塞性肺疾病的机制 首次整合代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序和机器学习,阐明苓甘五味姜辛汤通过生物钟基因Bmal1和Per2调控p38/JNK MAPK通路治疗COPD的新机制 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,缺乏临床试验验证;具体活性成分在体内的代谢和相互作用机制尚需进一步研究 揭示苓甘五味姜辛汤预防和治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制 慢性阻塞性肺疾病大鼠模型和CS-LPS刺激的BEAS-2B细胞模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 UPLC-MS/MS, 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 蛋白质印迹法, RT-PCR WGCNA, 机器学习算法(包括三种机器学习算法) 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 大鼠模型(数量未指定)和BEAS-2B细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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