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当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-11-14 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
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研究论文 | 本研究揭示了TTC36通过YBX3/SPRED1轴抑制肝细胞癌增殖但意外导致索拉非尼耐药的机制 | 首次发现TTC36通过稳定YBX3上调SPRED1抑制Ras/MAPK信号通路，同时揭示TTC36高表达通过PI3K/Akt过度激活导致索拉非尼耐药的新机制 | 未明确说明样本量具体数值，动物模型细节描述有限 | 探究TTC36在肝细胞癌中的肿瘤抑制功能及其对靶向治疗反应的影响 | 肝细胞癌组织、细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pulldown, 双荧光素酶报告基因检测, IHC染色, TUNEL染色 | 动物模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 362 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较犬类和人类肉瘤中肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并分析犬类NK免疫疗法临床试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类模型中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立犬类肉瘤浸润NK细胞特征，并将犬类组织特征用于解析首批犬类免疫疗法临床试验中的NK细胞变化 | 研究样本量有限，主要聚焦于肉瘤类型，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 改善自然杀伤细胞在实体癌中的免疫治疗效果，并识别潜在的生物标志物 | 犬类和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 犬类和人类捐赠者的多组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-11-14 |
Identification of CAF signature genes and construction of CAF-based risk signature in hepatocellular carcinoma by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690174
PMID:41208981
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研究论文 | 通过多组学分析识别肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞特征基因并构建基于CAF的风险预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学识别CAF特征基因，并构建具有预后预测价值的CAF风险模型 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发基于CAF的风险特征模型用于预测肝细胞癌预后和识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多变量Cox回归 | 多变量Cox回归模型 | 基因表达数据,空间分布数据,蛋白质表达数据 | 使用数据集GSE242889的样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2025-11-14 |
Identification of sex- and inflammation-associated heterogeneity in the mouse omentum
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670112
PMID:41208978
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统解析小鼠大网膜在生理和激活状态下的细胞异质性 | 首次建立按性别和激活状态分层的大网膜细胞图谱，发现未表征的免疫和基质细胞亚群及性别二态性基因表达 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 系统定义大网膜的细胞组成异质性及其在炎症和免疫调节中的作用 | 小鼠大网膜组织（包括雄性和雌性） | 单细胞组学 | 炎症性疾病，卵巢癌转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠大网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-11-14 |
Single-cell and machine learning-based pyroptosis-related gene signature predicts prognosis and immunotherapy response in glioblastoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1693940
PMID:41208987
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，开发了一个焦亡相关基因特征(PRGS)，用于预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次系统性地将单细胞分析与机器学习相结合，构建胶质母细胞瘤焦亡相关基因特征，并验证其在预后预测和免疫治疗反应评估中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 开发胶质母细胞瘤预后预测和免疫治疗反应评估的生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法 | StepCox[both]+Ridge, 十种机器学习算法组合 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-GBM、CGGA、GEO、GSE141383和GSE223063等多个数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 366 | 2025-11-14 |
Dysregulated arginine metabolism is associated with pro-tumor neutrophil polarization in liver cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1673665
PMID:41208994
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了精氨酸代谢在肝癌肿瘤微环境中调控中性粒细胞极化的机制 | 首次系统性地揭示了精氨酸代谢驱动的中性粒细胞功能异质性及其在肝癌进展中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证；样本来源有限 | 探究精氨酸代谢在肝癌肿瘤微环境中调控中性粒细胞极化的机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-11-14 |
Monocyte-driven IFN and TNF programs orchestrate inflammatory networks in antisynthetase syndrome-associated interstitial lung disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652999
PMID:41209011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗合成酶综合征相关间质性肺病中单核细胞驱动的干扰素和肿瘤坏死因子信号网络 | 首次在ASS-ILD中识别单核细胞特异性干扰素刺激基因活性，发现单核细胞亚群在炎症轨迹和免疫失调中的核心作用 | 样本量较小（仅3名患者），需更大队列验证发现 | 阐明ASS-ILD的免疫致病机制和细胞特异性干扰素特征 | 治疗初治ASS-ILD患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | AUCell, Seurat, Monocle, CellChat, decoupleR | 单细胞转录组数据 | 3名ASS-ILD患者和3名健康对照（共67,421个细胞），扩展队列126,026个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-11-14 |
Integrated bioinformatic analysis and machine learning developed a prognostic model based on mitochondrial function for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597633
PMID:41209008
|
研究论文 | 本研究通过整合线粒体基因表达数据和机器学习算法，开发了基于线粒体功能的急性髓系白血病预后模型MitoScore | 首次整合14种机器学习算法构建线粒体功能评分系统，并结合单细胞测序分析线粒体基因在免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本来源和验证队列的具体信息 | 开发基于线粒体功能的AML预后评估工具 | 急性髓系白血病患者样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 机器学习集成算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-11-14 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the critical role of fibroblasts in aortic progeria-associated vascular remodeling in Hutchinson-Gilford progeria syndrome mice
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638083
PMID:41209003
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了成纤维细胞在Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠主动脉早衰相关血管重塑中的关键作用 | 首次在HGPS小鼠模型中系统揭示了主动脉成纤维细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络，并鉴定出Lgals3bp作为潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究成纤维细胞在早衰综合征主动脉血管重塑中的作用机制 | HGPS小鼠主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HGPS小鼠主动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 370 | 2025-11-14 |
HOXA5-mediated spatial remodeling of tumor-immune interfaces across cancers promotes AML pathogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1677713
PMID:41209012
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了HOXA5在多种癌症中的空间免疫调控功能及其在AML发病机制中的关键作用 | 首次系统揭示HOXA5在泛癌水平上的空间免疫调控功能，发现其在AML中通过胆固醇生物合成和ECM重塑维持疾病进展，并识别巯嘌呤作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，功能验证仅限于AML细胞系，缺乏体内实验验证 | 探究HOXA5在多种癌症中的空间免疫调控功能和治疗潜力 | 33种癌症类型的多组学数据和AML细胞系（U937、KG-1） | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据 | TCGA数据集11,096例、GTEx数据集7,469例、AML细胞系3个生物学重复 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 371 | 2025-11-14 |
Elevated KNSTRN as a potential indicator for triple-negative breast cancer progression and immune infiltration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572359
PMID:41209020
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研究论文 | 本研究探讨KNSTRN在三阴性乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 首次确认KNSTRN在三阴性乳腺癌中的过表达与不良预后和免疫抑制微环境相关，并验证其促进肿瘤细胞增殖和迁移的功能 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 确定KNSTRN在三阴性乳腺癌预后、免疫浸润和进展中的潜在作用 | 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231和BT549)和患者组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, siRNA敲低, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 细胞实验数据 | 来自TCGA、GEO和METABRIC数据库的多个数据集，以及TNBC细胞系和患者组织样本 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-11-14 |
Profiling Shared Cytotoxic Immune Signatures in SLE-Associated Coronary Injury Through Transcriptomics and Machine Learning
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S539756
PMID:41209049
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研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析系统性红斑狼疮相关冠状动脉损伤中的共享细胞毒性免疫特征 | 首次发现SLE和CAD共享细胞毒性淋巴细胞驱动的分子轴，识别GZMK和KLRK1作为核心生物标志物 | 冠状动脉微血管功能障碍亚组样本量较小(n=4)，需要在扩大队列中进一步验证 | 揭示系统性红斑狼疮与冠状动脉疾病之间的共享分子机制 | 系统性红斑狼疮患者、冠状动脉疾病患者、外周血单个核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qPCR | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE45291,GSE61145等)和验证队列，包括4例SLE冠状动脉微血管功能障碍患者 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-11-14 |
Mathematical strategies for predicting resistant subpopulations from scRNAseq data of a PANC-1 3D tissue model: Insight into gemcitabine resistance and TGFB1-induced invasion and EMT
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.032
PMID:41209344
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析3D培养的PANC-1细胞模型，开发数学策略预测吉西他滨耐药亚群并研究TGFB1诱导的侵袭和上皮间质转化 | 开发了基于互信息的机器学习框架(gSELECT)和新型数学方法，能够从看似相似的细胞群体中预测耐药亚群 | 研究仅基于PANC-1细胞系，需要进一步的功能验证和临床前模型验证 | 研究胰腺导管腺癌的化疗耐药机制和侵袭表型 | 3D培养的PANC-1胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 数学建模 | 基于互信息的机器学习框架(gSELECT) | 单细胞RNA测序数据 | PANC-1细胞3D培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-11-14 |
Single-cell analysis decodes cellular dynamics in clear cell renal cell carcinoma with tumor thrombus
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.019
PMID:41209347
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析透明细胞肾细胞癌中肿瘤血栓形成的细胞动态和分子特征 | 首次对原发性ccRCC肿瘤及其匹配静脉肿瘤血栓进行系统性单细胞分析，揭示了血栓内独特的免疫抑制微环境和细胞间通讯网络 | 研究样本量有限，未包含不同临床分期的系统比较 | 阐明透明细胞肾细胞癌中肿瘤血栓形成的细胞和分子机制 | 原发性透明细胞肾细胞癌肿瘤组织及匹配的静脉肿瘤血栓 | 单细胞组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 匹配的原发肿瘤和肿瘤血栓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2025-11-14 |
The Alterations in the Osteoimmune Microenvironment of STZ-Induced Type 2 Diabetic Mice:A Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S544316
PMID:41209384
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示STZ诱导的2型糖尿病小鼠骨髓免疫微环境的改变 | 首次在单细胞水平描绘2型糖尿病小鼠骨髓免疫细胞的转录组特征和细胞间通讯网络 | 研究仅基于小鼠模型，样本量相对有限，需要进一步的人类样本验证 | 阐明2型糖尿病骨髓免疫微环境的细胞组成和功能变化 | 野生型和STZ诱导的2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, UMAP降维, 伪时间分析, 基因富集分析, CellphoneDB细胞通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 20,245个细胞（9,360个野生型细胞 + 10,885个糖尿病细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2025-11-14 |
Kushe Tincture Ameliorates DNCB-Induced Atopic Dermatitis by Affecting NF-Kb/JAK-STAT3 Pathway: Bioinformatics Analysis and Animal Experiment Verification
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562462
PMID:41209388
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和动物实验验证苦参酊剂通过影响NF-Kb/JAK-STAT3通路改善DNCB诱导的特应性皮炎 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和动物实验系统揭示苦参酊剂治疗特应性皮炎的分子机制 | 研究主要聚焦于NF-KB1和STAT3两个核心靶点，可能忽略其他潜在作用靶点 | 探索苦参酊剂治疗DNCB诱导的特应性皮炎的作用机制 | DNCB诱导的特应性皮炎小鼠模型 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 377 | 2025-11-14 |
Retinoic Acid-Loaded Cartilage Organoids Attenuate Chondrocyte Senescence in Osteoarthritis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S545622
PMID:41209382
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研究论文 | 本研究开发了一种负载视黄酸的仿生软骨类器官系统，用于减轻骨关节炎中的软骨细胞衰老 | 结合多组学分析和机器学习识别关键衰老相关基因，开发新型三相GelMA/HAMA软骨类器官系统实现视黄酸时空控释 | 研究主要基于大鼠DMM模型，需要进一步临床验证 | 开发靶向软骨细胞衰老的骨关节炎治疗策略 | 骨关节炎软骨细胞、大鼠DMM模型 | 机器学习和生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-11-14 |
Microbial function in food fermentations: Current research and future directions
2025, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100491
PMID:41209716
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综述 | 概述食品发酵中微生物功能研究方法，涵盖传统到新兴技术，并总结近期发酵食品微生物功能研究进展 | 强调从微生物组成研究向功能研究的范式转变，提出稳定同位素探测和单细胞测序等新兴技术的应用潜力 | 现有功能预测方法产生群体平均数据，掩盖功能异质性、稀有类群和低丰度种群中的关键贡献者 | 指导复杂发酵系统中微生物功能的针对性研究 | 食品发酵过程中的微生物群落 | 微生物组学 | NA | 扩增子测序、组学技术、稳定同位素探测、单细胞测序 | NA | 微生物组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 379 | 2025-11-14 |
Ce -NeRV3D - a C. elegans Neuron RNA-seq Visualization tool in 3D
2025, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001830
PMID:41210177
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研究论文 | 开发了一个用于在秀丽隐杆线虫3D神经系统中可视化基因表达模式的Blender插件工具 | 首次实现了在完整3D神经系统解剖结构中无限制数量基因表达模式的可视化，并提供可定制的颜色映射和交互式数据探索功能 | NA | 开发神经系统中基因表达空间分布的可视化工具 | 秀丽隐杆线虫的神经系统 | 生物信息学可视化 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、3D解剖结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-11-14 |
PRTS: Predicting Single-Cell Spatial Transcriptomic Maps from Histological Images
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0961
PMID:41210658
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研究论文 | 提出PRTS框架，能够直接从组织学图像预测单细胞分辨率的空间转录组数据 | 首次实现仅使用H&E染色组织图像就能准确预测单细胞水平转录组数据，将分析单元数量提升约27倍 | NA | 开发从组织学图像预测空间转录组数据的方法，降低空间转录组技术的应用成本 | 组织切片中的细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，组织学成像 | NA | 图像，转录组数据 | 每个组织切片约60,000个可分析细胞区域 | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |