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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-07-02 |
MICALL2 promotes angiogenesis of colorectal cancer by regulating the EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA axis
2026-May, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117757
PMID:41617093
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和WGCNA分析发现MICALL2在结直肠癌上皮细胞中高表达并通过EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA轴促进血管生成 | 首次揭示MICALL2通过抑制EGFR溶酶体降解稳定EGFR并激活PI3K/AKT通路进而上调KLF5和VEGFA表达促进结直肠癌血管生成的新机制 | 未提及具体局限性内容 | 探索结直肠癌血管生成的新机制和潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 结直肠癌样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2026-07-02 |
Kitasamycin overcomes ferroptosis and immunotherapy resistance by targeting the HUWE1-NCOA4-FTH1 axis
2026-May, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2623986
PMID:41612599
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研究论文 | 研究发现大环内酯类抗生素北里霉素通过靶向HUWE1-NCOA4-FTH1轴增强铁死亡和免疫治疗疗效 | 首次揭示抗生素北里霉素通过竞争性结合HUWE1抑制其E3泛素连接酶活性,稳定NCOA4并激活铁蛋白自噬通路,从而增强铁死亡和免疫治疗敏感性 | 临床样本中仅通过相关性分析验证了NCOA4低表达HUWE1高表达特征与免疫治疗预后的关联,缺乏前瞻性干预试验验证 | 探索抗生素在免疫治疗中调节铁死亡作用的机制,为需要抗生素治疗的癌症患者寻找增强免疫治疗效果的联合策略 | 北里霉素对铁死亡和免疫治疗抵抗的影响及其分子机制 | 癌症免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、多重免疫组化图像 | 多种黑色素瘤模型:B16F10皮下肿瘤模型、BRAF-PTEN驱动自发肿瘤模型、人源外周血单个核细胞人源化小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 363 | 2026-07-02 |
Multidimensional Characterization of Tumor-Immune Architecture Reveals Clinically Relevant Classic Hodgkin Lymphoma Subtypes
2026-May-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0859
PMID:41615883
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研究论文 | 采用多模态方法对经典霍奇金淋巴瘤进行多维表征,揭示了四种与临床相关的分子亚型 | 首次通过整合恶性细胞测序、空间转录组学和成像质谱流式技术对cHL进行系统性多维度分析,并基于肿瘤免疫架构识别出具有不同临床特征和空间组织的四种分子亚型 | 未提及具体局限性 | 通过多维分子和空间分析揭示经典霍奇金淋巴瘤的疾病异质性和临床相关亚型 | 经典霍奇金淋巴瘤(cHL)肿瘤样本 | 数字病理学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 测序,空间转录组学,成像质谱流式 | NA | 图像,基因表达数据,空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2026-07-02 |
Retinoic acid drives cell fate specification, maturation and retinal regionality in human retinal organoids
2026-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72130-3
PMID:42031716
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研究论文 | 视黄酸通过时空剂量调控驱动人视网膜类器官中的细胞命运特化、成熟及区域化特征 | 首次揭示视黄酸剂量依赖性地调控人视网膜类器官中黄斑样与外周样区域身份的建立,并结合单细胞与空间转录组学解析其机制 | 视黄酸浓度梯度在体内动态调控的复杂性尚未完全模拟,且类器官模型可能无法完全再现人视网膜的完整区域性特征 | 阐明视黄酸在人类视网膜发育中调控细胞命运、成熟及区域特化的分子机制 | 人视网膜类器官 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、空间表达数据 | 人视网膜类器官样本,具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组,10x Visium 用于空间转录组分析 |
| 365 | 2026-07-02 |
A macrophage MHC-I axis links intratumoral heterogeneity to terminal CD8+ T cell exhaustion in lung adenocarcinoma
2026-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01446-6
PMID:42031958
|
研究论文 | 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,研究肺腺癌中肿瘤内异质性如何加剧CD8 T细胞耗竭 | 首次揭示巨噬细胞MHC-I轴连接肿瘤内异质性与终末期CD8+T细胞耗竭,并开发六基因决策树分类器预测表型 | 未提及具体的实验验证或临床干预结果,分类器的临床实用性需进一步验证 | 探索肺腺癌中肿瘤内异质性与CD8 T细胞耗竭之间的分子机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本(包括批量、单细胞和空间转录组数据) | 数字病理学 | 肺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多个队列的批量、单细胞和空间数据 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 366 | 2026-07-02 |
Deep learning for predicting pituitary neuroendocrine tumour lineage and high-risk subtypes from histology
2026-Apr-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01444-8
PMID:42031964
|
研究论文 | 利用深度学习模型从常规H&E染色全切片图像预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 首次使用深度学习模型直接从常规H&E染色全切片图像中预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发,并通过空间转录组学验证了与复发相关的免疫和分子特征 | 复发预测的AUC仅为0.641,表明模型在预测复发方面性能有限 | 开发深度学习模型以预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 垂体神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | NA | 深度学习 | 图像 | 训练集925例(中国科学技术大学),外部验证集:太和医院226例、华山医院193例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 367 | 2026-07-02 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 该研究发现DAPK2通过磷酸化PKM2的苏氨酸45位点,促进扰动血流诱导的动脉粥样硬化形成 | 首次揭示DAPK2通过磷酸化PKM2的T45位点调控内皮细胞炎症反应,并鉴定该通路为动脉粥样硬化的新机制和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证尚需进一步开展 | 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用 | 人及小鼠动脉内皮细胞、Apoe-/-小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱, 免疫共沉淀, 邻近连接法 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 包括公开数据库数据及小鼠模型样本(具体数量未明确) | Illumina | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公开数据库包括基因芯片、RNA测序及单细胞RNA测序数据 |
| 368 | 2026-07-02 |
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168175
PMID:41616982
|
研究论文 | 研究发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化调控THBS1激活PI3K/AKT通路,促进肝细胞癌血管生成 | 首次发现ITIH2作为肝细胞癌预后生物标志物,通过泛素化介导的THBS1稳定性调控激活PI3K/AKT通路,促进血管生成,且不直接影响肿瘤细胞增殖或凋亡 | 未具体说明局限性,但可能包括样本量有限和机制细节需进一步验证 | 阐明肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展之间的分子机制 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归、多变量Cox回归 | 单细胞转录组数据 | 2例肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2026-07-02 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
|
研究论文 | 研究重复性增殖事件对造血干细胞和祖细胞年龄相关DNA损伤积累的改善作用 | 通过多次放血实验诱导小鼠HSPC持续增殖,发现重复增殖事件可清除年龄相关的DNA双链断裂积累,而不影响造血功能 | 未提供具体局限性信息 | 探究增殖速率增加对造血干细胞和祖细胞造血衰老的影响 | 小鼠和人的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 机器学 | 老年疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 370 | 2026-07-02 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
|
研究论文 | 该论文通过单细胞RNA测序和ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生的机制 | 首次利用单细胞多组学技术(scRNA-seq和scATAC-seq)揭示母体肥胖通过激活蛋白1(AP-1)转录因子增强炎症基因(如Tnf和Cd68)的染色质可及性,从而抑制神经发生的关键转录因子(如Neurod1、Neurog2和Ascl1)表达 | NA | 探究母体肥胖对胚胎神经发育影响的分子机制 | 母体肥胖小鼠及其E11.5和E13.5胚胎 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组、单细胞染色质可及性 | 母体肥胖小鼠(高脂饮食喂养2个月)及其E11.5和E13.5胚胎 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 371 | 2026-07-02 |
Transcriptional regulation of the main olfactory epithelium by environmental olfactory exposures
2026-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.24.713727
PMID:41929152
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究环境嗅觉暴露对小鼠主嗅觉上皮细胞类型特异性转录调控的影响 | 首次在稳态条件下识别环境嗅觉暴露对主嗅觉上皮细胞类型特异性转录的影响 | 未深入探讨多细胞相互作用和通讯在嗅觉上皮调节中的具体机制 | 研究环境嗅觉暴露如何影响小鼠主嗅觉上皮中不同细胞类型的转录反应 | 小鼠主嗅觉上皮,包括嗅觉感觉神经元、支持细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠主嗅觉上皮样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2026-07-02 |
Ferroptosis in heart failure: from molecular insights to therapeutic implications
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag019
PMID:41616804
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综述 | 本文综述了铁死亡在心力衰竭中的作用机制,从分子层面到治疗应用进行了全面分析 | 提出了'铁死亡中枢'概念框架,将铁动员、抗氧化崩溃、脂质启动和线粒体/钙放大器形成一个自我增强循环导致泵衰竭的新机制 | 铁死亡与心力衰竭之间的明确因果关系尚未建立,并且缺乏标准化的铁死亡特征和机制驱动的临床试验 | 探讨铁死亡在心力衰竭中的作用机制及潜在治疗策略 | 心力衰竭动物模型及人类心肌和心外膜脂肪组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2026-07-02 |
Spatially-resolved single cell atlas of liposarcoma reveals lineage hierarchies, immune niches, and regulatory circuits
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713651
PMID:41929055
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研究论文 | 利用单核多组学测序、表观基因组谱分析和空间转录组学技术,构建了脂肪肉瘤的空间分辨单细胞图谱,揭示了其谱系层次、免疫微环境和调控回路 | 首次在单细胞和空间分辨率下系统表征了高分化与去分化脂肪肉瘤的细胞和表观遗传异质性,发现了新的基因调控回路和中间亚型 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明脂肪肉瘤不同亚型之间的细胞和表观遗传异质性 | 高分化脂肪肉瘤和去分化脂肪肉瘤的肿瘤及免疫细胞 | 机器学习和数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单核多组学测序、表观基因组谱分析、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium | 单核多组学测序和空间转录组学平台 |
| 374 | 2026-07-02 |
MAP4K2 suppresses antitumor immunity in a pancreatic cancer model by promoting Treg differentiation
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196379
PMID:41615953
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研究论文 | 该研究揭示了MAP4K2通过促进Treg细胞分化抑制抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现MAP4K2通过磷酸化DDX39B诱导其核转位,进而促进Foxp3 RNA剪接和Treg分化,并证明靶向MAP4K2可增强胰腺癌免疫治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本分析仅限于scRNA-seq数据,缺乏直接的人体干预验证 | 阐明MAP4K2在免疫调节中的体内功能及其在肿瘤免疫抑制中的作用机制 | T细胞特异性Map4k2条件敲除小鼠及胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | scRNA-seq, 质谱分析, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | T细胞特异性Map4k2条件敲除小鼠及胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2026-07-02 |
A protective role of ECSIT in chemotherapy-induced intestinal mucositis by maintaining Lgr5+ intestinal stem cells and gut homeostasis
2026-Mar-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124236
PMID:41611204
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research paper | 本研究揭示了ECSIT在化疗所致肠黏膜炎中通过维持Lgr5+肠道干细胞和肠道稳态发挥保护作用 | 首次阐明了ECSIT通过稳定β-catenin复合物并调控Wnt信号通路来维持肠道干细胞平衡和黏膜修复的双重作用机制 | 未提及具体局限性 | 阐明ECSIT在化疗所致肠黏膜炎中对肠道干细胞平衡和黏膜修复的作用,特别是Wnt/β-catenin通路 | Lgr5+肠道干细胞和肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 化疗所致肠黏膜炎 | 多组学分析、基因编辑、单细胞测序 | NA | 多组学数据、单细胞测序数据 | 肠道上皮特异性敲除小鼠和Lgr5特异性诱导敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2026-07-02 |
IL-33 promotes rheumatoid arthritis progression by enhancing pro-inflammatory macrophage development in the synovial microenvironment
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20258645
PMID:41615676
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研究论文 | 研究IL-33在类风湿关节炎滑膜微环境中促进促炎性巨噬细胞分化,进而推动疾病进展的机制 | 首次揭示IL-33在RA滑膜液中与疾病活动度及自身免疫标志物的相关性比血清更强,并阐明IL-33/ST2信号通过MAPK/NF-κB通路促进单核细胞分化为促炎性巨噬细胞,形成炎症正反馈循环 | 未提及具体局限性,但样本量可能有限,且需进一步在更大队列中验证 | 探索IL-33在RA滑膜微环境中的作用,尤其是在促进促炎性巨噬细胞分化中的关键功能,为治疗抵抗患者提供新靶点 | 类风湿关节炎患者及滑膜微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, KEGG富集分析, 细胞实验 | NA | 血清和滑膜液样本, 单细胞转录组数据 | 匹配的RA患者血清和滑膜液样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2026-07-02 |
Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases
2026-Feb-28, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.034
PMID:41611568
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综述 | 系统总结了截至2025年9月的77种空间转录组学技术和594种分析工具,涵盖完整分析流程、平台依赖性考量以及空间多组学整合,并构建了持续更新的SpatialToolDB数据库平台 | 首次对空间转录组学分析工具进行大规模系统梳理(594种工具),并开发了整合技术、方法和数据库的持续更新平台SpatialToolDB,为平台选择和工具比较提供数据驱动基础 | 未明确说明具体局限性,但文中提及技术选择、方法比较和数据解释仍面临挑战,且部分工具性能可能受空间分辨率和检测效率差异影响 | 系统综述空间转录组学技术平台和分析工具,为生物医学研究中的平台选择和策略制定提供指导 | 空间转录组学技术、分析工具及相关数据库 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 378 | 2026-07-02 |
A systems-level machine learning approach uncovers therapeutic targets in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-09, npj drug discovery
DOI:10.1038/s44386-025-00036-z
PMID:42380275
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研究论文 | 本文提出一种系统级机器学习方法,整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用网络和药物邻近性分析,识别透明细胞肾细胞癌的治疗靶点 | 创新性地利用机器学习管道整合多组学数据(单细胞转录组、蛋白质网络、CRISPR筛选),发现具有新机制的治疗靶点和潜在抗癌药物组合 | 仅基于临床前细胞系筛选,缺乏体内模型和临床试验验证 | 识别透明细胞肾细胞癌中未被探索的内在治疗靶点及候选药物 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 | 机器学习 | 肾癌(透明细胞肾细胞癌) | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选, 药物邻近性分析 | 机器学习管道(系统级) | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用网络数据、药物靶点数据 | NA(论文未具体说明样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2026-07-02 |
Comprehensive tumour-immune profiling reveals TREM2+ tumour-associated macrophages facilitating lymph node metastasis in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70604
PMID:41612852
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研究论文 | 全面肿瘤免疫分析揭示TREM2+肿瘤相关巨噬细胞促进头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移的机制 | 首次通过整合688,866个单细胞转录组数据,系统揭示了TREM2+肿瘤相关巨噬细胞通过SPP1-CD44-BHLHE40轴促进CD8+ T细胞耗竭,进而导致淋巴结转移的免疫微环境机制 | NA(摘要未明确提及局限性) | 揭示头颈部鳞状细胞癌淋巴结转移相关的免疫微环境特征及TREM2+肿瘤相关巨噬细胞的功能机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 多重免疫组化, 体外共培养 | 机器学习预后模型 | 单细胞转录组数据, 微阵列数据, 临床队列数据 | 212个头颈部鳞状细胞癌样本共计688,866个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 380 | 2026-07-02 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
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研究论文 | 通过空间转录组数据整合单细胞RNA测序,解析树突细胞-T细胞相互作用的配体-受体网络,发现F11R等关键基因与自身免疫性皮肤炎症严重程度相关 | 首次建立空间框架识别树突细胞-T细胞通讯介质,发现F11R作为疾病严重程度相关的空间富集标志物 | 未在更大规模队列或不同疾病阶段验证F11R的临床相关性,缺乏功能实验验证其直接调控机制 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突细胞-T细胞通讯新介质 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突细胞和T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、CITE-seq数据 | 特应性皮炎和银屑病皮肤样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium空间转录组学和10x Chromium单细胞3'测序 |