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当前共找到 37441 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-03-14
Spatiotemporal transcriptome atlas of developing mouse lung
2025-05-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,构建了小鼠肺发育从E12.5到P0期的时空转录组图谱 首次报道了发育中肺的全面时空转录组图谱,结合空间和单细胞数据识别了10个关键空间域和谱系轨迹 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类肺发育,且未进行功能实验验证关键基因如Angpt2和Epha3的具体作用 旨在理解哺乳动物肺功能发育的复杂过程,包括分支形态发生和肺泡生成 小鼠肺组织,涵盖胚胎期E12.5到出生后P0的发育阶段 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 小鼠肺组织样本,覆盖E12.5至P0多个时间点 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
362 2026-03-14
An automatic annotation tool and reference database for T cell subtypes and states at single-cell resolution
2025-05-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究构建了最大的人类T细胞参考数据库,并开发了名为STCAT的自动注释工具,用于单细胞RNA测序数据中T细胞亚型和状态的精准注释 构建了包含134.8万个T细胞、涵盖35种条件和16种组织的最大人类T细胞参考数据库;开发了基于分层模型和标记物校正的新型自动注释工具STCAT,其准确率比现有工具提高28%;首次系统揭示了CD4 Treg细胞在肿瘤样本中的富集现象以及CD8 naive相关细胞在健康个体中的丰度特征 参考数据库主要基于现有公开数据集构建,可能无法涵盖所有疾病状态和组织类型;工具验证仅在六个独立数据集上进行,需要更广泛的临床验证 开发T细胞亚型和状态的自动注释工具及参考数据库,以促进T细胞免疫和肿瘤免疫学研究 人类T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) 单细胞组学 肺癌、COVID-19、卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 分层模型 单细胞转录组数据 1,348,268个T细胞,来自35种条件和16种组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
363 2026-03-14
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度GWAS关联基因的潜在因果作用 首次结合单细胞转录组轨迹分析与网络驱动基因识别,从细胞状态动态变化角度揭示骨密度调控新机制 研究基于小鼠模型数据,在人类中的直接验证尚需进一步实验 解析骨密度GWAS关联基因的细胞类型特异性功能与因果机制 骨髓来源基质细胞在成骨条件下的分化过程 单细胞转录组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 网络分析 单细胞转录组数据 多样性远交小鼠的骨髓基质细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
364 2026-03-14
The impact of breast radiotherapy on the tumor genome and immune ecosystem
2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了放疗对雌激素受体阳性乳腺癌患者肿瘤基因组和免疫微环境的影响 首次结合单细胞DNA测序和单细胞RNA测序技术,在放疗前后时间点分析乳腺癌肿瘤的克隆选择和免疫细胞动态变化 样本量较小(20名患者),仅针对雌激素受体阳性乳腺癌,且随访时间较短(放疗后7天) 阐明放疗如何调节乳腺癌肿瘤微环境,特别是对肿瘤基因组和免疫生态系统的影响 20名接受新辅助放疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 20名患者,其中8名进行scDNA-seq,11名进行scRNA-seq,在放疗前和放疗后7天采集肿瘤活检样本 NA 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
365 2026-03-14
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶EZH2在调控记忆B细胞(MBC)编程和回忆应答中的关键作用 首次在流感感染模型中系统阐明了EZH2如何调控MBC的形成、表型维持和功能潜能,并发现EZH2缺失导致MBC库向非生发中心型IgM+亚群偏移 EZH2敲除不完全,可能存在残留活性影响表型解读;研究主要聚焦流感感染模型,在其他病原体感染中的普适性需进一步验证 探究表观遗传酶EZH2在记忆B细胞分化与功能调控中的作用机制 小鼠(Mus musculus)记忆B细胞及其亚群 免疫学 传染病(流感) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确样本数量(使用抗原特异性MBC进行scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序 NA NA
366 2026-03-14
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析探索瘢痕疙瘩的分子机制,识别了关键基因和免疫细胞参与 结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序,首次系统识别DUSP1和HOXA5作为瘢痕疙瘩的关键枢纽基因,并揭示IL17信号通路和免疫细胞(如肥大细胞和巨噬细胞)的关键作用 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;多组学数据的整合分析可能存在技术偏差 识别瘢痕疙瘩的潜在致病机制、枢纽基因和免疫细胞参与,为靶向治疗提供新见解 瘢痕疙瘩组织 生物信息学 皮肤肿瘤(瘢痕疙瘩) bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫浸润分析, GSEA, GSVA, 网络分析 NA 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
367 2026-03-14
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,识别并验证了瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物及巨噬细胞极化类型 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,利用WGCNA和三种机器学习方法识别出BMP1和IL1R1作为新型生物标志物,并揭示了瘢痕疙瘩中M2巨噬细胞显著增加而M1减少的极化异常 研究依赖于公共数据库数据,样本量可能有限,且实验验证仅通过WB和IF进行,需要进一步功能研究确认机制 识别瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型,为治疗提供新见解 瘢痕疙瘩组织样本 生物信息学 瘢痕疙瘩 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习(LASSO, SVM-RFE, RF), 蛋白质印迹, 免疫荧光 LASSO, SVM-RFE, 随机森林 RNA-seq数据 多个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051),具体样本数未明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
368 2026-03-14
Kölliker's Organ Functions as a Developmental Hub in Mouse Cochlea Regulating Spiral Limbus and Tectorial Membrane Development
2025-03-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了Kölliker's器官作为发育枢纽,调控小鼠耳蜗螺旋缘和盖膜发育的关键作用 首次发现Kölliker's器官通过上皮-间质信号通路(涉及CTGF因子)非自主性调控螺旋缘间质基质发育,并确认其为新的耳聋基因 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;单细胞测序样本量有限 探究Kölliker's器官在耳蜗发育中的功能及其对听力形成的影响 基因敲除小鼠的耳蜗组织(Kölliker's器官、螺旋缘、盖膜) 发育生物学 听力障碍 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除、听觉脑干反应测试 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、组织形态学数据、生理功能数据 未明确样本数量的小鼠耳蜗组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
369 2026-03-14
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于半透性胶囊(SPCs)的高通量单细胞组学技术,用于多种核酸分析,包括数字PCR、基因组测序和单细胞RNA测序 开发了基于半透性胶囊的通用技术,克服了液滴微流体系统长期培养和克隆扩增的限制,提供了更高的转录本捕获效率 未明确说明技术在大规模应用中的成本、通量上限或与其他单细胞平台的直接比较数据 开发一种高效、可定制的单细胞组学技术,用于解析生物系统的复杂性和异质性 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本中的成熟粒细胞和单核细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、数字PCR、基因组测序、FACS分选 NA 单细胞转录组数据 造血系统疾病患者的白细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 CapSeq(胶囊测序) 基于半透性胶囊(SPCs)的单细胞测序技术,支持长期细胞培养和克隆扩增
370 2026-03-14
Gut microbial production of lithocholic acid reprograms pro-resolutive macrophages to enhance vedolizumab responsiveness via the TGR5/FXR-NF-κB axis
2025-Jan-02, The ISME journal
研究论文 本研究揭示了肠道微生物代谢物石胆酸通过TGR5/FXR-NF-κB轴重编程巨噬细胞为促消退表型,从而增强克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应性的机制 首次阐明了肠道微生物来源的石胆酸通过调控巨噬细胞表型转化来增强维多珠单抗疗效的分子机制,并建立了微生物-免疫互作环路 研究主要基于人源化小鼠模型,临床验证仍需进一步开展;机制研究集中在巨噬细胞,其他免疫细胞的作用未充分探讨 探究克罗恩病患者对维多珠单抗治疗反应差异的机制,寻找预测疗效的生物标志物 克罗恩病小鼠模型、临床患者粪便样本、肠道巨噬细胞 免疫代谢学 克罗恩病 宏基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序、转录组分析 人源化小鼠模型 基因组数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
371 2026-03-14
Linking Cellular Senescence to Vascular Pathology: The Diagnostic Potential of Superoxide Dismutase 2 in Aortic Dissection
2025, Vascular health and risk management IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学和单细胞转录组学分析,探讨了血管衰老的分子和细胞机制及其在主动脉夹层(AD)发病中的关键作用,并确定了超氧化物歧化酶2(SOD2)作为AD的潜在诊断生物标志物和治疗靶点 首次将SOD2与主动脉夹层的血管衰老和免疫调节联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示了其在巨噬细胞和树突状细胞中的特异性表达,同时构建了基因-药物相互作用网络以探索靶向治疗的可能性 研究主要基于公开数据集和单细胞测序数据,需要进一步的实验验证和临床队列研究来确认SOD2的诊断和治疗价值 探讨血管衰老在主动脉夹层发病中的分子和细胞机制,并寻找潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 主动脉夹层组织样本及相关公开数据集(GSE52093, GSE153434) 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, ROC分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 基于两个公开数据集(GSE52093, GSE153434)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
372 2026-03-14
Exhaustion of NK cells and interferon activation in anti-MDA5+ dermatomyositis are associated and determine the development of ILD
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了抗MDA5+皮肌炎患者中干扰素过度激活导致自然杀伤细胞耗竭,并与间质性肺病的发生发展相关 首次在抗MDA5+皮肌炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了干扰素信号通路广泛激活与自然杀伤细胞耗竭之间的关联,并证实了这种耗竭与间质性肺病严重程度的相关性 样本量较小(仅6名患者),且为横断面研究,无法确定因果关系 探究抗MDA5+皮肌炎患者外周血中自然杀伤细胞和干扰素信号的作用,特别是在间质性肺病发展中的作用 抗MDA5+皮肌炎患者(伴有或不伴有间质性肺病)的外周血单个核细胞和血清样本 数字病理学 皮肌炎与间质性肺病 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外细胞培养实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清细胞因子数据 6名新诊断的活动性抗MDA5+皮肌炎患者(3名伴有ILD,3名不伴有ILD),以及一个独立队列用于验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
373 2026-03-14
Exploration of the Prognostic Role of Apoptosis-Related Genes in Glioblastoma
2025, Stem cells international IF:3.8Q2
研究论文 本研究构建了一个基于凋亡相关基因的预后模型(AS模型),用于预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后,并探讨了其与肿瘤免疫微环境和细胞间通讯的关联 通过整合TCGA、CGGA和GEO数据库的转录组和单细胞测序数据,在101种机器学习算法组合优化下构建了凋亡相关基因预后模型,并发现HSPB1基因与风险评分高度相关,对GBM预后有良好预测效果 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且模型在外部数据集中的泛化能力需进一步评估 探索凋亡相关基因在胶质母细胞瘤预后中的作用,并构建一个高预测性能的预后模型 胶质母细胞瘤(GBM)患者及其肿瘤组织与相邻非肿瘤组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 转录组测序, 单细胞测序 机器学习算法组合(具体未指定,如Cox分析等) 基因表达数据 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多个数据集,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
374 2026-03-14
Glioblastoma Prognosis and Therapeutic Response Predicted by a Cancer-Associated Fibroblasts Risk Score
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究基于癌症相关成纤维细胞相关特征构建了胶质母细胞瘤的预后风险评分模型,旨在为患者提供精确分层和优化治疗策略的新见解 首次系统性地将癌症相关成纤维细胞特征整合到胶质母细胞瘤的预后模型中,并开发了包含风险评分和临床病理特征的综合列线图,提高了预测准确性 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本异质性和数据质量的限制,且模型需在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 开发一个基于癌症相关成纤维细胞特征的胶质母细胞瘤预后模型,以改善患者分层和治疗策略 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 回归分析模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
375 2026-03-14
Comprehensive Single-Cell Characterization of LDL in the Ovarian Cancer Microenvironment and Its Prognostic Implications
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,全面揭示了低密度脂蛋白(LDL)在卵巢癌肿瘤微环境中的分布、功能通路及预后价值 首次在单细胞水平系统表征LDL在卵巢癌微环境中的空间分布,并构建了基于LDL相关基因的卵巢癌预后签名模型(LDLOCPS) 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源和队列异质性可能影响模型泛化性 阐明LDL在卵巢癌肿瘤微环境中的具体作用和机制,并开发预后预测工具 卵巢癌患者的单细胞转录组数据和批量RNA-seq数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq 机器学习模型 转录组数据 多个队列的卵巢癌患者数据(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
376 2026-03-14
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Inflammatory Antigen-Presenting Macrophages Subtype Drive Vitiligo Pathogenesis Through STAT1-Mediated Dual Mechanisms
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了白癜风发病机制中一个关键的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型及其通过STAT1介导的双重作用机制 首次在白癜风中鉴定出炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型,并阐明其通过STAT1介导的直接抑制黑色素细胞和增强T细胞活化的双重致病机制 研究主要基于单细胞转录组数据,体内外实验验证仍需进一步扩展,样本量相对有限 阐明白癜风发病机制中巨噬细胞的异质性、功能及其调控网络 健康与白癜风患者的皮肤组织样本 数字病理学 白癜风 单细胞RNA测序 hdWGCNA 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但包括健康与白癜风患者的皮肤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
377 2026-03-14
Integrative Genomic and Single-Cell Insights Into Efferocytosis-Mediated Immune Regulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合基因组学和单细胞技术,探讨了efferocytosis在透明细胞肾细胞癌中的免疫调节作用及其预后意义 首次在ccRCC中系统量化efferocytosis通路活性,构建基于岭回归的预后模型,并通过多组学整合及单细胞/空间转录组学鉴定RAC1为关键风险基因 研究主要基于公共数据集,缺乏前瞻性临床队列验证;IHC验证数据来源单一(Human Protein Atlas) 阐明efferocytosis在ccRCC中的预后价值、分子机制及免疫调控作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本及相关基因组/转录组数据 计算生物学 肾细胞癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, 基因组变异分析 岭回归模型 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 未明确样本数量(基于公共数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
378 2026-03-14
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自74名不同神经系统疾病和中枢神经系统区域捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞的异质性,并识别了与疾病相关的亚群及能模拟其状态的化合物 构建了一个跨疾病的活体人类小胶质细胞资源库,识别了与疾病相关的亚群,并验证了能在体外模拟特定亚群状态的化合物,如喜树碱 NA 理解人类小胶质细胞的异质性,以促进针对其状态或功能的靶向治疗开发 活体人类小胶质细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 215,680个细胞来自74名捐赠者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
379 2026-03-14
Leveraging deep single-soma RNA sequencing to explore the neural basis of human somatosensation
2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞体深度RNA测序和空间转录组学技术,构建了人类背根神经节神经元图谱,揭示了人类体感生理学的新见解 首次通过单细胞体深度RNA测序技术,从个体人类背根神经节神经元中检测到平均超过9,000个独特基因,并识别出16种神经元类型,结合跨物种分析揭示了人类特异性神经元类型的存在 技术难度可能限制了样本获取和处理,且研究依赖于特定实验条件,可能影响结果的普适性 探索人类体感系统的神经基础,特别是背根神经节神经元的分子特征和功能 人类背根神经节神经元 数字病理学 NA RNA-seq, 空间转录组学, RNAscope原位杂交 NA RNA序列数据, 空间转录组数据 个体人类背根神经节神经元 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
380 2024-11-07
Mapping out multiple sclerosis with spatial transcriptomics
2024-Dec, Nature neuroscience IF:21.2Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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