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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-07-10 |
Decoding cellular communication networks and signaling pathways in bone, skeletal muscle, and bone-muscle crosstalk through spatial transcriptomics in a young male mouse
2026-05-19, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00520-w
PMID:42156722
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术解码年轻雄性小鼠骨骼、骨骼肌及骨-肌互作中的细胞通信网络和信号通路 | 首次构建了骨-肌组织间空间分辨的转录组级别细胞间通信图谱，整合10x Visium空间转录组与计算工具，揭示了多种配体-受体对在组织间的交互作用 | 仅基于小鼠模型，且未考虑年龄、性别或疾病状态对骨-肌互作的影响 | 探究骨与骨骼肌之间的分子串扰机制，建立空间转录组学视角下的细胞通信网络 | 年轻雄性小鼠的股骨及相邻骨骼肌组织 | 数字病理学 | 骨质疏松症, 肌少症, 代谢综合征 | 空间转录组学, 10x Genomics Visium, 计算工具（SMART, CellChat） | NA | 空间转录组数据, 免疫荧光染色数据, 单细胞RNA测序数据 | 年轻雄性小鼠的股骨和骨骼肌组织，以及独立的小鼠和人类单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台用于组织切片基因表达分析 |
| 362 | 2026-07-10 |
Eltrombopag restores T-cell homeostasis in aplastic anemia by regulating oxidative metabolism and reactive oxygen species levels
2026-May-18, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07060-7
PMID:42144489
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研究论文 | 本研究探讨艾曲泊帕通过调节氧化代谢和活性氧水平恢复再生障碍性贫血中T细胞稳态的机制 | 首次揭示了艾曲泊帕通过调控氧化代谢途径（上调ENPP1和ENTPD5）来恢复T细胞稳态的新机制，超越了其传统的造血促进作用 | 未在摘要中明确说明局限性 | 探究艾曲泊帕是否通过氧化代谢途径调节再生障碍性贫血中T细胞的功能表型 | 再生障碍性贫血小鼠模型及T细胞亚群（CD4⁺和CD8⁺ T细胞） | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 再生障碍性贫血小鼠模型，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2026-07-10 |
From complexity to clarity: aging bone marrow niche in bone and blood regeneration and malignancy
2026-05-18, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00543-3
PMID:42151108
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综述 | 本文综述了骨髓微环境在衰老过程中的动态变化及其对骨和血液再生与恶性肿瘤的影响 | 利用高分辨率成像、单细胞和空间转录组学及体内谱系追踪等新技术，揭示了骨髓微环境在衰老过程中的异质性和可塑性，并探讨了系统性因素如神经输入、代谢状态和炎症信号对骨髓微环境老化的影响 | 关键问题仍待解决，如间充质和成骨细胞谱系的身份和层次、内皮细胞亚群的特化、系统性调控的整合，以及衰老骨髓在恶性肿瘤和慢性炎症中是驱动因素还是被动参与者 | 重访骨髓微环境现有多模型，重点探讨成骨细胞与特殊血管之间的交互作用及其在衰老过程中的紊乱如何损害造血输出和骨骼重塑 | 骨髓微环境、造血干细胞、成骨细胞、血管内皮细胞、衰老的骨髓及其在骨和血液系统中的功能 | 生物信息学 | 老年病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、体内谱系追踪、高分辨率成像 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 364 | 2026-07-10 |
PMN-MDSCs-derived exosomal S100A9 drives breast cancer progression by enhancing cancer stemness and CXCL5-mediated metastatic potential
2026-May-18, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03134-7
PMID:42151127
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研究论文 | 揭示PMN-MDSCs来源的外泌体S100A9通过增强癌症干细胞性和CXCL5介导的转移潜能驱动乳腺癌进展的机制 | 首次阐明PMN-MDSCs通过外泌体S100A9激活STAT3-CXCL5-ERK正反馈调控轴，协同增强乳腺癌干细胞性和转移能力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证规模有限，具体机制在人体中的适用性需进一步验证 | 探究PMN-MDSCs如何通过外泌体S100A9调控乳腺癌干细胞性和转移潜能的分子机制 | PMN-MDSCs、乳腺癌干细胞（BCSCs）、4T1细胞、三阴性乳腺癌（TNBC）组织 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序、流式细胞术、外泌体功能分析、共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠乳腺癌实体瘤组织、TNBC临床样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞测序数据分析 |
| 365 | 2026-07-10 |
NPC2 deficiency as a potential target drives malignancy and chemo-resistance in DLBCL
2026-May-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00833-0
PMID:42143364
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据分析发现NPC2缺乏与弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的恶性进展和化疗耐药相关，并揭示其机制 | 首次发现NPC2通过调节线粒体功能和细胞运动性驱动DLBCL侵袭性和化疗耐药，提出其作为潜在治疗靶点 | 未明确说明研究局限性 | 探索NPC2在DLBCL进展和化疗耐药中的分子机制及潜在治疗价值 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者样本及SU-DHL-4和SU-DHL-2细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、shRNA敲低、qPCR、流式细胞术、异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA-seq数据集中的DLBCL患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2026-07-10 |
scRAPID-web: a web server for predicting protein-RNA interactions from single-cell transcriptomics
2026-May-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12870-0
PMID:42129640
|
研究论文 | scRAPID-web是一个基于单细胞转录组学预测蛋白质-RNA相互作用的网络服务器 | 将单细胞RNA测序数据与catRAPID预测整合，提供用户友好的网络界面，支持八种模式生物的RBP-RNA和RBP-RBP相互作用预测 | 依赖预先编译的文库和选择的基因调控网络推理算法，可能限制分析的灵活性和适用范围 | 开发可访问的网络工具，基于单细胞转录组数据预测蛋白质-RNA相互作用和调控网络 | 八种模式生物中与RNA结合蛋白和RNA相互作用相关的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2026-07-10 |
Multi-omics mapping identifies a C/EBPβ-S100a4⁺ macrophage axis as a therapeutic target in acute spinal cord injury
2026-May-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08239-2
PMID:42135765
|
研究论文 | 利用多组学整合方法鉴定急性脊髓损伤中的C/EBPβ-S100a4+巨噬细胞轴作为治疗靶点 | 首次通过高时间分辨率的单细胞RNA测序与系统网络建模，解析出C/EBPβ-S100a4+巨噬细胞轴作为急性神经炎症的主要驱动因子，并发现黄芩素能有效调控该轴 | 未提及明显局限性，但初步研究可能需进一步验证在人体中的适用性 | 阐明急性脊髓损伤后早期免疫细胞状态及其上游调控回路，以识别基于机理的治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型及激活的巨噬细胞 | 机器学习 | 急性脊髓损伤 | RNA-seq | CNN | 图像 | 小鼠脊髓样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2026-07-10 |
Cellular state heterogeneity underlying sex differences in Alzheimer's disease based on single-cell transcriptome
2026-May-14, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-02081-w
PMID:42135783
|
研究论文 | 基于单细胞转录组分析阿尔茨海默病中性别差异的细胞状态异质性 | 通过非负矩阵分解识别细胞类型特异性元程序，揭示性别偏向的细胞状态及其在代谢、细胞间通讯和疾病关联中的差异 | 未提及，但潜在包括样本来源的异质性和分析方法的计算偏差 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制，聚焦于细胞状态异质性 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑组织细胞，包括六种主要细胞类型 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞或单核转录组数据 | 603个样本（296个女性，307个男性；339个AD，264个正常）来自10个队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2026-07-10 |
Modulation of tumor-derived exosomes and reprogramming of cancer-associated fibroblasts for colorectal cancer therapy
2026-May-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02661-2
PMID:42092888
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧条件下结直肠癌细胞来源外泌体通过HIF1A-AS2/miR-33/HIF-1α轴激活成纤维细胞为癌症相关成纤维细胞的机制，并探索了潜在治疗策略 | 首次发现缺氧诱导的外泌体lncRNA HIF1A-AS2通过海绵吸附miR-33解除对HIF-1α抑制，激活Notch1/ERK信号通路，驱动正常成纤维细胞向癌相关成纤维细胞转化，并利用机器学习和单细胞转录组分析验证其作为预后标志物的潜力 | 研究主要基于体外细胞实验和异种移植模型，尚需临床样本验证及深入机制解析 | 阐明缺氧肿瘤外泌体介导的成纤维细胞重编程在结直肠癌进展中的作用及其分子机制 | 结直肠癌细胞来源外泌体、正常组织相关成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 外泌体分离与表征、单细胞RNA测序、机器学习分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多种结直肠癌细胞系及异种移植模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 370 | 2026-07-10 |
Seesaw signatures capture trajectory-like transcriptomic shifts and enable compact tumour cell classification across cancers
2026-May-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10172-5
PMID:42086757
|
research paper | 研究发现Seesaw配对能捕捉轨迹样转录组变化，实现跨癌种的紧凑肿瘤细胞分类 | 提出Seesaw配对概念，基于基因表达排名反转来识别恶性转化，仅需三个基因对即可在44个数据集上实现高精度分类 | 未明确说明实验验证或外部独立数据集中的泛化能力，可能受限于单细胞RNA-seq技术本身的数据异质性 | 开发一种简单、可解释的肿瘤细胞识别方法，提高跨癌种分类的准确性和普适性 | 44个单细胞RNA测序数据集，涵盖22种癌症类型 | 单细胞基因组学 | 多种癌症（如肺癌、前列腺癌等） | 单细胞RNA测序 | 基于Seesaw配对的分类器 | 单细胞基因表达数据 | 44个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2026-07-10 |
Cross-species comparison of amniote single-cell transcriptomes reveals evolutionary conservation and divergence in the chicken immune system
2026-May-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72642-y
PMID:42086564
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组比较，揭示鸡免疫系统的进化保守性和差异性 | 首次构建包含157万细胞、157种细胞类型的鸡单细胞转录组图谱，并整合龟类和鸭类数据与人类scRNA-seq数据进行比较，发现鸡滤泡树突状细胞起源于髓系而非基质系 | 仅涉及3种龟类、2种鸭类，人类数据为公开数据，可能存在批次效应和物种间比较的偏差 | 通过跨物种单细胞转录组比较，研究鸡免疫系统的进化保守性和差异性 | 鸡、龟、鸭和人类免疫细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 16只鸡（157万细胞，36组织）、3只龟（23万细胞，14组织）、2只鸭（2.2万细胞，3组织）、人类公共数据（96万细胞，32组织） | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | NA |
| 372 | 2026-07-10 |
Single-cell transcriptome sequencing (ScRNA-seq) uncovers the regulatory role of lodicule cells in rice floret opening (FO)
2026-May-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10191-2
PMID:42082742
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示水稻浆片细胞在颖花开放中的调控机制 | 首次利用单细胞转录组测序解析了浆片细胞在颖花开放中的异质性调控网络，特别是韧皮部与浆片细胞的通讯在渗透调节和细胞壁重塑中的作用 | 研究仅关注了两个时间点（开花前和开花期），未涵盖更早或更晚的发育阶段；功能验证实验不足 | 阐明水稻颖花开放中浆片细胞介导的分子调控机制 | 水稻小穗样本中的浆片细胞及相关细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 水稻小穗样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 373 | 2026-07-10 |
SCMBench: benchmarking domain-specific and foundation models for single-cell multi-omics data integration
2026-May-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72570-x
PMID:42069651
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研究论文 | 对域特定模型和基础模型在单细胞多组学数据整合中的表现进行基准测试 | 首次全面评估基础模型与域特定模型在多组学整合任务中的性能，并提出轻量级自适应策略来弥补基础模型的不足 | 未提及与其他数据类型或更大规模数据集的整合评估，可能限制泛化性 | 系统评估域特定模型和基础模型在单细胞多组学数据整合中的准确性、生物标志物检测、轨迹推断和批次校正能力 | 23种单细胞多组学数据整合方法 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 域特定模型和基础模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 374 | 2026-07-10 |
Genetic profile of Lepr+ skeletal stem/progenitor cells in the periodontal ligament and functional compensation during aging and bone repair
2026-05, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117833
PMID:41692367
|
研究论文 | 通过谱系追踪和单细胞RNA测序，研究了牙周膜中Lepr+骨骼干/祖细胞的遗传特征，揭示了其层级组织、功能特性和在衰老及骨修复中的补偿机制 | 首次揭示Lepr牙周膜细胞中Thy1阳性而Runx2阴性的亚群处于层级顶端，并发现Kitl表达特异性，以及衰老过程中Lepr细胞贡献下降且存在其他细胞群的补偿作用 | Lepr PDLCs对骨修复的贡献有限，且遗传消除后再生骨量未减少，提示需要进一步研究其他SSPC群体的具体作用 | 阐明牙周膜中Lepr阳性骨骼干/祖细胞的层级组织、干性维持及其在衰老和骨修复中的功能 | 小鼠牙周膜中的Lepr阳性骨骼干/祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 375 | 2026-07-10 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-05, Gene therapy
IF:4.6Q2
DOI:10.1038/s41434-026-00600-w
PMID:41813829
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单核RNA测序，揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序相结合，系统绘制rAAV血清型、性别和肝小叶区域分布对转导及转录组变化的影响图谱 | 未明确提及研究局限性 | 探索rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导及转录组变化的影响 | 雄性及雌性小鼠肝脏 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 小鼠肝脏样本（具体数量未提） | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2026-07-10 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-May-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
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研究论文 | 研究通过抑制胰腺导管腺癌中的TAK1激酶，激活cGAS-STING通路诱发DNA损伤，增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 首次揭示TAK1通过磷酸化Ephrin受体A2和RAD51维持基因组完整性的机制，并将TAK1抑制与免疫原性细胞死亡和肿瘤微环境重编程联系起来 | 未提及在人体临床试验中的疗效评估及长期安全性数据 | 探索靶向TAK1作为胰腺癌免疫治疗新策略的可能性 | 人类胰腺导管腺癌样本、基因工程小鼠模型及肿瘤-免疫细胞共培养体系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 人类胰腺癌样本（具体数量未说明）、p48-Cre/Trp53f/f/LSL-KrasG12D基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2026-07-10 |
A Muribaculaceae-enriched microbiota exacerbates TLR4-dependent Acinetobacter baumannii-induced hyperinflammatory sepsis
2026-Apr-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72435-3
PMID:42062271
|
研究论文 | 本研究揭示了富含Muribaculaceae的肠道菌群通过TLR4依赖性过度炎症加剧鲍曼不动杆菌诱导的高炎症性败血症 | 首次发现特定肠道菌群配置（富含Muribaculaceae）通过TLR4依赖性方式调节宿主对鲍曼不动杆菌感染的炎症反应阈值，而非病原体清除能力，决定败血症结局 | 仅使用雌性C57BL/6小鼠模型，未在其他物种或性别中验证；未明确热稳定低分子量代谢物的具体化学身份 | 探究肠道菌群配置如何影响宿主对鲍曼不动杆菌诱导败血症的易感性及其分子机制 | 雌性C57BL/6小鼠及其肠道菌群，特别是Sangeribacter muris KT1-3菌株 | 机器学习 | 败血症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个雌性C57BL/6小鼠群体 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 378 | 2026-07-10 |
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72284-0
PMID:42056094
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研究论文 | 提出一种名为SpaCNA的计算框架，用于从空间转录组数据中稳健检测拷贝数改变 | 整合多模态信息（基因表达与空间位置），利用隐藏马尔可夫随机场模型实现空间连续的CNA检测，并支持三维重建 | 未提及局限性 | 开发高精度检测空间转录组中拷贝数改变的方法，以分析肿瘤内异质性和空间肿瘤生物学 | 模拟数据及乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌的真实空间转录组数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 隐藏马尔可夫随机场 | 基因表达数据 | 多个模拟数据集及三组真实癌症数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2026-07-10 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
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研究论文 | 该研究通过整合空间分析、单细胞RNA测序和多重免疫组化，发现肿瘤细胞衍生的干扰素通过STAT信号诱导肿瘤相关巨噬细胞表达骨桥蛋白，形成免疫抑制性微环境，导致PARP抑制剂耐药 | 首次揭示肿瘤细胞来源的干扰素在空间上重编程骨桥蛋白富集的巨噬细胞微环境，建立干扰素-骨桥蛋白空间轴介导的PARP抑制剂耐药新机制，并证明骨桥蛋白可作为预后生物标志物和治疗靶点 | 未描述具体局限性 | 探究PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中耐药的空间免疫微环境机制 | 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验中的初治高级别浆液性卵巢癌标本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析，单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | 空间蛋白质组学数据，单细胞转录组数据，组织切片图像数据 | 来自前瞻性临床试验的卵巢癌患者标本，具体数量未标出 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析平台 |
| 380 | 2026-07-10 |
A colon mimetic screening approach reveals Lactobacillus fermentum as a microbiome-based therapy for COPD
2026-04-14, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-026-00978-w
PMID:41980958
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研究论文 | 通过结肠模拟个性化药物元分析筛选平台发现发酵乳杆菌作为慢性阻塞性肺疾病的微生物组疗法 | 首次利用结肠模拟个性化药物元分析筛选平台从重度COPD患者粪便样本中筛选出具有治疗潜力的发酵乳杆菌，并通过单细胞转录组学和粪便微生物组分析揭示其作用机制 | 研究仅处于临床前阶段，未进行人体临床试验验证 | 评估发酵乳杆菌对COPD的治疗效果及其作用机制 | 烟雾暴露小鼠模型 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞转录组学 | 个性化药物元分析筛选平台 | 基因表达数据, 微生物组数据 | 重度COPD患者粪便样本用于筛选，烟雾暴露小鼠用于治疗实验，具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序, 粪便微生物组分析 | NA | NA |