单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 35396 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-01-16
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The world journal of men's health
研究论文 本研究通过整合单细胞测序数据与孟德尔随机化分析,识别了与前列腺癌细胞相关的基因,特别是TMEM59在疾病进展中的潜在作用 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析来识别前列腺癌预后相关基因,并验证了TMEM59作为保护性因子的功能 样本量较小(仅6例前列腺癌病例),且依赖于公共数据库数据,可能限制结果的普遍性 研究前列腺癌包膜侵犯相关的预后基因 前列腺癌细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序, 孟德尔随机化分析, 免疫组织化学, 细胞功能实验 hdWGCNA, Seurat, Cox回归 单细胞RNA-seq数据, SNP数据, 临床数据 6例前列腺癌病例的单细胞数据,以及TCGA和GEO的临床与基因表达数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
362 2026-01-16
Cyst-independent oocyte phagocytosis builds the female reproductive reserve in mice
2026-Jan, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究开发了一种高分辨率四维卵巢发生成像系统,揭示了小鼠卵巢中不依赖囊肿的卵母细胞吞噬机制在决定卵母细胞存活中的关键作用 首次发现并描述了不依赖囊肿的卵母细胞吞噬机制,其中优势卵母细胞通过捕获和吸收牺牲卵母细胞的细胞碎片来富集自身细胞质,从而支持其存活 研究主要基于小鼠模型,其机制在人类或其他哺乳动物中的普适性尚未验证 探究哺乳动物卵巢发生过程中卵母细胞命运决定的详细机制 小鼠卵巢中的卵母细胞 发育生物学 NA 高分辨率四维成像系统、单细胞测序 NA 活体成像数据、单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
363 2026-01-16
Type 2 diabetes Reprograms Bone Marrow Hematopoiesis and Dysregulates Immune Signaling in Response to Stroke
2025-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病如何通过重编程骨髓造血功能和失调免疫信号通路来恶化中风后的免疫反应和预后 首次在单细胞水平上揭示了2型糖尿病背景下中风后骨髓造血功能的重编程、细胞间通讯网络的重组以及代谢与免疫信号通路的失调 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待验证;研究主要关注骨髓,未全面评估外周免疫器官的影响 阐明2型糖尿病恶化中风预后的潜在免疫机制 对照(db/+)和糖尿病(db/db)小鼠的骨髓细胞 单细胞组学与免疫学 2型糖尿病与缺血性中风 单细胞RNA测序,GeoMx数字空间谱分析,nCounter分析,流式细胞术 伪时间轨迹分析,CellChat细胞通讯分析,AUCell富集分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因表达数据,流式细胞数据 对照和糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,数字分子谱分析 GeoMx DSP,nCounter GeoMx数字空间谱分析用于空间基因表达分析,nCounter用于靶向基因表达分析
364 2026-01-16
A stem cell knockout village reveals lineage rewiring and a non-canonical islet cell fate in monogenic diabetes
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过建立敲除村框架,利用纵向单细胞RNA测序分析79个人类多能干细胞突变系,揭示了单基因糖尿病中细胞命运重连和非经典胰岛细胞命运的形成机制 首次引入敲除村框架进行大规模纵向单细胞RNA测序分析,揭示了单基因糖尿病基因突变导致β细胞向肠嗜铬样细胞命运转变的新机制,并预测验证了ISL1作为关键下游效应因子 研究主要基于体外干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;突变系数量虽多,但仅覆盖30个发育调节因子 探究单基因糖尿病中基因突变如何改变发育轨迹并产生病理细胞状态 79个人类多能干细胞突变系,靶向30个发育调节因子(包括15个糖尿病基因),分化为胰岛细胞 单细胞组学 单基因糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 79个干细胞突变系,覆盖五个胰岛分化阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
365 2026-01-16
Site-specific ERα phosphorylation determines sex-dependent metabolic, reproductive, and body-compositional phenotypes in mice
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过构建ERα特定丝氨酸位点磷酸化缺陷的基因敲入小鼠,揭示了位点特异性ERα磷酸化对小鼠代谢、生殖和身体组成的性别依赖性调控作用 首次在体内系统研究了ERα两个保守磷酸化位点(S171和S216)的生理功能,并发现这些位点对代谢、生殖和骨骼表型具有性别特异性的调控作用 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证;机制研究主要基于转录组分析,具体的信号通路和分子机制有待深入 探究雌激素受体α(ERα)特定磷酸化位点在调节代谢、生殖和身体组成中的生理功能 ERα S171A和S216A磷酸化缺陷基因敲入小鼠 分子生物学 代谢性疾病 基因敲入、单细胞空间转录组学、代谢谱分析 NA 转录组数据、代谢数据、骨骼密度数据 基因敲入小鼠模型 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
366 2026-01-16
CellMentor: cell-type aware dimensionality reduction for single-cell RNA-sequencing data
2025-Dec-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellMentor的全监督降维方法,用于单细胞RNA测序数据分析 CellMentor是一种基于非负矩阵分解的全监督降维方法,首次将细胞类型标签直接整合到优化目标中,以最小化已知群体内的变异并最大化类型间的区分 NA 开发一种改进的单细胞RNA测序数据降维方法,以优化细胞类型识别 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
367 2026-01-16
Emerging technologies in poultry genomics: Unlocking innovation for the future of sustainable production
2025-Dec-10, Poultry science IF:3.8Q1
综述 本文综述了家禽基因组学领域新兴技术,包括功能注释、CRISPR编辑、单细胞RNA测序和整合组学框架,以推动可持续家禽生产 整合FAANG和ChickenGTEx项目提供全面调控图谱,结合CRISPR编辑和单细胞技术实现从统计关联到生物学因果的转变 统计功效不足、组织与发育特异性背景的局限性以及基因组预测的转化挑战 推动可持续家禽生产,通过基因组学技术提升生产效率、抗病性和动物福利 家禽(鸡) 基因组学 NA 单细胞RNA测序、CRISPR编辑、整合组学(基因组学、转录组学、表观基因组学、3D染色质数据) NA 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据、3D染色质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
368 2026-01-16
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire蛋白通过调控胸腺干扰素信号通路,影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受的机制 首次在单细胞分辨率下系统揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究主要基于转录组分析,缺乏功能实验的直接验证 阐明Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
369 2026-01-16
Single-cell sequencing reveals MCAM+ MyCAFs as key pro-angiogenic cells interacting with endothelial cells in solid-type adenoid cystic carcinoma
2025-Dec-08, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了在实体型腺样囊性癌中,MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞是关键的促血管生成细胞,它们通过转录因子MEF2C上调促血管生成因子的表达,从而促进血管生成和肿瘤生长 首次在实体型腺样囊性癌中鉴定出MCAM+肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞作为关键的促血管生成细胞亚群,并揭示了其通过MEF2C转录因子调控促血管生成因子转录的上游机制 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本的直接验证可能有限,且未详细探讨MCAM+ myCAFs与其他肿瘤微环境成分的相互作用 探究实体型腺样囊性癌中癌症相关成纤维细胞与血管生成之间的关系及其分子机制 实体型与非实体型腺样囊性癌中的癌症相关成纤维细胞、内皮细胞以及SACC83细胞系 数字病理学 腺样囊性癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及原代CAFs分离、细胞系实验及体内模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
370 2026-01-16
Intratumoral Collinsella aerofaciens exhibits antitumor activity in endometrial carcinoma through activation of the p53 signaling pathway
2025-Dec-08, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了子宫内膜癌肿瘤内微生物群的组成,并鉴定出Collinsella aerofaciens通过激活p53信号通路发挥抗肿瘤作用 首次在子宫内膜癌中鉴定出Collinsella aerofaciens作为新型抑菌菌,并通过多组学技术揭示了其通过激活p53通路抑制肿瘤的机制 微生物功能机制仍需进一步体内验证,样本量可能有限 表征子宫内膜癌肿瘤内微生物组,阐明微生物空间定位并鉴定具有肿瘤抑制特性的细菌 子宫内膜癌患者的肿瘤组织、癌旁正常组织、EC细胞系及小鼠模型 微生物组学与肿瘤学 子宫内膜癌 5R 16S rRNA测序, 荧光原位杂交, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RNA测序, 粪便微生物移植 NA 微生物组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 子宫内膜癌患者的肿瘤和癌旁组织样本(具体数量未明确) NA 16S rRNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
371 2026-01-16
Neutrophil extracellular traps released by CD177+ neutrophils aggravated inflammation and neuronal impairment post-SCI
2025-Dec-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在脊髓损伤小鼠模型中鉴定出三个不同的中性粒细胞亚群,并发现CD177+中性粒细胞通过释放中性粒细胞胞外陷阱加剧炎症和神经元损伤 首次在脊髓损伤后鉴定出中性粒细胞亚群,并揭示CD177+中性粒细胞通过PAD4和ROS依赖的NETs形成促进炎症和神经元凋亡的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,人类样本的验证仍需扩大 探究脊髓损伤后中性粒细胞的功能异质性及其在炎症和神经元损伤中的作用 脊髓损伤小鼠模型和患者样本中的中性粒细胞 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型和SCI患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
372 2026-01-16
Harnessing plasma transcriptomics for non-invasive cancer biomarker identification: a comprehensive review
2025-Dec-07, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文全面综述了利用血浆转录组学进行非侵入性癌症生物标志物识别的技术、分析流程、挑战与未来方向 系统性地评估了多种转录组学技术(包括RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学)在血浆样本中的应用潜力,并强调了整合分析(如元分析和AI辅助的多组学整合)这一新兴趋势对生物标志物发现的增强作用 血浆转录组学存在技术局限性,如RNA降解、产量低以及缺乏标准化流程,这限制了其临床转化 旨在为癌症研究人员和临床医生提供关于血浆转录组学的基础知识和实用见解,推动其在精准肿瘤学和非侵入性癌症诊断中的应用 血浆样本中的转录组 自然语言处理 癌症 高通量测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
373 2026-01-16
A DSSM network for inferring and prioritizing cell-type-specific regulons using single-cell RNA-seq data
2025-Dec-07, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本研究提出了一种基于深度结构化语义模型(DSSMReg)的方法,用于从单细胞RNA-seq数据中推断和优先排序细胞类型特异性调控模块 利用深度结构化语义模型将转录因子和靶基因映射到低维语义空间,通过余弦相似度评估调控强度,并结合AUCell算法对调控模块进行重要性排序 未明确提及模型在处理大规模数据或复杂组织样本时的计算效率或泛化能力限制 开发一种从单细胞转录组数据中识别细胞类型特异性调控模块的计算方法 转录因子及其靶基因形成的调控模块(regulons) 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA-seq DSSM(深度结构化语义模型) 单细胞转录组数据、转录因子基序数据 五个细胞系的scRNA-seq数据,以及三阴性乳腺癌和人类骨髓造血干细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
374 2026-01-16
Organoid-derived photoreceptor precursors enriched by CD9⁻CD81mid sorting restore visual function in RCS rats
2025-Dec-07, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过分析人视网膜类器官的单细胞RNA测序数据,鉴定出CD9⁻CD81mid表面标记物组合,用于富集光感受器前体细胞,并将其移植至RCS大鼠视网膜下腔,成功改善了视觉功能 首次提出基于CD9⁻CD81mid表面标记物的非遗传性富集策略,避免了基因标记的临床转化限制,为视网膜退行性疾病的细胞治疗提供了更安全的替代方案 研究仅在RCS大鼠模型中进行,尚未在更大型动物或人体中进行验证;长期安全性和免疫排斥反应需进一步评估 开发一种临床可转化的非遗传性策略,用于富集人光感受器前体细胞,以治疗视网膜退行性疾病 人视网膜类器官来源的光感受器前体细胞及RCS大鼠模型 数字病理学 视网膜退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、流式细胞术、荧光激活细胞分选(FACS) NA 单细胞RNA测序数据、图像数据、电生理数据 未明确说明具体样本数量,涉及人视网膜类器官及RCS大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
375 2026-01-16
Using single-cell and transcriptome data to identify prognostic genes associated with SUMO-ylation and their molecular regulatory mechanisms in breast cancer
2025-Dec-06, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序和转录组数据,识别了与SUMO化相关的乳腺癌预后基因,并开发了一个风险模型 结合单细胞RNA测序和转录组数据,首次系统性地识别了与SUMO化相关的乳腺癌预后基因,并构建了具有良好预测性能的风险模型 研究主要基于生物信息学分析,虽然进行了RT-qPCR验证,但缺乏更深入的体内外功能实验验证 探索SUMO化相关基因在乳腺癌中的预后价值及其分子调控机制 乳腺癌患者组织样本 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 转录组测序, RT-qPCR 风险模型, 列线图模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
376 2026-01-16
A mitochondria-related gene-based signature predicts pancreatic ductal adenocarcinoma clinical outcome and revealed CAMK2A/THEM4 regulates progression phenotypes and mitophagy in vivo and in vitro
2025-Dec-06, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究开发了一个基于线粒体相关基因的预后特征,用于预测胰腺导管腺癌的临床结果,并揭示了CAMK2A/THEM4在体内外调节进展表型和线粒体自噬的作用 首次开发了基于线粒体相关基因的胰腺癌预后特征,并深入研究了CAMK2A和THEM4的协同作用机制,提出了CAMK2A-THEM4-AKT轴作为新的治疗靶点 NA 开发稳健的分子特征以改善胰腺导管腺癌的风险分层并识别潜在治疗靶点 胰腺导管腺癌患者 机器学习 胰腺癌 机器学习,单细胞测序,免疫组化微阵列,体内异种移植模型 NA 基因表达数据,单细胞测序数据,免疫组化数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
377 2025-12-08
From bulk RNA sequencing to spatial transcriptomics: a comparative review of differential gene expression analysis methods
2025-Dec-06, Human genomics IF:3.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
378 2026-01-16
Plate-based 10X Genomics-compatible single-cell RNA-sequencing based on Smart-seq3xpress
2025-Dec-06, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文开发了一种基于Smart-seq3xpress原理的板式、10X兼容的单细胞RNA测序策略,旨在解决10X Genomics技术在微流控方法上的限制 PB10X方法首次将板式单细胞RNA测序与10X兼容性结合,支持直接索引排序并生成与标准10X文库构建试剂盒兼容的cDNA,同时解决了Smart-seq3xpress中的链入侵伪影问题 该方法主要针对小规模细胞群体的成本效益分析,可能在大规模应用中存在限制,且目前仅在Jurkat淋巴母细胞上进行了性能验证 开发一种成本效益高、兼容10X Genomics的板式单细胞RNA测序方法,以改进小规模细胞群体的基因表达和T细胞受体谱分析 Jurkat淋巴母细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据和T细胞受体序列数据 未明确指定具体样本数量,但涉及Jurkat淋巴母细胞群体 10X Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 10X Single Cell 5'文库构建试剂盒, 包括5' V(D)J和5'基因表达试剂盒 基于Smart-seq3xpress原理的板式10X兼容策略,支持384孔板索引排序
379 2026-01-16
Ferroptosis-induced remodeling of glycosylation the immune microenvironment and improves survival in pancreatic cancer
2025-Dec-05, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
研究论文 本研究通过诱导铁死亡,系统分析了胰腺导管腺癌中糖基化模式、基因表达和免疫微环境的重塑,揭示了铁死亡与糖基化及肿瘤免疫之间的复杂关系 首次在铁死亡研究中应用O-GlcNAc修饰肽和N-糖基化肽的双通路特异性富集策略,实现了细胞死亡过程中糖基化模式的系统分析;结合高分辨率质谱、转录组和单细胞转录组数据,构建了多组学相互验证的全景分析框架;引入Scissor方法将TCGA铁死亡通路活性映射到单细胞数据,实现了从群体水平到细胞亚群的跨尺度分析 研究主要依赖高通量组学和计算分析,缺乏系统的体外和体内功能验证、联合药物敏感性实验以及真实世界临床队列的支持 探究铁死亡与肿瘤糖基化及免疫微环境重塑之间的相互作用,为胰腺癌治疗提供新的治疗策略 胰腺导管腺癌细胞 数字病理学 胰腺癌 基于质谱的糖蛋白组学、转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot NA 蛋白质组学数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
380 2026-01-16
Polystyrene nanoplastics disrupt epididymal initial segment by perturbing NK cell differentiation and epithelial homeostasis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学、非靶向代谢组学和体内实验,探索了聚苯乙烯纳米塑料暴露对大鼠附睾起始段的细胞重塑影响 首次从多组学角度详细研究了聚苯乙烯纳米塑料对附睾起始段的损伤机制,揭示了其对自然杀伤细胞分化、上皮稳态和血-附睾屏障功能的破坏作用 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证;长期暴露效应和可逆性仍需进一步研究 探究环境污染物聚苯乙烯纳米塑料对雄性生殖系统附睾起始段的毒性作用机制 大鼠附睾起始段组织、精子细胞、自然杀伤细胞、上皮细胞 单细胞组学 生殖系统疾病 单细胞转录组学, 非靶向代谢组学, 体内实验 NA 转录组数据, 代谢组数据, 组织学图像 大鼠分组研究(对照组、低剂量组、中剂量组、高剂量组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部