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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-06-08 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 利用单细胞多组学和机器学习揭示透明细胞肾细胞癌中的triaptosis异质性 | 首次在单细胞分辨率下描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性景观,并基于高triaptosis上皮亚群开发了稳健的4基因预后特征 | NA | 研究透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性及其在预后和治疗指导中的潜在应用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量转录组学 | 机器学习模型(4基因预后特征) | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2026-06-08 |
Happening in the Prostate Tumor Microenvironment: Ion Channels and Extrachromosomal DNA Driving Phenotypic Plasticity
2026-May, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70139
PMID:41632930
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综述 | 本文评估了离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中驱动表型可塑性的证据,并分析了单细胞RNA测序数据 | 首次系统整合离子通道与染色体外DNA在前列腺癌表型可塑性中的协同作用,并通过公共单细胞数据集揭示细胞类型特异性表达模式 | 没有提供新的实验数据,依赖现有文献和两个公开数据集的分析 | 研究离子通道和染色体外DNA在前列腺癌肿瘤微环境中驱动表型可塑性和耐药性的机制 | 前列腺癌肿瘤微环境中的离子通道和染色体外DNA | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开可用的单细胞RNA测序数据集(原发性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2026-06-08 |
Adenosine A2B Receptor Promotes Tumor Progression and Metastases in Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3934
PMID:41642698
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研究论文 | 本研究利用多组学方法分析未分化多形性肉瘤(UPS)配对原发和转移肿瘤样本,发现ADORA2B促进肿瘤进展和转移的机制 | 首次发现ADORA2B作为UPS转移的关键驱动因子,并通过空间转录组学、CRISPR敲除及体内模型验证其促转移功能 | 未明确说明局限性 | 探究UPS转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 未分化多形性肉瘤(UPS)患者的原发和转移肿瘤样本 | 机器学习 | 肉瘤 | 空间转录组学、批量RNA测序、CRISPR-Cas9敲除 | NA | 转录组数据 | 13例UPS患者的配对原发和转移肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2026-06-08 |
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-May, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.014
PMID:41644365
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研究论文 | 评估IM19抗CD19 CAR T细胞疗法治疗难治性系统性红斑狼疮的疗效和安全性,特别关注狼疮性肾炎 | 首次在难治性系统性红斑狼疮患者中评估IM19 CAR T细胞疗法的异质性反应,并通过重复肾活检和单细胞RNA测序深入分析 | 样本量小(仅6例),单臂开放标签设计,缺乏对照组,迷你综述纳入文献有限 | 评估IM19 CAR T细胞疗法在难治性系统性红斑狼疮患者中的疗效和安全性,特别是狼疮性肾炎的反应 | 难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累患者 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | CAR T细胞疗法、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2026-06-08 |
YY1-mediated NDUFA9 upregulation promotes NSCLC cell growth through mitochondrial and Akt-mTOR pathway modulation
2026-Apr-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08562-y
PMID:42014681
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研究论文 | 本研究揭示了YY1通过上调NDUFA9表达,调控线粒体功能和Akt-mTOR信号通路,促进非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖的作用机制 | 首次全面阐明NDUFA9在NSCLC中的表达上调及其通过调节线粒体功能和Akt-mTOR通路促进肿瘤进展的机制,并发现YY1作为关键转录因子直接调控NDUFA9表达 | NA | 探究NDUFA9在非小细胞肺癌发病机制中的表达和功能角色,以及YY1转录因子对其的调控作用 | 非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤组织和细胞系 | 计算机视觉 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库和临床NSCLC患者样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 366 | 2026-06-08 |
Tumor cell derived CCL20 exacerbates the immunosuppressive microenvironment by recruiting CCR6+ Tregs in pancreatic cancer
2026-Apr-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218290
PMID:41643988
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研究论文 | 研究发现胰腺癌细胞分泌的CCL20通过招募CCR6阳性调节性T细胞加剧免疫抑制微环境 | 首次揭示肿瘤细胞来源的CCL20通过CCR6-Treg轴促进胰腺癌免疫逃逸,并验证了CCL20-CCR6阻断联合抗PD1治疗的有效性 | 未明确SP5调控CCL20的具体分子机制;研究仅基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 解析胰腺癌免疫抑制微环境形成机制,探索CCL20-CCR6轴作为治疗靶点的潜力 | 胰腺癌细胞、CCR6阳性调节性T细胞、CD8 T细胞、SP5转录因子 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲除小鼠模型 | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 胰腺癌患者肿瘤组织样本及小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 367 | 2026-06-08 |
autoFISH: a modular toolbox for sequential single-molecule RNA FISH experiments
2026-Apr-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09979-z
PMID:41942712
|
研究论文 | autoFISH是一种模块化工具箱,用于进行顺序单分子RNA FISH实验,旨在通过开源硬件、易用控制软件和整合分析工具降低设备成本和实验复杂性 | 提出了一个低成本、用户友好的自动化单分子RNA FISH平台,包含开源硬件组件、可访问的控制软件和集成分析工具,并优化了保存核结构的组织透明化方法 | 未提及具体局限性 | 开发一种经济实惠、易于使用的自动化单分子RNA FISH平台,以推动空间转录组学研究 | 多种细胞类型和组织样本 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交 (smFISH) | NA | 图像 | 多种细胞类型和组织样本(具体数量未提及) | NA | 单分子RNA FISH | autoFISH | 开源硬件组件、控制软件和集成分析工具的自动化平台 |
| 368 | 2026-06-08 |
Genetic insights into therapeutic targets for gestational diabetes mellitus: a multi-omics analysis
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05053-x
PMID:41632246
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研究论文 | 通过多组学分析识别妊娠期糖尿病的潜在药物靶点 | 整合了cis-eQTL、cis-pQTL、孟德尔随机化、单细胞RNA测序等多组学方法,首次系统鉴定出5个与GDM风险因果相关的可成药基因,并验证其组织及细胞类型特异性表达 | 未提及具体局限性 | 为妊娠期糖尿病寻找遗传学支持的药物靶点,推动机制导向的治疗和精准预防策略 | 妊娠期糖尿病相关基因及其在胎盘组织中的表达模式 | 自然语言处理 | 妊娠期糖尿病 | 孟德尔随机化、顺式表达数量性状位点分析、顺式蛋白质数量性状位点分析、单细胞RNA测序 | NA | 表达定量数据、蛋白质定量数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2026-06-08 |
The transcription factor Tcf21 is necessary for adoption of cell fates by Foxd1+ stromal progenitors during kidney development
2026-Apr-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00345.2025
PMID:41632505
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序和染色质可及性分析,揭示了转录因子Tcf21在肾脏发育中调控Foxd1+基质祖细胞命运决定的关键作用,其缺失会导致基质细胞分化异常、纤维化重塑及肾功能障碍 | 首次通过整合单细胞转录组、单细胞ATAC-seq和免疫组化等多模态数据,系统阐明Tcf21在肾脏基质祖细胞命运决定中的核心调控机制,并建立早期发育缺陷与成年期纤维化疾病的直接关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏发育中的Tcf21功能尚需验证;未进行谱系追踪来证实异常Emcn+细胞的最终命运;未阐明Tcf21下游直接靶基因的调控网络 | 探究转录因子Tcf21在肾脏发育中调控Foxd1+基质祖细胞命运决定的分子机制 | 胚胎E14.5和E18.5期Tcf21条件性敲除小鼠的Foxd1谱系细胞及对照肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 组织病理图像 | E14.5和E18.5期Tcf21条件性敲除及对照小鼠肾脏样本(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 370 | 2026-06-08 |
YAP1-driven tumor-like cancer-associated fibroblasts modulate biomechanics of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02346-z
PMID:41634388
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序鉴定出肿瘤样癌相关成纤维细胞(tCAFs)亚群,并揭示YAP1驱动其调控胰腺导管腺癌生物力学特性的机制 | 首次发现YAP1驱动的肿瘤样癌相关成纤维细胞(tCAFs)亚群及其在基质重塑和疾病进展中的关键作用;结合磁共振弹性成像(MRE)无创量化肿瘤硬度 | 未明确说明研究局限性 | 探究YAP1与癌相关成纤维细胞(CAFs)亚型在胰腺导管腺癌基质重塑中的相互作用及机制 | 胰腺导管腺癌患者及KPC小鼠模型中的肿瘤组织、CAFs亚群、细胞外基质(ECM) | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、磁共振弹性成像 | NA | 单细胞转录组数据、弹性成像数据 | 包括PDAC患者和KPC小鼠模型,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2026-06-08 |
Mechanical Strain-Programmed SDC1+ Sheath Fibroblasts Trigger CXCR4hi Neutrophil-Mediated Enthesitis in Ankylosing Spondylitis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520617
PMID:41637585
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研究论文 | 通过构建机械应变相关的强直性脊柱炎小鼠模型,结合单细胞RNA测序图谱,揭示了SDC1+鞘成纤维细胞与CXCR4hi中性粒细胞在肌腱端炎发病中的关键作用及分子机制 | 首次在单细胞水平鉴定出机械应变诱导的疾病特异性SDC1+鞘成纤维细胞亚群,并阐明其通过CXCL5-CXCR4轴招募和激活中性粒细胞形成胞外诱捕网加剧肌腱端炎,同时发现SOX5增强子和超级增强子调控该细胞命运分支 | 研究主要基于SKG小鼠模型,结论在人体组织中的验证尚待进一步开展;机械应变的具体物理刺激参数及其下游信号转导的完整网络仍需深入解析 | 阐明机械应变相关强直性脊柱炎肌腱端炎的细胞互作和分子机制 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠及其后足加载/卸载模型中的滑膜组织细胞 | 计算生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序、慢病毒介导的基因沉默、中和抗体治疗 | NA | 单细胞转录组数据 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠后足组织样本(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台用于构建机械应变相关AS肌腱端炎的单细胞转录组图谱 |
| 372 | 2026-06-08 |
Decoding schizophrenia through postmortem human brain transcriptomics
2026-Apr, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102434
PMID:41637815
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综述 | 通过对死后人脑转录组分析,揭示精神分裂症的分子病理机制 | 整合大量死后脑组织转录组数据,从单细胞分辨率揭示精神分裂症中细胞类型特异性和个体异质性的基因表达变化,尤其发现上层层兴奋性神经元易受损伤 | 死后组织分析固有方法学挑战,如样本质量、降解等影响结论稳健性 | 阐明精神分裂症的分子特征和病理生理学机制 | 精神分裂症患者死后脑组织样本 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2026-06-08 |
Exosome-related lactylation gene signature defines diagnostic biomarkers of periodontitis through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Apr, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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research paper | 通过整合bulk和单细胞转录组数据建立了基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型 | 首次建立基于外泌体相关乳酸化修饰基因的牙周炎诊断模型,并利用单细胞RNA测序揭示乳酸化修饰在牙周炎不同细胞类型中的异质性和细胞特异性重构 | 未提及明显局限性 | 探索外泌体相关乳酸化修饰基因作为牙周炎的潜在诊断标志物 | 牙周炎患者与健康对照的组织样本和单细胞数据 | machine learning | geriatric disease | RNA-seq | CNN | image, text | 训练队列和两个独立验证队列,具体样本数未在摘要中提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2026-06-08 |
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1016
PMID:41638263
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研究论文 | 揭示胞葬作用缺陷在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中加剧局部炎症并预测复发 | 首次系统地表征慢性鼻窦炎中胞葬作用缺陷,并鉴定出5分子标志物面板用于预测鼻息肉复发 | NA | 探究胞葬作用在慢性鼻窦炎中的作用及其与炎症内型和临床结局的关联 | 慢性鼻窦炎患者鼻息肉组织与健康鼻黏膜组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 实时定量PCR,免疫组化,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA测序数据 |
| 375 | 2026-06-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular dynamics and emergency hematopoiesis in banana shrimp Penaeus merguiensis hemocytes upon Yellow Head Virus infection
2026-Apr, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111178
PMID:41638371
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示了香蕉虾血细胞在黄头病毒(YHV)感染下的细胞动态和应急造血过程 | 首次通过单细胞RNA测序构建了香蕉虾血细胞在YHV感染下的高分辨率转录组图谱,鉴定了8个血细胞簇,并揭示了病毒诱导的成熟免疫细胞耗竭和未成熟祖细胞簇扩增的应急造血机制 | 未在标题和摘要中明确提及局限性,可能缺乏对病毒-宿主相互作用下游机制的验证或实验重复 | 阐明香蕉虾血细胞在黄头病毒感染下的细胞免疫动态和应急造血应答机制 | 香蕉虾(Penaeus merguiensis)血细胞 | 单细胞转录组学 | 黄头病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 13个主要组织整合参考转录组以及正常和YHV感染状态下的血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2026-06-08 |
Unraveling dengue virus-host interactions through transcriptomics: Insights into disease progression and severity signatures
2026-Apr, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108350
PMID:41638513
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综述 | 综述转录组学技术(包括微阵列、bulk RNA-seq、scRNA-seq、ViscRNA-seq和空间转录组学)在揭示登革病毒与宿主相互作用机制及疾病进展与严重性标志方面的研究进展 | 系统整合了多种转录组学技术(尤其是单细胞和空间转录组学)在登革病毒研究中的应用,强调了病毒-宿主相互作用的动态和空间特征 | 综述依赖已发表研究,可能缺乏最新数据整合;未深入探讨技术差异对结果一致性的影响 | 阐明转录组学如何揭示登革病毒调控宿主基因表达的机制,并识别与疾病进展和严重性相关的生物标志物及治疗靶点 | 登革病毒感染的宿主细胞及动物模型 | 自然语言处理 | 登革热 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 377 | 2026-06-08 |
The CD74-MIF axis contributes to acute uveitic injury by upregulating proinflammatory cytokine secretion in murine cytomegalovirus intracameral infection mouse models
2026-Apr, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110907
PMID:41655503
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研究论文 | 本研究探讨了CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中通过上调促炎细胞因子分泌加重急性葡萄膜炎损伤的机制 | 首次揭示CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染驱动的急性葡萄膜炎中的关键作用,并证明其通过促进促炎细胞因子分泌加剧眼内炎症 | NA | 阐明CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒眼内感染诱导的急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 | 小鼠巨细胞病毒眼内感染模型中的C57BL/6和BALB/c小鼠 | NA | 急性葡萄膜炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠品系(C57BL/6和BALB/c) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2026-06-08 |
YTHDF2-orchestrated m6A methylation of BECN1 induces Scoparone-mediated hepatic stellate cell ferroptosis to attenuate liver fibrosis
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157912
PMID:41655543
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研究论文 | 该文章研究了Scoparone通过YTHDF2介导的BECN1 m6A甲基化诱导肝星状细胞铁死亡来减轻肝纤维化的分子机制 | 首次揭示了Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来抗肝纤维化的新机制,特别是YTHDF2识别BECN1 mRNA的m6A甲基化位点促进其翻译的发现 | 未提及具体局限性 | 阐明Scoparone通过m6A表观转录组调控肝星状细胞铁死亡来改善肝纤维化的分子机制 | 小鼠肝纤维化模型和人类肝星状细胞 | 机器学习 | 肝纤维化 | 单细胞测序, 空间转录组测序, 转录组测序, 免疫沉淀, 激光共聚焦 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝纤维化模型和人类肝纤维化组织标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组测序 |
| 379 | 2026-06-08 |
Inhibiting Endoplasmic Reticulum/Plasma Membrane contact ameliorates endometrial fibrosis by preventing senescence in endometrial epithelial cells
2026-Apr, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 首次对小鼠宫腔粘连模型进行单细胞RNA测序,发现内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老,促进内膜纤维化 | 首次将单细胞RNA测序应用于小鼠宫腔粘连模型,揭示了内质网/质膜接触通过STIM1/Orai1钙通道诱导子宫内膜上皮细胞衰老的新机制 | 目前发病机制尚未完全阐明,缺乏有效疗法且复发率高 | 阐明宫腔粘连的发病机制并探索新治疗策略 | 小鼠宫腔粘连模型的子宫内膜上皮细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠宫腔粘连模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 或其他兼容试剂盒 |
| 380 | 2026-06-08 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Apr, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 整合多组学数据揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化及遗传支持候选基因 | 首次结合单细胞RNA测序、DNA甲基化分析和孟德尔随机化研究,多组学整合揭示CTEPH的免疫细胞组成变化、表观遗传调控异常及遗传支持的候选基因 | 未提及样本量及外部验证队列,部分发现需进一步功能验证 | 探索慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物和致病机制 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 机器学习和计算生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、遗传变异数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化测序 | NA | NA |