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当前共找到 40234 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-06-06 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了一种基于坐标卷积神经网络的自动细胞类型识别方法BP-Coord，用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过引入坐标信息作为额外通道增强CNN的空间感知能力，并在CoordConv层前添加双三次插值上采样层以捕捉更精确的位置信息 | 未提及具体局限性 | 解决传统CNN在scRNA-seq数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 5个公开scRNA-seq基准数据集，包括大规模PBMC数据集和小样本不平衡数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2026-06-06 |
Single-cell and haplotype-resolved transcriptomics reveal molecular signatures of orchid floral structures
2026-Jun-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.016
PMID:41928475
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研究论文 | 通过单细胞和单倍型分辨转录组学，揭示兰花花朵结构特化的细胞和分子特征 | 首次整合单细胞转录组与单倍型分辨基因组，揭示细胞类型特异性和等位基因特异性表达如何塑造种间杂交性状 | NA | 解析兰花花朵特化结构的细胞异质性和分子基础 | 石斛‘朝拜微笑’的花芽 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 单倍型分辨基因组 | NA | 基因表达数据, 基因组序列 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'基因表达 |
| 363 | 2026-06-06 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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研究论文 | 通过大规模单细胞转录组测序分析人类胰岛，揭示2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次在多个供体（包括非糖尿病、前驱糖尿病和T2D状态）中生成245878个单细胞转录组图谱，识别出14种细胞类型，并发现T2D β细胞中511个差异表达基因，包括与维生素A代谢相关的基因，结合遗传、蛋白质组和小鼠模型数据，鉴定出58个候选因果T2D基因 | 未提供具体局限性描述 | 研究人类胰岛细胞在2型糖尿病中的特异性改变 | 来自48个供体的人类胰岛细胞，涵盖非糖尿病、前驱糖尿病和T2D状态 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 245878个人类胰岛细胞，来自48个供体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 364 | 2026-06-06 |
LMCD1 aggravates cardiac fibrosis after myocardial infarction via activating STAT5A
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2026.120153
PMID:42066818
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研究论文 | 本研究探索LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用，发现其通过激活STAT5A促进纤维化过程 | 首次揭示LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的促纤维化作用，并阐明其通过直接结合并激活STAT5A的分子机制 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证，缺乏人类样本验证；未探讨STAT5A下游具体靶基因 | 阐明LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的功能及分子机制，为抗纤维化治疗提供新靶点 | 小鼠心肌梗死模型、TGF-β1诱导的原代心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞测序数据、蛋白表达数据 | 小鼠心肌梗死模型（LAD结扎术）；原代心脏成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 利用公开的单细胞RNA测序数据集进行分析 |
| 365 | 2026-06-06 |
Pathogenic and Clinical Implications of the 2-Way Interplay Between Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential and Multiple Myeloma
2026-Jun, Clinical lymphoma, myeloma & leukemia
DOI:10.1016/j.clml.2026.04.003
PMID:42067472
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综述 | 探讨不确定潜能克隆造血与多发性骨髓瘤之间双向相互作用的致病和临床意义 | 首次系统阐述CHIP作为肿瘤微环境修饰因子，通过双向相互作用影响MM进展和治疗反应的新机制 | NA | 总结CHIP在MM中的转化和临床影响证据 | 不确定潜能克隆造血和多发性骨髓瘤 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 366 | 2026-06-06 |
Eosinophils drive intestinal remodelling and innate defence in reproduction
2026-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10531-6
PMID:42129565
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研究论文 | 揭示嗜酸性粒细胞在妊娠和哺乳期间驱动肠道重塑并增强先天防御功能的新机制 | 首次发现嗜酸性粒细胞在无感染或炎症条件下于小肠中积累，以干细胞内在方式促进杯状细胞分化和黏液产生，从而增强先天防御；并证明产后肠道重塑和防御功能可持续数周 | 研究主要在动物模型（小鼠）中进行，未在人类中验证相关机制 | 探索妊娠至哺乳期间母体肠道免疫适应性的变化及其对先天防御的影响 | 妊娠和哺乳期小鼠的小肠组织及嗜酸性粒细胞 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、类器官培养、遗传和药理学干扰 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 妊娠、哺乳期及产后小鼠小肠样本（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 367 | 2026-06-06 |
Accurate delineation of cellular niches via integrated spatial transcriptomics and histological imaging with SYMOL
2026-Jun-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281603.125
PMID:42134991
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研究论文 | 提出SYMOL协同自监督多模态框架，整合空间转录组学与组织学图像以实现细胞微环境的精确划分 | 通过预训练大视觉模型提取独特视觉特征，并融合空间坐标、基因表达及多通道免疫组化与H&E染色图像，实现跨模态形态学感知嵌入学习 | 未明确提及，但依赖公开数据集验证，可能缺乏新样本类型的泛化性测试 | 开发统一框架有效整合空间转录组学与组织学图像，提升细胞微环境识别和多切片整合能力 | 多个公开空间转录组数据集，包含多通道IHC和H&E图像 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 自监督多模态框架（SYMOL） | 图像和基因表达数据 | 多个公开空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 368 | 2026-06-06 |
Polyclonal selection of immune checkpoint mutations in thyroid autoimmunity
2026-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10493-9
PMID:41981327
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研究论文 | 利用全外显子测序和靶向NanoSeq技术，在自身免疫性甲状腺疾病中发现多个B细胞克隆通过获得性免疫检查点基因突变逃避免疫耐受 | 首次通过高精度单分子DNA测序技术系统性发现自身免疫病中免疫检查点基因（TNFRSF14和CD274）的多克隆体细胞突变，并揭示了多克隆体细胞进化级联驱动自身免疫的机制 | 未提供明确局限性信息 | 探究体细胞突变是否使自身反应性淋巴细胞逃避免疫检查点约束并导致自身免疫病 | 自身免疫性甲状腺疾病患者的组织样本 | 自然语言处理 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 全外显子测序,靶向NanoSeq,激光显微切割,甲基化测序,空间转录组学,免疫染色,单核DNA测序,抗体合成 | NA | DNA测序数据,转录组数据,图像数据 | 多名供体样本，具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2026-06-06 |
The USP7-VIM axis mediates lipid metabolic remodelling and compromises CD8+ T-cell mitochondrial fitness in glioblastoma
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152623
PMID:42162598
|
研究论文 | 揭示USP7-VIM轴通过调节脂质代谢重塑并损害胶质母细胞瘤中CD8+ T细胞的线粒体适应性 | 首次发现细胞外肿瘤来源的波形蛋白（VIM）与CD8 T细胞抗肿瘤免疫受损及代谢适应性改变相关，并鉴定去泛素化酶USP7为维持VIM蛋白水平的关键调节因子 | 未提及具体局限性 | 研究胶质母细胞瘤中波形蛋白在肿瘤免疫调节中的作用及其机制 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞及CD8+ T细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 功能分析, 代谢分析 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2026-06-06 |
Beta-Glucan modulates monocyte plasticity and differentiation capacity to mitigate DSS-induced colitis
2026-Jun-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107339
PMID:42220316
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研究论文 | β-葡聚糖通过训练免疫重编程骨髓造血祖细胞和外周单核细胞，诱导单核细胞可塑性转变，减轻DSS诱导的结肠炎严重程度，并通过单细胞RNA测序揭示修复性Cx3cr1巨噬细胞的扩增与结肠上皮再生的加速相关 | 首次揭示β-葡聚糖诱导的训练免疫通过调节单核细胞分化来改善实验性结肠炎，并证明该保护效应可通过过继转移骨髓或外周单核细胞传递，为炎症性肠病治疗提供了基于训练免疫的新型策略 | 仅在DSS诱导的结肠炎小鼠模型中验证，缺乏人体临床试验数据；训练免疫的长期效应和潜在副作用未充分评估 | 探究β-葡聚糖诱导的训练免疫如何影响炎症性肠病发病机制，并评估其治疗潜力 | 小鼠骨髓造血祖细胞、外周单核细胞、Cx3cr1巨噬细胞、结肠上皮细胞 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2026-06-06 |
Supervised deep learning with gene functional annotation for cell classification
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014327
PMID:42224351
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研究论文 | 开发了监督式深度学习与基因功能注释（SDAN）方法，通过图神经网络整合基因功能注释信息与基因表达谱，用于单细胞RNA测序数据的细胞分类 | 创新性地将基因功能注释信息（如蛋白质-蛋白质相互作用）与图神经网络相结合，识别功能一致性的基因集以优化细胞分类，同时实现准确分类和基因功能集分配双重目标 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 克服单细胞RNA测序数据分析中因大量细胞导致差异表达基因p值极小但效应量可忽略的问题，提高生物解释的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞及其基因表达模式 | 机器学习 | 新型冠状病毒病、痴呆症、癌症 | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2026-06-06 |
Dual epitope anti-LILRB4 synthetic T-cell receptor and antigen receptor (STAR)-T-cell therapy for relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2026-Jun-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02765-7
PMID:42225613
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research paper | 开发了双表位抗LILRB4的合成T细胞受体和抗原受体（STAR）-T细胞疗法，并进行了针对复发/难治性急性髓系白血病的首次人体临床试验 | 首次开发了基于纳米抗体的双表位抗LILRB4 STAR-T细胞，并在人体临床试验中验证了其治疗潜力 | 样本量较小（仅9名患者），部分患者因感染死亡，且单细胞RNA测序揭示了单核细胞介导的T细胞功能抑制可能是治疗失败的原因 | 开发针对LILRB4的STAR-T细胞疗法用于治疗LILRB4阳性的复发/难治性急性髓系白血病 | LILRB4阳性的复发/难治性急性髓系白血病患者 | machine learning | 急性髓系白血病 | 噬菌体展示文库筛选、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9名LILRB4阳性复发/难治性急性髓系白血病患者，其中6名完成安全性和疗效评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2026-06-06 |
Multi-omics insights for deciphering prognosis-related T cell subsets in hepatocellular carcinoma
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70708
PMID:42226614
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研究论文 | 通过多组学分析揭示肝细胞癌中与预后相关的T细胞亚群及其分子特征 | 首次通过质谱流式、批量RNA测序和单细胞RNA测序等多组学方法，系统描绘了肝细胞癌中T细胞景观与预后的关联，并发现CD4+CD8+双阳性T细胞及内皮源性HBEGF-DPT轴作为潜在预后标志物和治疗靶点 | 未详细说明，但基于摘要可能涉及样本量限制或验证范围 | 解析肝细胞癌中与预后相关的T细胞亚群及其分子相互作用 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、肝细胞癌细胞系以及同源小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌（肝细胞癌） | 质谱流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、基因敲低、Transwell迁移、共培养、qPCR、伤口愈合实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 | 多个肝细胞癌队列及同源小鼠模型，具体样本数未列明 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2026-06-06 |
Identification of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Extracellular Matrix Signatures from In-Depth Proteomic Profiling that Correlate with Lymphocyte Infiltration
2026-Jun-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0460
PMID:42133429
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研究论文 | 通过深度蛋白质组学分析鉴定与淋巴细胞浸润相关的胰腺导管腺癌胞外基质特征 | 首次通过ECM聚焦蛋白质组学揭示不同CD8+ T细胞浸润水平的PDAC小鼠模型具有不同的ECM特征，并发现区分热/冷肿瘤的ECM蛋白由多种基质细胞群分泌 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证规模有限，且单细胞RNA测序数据来源为公开数据集 | 探明胰腺导管腺癌中ECM与免疫细胞浸润之间的相互作用关系 | 不同CD8+ T细胞浸润水平的PDAC小鼠模型及人类PDAC样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据，单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型样本及公共人类PDAC单细胞RNA测序数据集 | NA | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2026-06-06 |
Hypoxia-mediated epigenetic silencing of YTHDF2 promotes endometriosis progression via the NFE2L1-NF-κB axis
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152621
PMID:42162597
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研究论文 | 揭示缺氧通过表观遗传沉默YTHDF2促进子宫内膜异位症进展的分子机制，涉及NFE2L1-NF-κB信号轴 | 首次阐明mA读取蛋白YTHDF2在子宫内膜异位症中的下调机制及其通过NFE2L1-NF-κB轴驱动疾病进展的新通路，并基于多组学分析（MeRIP-seq、RIP-seq、scRNA-seq）揭示YTHDF2缺失通过mA依赖性方式增强NFE2L1 mRNA稳定性 | 未说明具体局限性 | 研究YTHDF2在子宫内膜异位症进展中的作用及其分子调控机制 | 子宫内膜异位症患者的异位组织、子宫内膜基质细胞以及小鼠模型 | 分子生物学 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq, MeRIP-seq, RIP-seq, 单细胞RNA测序, 免疫印迹, 定量PCR, 荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 表观遗传修饰数据 | 未明确提及患者样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-seq | NA | NA |
| 376 | 2026-06-06 |
Elucidating disease pathogenesis using formalin-fixed paraffin-embedded samples: Integrating genomics, spatial transcriptomics, and histology - A focus on vascular anomalies
2026-Jun, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100779
PMID:42218013
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综述 | 综述利用福尔马林固定石蜡包埋样本整合基因组学、空间转录组学和组织学阐明疾病发病机制，聚焦于血管异常 | 强调结合下一代测序基因组突变分析和空间转录组学从福尔马林固定石蜡包埋样本中揭示疾病的多层次机制，推动诊断准确性和个性化治疗策略的创新 | 福尔马林固定石蜡包埋样本存在核酸降解和实验室间差异，阻碍其广泛应用，且缺乏统一的多层次病理研究流程 | 探讨如何通过整合下一代测序基因组突变分析和空间转录组学，利用福尔马林固定石蜡包埋样本揭示疾病发病机制 | 福尔马林固定石蜡包埋样本 | 数字病理学 | 血管异常 | NGS, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | NA | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq, 10x Visium | 用于福尔马林固定石蜡包埋样本的下一代测序和空间转录组平台 |
| 377 | 2026-06-06 |
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102387
PMID:42229582
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研究论文 | 利用纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，构建了小鼠胰岛在肥胖诱导胰岛素抵抗过程中细胞重塑的高分辨率图谱，揭示了内分泌与非内分泌细胞的动态变化及关键信号通路 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq纵向追踪高脂饮食诱导的胰岛细胞重塑，发现CCL27a-趋化因子受体信号在β细胞与M1巨噬细胞间的减弱，并在人类中验证了CCL27位点变异与2型糖尿病风险及HOMA-IR的关联 | 未提及具体局限性 | 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰岛细胞（包括内分泌和非内分泌）的纵向转录组动态变化及细胞间通讯机制 | C57BL/6小鼠胰岛细胞及INS-1细胞系 | 机器学习和单细胞组学 | 2型糖尿病、胰岛素抵抗 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 8、16、24周高脂饮食喂养的C57BL/6小鼠和年龄匹配的正常饮食对照小鼠的胰岛样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 378 | 2026-06-06 |
Chemical Reprogramming of Fibroblasts to Functional Mammary Epithelial Cells via a Single BMP Inhibitor
2026-Jun, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70173
PMID:42244440
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研究论文 | 通过单一BMP通路抑制剂LDN193189可直接将山羊耳成纤维细胞重编程为功能性乳腺上皮细胞 | 首次使用单一小分子化合物实现成纤维细胞向乳腺上皮细胞的直接重编程，无需基因操作 | 未提及长期稳定性和潜在的安全性问题 | 建立化学组成明确的简单体细胞平台以高效生成功能性乳腺上皮细胞 | 山羊耳成纤维细胞 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | 山羊耳成纤维细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 379 | 2026-06-06 |
Decoding Multicellular Communication Motifs from Spatial Transcriptomics with ALARMIST
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.21.726986
PMID:42244777
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研究论文 | 本文介绍了ALARMIST，一个从空间转录组数据中推断可解释多细胞通信模式的概率框架，能够识别涉及多种细胞类型和配体-受体相互作用的重复通信子网络 | 首次提出从空间转录组数据中推断多细胞通信基序的概率框架，能够捕捉传统方法忽略的高阶细胞间相互作用，并量化每个基序对细胞的表型效应 | 方法依赖空间转录组数据的质量和分辨率，可能无法完全捕捉动态或稀有的细胞通信事件，且验证和推广需更多独立数据集 | 开发一种能够从空间转录组数据中解码多细胞通信基序的计算方法，以揭示组织微环境中的复杂相互作用及其对疾病进展的影响 | 肺腺癌（LUAD）和胶质母细胞瘤（GBM）的空间转录组数据集 | 数字病理学 | 肺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 概率框架 | 空间转录组数据 | 包括配对肺腺癌和原位腺癌样本，以及配对低级别和高级别胶质瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2026-06-06 |
Stress Responsive bZIP Transcription Factors ATF4 and BACH1 Cooperate With MAF-Family bZIP Protein NRL to Fine-Tune Rod Photoreceptor Gene Expression
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.9
PMID:42246540
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研究论文 | 本研究发现bZIP转录因子ATF4和BACH1与NRL相互作用，共同精细调控视杆细胞的基因表达 | 首次鉴定ATF4和BACH1为NRL的相互作用蛋白，并揭示它们在视杆细胞基因表达中的不同调控作用（ATF4促进、BACH1抑制） | BACH1与NRL的相互作用可能涉及其他辅助因子，其直接结合机制尚不明确 | 鉴定与NRL相互作用的bZIP蛋白，阐明视杆细胞基因表达的调控机制 | 小鼠视网膜中的视杆细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | CUT&Tag, scRNA-seq, 酵母双杂交, 免疫共沉淀 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |