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当前共找到 32278 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-11-03 |
Matrix stiffness drives squamous cell carcinoma progression via a Piezo1-mediated mechanotransduction feedback loop
2025-Oct-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.041
PMID:41151627
|
研究论文 | 本研究揭示了基质硬度通过Piezo1介导的机械转导反馈环路驱动鳞状细胞癌进展的机制 | 首次发现Piezo1-RCC2-YAP轴将机械信号转化为促肿瘤信号，并形成自增强反馈环路促进肿瘤进展 | 样本量有限，临床相关性研究仅基于53例皮肤鳞癌患者队列 | 研究基质硬度如何通过Piezo1介导的机械转导驱动鳞状细胞癌进展及其临床意义 | 人类皮肤、口腔和肺鳞状细胞癌样本，体外可调硬度凝胶模型，异种移植模型 | 癌症生物学 | 鳞状细胞癌 | 原子力显微镜，空间转录组学，单细胞RNA测序 | 体外细胞模型，异种移植模型 | 基因表达数据，组织硬度测量数据，临床病理数据 | 人类SCC样本（皮肤、口腔、肺），皮肤鳞癌临床队列53例 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-11-03 |
Targeting ICAM1/ITGB2 with plumbagin preserves intercellular adhesion and attenuates gastric precancerous lesions
2025-Oct-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157449
PMID:41175578
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研究论文 | 本研究探讨了白花丹素通过靶向ICAM1/ITGB2相互作用维持细胞间黏附并减轻胃癌前病变的机制 | 首次发现白花丹素直接结合ICAM1蛋白的THR-85位点，阻断ICAM1/ITGB2相互作用，从而恢复细胞间黏附 | 研究主要聚焦于ICAM1/ITGB2通路，可能忽略其他潜在机制 | 研究白花丹素对胃癌前病变的治疗效果及其分子机制 | 临床样本、人源胃类器官、胃癌前细胞(MC细胞)、ICAM1⁻/⁻细胞、GPL小鼠模型 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞测序、免疫荧光、Western blotting、MST、CETSA、DARTs、Co-IP | NA | 测序数据、蛋白质数据、图像数据 | 未明确具体样本数量，包括临床样本、类器官、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-11-03 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
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研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程，用于分析结肠肿瘤微环境中金属相关通路 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅为概念验证研究，仅使用单个样本，需要更大队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属依赖性信号传导及其与基因表达的关联 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间生物学 | 结直肠癌 | 元素成像, 空间转录组学 | 相关性分析 | 图像, 基因表达数据 | 单个结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像, 空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2025-11-03 |
A comprehensive single-cell atlas of three centenarian cohorts unveils unique natural killer cell signatures and enhanced mutual interactions among peripheral immune cells
2025-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105922
PMID:40945050
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研究论文 | 通过单细胞技术分析三个百岁老人队列的外周免疫细胞特征，揭示NK细胞的独特年轻化特征和增强的细胞间相互作用 | 首次通过多组学方法系统比较百岁老人与对照人群的免疫特征，发现NK细胞具有年轻化特征和增强的细胞互作网络 | 样本量相对有限，且部分数据来自公共数据库 | 研究百岁老人群体的免疫特征与健康衰老的关系 | 百岁老人、其子女及对照人群的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 31名百岁老人、17名子女和26名对照（来自三个队列） | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式, 流式细胞术 | NA | NA |
| 365 | 2025-11-03 |
Qingre huazhuo tang regulates IgA nephropathy through immune checkpoints and ferroptosis
2025-Oct, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2024.11.005
PMID:41169938
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞测序和实验验证探讨清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | 首次结合网络药理学、单细胞测序和实验验证系统阐明清热化浊汤治疗IgA肾病的作用机制 | 机制研究仍需进一步深入验证 | 验证清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | IgA肾病患者的足细胞 | 生物医学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 实验验证 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 366 | 2025-11-03 |
Somatic TEK Mutation Identified in a Patient with Calvarial Venous Malformations
2025-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101123
PMID:41153341
|
研究论文 | 首次报道一例儿童颅骨静脉畸形患者携带体细胞TEK L914F突变及其分子机制 | 首次在儿童颅骨静脉畸形中发现体细胞TEK L914F致病突变 | 单一样本病例，需要进一步研究确定治疗靶点 | 探索颅骨静脉畸形的遗传基础 | 16岁女性颅骨静脉畸形患者 | 数字病理 | 血管畸形 | 外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,RNA测序数据 | 1例患者（病变组织和血液DNA） | NA | 单细胞RNA测序,外显子组测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-11-03 |
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Sep-19, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过促进成纤维细胞向脂肪细胞转化导致心脏梗死区域脂肪化生 | 首次发现成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖性途径介导成纤维细胞向脂肪细胞转化 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析 | 探究心脏梗死后脂肪化生的细胞机制 | 心肌梗死小鼠模型和人类心肌梗死患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-11-03 |
TissueFormer: a neural network for labeling tissue from grouped single-cell RNA profiles
2025-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.17.670735
PMID:40894666
|
研究论文 | 提出一种基于Transformer的神经网络TissueFormer，用于从单细胞RNA谱组中推断群体水平标签 | 首次将Transformer架构应用于分析单细胞RNA谱组，同时保留单细胞分辨率并利用细胞组成信号 | 仅在小鼠大脑空间转录组数据上验证，尚未在其他组织或疾病模型中测试 | 开发能够利用细胞组成信号预测群体水平表型的计算方法 | 小鼠大脑皮层区域的空间转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞RNA表达谱，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 369 | 2025-11-03 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
|
综述 | 回顾基于图像的细胞表型分析的计算方法发展历程，总结当前流程、局限性和未来发展方向 | 深度学习彻底重塑了基于图像的细胞表型分析，改进了特征提取、可扩展性和多模态数据整合能力 | 该领域仍面临需要创新解决方案的重大挑战 | 为研究人员提供导航这一快速发展领域进展和新挑战的路线图 | 基于图像的细胞表型分析技术 | 计算机视觉 | NA | 显微镜成像，深度学习 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 高通量显微镜，单细胞分析 | NA | NA |
| 370 | 2025-11-03 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学和多组学数据揭示CSCs异质性与代谢可塑性，提出双代谢抑制、合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物，难以在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs | 探讨癌症干细胞生物学特性及开发针对性治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, CRISPR筛选, AI驱动分析 | 3D类器官模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 371 | 2025-11-03 |
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2025-Aug-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.07.014
PMID:40754225
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研究论文 | 本研究开发了一种源自肝穿刺活检的类器官模型，能够重现酒精相关肝病的上皮异质性并实现精准疾病建模 | 首次从肝穿刺活检而非手术切除组织中生成类器官，成功捕获了肝脏上皮细胞的异质性，并保留了疾病阶段特征 | 研究样本量相对有限，早期阶段28例，晚期阶段34例 | 开发能够准确模拟酒精相关肝病的人类疾病模型 | 酒精相关肝病患者的肝穿刺活检组织 | 疾病建模 | 酒精相关肝病 | 免疫荧光染色、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 图像数据、基因表达数据 | 62例患者（早期28例，晚期34例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-11-03 |
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
|
研究论文 | 开发了一个多尺度生成和预测模型Spatia，用于整合细胞形态、基因表达和空间背景信息 | 首个能够融合细胞形态、基因表达和空间背景的统一表示模型，并具备生成高分辨率细胞图像的能力 | 未明确说明模型在特定疾病类型或组织类型上的泛化能力限制 | 学习统一的空间感知表示，整合细胞形态、基因表达和空间背景信息 | 空间转录组学数据中的细胞、生态位和组织 | 数字病理学 | 多种疾病 | 空间转录组学 | Transformer, 扩散模型, 交叉注意力 | 图像, 基因表达数据 | 1700万细胞-基因对，100万生态位-基因对，1万组织-基因对，来自49名供体，17种组织类型，12种疾病状态 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 373 | 2025-11-03 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02148-8
PMID:40195561
|
研究论文 | 提出CHOIR方法通过随机森林分类器和置换测试优化单细胞数据聚类，提高细胞类型和状态检测的统计显著性 | 首次将随机森林分类器和置换测试框架应用于层次聚类树，统计确定代表不同细胞群体的聚类 | NA | 解决单细胞数据聚类中过聚类或欠聚类的问题，提高细胞类型识别的有效性 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、空间转录组和多组学数据集 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 多组学 | 随机森林, 层次聚类 | 单细胞数据 | 230个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 374 | 2025-11-03 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveals ACACA as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker across cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599223
PMID:41169354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，揭示ACACA作为跨癌种潜在预后和免疫治疗生物标志物 | 首次在多癌种水平系统研究ACACA的表达模式及其与免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于肺癌和肉瘤细胞 | 探索ACACA在癌症中的多组学特征和免疫学意义 | 多种癌症类型（重点关注肺癌和肉瘤） | 生物信息学 | 多癌种（重点关注肺癌和肉瘤） | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,转录组学,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床数据 | TCGA、CPTAC、HPA和GEO数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-11-03 |
ADAM8 in macrophages exacerbates sepsis-induced cardiomyopathy by impeding efferocytosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654688
PMID:41169382
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研究论文 | 本研究揭示了ADAM8在巨噬细胞中通过阻碍胞葬作用加剧脓毒症诱发的心肌病 | 首次发现ADAM8在脓毒症心肌病中调控巨噬细胞胞葬作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究ADAM8在脓毒症诱发心肌病中的具体作用机制 | 小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞转录组测序，RNA转录组测序，免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2025-11-03 |
Multi-omics analysis and evidence of IL1R1 as a potential biomarker for diabetes-associated intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1692185
PMID:41169383
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1R1作为糖尿病相关椎间盘退变的潜在生物标志物 | 首次将IL1R1确立为连接2型糖尿病和椎间盘退变的关键分子桥梁，揭示了中性粒细胞介导的炎症机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索2型糖尿病与椎间盘退变之间的共享分子机制 | 人类T2DM和IDD转录组数据集、糖尿病小鼠髓核组织 | 生物信息学 | 糖尿病相关椎间盘退变 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接 | LASSO, 随机森林, 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-11-03 |
Comprehensive analyses of single-cell and bulk RNA-seq reveal the biological and prognostic roles of BMP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686938
PMID:41169612
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA-seq综合分析BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和预后作用 | 首次系统揭示BMP4在胰腺癌中的代谢调控功能及其作为独立预后因子的价值 | BMP4对免疫细胞浸润的影响有限，其预后作用主要独立于免疫调节机制 | 探究BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和临床预后意义 | 胰腺腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 378 | 2025-11-03 |
Opportunities and challenges in the application of spatiotemporal transcriptomics in plant research
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1684057
PMID:41169728
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综述 | 探讨时空转录组学技术在植物研究中的应用机遇与挑战 | 系统阐述空间转录组技术如何整合高通量转录组学与高分辨率组织成像，突破传统转录组学局限 | NA | 为系统揭示生命过程的时空调控提供理论和方法学支持 | 植物组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2025-11-03 |
Research advances of the establishment and characterization of Helicobacter pylori infection animal models
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1683366
PMID:41170432
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综述 | 本文综述了幽门螺杆菌感染动物模型的建立与表征研究进展 | 探讨了空间转录组学在该领域的潜在应用，并系统总结了模型建立的关键要素 | 综述性文章，不包含原始实验数据 | 支持临床前研究，建立稳定可重复的动物模型以模拟人类感染和疾病进展 | 幽门螺杆菌感染动物模型 | NA | 胃部疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2025-11-03 |
Multiplets in scRNA-seq data: Extent of the problem and efficacy of methods for removal
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0333687
PMID:41166377
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研究论文 | 评估单细胞RNA测序数据中多重捕获问题的普遍程度及现有检测方法的有效性 | 通过细胞哈希数据确定真实多重捕获率的下限，揭示常用启发式估计系统性低估问题，并提出改进的泊松模型 | 大多数数据集缺乏多重标记技术验证，研究者只能依赖有限的工具和启发式方法 | 评估单细胞RNA测序中多重捕获问题的严重性和现有检测方法的效能 | 公共可用的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞哈希技术 | 泊松模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |