单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3741	2025-02-09	Case study of a neuroendocrine tumor of uncertain origin: single-cell transcriptomics unravels potential primary location 2024-Dec-31, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-06071-z PMID:39738894	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和全外显子测序技术，探索了一例来源不明的神经内分泌肿瘤的原发部位	利用单细胞RNA测序和全外显子测序技术，结合公开的转录组数据集，开发并验证了用于组织来源识别的分子基因特征	研究仅针对一例病例，样本量较小，结果可能不具有广泛代表性	确定非器官局限性神经内分泌肿瘤的原发部位，以进行准确的诊断和管理	一例位于十二指肠和胰头之间的腹膜后非功能性神经内分泌肿瘤	数字病理学	神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），全外显子测序（WES）	NA	转录组数据	一例病例
3742	2025-02-09	Identification of psoriasis-associated immune marker G3BP2 through single-cell RNA sequencing and meta analysis 2024-12, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13851 PMID:39267394	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和元分析，揭示了银屑病在细胞水平的潜在机制，并识别了在银屑病进展中起显著作用的免疫调节标记基因	创新性地结合了单细胞RNA测序和元分析，首次识别了与银屑病发病和进展相关的免疫调节标记基因G3BP2	样本量较小，仅包括12名银屑病患者的皮肤组织样本	探索银屑病的发病机制并识别有效的治疗靶点	银屑病患者的皮肤组织	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），元分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），LASSO回归，ROC曲线分析	NA	RNA测序数据	12名银屑病患者的皮肤组织样本
3743	2025-02-09	ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis 2024-Nov-01, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/ard-2024-225778 PMID:39486872	研究论文	本研究探讨了类风湿性关节炎（RA）中组织驻留滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用	发现了一种新型的组织重塑CD45-CD31-PDPN+ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群，并揭示了其在RA进展中的调控机制	研究主要依赖于单细胞和空间转录组学技术，可能受限于样本量和技术的分辨率	研究类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用	类风湿性关节炎患者的滑膜组织和滑膜成纤维细胞	数字病理学	类风湿性关节炎	单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光、流式细胞术、细胞共培养、RNA测序	NA	基因表达数据、细胞表型数据	两个队列（PEAC和R4RA）的类风湿性关节炎患者样本
3744	2025-02-09	Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis 2024-Oct-15, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/ard-2024-225928 PMID:39375009	研究论文	本研究采用多组学方法，识别了膝骨关节炎（KOA）患者髌下脂肪垫（IFP）中的主要细胞类型及其转录组特征，并探讨了IFP在KOA、性别和肥胖状态下的差异	首次提供了人类IFP的细胞和转录组多样性的全面图谱，并确定了IFP成纤维细胞作为与KOA疾病、性别或肥胖相关的转录组和代谢差异的关键细胞	样本量相对较小，仅包括21个IFP样本（6个健康对照和15个KOA捐赠者）	探讨膝骨关节炎（KOA）患者髌下脂肪垫（IFP）的细胞和转录组多样性及其在KOA、性别和肥胖状态下的差异	膝骨关节炎（KOA）患者和健康对照者的髌下脂肪垫（IFP）	数字病理学	膝骨关节炎	单核RNA测序、空间转录组学、生物信息学分析、代谢组学	NA	RNA测序数据、空间转录组数据、代谢组数据	21个IFP样本（6个健康对照和15个KOA捐赠者），共82,924个细胞核
3745	2025-02-09	Inducible pluripotent stem cells to study human mast cell trajectories 2024-Oct, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2024.07.003 PMID:39038754	研究论文	本文开发了一种从诱导多能干细胞（iPSC）分化人类肥大细胞（MC）的体外模型，用于研究人类MC的分化轨迹	利用iPSC技术生成人类MC前体和成熟MC群体，为研究MC生物学和分化轨迹的转录调控提供了新的模型系统	研究中使用的细胞模型系统可能无法完全模拟体内MC的分化和功能	研究人类肥大细胞的分化轨迹和亚型	人类肥大细胞及其前体细胞	细胞生物学	炎症性疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	iPSC分化模型	细胞数据	547个单细胞（来自MCFC培养第4周的细胞）
3746	2025-02-09	Modeling Lewy body disease with SNCA triplication iPSC-derived cortical organoids and identifying therapeutic drugs 2024-Sep-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adk3700 PMID:39259788	研究论文	本文通过使用SNCA三倍体诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的皮质类器官模拟路易体病（LBD），并筛选出四种潜在的治疗药物	首次使用SNCA三倍体iPSCs衍生的皮质类器官模拟LBD，并通过单细胞RNA测序和功能验证揭示了兴奋性神经元中的突触和线粒体功能障碍	研究主要基于体外模型，尚未在体内验证药物的疗效	研究路易体病（LBD）中α-突触核蛋白（α-SYN）病理的机制，并筛选潜在的治疗药物	SNCA三倍体iPSCs衍生的皮质类器官和兴奋性神经元	数字病理学	路易体病	单细胞RNA测序，实时震动诱导转化实验	iPSCs衍生的皮质类器官	基因表达数据，药物筛选数据	1280种FDA批准的药物，SNCA三倍体iPSCs衍生的皮质类器官
3747	2025-02-09	The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.002 PMID:39089253	研究论文	本文通过纵向双光子成像和单细胞转录组学技术，揭示了脉络丛在脑炎症中的调控机制	首次详细描述了脉络丛上皮细胞在神经炎症期间如何短暂特化以滋养免疫细胞，并协调其招募、存活和分化	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨脉络丛在脑炎症中的调控机制	小鼠脉络丛和免疫细胞	神经科学	脑膜炎	纵向双光子成像，单细胞转录组学	NA	图像，转录组数据	小鼠模型
3748	2025-02-09	NR3C2 affects the proliferation and invasiveness of colon cancer cells through the Wnt/β-Catenin signaling pathway 2024-Sep-05, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-05935-8 PMID:39237674	研究论文	本研究探讨了核受体亚家族3组C成员2（NR3C2）与结肠癌结果之间的潜在关联及其机制	首次揭示了NR3C2通过Wnt/β-Catenin信号通路影响结肠癌细胞的增殖和侵袭性	研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，样本量有限，且未进行大规模临床验证	探索NR3C2与结肠癌结果的相关性及其机制	结肠癌细胞	癌症研究	结肠癌	mRNA数据分析、生物信息学方法、ROC曲线、单细胞转录组分析、细胞培养实验	NA	mRNA数据、临床记录、单细胞数据	TCGA数据库中的结肠癌数据、GEO数据库中的单细胞数据、3个新鲜结肠癌样本及其旁癌样本
3749	2025-02-09	Stellate cells are in utero markers of pancreatic disease in cystic fibrosis 2024-Aug-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-024-00871-2 PMID:39112965	研究论文	本文通过绵羊CF模型研究了囊性纤维化（CF）胰腺疾病的演变过程，发现星状细胞在CF胰腺疾病中的关键作用	首次在CF绵羊模型中通过单细胞RNA测序技术识别出在CF胰腺疾病中显著过表达的独特细胞群体，特别是星状细胞	研究仅基于绵羊模型，尚未在人类中进行验证	探讨囊性纤维化胰腺疾病的早期演变机制	CFTR-/-绵羊的胎儿胰腺	数字病理学	囊性纤维化	RNA-seq, scRNA-seq, 免疫化学	CFTR-/-绵羊模型	RNA序列数据	从妊娠50天到足月的六个时间点收集的胎儿胰腺样本
3750	2025-02-09	Unravelling CD4+ T cell diversity and tissue adaptation of Tregs in abdominal aortic aneurysms through single-cell sequencing 2024-08, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13796 PMID:38637948	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的多样性和调节性T细胞（Tregs）的组织适应性	首次在腹主动脉瘤中识别出Tregs的前体细胞，并揭示了这些细胞在外周组织中起源并在主动脉中获得组织特异性表型的过程	Tregs获得组织特异性表型的具体时间和机制仍不明确	探讨腹主动脉瘤中CD4+ T细胞的异质性及Tregs的组织适应性	腹主动脉瘤患者的CD4+ T细胞和脾脏细胞	生物信息学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
3751	2025-02-09	Endothelial Cell Flow-Mediated Quiescence Is Temporally Regulated and Utilizes the Cell Cycle Inhibitor p27 2024-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320671 PMID:38602102	研究论文	本文研究了内皮细胞在血流诱导的机械传导下如何调节细胞周期并进入静止状态，特别是通过p27细胞周期抑制剂的调控	揭示了内皮细胞在血流刺激下静止状态的独特性质和时序调控机制，特别是p27在其中的关键作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探究内皮细胞在血流诱导下如何调节细胞周期并进入静止状态	人内皮细胞、小鼠和斑马鱼的内皮细胞	细胞生物学	血管功能障碍	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	基因表达数据	NA
3752	2025-02-09	Single-cell profiling of bronchoalveolar cells reveals a Th17 signature in neutrophilic severe equine asthma 2024-04, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13745 PMID:38153159	研究论文	本文通过单细胞mRNA测序技术，研究了严重马哮喘（SEA）中的免疫机制，揭示了Th17免疫反应在其中的主导作用	首次在SEA中通过单细胞mRNA测序技术揭示了Th17免疫反应的主导作用，并发现了单核细胞-淋巴细胞复合物及CXCL13在中间单核细胞中的上调	研究样本量较小，仅包括11匹温血马	揭示严重马哮喘（SEA）中的免疫机制	温血马（5匹对照马和6匹SEA马）的冷冻保存的支气管肺泡细胞	数字病理学	哮喘	单细胞mRNA测序（scRNA-seq）	NA	mRNA序列数据	11匹温血马（5匹对照马和6匹SEA马）
3753	2025-02-09	Modeling primitive and definitive erythropoiesis with induced pluripotent stem cells 2024-03-26, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2023011708 PMID:38290102	研究论文	本文利用诱导多能干细胞（iPSCs）模拟原始和最终红细胞生成，比较了两种红细胞的功能特性	通过iPSCs生成同基因背景的原始和最终红细胞，并直接与胎儿肝脏来源的红细胞进行比较，揭示了两种红细胞生成程序的差异	研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内红细胞生成的复杂性	研究红细胞生成的不同阶段及其功能特性，探索iPSCs在遗传性血液疾病建模中的应用	诱导多能干细胞（iPSCs）及其分化的红细胞	细胞生物学	血液疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	健康胎儿肝脏细胞来源的iPSCs及其分化的红细胞
3754	2025-02-09	Investigating adverse genomic and regulatory changes caused by replacement of the full-length CFTR cDNA using Cas9 and AAV 2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids DOI:10.1016/j.omtn.2024.102134 PMID:38384445	研究论文	本文研究了使用Cas9和AAV替换全长CFTR cDNA后引起的基因组和调控变化的安全性	通过多种测序技术（CAST-seq、ATAC-seq、scRNA-seq）全面评估了基因编辑后的基因组和调控变化，验证了该策略的安全性	研究中发现的基因组重排和大片段插入/缺失虽然比例较低，但仍需进一步评估其长期影响	评估一种基于Cas9和AAV的通用基因编辑策略在治疗囊性纤维化中的安全性	气道基底干细胞	基因编辑	囊性纤维化	Cas9基因编辑、AAV、CAST-seq、ATAC-seq、scRNA-seq	NA	基因组数据、单细胞RNA测序数据、开放染色质数据	NA
3755	2025-02-09	Rapid anti-myeloma activity by T cells expressing an anti-BCMA CAR with a human heavy-chain-only antigen-binding domain 2024-Feb-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2023.12.018 PMID:38155568	研究论文	本文介绍了一种新型的完全人源化抗BCMA嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法FHVH33-CD8BBZ，用于治疗多发性骨髓瘤（MM）的首次人体临床试验	开发了一种具有重链唯一抗原识别域、4-1BB域和CD3ζ域的完全人源化抗BCMA CAR，并首次在人体临床试验中验证其疗效	样本量较小（25名患者），且未进行长期随访以评估持久性疗效	评估新型CAR-T细胞疗法FHVH33-CD8BBZ在多发性骨髓瘤患者中的安全性和有效性	25名复发多发性骨髓瘤患者	生物医学工程	多发性骨髓瘤	嵌合抗原受体T细胞疗法（CAR-T）	NA	临床数据	25名复发多发性骨髓瘤患者
3756	2025-02-09	Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041 PMID:39916959	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3技术，揭示了葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的细胞异质性，并识别了预后生物标志物	首次在UVM中构建了单细胞分辨率的细胞因子反应词典，并利用AlphaFold 3预测关键蛋白的3D结构	研究样本量有限，且主要依赖于体外实验数据，未进行大规模临床试验验证	阐明UVM中的细胞异质性并识别预后生物标志物	葡萄膜黑色素瘤（UVM）的原发性和转移性样本	数字病理学	葡萄膜黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），AlphaFold 3，CRISPR-Cas9筛选分析	LASSO回归，ROC曲线分析，伪时间轨迹映射	RNA测序数据，蛋白质结构预测数据	TCGA-UVM和GSE84976队列中的样本
3757	2025-02-09	Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660 PMID:39916961	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了2型糖尿病患者外周血单个核细胞的功能失调特征	首次使用单细胞RNA测序技术分析2型糖尿病患者外周血单个核细胞的转录组图谱，揭示了免疫细胞的功能失调特征	样本量较小，仅包括3名健康参与者和3名2型糖尿病患者	探索2型糖尿病患者外周血单个核细胞的免疫状态和潜在免疫机制	2型糖尿病患者的外周血单个核细胞	生物信息学	2型糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	3名健康参与者和3名2型糖尿病患者
3758	2025-02-09	M2 macrophages drive leukemic transformation by imposing resistance to phagocytosis and improving mitochondrial metabolism 2023-04-14, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adf8522 PMID:37058562	研究论文	本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫组织化学研究，揭示了急性髓性白血病（AML）患者骨髓中先天免疫区室向支持肿瘤的M2极化巨噬细胞景观转变，并探讨了这些巨噬细胞如何通过减少吞噬活性和增强线粒体代谢促进白血病转化	研究发现AML相关的M2极化巨噬细胞通过减少吞噬活性和增强线粒体代谢促进白血病转化，揭示了免疫景观在白血病发展中的作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探讨急性髓性白血病（AML）患者骨髓中M2极化巨噬细胞在白血病转化中的作用	急性髓性白血病（AML）患者骨髓中的M2极化巨噬细胞和白血病原始细胞	肿瘤免疫学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	AML患者的骨髓样本
3759	2025-02-09	Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition 2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.04.03.535302 PMID:37066136	研究论文	本文研究了脂肪细胞在瘢痕形成中的作用，发现脂肪细胞通过机械感应转化为成纤维细胞，从而驱动伤口纤维化	首次揭示了脂肪细胞通过机械感应转化为成纤维细胞的机制，并提出了通过抑制Piezo来预防和修复瘢痕的新方法	研究主要基于小鼠模型和人类异种移植伤口模型，尚未在更广泛的人类临床环境中验证	探讨脂肪细胞在瘢痕形成中的作用，并寻找减少纤维化的治疗方法	脂肪细胞和成纤维细胞	生物医学	瘢痕形成	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Visium、CODEX	小鼠伤口模型和人类异种移植伤口模型	基因表达数据、空间转录组数据	小鼠和人类异种移植伤口模型
3760	2025-02-09	SK3 in POMC neurons plays a sexually dimorphic role in energy and glucose homeostasis 2022-Oct-09, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-022-00907-2 PMID:36210455	研究论文	本研究探讨了POMC神经元中SK3在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用	揭示了SK3在POMC神经元中的性别二态性作用，特别是在能量和葡萄糖稳态方面，独立于体重控制	研究未完全阐明POMC神经元功能性别差异的机制	研究POMC神经元中SK3在能量和葡萄糖稳态中的性别二态性作用	小鼠的POMC神经元	神经科学	代谢疾病	单细胞RNA-Seq, Cre-loxP策略	NA	基因表达数据	雄性及雌性小鼠