单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37637 篇文献,本页显示第 3721 - 3740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3721 2026-01-27
Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review
2024-07-08, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2
综述 本文综述了转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用,强调了其在心脏生物工程和再生医学中的重要性 聚焦于转录组学技术(如bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、单核RNA-seq和空间转录组学)在解析心肌细胞-生物材料相互作用网络中的创新应用,并探讨了纵向研究、通路分析和机器学习等方法的整合潜力 存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异以及分析流程复杂等挑战 旨在通过转录组学方法深入理解心肌细胞与生物材料的相互作用机制,以促进心脏健康相关研究 心肌细胞与生物材料的相互作用 数字病理学 心血管疾病 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 机器学习 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
3722 2026-01-26
Single-cell dissection of CD8+ T cell-driven immune dysregulation in type 1 diabetes mellitus: Mechanistic links to diabetic foot pathogenesis
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病患者外周血单个核细胞中CD8+ T细胞驱动的免疫失调机制,并探讨了其与糖尿病足等并发症的潜在联系 首次在1型糖尿病患者中发现了一个新的耗竭性CD4+ T细胞亚群(PDCD1+, LAG3+),并揭示了GALECTIN-CD44信号轴在驱动单核细胞/树突状细胞与CD8+ T/NK细胞间促炎性串扰中的核心作用 研究样本量相对有限(共77例),且为横断面研究,无法确定观察到的免疫失调是疾病的原因还是结果 阐明1型糖尿病进展的细胞网络及其与糖尿病并发症的潜在联系 1型糖尿病(T1DM)患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 无监督聚类分析,细胞间通讯分析 单细胞转录组数据 46名3期1型糖尿病患者和31名匹配对照者的外周血单个核细胞,共87,542个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3723 2026-01-26
Single-cell sequencing reveals APOE deletion alleviates adipose wasting in cancer cachexia via macrophage repolarization
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了载脂蛋白E(ApoE)缺失通过巨噬细胞重编程缓解癌症恶病质中脂肪组织消耗的机制 首次在癌症恶病质背景下,通过单细胞测序技术揭示了ApoE调控脂肪组织稳态的新机制,特别是发现了Cbr2+巨噬细胞亚群向M2表型转化的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨ApoE调控巨噬细胞极化的具体分子通路 探究ApoE在癌症恶病质脂肪组织重塑中的作用机制 癌症恶病质患者样本、小鼠模型、脂肪细胞 单细胞组学 癌症恶病质 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 未明确样本数量,包括恶病质患者血浆/皮下脂肪样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3724 2026-01-26
Research progress on immunotherapeutics for triple-negative breast cancer from a single-cell perspective
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文从单细胞视角综述了三阴性乳腺癌免疫治疗的研究进展,整合了单细胞多组学技术与药理学的最新发现 从单细胞多组学(scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)的独特视角,系统整合了肿瘤微环境重塑机制与免疫治疗开发,提出了单细胞指导的免疫治疗创新策略 作为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未涉及原始实验数据验证 总结三阴性乳腺癌免疫治疗的最新进展,探讨肿瘤微环境对免疫治疗耐药性的影响,并展望单细胞技术指导下的精准治疗策略 三阴性乳腺癌及其肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
3725 2026-01-26
A PNPLA3-NACC1-RIPK3 pathway mediates macrophage necroptosis and inflammation in MASLD
2026-Feb-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示PNPLA3 148M变异通过巨噬细胞特异性NF-κB-NACC1-RIPK3轴促进巨噬细胞坏死性凋亡和炎症信号,从而加剧肝细胞脂肪变性和肝星状细胞活化 首次阐明PNPLA3 148M变异在巨噬细胞中的特异性作用机制,并发现NACC1作为RIPK3的关键转录调节因子 研究主要基于体外诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养模型,体内验证和临床转化仍需进一步研究 探究PNPLA3 148M变异如何改变巨噬细胞行为及多细胞肝脏病理在脂毒性应激下的作用 人诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养(包含肝细胞、肝星状细胞和同基因巨噬细胞) 代谢功能障碍相关脂肪肝病 代谢功能障碍相关脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3726 2026-01-26
Exploring key genes in NAFLD linked to glutamine metabolism: A comprehensive analysis combining multi-omics, machine learning and SHAP
2026-Feb, Asia Pacific journal of clinical nutrition IF:1.3Q4
研究论文 本研究通过整合多组学、机器学习和SHAP分析,探索与非酒精性脂肪肝病相关的谷氨酰胺代谢关键基因 结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和多种机器学习算法,识别与NAFLD风险相关的代谢物和基因,并利用SHAP方法解释模型贡献 未明确说明样本来源和具体数量,可能限制结果的普适性 探索NAFLD的发病机制,寻找新的诊断和治疗靶点 非酒精性脂肪肝病相关的血清代谢物和基因 机器学习 非酒精性脂肪肝病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、GO和KEGG富集分析、LASSO回归、机器学习算法(Catboost、NGboost、XGboost)、SHAP分析 Catboost、NGboost、XGboost 多组学数据(包括代谢组和转录组) 涉及1,400种血清代谢物和两个NAFLD数据集,具体样本数量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3727 2026-01-26
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Jan-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学,探究了两种小鼠肺腺癌前体模型的分子演化和免疫反应 首次结合空间技术与遗传分析,系统比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前体模型在分子和免疫演化上的差异 研究基于小鼠模型,结果向人类癌症的转化需进一步验证 探究肺腺癌前体在有无致癌物暴露下的分子和免疫演化差异 小鼠肺腺癌前体模型(129S4 K 遗传工程模型和 129S4 U 致癌物诱导模型) 数字病理学 肺癌 全外显子组测序, 成像质谱流式细胞术, 空间转录组学 NA 空间单细胞数据, 空间转录组数据, 基因组数据 141只小鼠中的156个病灶,包括284个IMC感兴趣区域和51,531个空间转录组点 NA 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术 NA NA
3728 2026-01-26
Bimekizumab long-term response in psoriasis: Mechanistic insights into efficacy level and durability
2026-Jan-22, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本文评估了bimekizumab在银屑病患者中长达4年的临床反应持久性,并探讨了其分子机制 通过单细胞RNA测序揭示了病变皮肤中表达IL17A和/或IL17F的组织驻留记忆T细胞亚群,并发现其与bimekizumab疗效持久性相关 研究基于回顾性临床数据整合和转录组分析,可能受样本选择和测序技术限制 评估bimekizumab治疗银屑病的长期疗效持久性并探究其分子机制 银屑病患者 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 转录组数据 503名患者(来自临床试验),另加三个独立单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3729 2026-01-26
A Nanovesicle-Sericin-Based Hydrogel Scaffold for RGC Survival in Glaucoma via Regulation of Microglial Polarization
2026-Jan-21, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了一种负载干细胞和纳米囊泡的丝胶基水凝胶支架,旨在通过调节小胶质细胞极化来促进青光眼模型中视网膜神经节细胞的存活 开发了一种新型的、集成了源自牙周膜干细胞的纳米囊泡(负载原花青素)的丝胶基光交联水凝胶支架,用于协同调节神经炎症微环境 NA 开发一种生物材料支架,以改善青光眼病理条件下视网膜神经节细胞的存活 视网膜神经节细胞、小胶质细胞、牙周膜干细胞 生物材料与组织工程 青光眼 单细胞RNA测序、RNA测序、超速离心、脂质体挤出 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3730 2026-01-26
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组数据和临床分析,揭示了前列腺癌中雄激素受体依赖性的异质性,并识别了与治疗抵抗相关的分子亚型及关键耐药驱动因子MCL1 结合CRISPR-Cas9筛选、多队列转录组整合及空间与单细胞测序,系统解析了前列腺癌的AR依赖性和耐药机制,并发现了具有独立预后价值的侵袭性分子亚型(Cluster 3) 研究主要基于细胞系和回顾性队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本来源可能受限于特定平台或技术 解析前列腺癌中雄激素受体依赖性和耐药机制,以识别亚型特异性治疗靶点 前列腺癌细胞系(如VCaP、LNCaP、DU145等)、TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的临床样本、原发性和转移性肿瘤组织 数字病理学 前列腺癌 CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 共识聚类、模糊聚类 转录组数据、临床数据 多个细胞系及TCGA-PRAD、Changhai、DKFZ队列的样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
3731 2026-01-23
Single-cell transcriptome analysis reveals mechanisms by which hippocampal deep brain stimulation promotes neurorepair and microglial subpopulation remodeling in ischemic stroke
2026-Jan-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3732 2026-01-26
APM⁺ macrophages associated with plaque vulnerability via MIF-CD74 signaling: a multi-omics study
2026-Jan-21, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了与斑块脆弱性相关的APM⁺巨噬细胞及其通过MIF-CD74信号通路的作用机制 首次结合代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性地解析了APM⁺巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块不稳定中的核心作用 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 探究动脉粥样硬化与缺血性心肌病共享的代谢失调机制及斑块不稳定性的细胞基础 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群 数字病理学 心血管疾病 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 机器学习 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 涉及ApoE-/-小鼠模型及多个队列的人类样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3733 2026-01-26
ELK1 promotes the progress of myeloid leukemia by hindering the differentiation of neutrophils
2026-Jan-20, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了ELK1在急性髓系白血病(AML)进展中的作用,发现其通过阻碍中性粒细胞分化促进疾病发展 首次揭示ELK1通过损害造血干细胞干性并阻碍中性粒细胞分化来加速KrasG12D诱导的髓系白血病发展,并证明抑制ELK1可促进白血病细胞向成熟中性粒细胞分化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证ELK1抑制剂的治疗效果 探索ELK1在AML发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 小鼠模型(条件性Elk1和KrasG12D表达小鼠)、骨髓移植样本、未分化白血病细胞 分子生物学与血液肿瘤学 急性髓系白血病 条件性基因表达、骨髓移植、bulk-cell RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 多种转基因小鼠品系及体外培养的白血病细胞 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
3734 2026-01-26
Multi-Scale Transcriptomics Redefining the Tumor Immune Microenvironment
2026-Jan-15, Biotech (Basel (Switzerland))
综述 本文综述了批量、单细胞和空间转录组学方法在肿瘤免疫微环境研究中的原理、应用和局限性,并强调了整合分析的新兴策略 提出了多尺度转录组学框架,整合批量、单细胞和空间转录组数据,以更详细和机制性地理解肿瘤免疫微环境 综述文章未进行原始数据分析,主要总结现有方法,可能未涵盖最新技术进展 重新定义肿瘤免疫微环境,以支持更精确的生物技术和免疫治疗策略的开发 肿瘤免疫微环境 数字病理学 肿瘤 高通量测序技术 NA 转录组数据 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
3735 2026-01-26
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Jan-09, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病发展的免疫-基质微环境中的关键细胞群和相互作用 开发了一种使用微型支气管镜的位点特异性矽肺病小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯建模,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)及其分化亚群与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)在矽肺纤维化中的动态互作网络 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证和机制深入解析有待后续实验补充,且小鼠模型与人类疾病在病理进程上可能存在差异 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以发现潜在的治疗靶点 矽肺病患者(人类)和小鼠模型中的肺组织细胞 数字病理学 肺纤维化/矽肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 细胞-细胞通讯建模 单细胞转录组数据 矽肺患者的全肺灌洗液样本及小鼠模型肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3736 2026-01-26
Discovery of New Markers for Haemogenic Endothelium and Haematopoietic Progenitors in the Mouse Yolk Sac
2026-Jan-06, Journal of developmental biology IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过重新注释小鼠卵黄囊单细胞RNA测序数据,发现了造血内皮和红系-髓系祖细胞的新分子标记物 通过亚聚类和拟时序分析,鉴定了造血内皮细胞和红系-髓系祖细胞的新型细胞表面标记物(FXYD5、SCARF1、FCER1G),并揭示了可能调控卵黄囊造血发生的候选信号和代谢通路 研究基于公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能受限于原始数据的质量和覆盖度;研究结果主要在小鼠模型中验证,在人类或其他哺乳动物中的适用性有待进一步确认 阐明小鼠卵黄囊中造血内皮和红系-髓系祖细胞的起源、身份和分化动力学 小鼠胚胎卵黄囊中的造血-血管细胞群体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 拟时序分析 单细胞转录组数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集(未指定具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3737 2026-01-26
GDF3 promotes adipose tissue macrophage-mediated inflammation via altered chromatin accessibility during aging
2026-Jan, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本文揭示了巨噬细胞通过自分泌GDF3-SMAD2/3信号维持炎症表型并加剧内毒素血症的机制 发现GDF3-SMAD2/3轴通过限制甲基化依赖性染色质压缩驱动年龄相关染色质重塑和巨噬细胞炎症 NA 探究衰老过程中巨噬细胞炎症表型维持的机制及其与内毒素血症的关系 小鼠巨噬细胞、人类脂肪组织样本及11,084名社区动脉粥样硬化风险研究参与者 NA NA 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序分析 NA RNA测序数据、染色质可及性数据 人类脂肪组织样本及11,084名参与者 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
3738 2026-01-26
Dynamics of lung-infiltrating virus-specific T cells associated with age-dependent SARS-CoV-2 pneumonia severity
2026-Jan, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究利用Nr4a3-Tocky小鼠模型,探究了年龄相关的T细胞功能障碍与SARS-CoV-2肺炎严重程度之间的关联 建立了一种新型的鼠适应SARS-CoV-2毒株感染Nr4a3-Tocky小鼠模型,该模型能够通过荧光Timer蛋白在体内实时分析抗原反应性T细胞的动态和诱导过程 研究基于小鼠模型,其结果向人类临床的转化需要进一步验证 阐明SARS-CoV-2肺炎年龄依赖性发病的免疫学机制 成年和老年Nr4a3-Tocky小鼠 免疫学 COVID-19肺炎 单细胞RNA测序,Timer蛋白荧光分析,细胞因子检测 NA RNA序列数据,荧光成像数据,细胞因子浓度数据 未明确说明具体数量,但涉及成年和老年两组小鼠,并在感染后多个时间点(1-8 d.p.i.)进行分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3739 2026-01-26
Immune checkpoint TIM-3 defines hyperactivated NK cells and predicts fatal outcome in severe fever with thrombocytopenia syndrome
2026-Jan, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本研究探讨了TIM-3在严重发热伴血小板减少综合征患者外周血NK细胞上的表达特征及其与疾病预后的关系 首次在SFTS中系统表征TIM-3⁺ NK细胞的表达谱,发现其与致死结局相关,并鉴定sTIM-3和sGalectin-9作为新型预后生物标志物 样本量较小(21例患者),单中心研究,需要更大规模队列验证 阐明TIM-3在SFTS免疫失调中的作用机制并寻找预后生物标志物 严重发热伴血小板减少综合征患者的外周血NK细胞及血清样本 免疫学 病毒感染性疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据,流式细胞数据,血清蛋白数据 21例SFTS患者和14例健康供者的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3740 2026-01-26
Integrative Multiomics Nominate GGCT as a Crucial Regulator of Immunosuppression in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统探索了结直肠癌中的免疫逃逸相关特征,并鉴定出GGCT作为一个关键的免疫抑制调节因子和预后生物标志物 首次在单细胞水平上系统表征结直肠癌的免疫逃逸机制,并通过多组学整合和高维加权基因共表达网络分析鉴定出GGCT作为新的预后生物标志物和治疗靶点 研究主要基于公共队列数据,缺乏实验验证;单细胞数据分析可能受样本异质性和批次效应影响 探索结直肠癌中免疫逃逸机制并鉴定关键调控因子 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞群体 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 高维加权基因共表达网络分析 基因表达数据 多个公共队列数据(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
回到顶部