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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 3721 - 3740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3721 | 2026-04-24 |
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf106
PMID:40626041
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综述文章 | 讨论调控和系统基因组学的最新发展、技术局限与未来方向 | 系统评述了顺式调控密码的解读进展、序列-功能神经网络方法及新兴空间转录组学技术 | 指出当前计算方法的基准测试挑战、技术局限及知识空白 | 旨在推动更通用的顺式调控代码模型的构建 | 非编码区的顺式调控元件及基因调控网络 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、三维染色质组织分析、基因组学检测 | 序列-功能神经网络 | 基因表达数据、染色质构象数据、基因组序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3722 | 2026-04-24 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.15.628587
PMID:39763751
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研究论文 | 通过结合成像空间转录组学（MERFISH）和免疫组化共染技术优化工作流程，系统分析了小鼠视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布、多样性和血管周围性 | 首次在分子水平上全面描绘了视网膜神经节细胞（RGC）类型在二维视网膜表面的空间拓扑结构，鉴定了血管周围RGC类型并验证了其进化保守性和神经保护作用 | 主要基于小鼠模型，人类数据仅来自有限的组织样本；且工作流程需要薄切片可能丢失完整细胞形态信息 | 揭示视网膜神经节细胞类型在视网膜表面的空间组织规律及其与血管微环境的关系 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）及人类视网膜同源细胞类型 | 数字病理学 | 视神经疾病 | MERFISH，免疫组织化学染色，视神经压迫模型 | 计算配准方法 | 图像 | 小鼠视网膜平铺片（数量未具体说明），人类视网膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 成像空间转录组学（MERFISH）结合免疫组化共染技术 |
| 3723 | 2026-04-24 |
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01915-9
PMID:39112630
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组、空间转录组、谱系追踪和先进成像技术，揭示了与年龄相关的胸腺上皮细胞缺陷限制了胸腺功能和再生能力 | 首次发现两种非典型的与年龄相关的胸腺上皮细胞（aaTECs）状态的产生，这些细胞形成高密度髓周上皮簇，缺乏胸腺细胞，并与FOXN1下调相关，为胸腺衰老和免疫衰老提供了新机制 | 未明确提及 | 探索胸腺衰老过程中非造血基质细胞的年龄相关变化及其对胸腺功能和再生的影响 | 胸腺中的非造血基质细胞，特别是胸腺上皮细胞（TECs） | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、成像数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 3724 | 2026-04-24 |
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01888-9
PMID:39164479
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研究论文 | 通过单细胞转录组学评估mRNA疫苗接种后人类血液和淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型 | 利用深度学习反向表位映射方法Trex预测抗原特异性，结合单细胞转录组学揭示了淋巴结和血液中刺突蛋白特异性CD4+ T细胞的异质性表型，并比较了疫苗接种与感染后的差异 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 探究mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型特征 | BNT162b2 mRNA疫苗接种者和SARS-CoV-2感染者的刺突蛋白特异性CD4+ T细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 深度学习模型Trex | 单细胞转录组数据 | 1277个刺突特异性CD4+ T细胞（其中238个通过Trex方法预测） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3725 | 2026-04-24 |
Comprehensive single cell transcriptomics analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathways
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597347
PMID:38895216
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研究论文 | 对小鼠骨肉瘤进行单细胞转录组学分析，揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用及额外靶向通路 | 首次通过单细胞RNA测序在免疫活性转基因小鼠模型中全面分析Skp2敲除对骨肉瘤肿瘤异质性、微环境复杂性、转移和免疫激活的影响，并发现潜在逃逸机制 | NA | 探索Skp2在骨肉瘤中的功能及其作为治疗靶点的潜力，并揭示相关分子机制 | 小鼠骨肉瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤小鼠模型的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3726 | 2026-04-24 |
Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia
2024-06, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-024-01661-3
PMID:38605142
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研究论文 | 本研究探讨了IL-1β诱导的中性粒细胞胞外陷阱在肢体缺血中促进内皮功能障碍和加重缺血的机制 | 首次揭示IL-1β通过诱导NETs形成，并激活STAT1信号通路，导致内皮细胞激活和炎症，从而加重下肢缺血 | 文章未提及具体实验样本量及模型局限性 | 探究NETs在肢体缺血相关血管炎症和重塑中的功能意义 | 人类肢体缺血组织及小鼠缺血模型中的中性粒细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 下肢缺血，血管疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据，图像，蛋白质表达数据 | 人类肢体缺血样本和小鼠缺血模型样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3727 | 2026-04-24 |
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07251-0
PMID:38570678
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研究论文 | 通过活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学，研究了肠道中免疫微环境如何塑造调节性T细胞的功能 | 首次揭示了固有层而非淋巴聚集区是支持效应调节性T细胞功能的关键微环境，并识别了CD206巨噬细胞与效应T细胞之间的耐受性相互作用 | 未说明 | 理解肠道免疫系统中调节性T细胞的空间组织和功能维持机制 | 小鼠肠道组织中对肝螺杆菌有反应的调节性T细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 活体成像、光激活引导单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠肠道样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3728 | 2026-04-24 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07187-5
PMID:38509377
|
研究论文 | 研究鉴定出一个由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群，该亚群在再刺激时表现出加剧的促炎反应，并促进中枢神经系统病理 | 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传记忆，并阐明ACLY-p300轴通过调控染色质可及性控制该记忆的形成 | 未明确记忆星形胶质细胞在人类多发性硬化症中的长期稳定性及与其他神经退行性疾病的关联 | 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性及其整合过去刺激事件的能力 | 星形胶质细胞和实验性自身免疫性脑脊髓炎与多发性硬化症模型 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫沉淀测序、核酸靶向检测测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 测序数据和图像数据 | 急性与慢性EAE小鼠模型及人类慢性多发性硬化症尸检样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq、ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞转录组分析；Illumina NovaSeq用于测序文库测序 |
| 3729 | 2026-04-24 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.04.574196
PMID:38260616
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研究论文 | 本文描述了表观遗传调控的记忆性星形胶质细胞亚群，通过整合过去刺激事件加剧炎性反应，促进中枢神经系统病理过程 | 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传控制的记忆亚群，并阐明ACLY-p300通路通过乙酰辅酶A调节染色质可及性来维持促炎记忆的机制 | 主要基于动物模型（EAE），人体验证仅限于MS慢性病灶的关联分析，记忆功能在人类中的直接证据有限 | 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性、调控机制及其对后续刺激的响应能力 | 多发性硬化症（MS）及实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATAC-seq、ChIP-seq、FIND-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、组蛋白修饰数据 | EAE模型小鼠（急性/慢性），以及慢性MS患者脑组织样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'转录组测序，Illumina NovaSeq高通量测序平台 |
| 3730 | 2026-04-24 |
A robust platform for integrative spatial multi-omics analysis to map immune responses to SARS-CoV-2 infection in lung tissues
2023-11, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13679
PMID:37605469
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研究论文 | 开发了一个稳健的空间多组学整合平台，用于分析SARS-CoV-2感染肺组织中的免疫反应 | 通过创新的计算映射方法，首次整合五种组织分析技术（空间转录组学Visium、GeoMx、RNAScope和蛋白质组学CODEX、PhenoImager HT），全面比较病毒感染的肺组织在不同细胞分辨率下的转录组和靶向蛋白质组 | 未在摘要中明确提及 | 理解SARS-CoV-2病毒在肺组织中的分子和细胞反应，尤其是巨噬细胞浸润及其微环境 | COVID-19感染的肺组织样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 组织图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 感染和未感染的肺组织样本，具体数量未说明 | 10x Genomics, NanoString, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 10x Visium, GeoMx, RNAScope, CODEX, PhenoImager HT | 10x Visium用于空间转录组，GeoMx用于数字空间分析，RNAScope用于原位杂交，CODEX用于多重蛋白质成像，PhenoImager HT用于高通量成像 |
| 3731 | 2026-04-24 |
Differential Expression Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data: Current Statistical Approaches and Outstanding Challenges
2022-Jul-18, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24070995
PMID:35885218
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综述 | 本文批判性讨论了单细胞RNA测序数据中差异表达分析的六类统计方法及其局限性 | 首次将差异表达分析方法系统划分为六类，并详细讨论每类方法的统计原理和局限性 | 方法分类可能不全面，且未提供实证数据集验证结论 | 综述单细胞RNA-seq数据差异表达分析的统计方法及挑战 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3732 | 2026-04-24 |
MOCA for Integrated Analysis of Gene Expression and Genetic Variation in Single Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.831040
PMID:35432484
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研究论文 | 提出MOCA软件，用于联合分析单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 首次实现单细胞层面基因表达与遗传变异的联合一致性分析，识别收敛和发散表达模式 | 未提及具体局限性 | 开发分析工具以探究体细胞变异对基因表达模式演化的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达与遗传变异 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3733 | 2026-04-24 |
Autoreactive T cell receptors with shared germline-like α chains in type 1 diabetes
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151349
PMID:34806648
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序鉴定1型糖尿病患者中共享种系样α链的自身反应性T细胞受体 | 首次发现1型糖尿病中一类共享TCRα链的“公共”T细胞受体，这些受体具有种系约束性抗原识别特性，并且部分展现出对不同胰岛抗原肽的交叉反应性 | 未明确说明局限性 | 研究1型糖尿病中自身反应性T细胞的T细胞受体特征及其在发病机制中的作用 | 健康供体、新发T1D供体和已确诊T1D供体的外周血CD4+记忆T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 从多个供体中分离的2767个单个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用多重CD154富集法分离IAR T细胞后进行scRNA-Seq |
| 3734 | 2026-04-24 |
Intratumoral Plasmid IL12 Expands CD8+ T Cells and Induces a CXCR3 Gene Signature in Triple-negative Breast Tumors that Sensitizes Patients to Anti-PD-1 Therapy
2021-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-3944
PMID:33593880
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研究论文 | 该论文研究了瘤内注射IL12质粒通过电穿孔（Tavo）在三阴性乳腺癌中扩增CD8+ T细胞并诱导CXCR3基因特征，从而增强患者对抗PD-1治疗的敏感性 | 首次在TNBC患者中证明瘤内IL12质粒治疗可诱导与CD8+ T细胞浸润和PD-1/PD-L1表达相关的CXCR3基因特征，并可能使对抗PD-L1治疗无反应的患者转化为对抗PD-1治疗有反应 | 仅涉及单臂临床试验，样本量有限，且结论主要基于小鼠模型和少数患者数据 | 探索瘤内IL12质粒治疗在三阴性乳腺癌中增强免疫原性和T细胞浸润的能力，并评估其对抗PD-1治疗效果的预测价值 | 三阴性乳腺癌小鼠模型、治疗难治性晚期TNBC患者（OMS-I140试验）、以及公开的乳腺癌和黑色素瘤数据集 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、电穿孔基因递送 | NA | 单细胞RNA测序数据、公开数据集 | 小鼠模型多个样本；OMS-I140临床试验为单臂、前瞻性设计，具体样本量未在摘要中提及；公开数据集包括乳腺癌和黑色素瘤数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析小鼠肿瘤 |
| 3735 | 2026-04-23 |
Spatiotemporally programming the immune-osteogenic cascade with a dual-immunomodulatory scaffold for functional bone regeneration
2026-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.04.002
PMID:42016199
|
研究论文 | 本文提出了一种双免疫调节骨支架（DIBS），通过顺序调节巨噬细胞和间充质干细胞的免疫功能，以修复临界尺寸骨缺损 | 创新点在于开发了一种双免疫调节支架，不仅调控巨噬细胞表型转换，还激活归巢间充质干细胞的免疫调节功能，通过CCL2/CCR2信号轴促进血管生成和成骨分化 | NA | 研究目的是通过免疫-成骨级联调控，实现功能性骨再生 | 研究对象为临界尺寸骨缺损的修复过程，涉及巨噬细胞和间充质干细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3736 | 2026-04-23 |
Ion channel/Stat6-driven nano-immune programming of tissue-resident macrophages by amide-functionalized nanocellulose
2026-Aug, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.03.038
PMID:42004621
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析，探讨了酰胺功能化纳米纤维素对组织驻留巨噬细胞的免疫重编程机制 | 揭示了酰胺功能化纳米纤维素通过激活电压门控离子通道和Stat6信号通路，促进M2巨噬细胞极化，而不引发适应性免疫反应 | 研究仅基于14天亚急性窗口和28天脾细胞分析，长期效应和具体分子机制需进一步验证 | 阐明纳米纤维素表面化学介导的免疫重编程机制 | 原始纤维素纳米晶体和酰胺功能化纤维素纳米晶体 | 纳米生物材料 | NA | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, 药理学抑制, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3737 | 2026-04-23 |
Construction of ammonia death-related lncRNA prognostic signature model and immunomodulatory effect in glioblastoma multiforme
2026-Jul-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2026.150266
PMID:41861940
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研究论文 | 本研究构建了一个与氨死亡相关的lncRNA预后特征模型，并探讨了其在多形性胶质母细胞瘤中的免疫调节作用 | 首次将氨诱导的细胞死亡（一种不同于凋亡和铁死亡的新机制）相关的lncRNA与GBM预后及免疫微环境联系起来，构建了新型预后特征模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞验证，缺乏体内实验和临床样本的直接功能验证 | 探索氨死亡相关lncRNA在GBM中的预后价值，并阐明其代谢-免疫调控机制 | 多形性胶质母细胞瘤（GBM）患者数据及GBM细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-GBM数据集和独立CGGA队列，以及U-251、U-87 MG人GBM细胞系和正常人星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3738 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell atlases and machine learning to construct 'in silico patients' for predicting individualized drug responses
2026-Jun, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2026.117873
PMID:41796725
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综述 | 本文综述了整合单细胞图谱和机器学习构建'硅基患者'框架以预测个体化药物反应的新兴概念 | 提出'硅基患者'预测框架，整合大规模单细胞图谱、药物基因组数据库和患者特异性scRNA-seq数据，利用AI（特别是深度学习和迁移学习）实现个体化药物反应预测，并形成'预测-验证-优化'闭环 | 当前挑战包括多组学和空间信息整合的复杂性，以及临床转化中的验证需求 | 开发下一代个体化药物反应预测工具，以应对肿瘤内细胞异质性驱动的耐药性挑战 | 肿瘤生态系统，包括肿瘤微环境（TME）和临床相关患者单细胞数据 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学整合 | 深度学习，迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据，药物基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3739 | 2026-04-23 |
ELK1/NOL3/GRP78 axis regulates proliferation and stemness in TP53-mutant colon cancer by enhancing adaptive endoplasmic reticulum stress
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168227
PMID:41864308
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研究论文 | 本文研究了ELK1/NOL3/GRP78轴在TP53突变结肠癌中通过增强适应性内质网应激来调控增殖和干细胞特性的机制 | 揭示了TP53突变肿瘤干细胞中内质网应激与线粒体代谢途径的同步激活，并首次将ELK1/NOL3/GRP78轴鉴定为驱动适应性内质网应激和干细胞特性的上游调控因子 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证有限，且未探讨该轴在其他癌症类型中的普适性 | 探究TP53突变结肠癌中适应性内质网应激的上游调控机制及其对肿瘤进展的影响 | TP53突变与野生型结肠癌细胞系（SW480、HT-29、HCT116）及TCGA-COAD和GEO队列的临床数据 | 癌症生物学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、DESeq2、LASSO回归、CCK-8、集落形成、微球形成、异种移植、双荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据 | TCGA-COAD和GEO队列的结肠癌样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3740 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the characteristics of porcine viral diseases, development, and immune repertoires: Current status and challenges
2026-Jun, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2026.105929
PMID:41865947
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在猪研究中的应用进展，涵盖疾病机制、发育生物学和免疫学特征三个方面 | 首次系统性地将scRNA-seq技术在猪研究中的三大应用方向（疾病解码、发育探索、免疫分析）进行整合综述，并分析了该技术在当前猪研究中的独特挑战与未来前景 | 猪参考基因组注释不完整、样本获取与处理困难、数据分析复杂度高 | 为scRNA-seq在猪传染病防控、遗传育种和生物医学模型开发中发挥更大作用提供研究思路 | 猪（作为农业经济动物和人类疾病模型） | 数字病理学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |