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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3701 | 2025-10-06 | 
         CD206+ macrophages facilitate wound healing through interactions with Gpnmbhi fibroblasts 
        
          2025-Jul, EMBO reports
          
          IF:6.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s44319-025-00496-4
          PMID:40495034
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了CD206+巨噬细胞通过与Gpnmb高表达成纤维细胞相互作用促进伤口愈合的机制 | 首次通过CD206巨噬细胞耗竭模型和单细胞转录组学证实了CD206+巨噬细胞通过PDGF-A信号通路与Gpnmbhi成纤维细胞通讯促进伤口愈合 | 研究仅使用小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究CD206+巨噬细胞在伤口愈合过程中的具体作用机制 | 小鼠伤口愈合模型中的CD206+巨噬细胞和Gpnmbhi成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞转录组测序 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3702 | 2025-10-06 | 
         Applications of Spatial Transcriptomics in Veterinary Medicine: A Scoping Review of Research, Diagnostics, and Treatment Strategies 
        
          2025-Jun-26, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
        
          DOI:10.3390/ijms26136163
          PMID:40649940
         
       | 
      
      综述 | 本文对空间转录组学在兽医医学中的应用进行了范围综述,涵盖研究、诊断和治疗策略 | 首次系统梳理空间转录组学在兽医医学中的应用现状,识别研究空白和未来方向 | 兽医医学领域的代表性有限,存在疾病、物种、器官和地理偏见 | 评估空间转录组学在人类和动物健康研究、诊断和治疗中的应用现状 | 1398项符合纳入标准的研究,涵盖人类和动物健康研究 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 1398项研究 | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq, GeoMx, CosMX | 10x Visium空间转录组平台,Nanostring GeoMx和CosMX平台,MERFISH技术 | 
| 3703 | 2025-10-06 | 
         Single cell immunophenotyping identifies CD8+ GZMK+ IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease 
        
          2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2025.06.09.658661
          PMID:40661371
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别出CD8+ GZMK+ IFNG+ T细胞是皮肤莱姆病中的关键免疫群体 | 首次使用单细胞转录组学结合适应性免疫受体测序全面解析皮肤莱姆病中的T细胞反应 | 样本量仍有限,且未详细探讨其他免疫细胞亚群的功能 | 研究皮肤莱姆病中T细胞的免疫反应特征 | 莱姆病患者的游走性红斑病变组织和自体未受累皮肤组织 | 单细胞生物学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序,适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩展样本量(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3704 | 2025-10-06 | 
         Single-cell transcriptomics yield insights into the stress-immune interplay and inform disease risk 
        
          2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2025.06.05.658150
          PMID:40661381
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞转录组学研究应激激素对免疫细胞的调控机制及其与疾病风险的关联 | 首次在单细胞分辨率下揭示生理水平应激激素诱导的细胞类型特异性转录组变化,并发现可用于区分应激相关疾病的分子特征 | 使用体外模型可能无法完全模拟体内复杂的应激环境 | 探究应激激素在单细胞水平对免疫功能的调控机制及其与疾病风险的关联 | 原代外周血单个核细胞和中性粒细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病, 精神疾病, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个独立人类队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3705 | 2025-10-06 | 
         Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging 
        
          2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
        
          DOI:10.1101/2025.06.08.658533
          PMID:40661498
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨细胞衰老反应在老年个体伤口愈合延迟中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示衰老伤口中p16/p21/Ki67衰老成纤维细胞数量减少和功能转变 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明年龄相关的细胞衰老反应改变如何影响伤口愈合过程 | 年轻与老年小鼠的皮肤伤口组织及人类供体伤口组织 | 细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠的伤口组织及有限人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3706 | 2025-10-06 | 
         NPAS4 Depletion in POMC Neurons Protects From Obesity and Alters the Feeding-regulated Transcriptome in Male Mice 
        
          2025-May-19, Endocrinology
          
          IF:3.8Q2
          
         
        
          DOI:10.1210/endocr/bqaf083
          PMID:40296822
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了转录因子NPAS4在POMC神经元中对摄食行为的调控作用 | 首次发现NPAS4在POMC神经元中被摄食刺激诱导,并证明其缺失通过改变抑制性GABA能信号传导来调控摄食行为 | 研究仅使用雄性小鼠,未评估性别差异;机制研究仍需进一步深入 | 探究NPAS4在POMC神经元中对摄食调控的作用机制 | 雄性小鼠的POMC神经元 | 神经科学 | 肥胖症 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3707 | 2025-10-06 | 
         Adipose-derived leptin and complement factor D mediate osteoarthritis severity and pain 
        
          2025-Apr-25, Science advances
          
          IF:11.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1126/sciadv.adt5915
          PMID:40279436
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了脂肪源性瘦素和补体因子D在骨关节炎严重程度和疼痛中的关键作用 | 首次通过脂肪营养不良小鼠模型证实脂肪-关节信号交流的存在,并发现瘦素通过调控补体因子D影响骨关节炎表型 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肥胖相关脂肪因子在骨关节炎发病机制中的具体作用 | 脂肪营养不良小鼠模型、脂肪组织植入物、关节组织 | 骨科学 | 骨关节炎 | 空间转录组学、全局无监督多组学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 3708 | 2025-10-06 | 
         Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review 
        
          2025-Apr-08, BMC nephrology
          
          IF:2.2Q2
          
         
        
          DOI:10.1186/s12882-025-04103-5
          PMID:40200175
         
       | 
      
      文献综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用与发展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,以前所未有的分辨率解析肾脏微环境中细胞亚群的动态相互作用 | NA | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用价值 | 肾脏疾病相关的细胞异质性和空间组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 3709 | 2025-10-06 | 
         Transcriptional regulatory network analysis identifies GRN as a key regulator bridging chemotherapy and immunotherapy response in small cell lung cancer 
        
          2025-Feb-05, Journal of hematology & oncology
          
          IF:29.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s13045-025-01667-5
          PMID:39910394
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过构建小细胞肺癌的转录调控网络,发现GRN是连接化疗和免疫治疗反应的关键调控因子 | 首次识别GRN作为小细胞肺癌化疗和免疫治疗反应的关键枢纽基因,揭示了其在治疗耐药中的桥梁作用 | 研究机制仍需进一步实验验证,临床样本量有限 | 探索小细胞肺癌对化疗和免疫治疗耐药的分子机制 | 小细胞肺癌细胞和患者样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,转录调控网络分析 | 网络分析 | 基因组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3710 | 2025-10-06 | 
         High Glucose Promotes the Ferroptosis and Dysfunction of Endothelial Cells by Downregulating SLC3A2 and Promoting the Development of Nephropathy 
        
          2025, International journal of endocrinology
          
          IF:2.3Q3
          
         
        
          DOI:10.1155/ije/1186113
          PMID:40703306
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨高葡萄糖通过下调SLC3A2促进内皮细胞铁死亡和功能障碍,从而推动糖尿病肾病发展的机制 | 首次发现SLC3A2是糖尿病肾病中铁死亡的关键调节因子,并证实STAT1抑制剂氟达拉滨具有治疗潜力 | 需要进一步研究具体机制和治疗策略,样本来源有限 | 探究糖尿病肾病中内皮细胞功能障碍和铁死亡的分子机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和STZ处理的糖尿病小鼠 | 生物医学研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,qPCR,western blotting,铁测量,TUNEL检测,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | GSE13535数据集和实验细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3711 | 2025-10-06 | 
         Integrative multi-omics analysis reveals the interaction mechanisms between gut microbiota metabolites and ferroptosis in rheumatoid arthritis 
        
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1608262
          PMID:40703513
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合多组学方法揭示肠道微生物代谢物与铁死亡在类风湿关节炎中的相互作用机制 | 首次整合多组学数据与机器学习算法,结合单细胞转录组分析,系统阐明GPX3和MYC作为关键铁死亡调节因子在RA中的作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验确认 | 系统研究类风湿关节炎中铁死亡关键基因与肠道代谢物的调控关系 | 类风湿关节炎患者的多组学数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | LASSO,SVM,RFE-RF | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3712 | 2025-10-06 | 
         A novel mast cell marker gene-related prognostic signature to predict prognosis and reveal the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma 
        
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1538641
          PMID:40703522
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肥大细胞标志基因,构建了基于14个肥大细胞相关基因的头颈鳞状细胞癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建基于肥大细胞相关基因的HNSCC预后预测模型,并揭示其与免疫景观的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 开发头颈鳞状细胞癌的预后预测模型并探索其免疫特征 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Cox回归, LASSO回归 | 预后预测模型, 诺模图 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的HNSCC患者数据(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 3713 | 2025-10-06 | 
         Identification of lactylation-associated immune and metabolic regulators in bladder cancer via integrated bulk and single-cell transcriptomics 
        
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1604758
          PMID:40703521
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组学识别膀胱癌中乳酸化相关的免疫和代谢调控因子 | 首次在膀胱癌中系统鉴定乳酸化相关枢纽基因,揭示FASN和RUNX2通过调控非组蛋白乳酸化影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于TCGA数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究乳酸代谢重编程和组蛋白乳酸化在膀胱癌进展中的调控机制 | 膀胱癌细胞系和TCGA数据库中的膀胱癌转录组数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析,体外功能实验 | NA | 转录组数据,单细胞数据 | TCGA数据库膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA | 
| 3714 | 2025-10-06 | 
         Multi-Target Synergy Against Acute Lung Injury: Systems Pharmacology Decoding Dahuang-Huangqin Herb Pair's Therapeutic Mechanism 
        
          2025, Journal of inflammation research
          
          IF:4.2Q2
          
         
        
          DOI:10.2147/JIR.S527378
          PMID:40703642
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过整合网络药理学和多组学方法解析大黄-黄芩药对治疗急性肺损伤的多靶点协同作用机制 | 首次结合网络药理学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子对接等多模态方法系统解析中药药对的治疗机制 | 临床应用仍需药效学优化验证 | 研究大黄-黄芩药对治疗急性肺损伤的治疗机制 | 大黄-黄芩药对的活性成分及其与急性肺损伤相关的分子靶点 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 网络药理学,多组学分析,单细胞RNA测序,分子对接,孟德尔随机化 | 网络分析,分子对接模型 | 转录组数据,蛋白质相互作用数据,分子结构数据 | 207个活性成分和93个治疗靶点 | NA | 单细胞RNA测序,转录组学 | NA | NA | 
| 3715 | 2025-10-06 | 
         A comprehensive characterization of metabolic signatures-hypoxia, glycolysis, and lactylation-in non-healing diabetic foot ulcers 
        
          2025, Frontiers in molecular biosciences
          
          IF:3.9Q2
          
         
        
          DOI:10.3389/fmolb.2025.1593390
          PMID:40703704
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法全面表征了糖尿病足溃疡中的代谢特征,包括缺氧、糖酵解和乳酸化修饰 | 首次在单细胞水平系统揭示糖尿病足溃疡中代谢重编程与细胞间通讯紊乱的关联,并识别出与代谢和免疫调控相关的诊断生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模的外部验证来确认生物标志物的临床应用价值 | 探究糖尿病足溃疡中代谢失调的分子机制并识别潜在的诊断和治疗靶点 | 糖尿病足溃疡组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, KEGG/GO富集分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | LASSO, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 3716 | 2025-10-06 | 
         Multi-omics and AI-driven advances in miRNA-mediated hair follicle regulation in cashmere goats 
        
          2025, Frontiers in veterinary science
          
          IF:2.6Q1
          
         
        
          DOI:10.3389/fvets.2025.1635202
          PMID:40703926
         
       | 
      
      综述 | 综述了多组学与人工智能驱动下miRNA调控绒山羊毛囊发育的最新进展 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学与人工智能分析揭示miRNA在毛囊调控中的新机制 | NA | 探索miRNA在绒山羊毛囊发育和纤维性状调控中的作用机制 | 绒山羊毛囊组织及相关细胞类型(角质形成细胞、真皮乳头细胞、滤泡干细胞) | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组学, 蛋白质组学, 表观基因组学 | AI | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 3717 | 2024-08-07 | 
         Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Interaction between CCL19+ Inflammatory Keratinocytes and CCR7+ Dendritic Cells and B Cells in Pemphigus 
        
          2024-Oct, The Journal of investigative dermatology
          
          IF:5.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.jid.2024.03.016
          PMID:38537931
         
       | 
      
      NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 3718 | 2024-09-07 | 
         Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19 
        
          2024-Oct, EBioMedicine
          
          IF:9.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
          PMID:39236555
         
       | 
      
      NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 3719 | 2025-10-06 | 
         Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression 
        
          2024-08-02, Signal transduction and targeted therapy
          
          IF:40.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41392-024-01912-2
          PMID:39090109
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心脏粘液瘤中抑制性免疫微环境的关键作用 | 首次构建心脏粘液瘤的单细胞图谱,发现粘液瘤细胞具有成纤维细胞样特征但表达独特的磷酸二酯酶和增殖相关基因,并揭示了M2样巨噬细胞浸润与栓塞发生的临床关联 | 样本数量有限,体外共培养实验未能完全模拟体内复杂微环境 | 解析心脏粘液瘤的细胞组成和免疫微环境特征 | 心脏粘液瘤组织和其中的细胞群体 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,641个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3720 | 2025-10-06 | 
         A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication 
        
          2024-06-28, Signal transduction and targeted therapy
          
          IF:40.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41392-024-01874-5
          PMID:38937432
         
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      研究论文 | 本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合物通过调控ORF9b蛋白稳定性在SARS-CoV-2复制中的关键作用 | 首次发现ORF9b蛋白在K67位点发生泛素化并通过蛋白酶体途径降解,鉴定出TOM70作为底物受体连接ORF9b与HSP90α和CUL5形成复合物 | 未明确说明研究的样本规模和技术重复次数 | 阐明SARS-CoV-2 ORF9b蛋白的稳定性调控机制及其在病毒复制中的作用 | SARS-CoV-2病毒ORF9b蛋白及其与宿主蛋白的相互作用 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞测序,蛋白质泛素化分析 | NA | 测序数据,蛋白质相互作用数据 | COVID-19患者肺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |