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当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 3701 - 3720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3701 2025-10-06
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学测序技术全面解析哮喘诱导下肺神经免疫图谱的转录组变化 首次结合单核RNA测序与空间转录组学揭示哮喘诱导下迷走神经节和肺组织中神经免疫转录组的细胞簇特异性及空间分布特征 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 小鼠迷走神经节(结状/颈静脉神经节)和肺组织 空间转录组学 哮喘 RNA测序, 单核RNA测序, 空间RNA测序 NA 转录组数据 初始状态和经链格孢诱导的哮喘小鼠模型 NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 标准RNA测序 NA NA
3702 2025-10-06
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-12-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析筛选胰腺癌分子成像靶点,并开发靶向claudin-4的PET成像探针 首次结合空间转录组学和蛋白质组学数据驱动筛选胰腺癌分子成像靶点,发现claudin-4作为高特异性成像靶标 研究基于人类手术样本,样本来源和数量可能存在限制 开发胰腺癌特异性分子成像靶点和成像探针 胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 空间转录组学 胰腺癌 空间转录组学, 蛋白质组学, PET成像 NA 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 人类手术样本 NA 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
3703 2025-10-06
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御的新机制 首次发现肺成纤维细胞在真菌感染中具有保护性功能,通过获得新的免疫调节特性和增强ECM分泌能力来限制感染严重程度 研究主要关注periostin阳性成纤维细胞亚群,其他成纤维细胞亚群的功能尚未完全阐明 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染过程中的功能响应和防御机制 肺成纤维细胞,烟曲霉菌,免疫正常和免疫抑制宿主 免疫学,传染病学 侵袭性曲霉病,真菌性肺炎 细胞谱系追踪,靶向细胞消融,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3704 2025-10-06
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-12-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了利鲁唑通过增加BDNF水平逆转颅脑放疗引起的认知功能障碍和神经退行性后果 首次证明FDA批准的药物利鲁唑可通过增加BDNF水平逆转放疗引起的认知功能障碍,并利用空间转录组学揭示其神经保护机制 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证;未评估长期治疗效果和潜在副作用 开发针对放疗诱导认知功能障碍的神经保护治疗方法 成年小鼠模型(颅脑照射9 Gy) 神经科学 脑癌放疗相关认知功能障碍 空间转录组学,双免疫荧光染色,生化评估 动物模型 基因表达数据,免疫荧光图像,行为学数据 多组小鼠实验(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
3705 2025-10-06
Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Dec-09, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间分析揭示了化疗诱导的骨髓细胞驱动T细胞耗竭在卵巢癌中的空间限制机制 发现了化疗诱导的骨髓细胞网络(Myelonets)通过NECTIN2-TIGIT相互作用导致CD8 T细胞耗竭的空间限制机制 样本量相对有限(117例),且仅针对高级别浆液性卵巢癌 探究化疗对卵巢癌抗肿瘤免疫的适应性变化 117例高级别浆液性卵巢癌样本(化疗前后采集) 数字病理学 卵巢癌 单细胞转录组测序,空间转录组学 NA 单细胞数据,空间转录组数据 117例HGSC样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
3706 2025-10-06
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的关键作用,发现其失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 首次发现内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3同时失活(而非仅PHD2)通过激活糖酵解/MCT4轴促进肾脏不良修复,并证明MCT4抑制剂可恢复适应性修复 机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 探究缺血性急性肾损伤向慢性肾病转变的内皮细胞机制 小鼠和人类肾脏内皮细胞 病理生理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3707 2025-10-06
VICTOR: Validation and inspection of cell type annotation through optimal regression
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 介绍了一种名为VICTOR的新方法,用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的可靠性 通过弹性网络正则化回归结合最优阈值来评估细胞注释的置信度,在识别不准确注释方面表现优于现有方法 NA 开发评估单细胞数据细胞类型注释可靠性的方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 弹性网络正则化回归 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3708 2025-10-06
A temporal cortex cell atlas highlights gene expression dynamics during human brain maturation
2024-Dec, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过单核RNA测序构建人类颞叶皮层的儿科和成人联合细胞图谱,揭示大脑成熟过程中的基因表达动态 首次构建包含非洲裔样本的儿科和成人联合细胞图谱,发现与认知和突触可塑性相关的LTK和FREM兴奋性神经元亚型在儿科组织中表达升高 研究主要聚焦于颞叶皮层,可能无法完全代表其他脑区的发育特征 探索人类大脑成熟过程中的细胞类型特异性基因表达动态 人类颞叶组织样本,包含儿科和成人样本及非洲裔样本 单细胞基因组学 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 未明确指定样本数量,但鉴定了75种细胞亚型 NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
3709 2025-10-06
Tumor Expression of CD83 Reduces Glioma Progression and Is Associated with Reduced Immunosuppression
2024-12-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质瘤中CD83+肿瘤细胞可抑制肿瘤进展并改善免疫抑制微环境 首次发现肿瘤细胞自身表达的CD83能够调节免疫微环境并增强抗肿瘤T细胞反应 需要进一步研究CD83表达是否能够增强免疫治疗效果 探究CD83在胶质瘤免疫抑制微环境中的作用机制 人类和小鼠胶质瘤样本 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3710 2025-10-06
Physical inactivity exacerbates pathologic inflammatory signalling at the single cell level in patients with systemic lupus
2024-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,系统性红斑狼疮患者的身体不活动会加剧免疫细胞的病理性炎症信号传导 首次在单细胞水平揭示身体不活动如何通过CD4+和CD8+T细胞加剧系统性红斑狼疮患者的病理性炎症信号传导 研究基于自我报告的身体活动数据,样本量相对有限(123例患者) 探究身体活动对系统性红斑狼疮患者免疫细胞功能和炎症信号传导的影响机制 123名系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 单细胞基因组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 123名系统性红斑狼疮患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3711 2025-10-06
Improved characterization of 3' single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术改进3'单细胞RNA-seq文库中polyA位点表征的能力 利用亲和碱基化学测序技术首次实现对胸腺嘧啶同聚物区域的准确测序,直接独立分配reads到polyA位点 与单端比对相比并未持续提高reads比对率,未排除其他新兴平台可能具有相似性能 改进3'单细胞RNA-seq文库的表征方法,特别是polyA位点的精确量化 单细胞RNA-seq文库中的polyA位点 单细胞测序技术 NA 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA Element Biosciences, Illumina 单细胞RNA-seq Element Aviti Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术
3712 2025-10-06
Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions
2024-Dec, PRX life
研究论文 通过分析单细胞RNA测序数据,研究细胞表型转变过程中基因调控网络的协调机制 首次在五种不同细胞转变过程中观察到基因调控网络社区间相互作用的共同模式:调控数量和强度先增加后减少 仅基于五种细胞转变过程的分析,需要更多系统验证 探索细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 五种不同细胞转变过程中的基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 过渡路径理论 单细胞RNA测序数据 五种不同细胞转变过程的数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3713 2025-10-06
OneSC: a computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本研究开发了一个名为OneSC的计算平台,用于模拟细胞状态转换过程 提出了一种基于随机微分方程系统和核心转录因子调控网络的细胞状态转换模拟方法,优先生成能够产生忠实细胞状态转换的布尔网络 NA 开发计算模型以在计算机中模拟细胞状态转换过程 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 随机微分方程系统、布尔网络 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3714 2025-10-06
Human single cell RNA-sequencing reveals a targetable CD8+ exhausted T cell population that maintains mouse low-grade glioma growth
2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序发现CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中维持肿瘤生长的特殊功能 首次揭示CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中作为肿瘤生长调节因子的新功能,而非传统认知的细胞毒性效应 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究低级别胶质瘤中T细胞的功能特性和免疫治疗机制 人类和小鼠的低级别胶质瘤组织样本 数字病理学 脑胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个单细胞RNA测序数据集和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3715 2025-10-06
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学技术构建了儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱,揭示了肾脏基质细胞与浸润免疫细胞之间的复杂相互作用 首次在儿童狼疮性肾炎中应用空间转录组学技术,在单细胞水平上同时保留空间位置信息,揭示了免疫细胞特异性定位和基因表达的空间依赖性 样本量较小(8例患者和4例对照),组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 探究儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 空间转录组学 狼疮性肾炎 空间转录组学,单细胞转录组学 NA 空间转录组数据,单细胞转录组数据 8例儿童狼疮性肾炎患者和4例对照个体的肾脏组织 NA 空间转录组学,单细胞转录组学 NA NA
3716 2025-10-06
Endogenous antigens shape the transcriptome and TCR repertoire in an autoimmune arthritis model
2024-Nov-26, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了内源性抗原如何影响自身免疫性关节炎模型中T细胞的转录组和TCR受体库 首次在Zap70信号缺陷的自身免疫性关节炎模型中,结合单细胞RNA测序和TCR测序,揭示了内源性逆转录病毒通过超抗原反应破坏外周耐受的新机制 研究仅使用SKG小鼠模型,结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 探究信号通路缺陷条件下致病性自身反应性CD4+ T细胞的发育和活化机制 BALB/c-Zap70*W163C (SKG)小鼠中高度致关节炎的初始CD4+ T细胞亚群 免疫学 自身免疫性关节炎 bulk RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA 基因表达数据, TCR序列数据 SKG小鼠和野生型小鼠的CD4+ T细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序 NA NA
3717 2025-10-06
Cell-specific priors rescue differential gene expression in spatial spot-based technologies
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究评估了传统差异表达基因分析方法在空间转录组数据中的适用性,并提出了一种基于细胞类型特异性先验知识的改进方案 开发了空间转录组数据模拟器验证传统DEG方法的局限性,并提出基于细胞特异性先验的简单基因选择方案,显著提高了DEG识别的准确性 研究主要基于计算机模拟数据,需要在实际生物样本中进一步验证方法的有效性 评估和改进空间转录组数据中差异表达基因的分析方法 空间转录组数据,特别是基于spot的技术平台如Visium产生的数据 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq 计算机模拟器,基因选择算法 基因表达数据,空间位置信息 NA 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA-seq 10x Visium 基于spot的空间转录组技术平台
3718 2025-10-06
ETV2 transcriptionally activates Rig1 gene expression and promotes reprogramming of the endothelial lineage
2024-11-19, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究揭示了ETV2通过直接激活Rig1基因表达促进成纤维细胞重编程为内皮细胞的分子机制 首次发现ETV2是Rig1基因的直接上游激活因子,并证明RIG1和NFκB1在ETV2介导的内皮细胞重编程中的关键作用 研究主要基于小鼠胚胎成纤维细胞,在人类细胞中的适用性需要进一步验证 阐明ETV2介导的细胞重编程分子机制 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和内皮细胞 细胞重编程 缺血性心脏病 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 电泳迁移率实验, 转录分析, shRNA敲低 NA 基因表达数据, 蛋白质-DNA相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3719 2025-10-06
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了PRMT5和WDR77通过ΔNp63α-p21轴协同促进鳞状细胞癌增殖的新机制 首次发现PRMT5和WDR77通过稳定ΔNp63α蛋白并抑制p21来协同促进鳞状细胞癌增殖 鳞状细胞癌中PRMT5的具体作用机制仍需进一步探索 探究PRMT5在鳞状细胞癌增殖中的作用机制 鳞状细胞癌患者数据、细胞系和体内小鼠模型 癌症生物学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, MTT检测, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞增殖数据 TCGA和DepMap数据库中的鳞状细胞癌患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3720 2025-10-06
scDOT: optimal transport for mapping senescent cells in spatial transcriptomics
2024-Nov-08, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发了scDOT方法,结合空间转录组学和单细胞RNA测序来重建单细胞分辨率空间图谱并识别衰老细胞 整合最优传输和表达反卷积来学习细胞与spots之间的非线性耦合关系,推断细胞位置 NA 提高空间转录组数据的分辨率,识别衰老细胞的空间组织 衰老细胞及其邻近细胞 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 最优传输模型 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
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