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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2025-10-06 | 
         Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment 
        
          2024-02-20, Cell reports. Medicine
          
         
        
          DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
          PMID:38280378
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌在治疗过程中的谱系与生态演化模型 | 提出基于谱系与生态评分的联合动态分析框架,首次在单细胞水平揭示肝癌治疗响应的演化轨迹 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 建立监测肿瘤治疗响应演化的分析框架 | 肝细胞癌患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 谱系-生态评分系统 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 纵向肿瘤活检样本+716例肝癌患者验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3682 | 2025-10-06 | 
         Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis 
        
          2023-12-06, Science translational medicine
          
          IF:15.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
          PMID:38055798
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了烟草烟雾暴露如何通过招募炎性单核细胞建立有利于结核分枝杆菌生长的肺部微环境 | 首次发现吸烟者肺部存在未成熟炎性单核细胞的富集,并鉴定CD93作为这些新招募单核细胞的标志物,阐明了CCR2信号通路在单核细胞招募中的作用机制 | 研究样本量有限,主要基于支气管肺泡灌洗细胞,未涵盖更广泛的肺部组织样本 | 探究吸烟如何促进肺部微环境对结核分枝杆菌生长的易感性 | 当前吸烟者和从不吸烟者的原发性支气管肺泡灌洗细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 当前吸烟者和从不吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3683 | 2025-10-06 | 
         Exploring the comorbidity mechanisms of ITGB2 in rheumatoid arthritis and membranous nephropathy through integrated bioinformatics analysis 
        
          2025-Dec, Renal failure
          
          IF:3.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1080/0886022X.2025.2536730
          PMID:40697036
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合生物信息学分析探索ITGB2在类风湿关节炎和膜性肾病共病机制中的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析RA和MN的共病机制,发现ITGB2是关键的共享致病基因 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索类风湿关节炎和膜性肾病的共同发病机制 | 类风湿关节炎和膜性肾病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎, 膜性肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林算法, Monocle3, CellChat | 基因表达数据 | 从GEO和ImmPort数据库获取的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 3684 | 2025-10-06 | 
         Potential regulatory mechanism of overexpression of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U on the glycolytic pathway in hepatocellular carcinoma 
        
          2025-Sep-05, Gene
          
          IF:2.6Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.gene.2025.149603
          PMID:40473062
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的潜在分子调控机制 | 首次综合运用多组学数据和CRISPR筛选技术揭示PIGU通过调控糖酵解关键步骤促进肝癌发展的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的分子调控机制 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721、Huh7细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | CRISPR基因编辑, 免疫组化, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 细胞功能实验 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 3773例HCC样本(RNA), 234例HCC样本(IHC和蛋白质组), 22861个HCC细胞(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列, 蛋白质组学 | NA | NA | 
| 3685 | 2025-10-06 | 
         Identification of inflammation-related biomarkers and therapeutic targets for neurogenic bladder fibrosis via multi-omics analysis 
        
          2025-Sep, Computers in biology and medicine
          
          IF:7.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110721
          PMID:40618693
         
       | 
      
      研究论文 | 通过多组学分析识别神经源性膀胱纤维化的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,结合机器学习方法鉴定出HIF-1α等四个诊断标志物,并发现MEK抑制剂PD-0325901的治疗潜力 | 研究样本量有限,主要基于动物模型,临床验证需要进一步扩大 | 识别神经源性膀胱纤维化的诊断生物标志物并探索潜在治疗药物 | 神经源性膀胱纤维化大鼠模型和患者膀胱组织 | 生物信息学 | 神经源性膀胱疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 3686 | 2025-10-06 | 
         Leveraging machine learning and single-cell RNA sequencing strategies to develop a risk prognosis scoring based on liquid-liquid phase separation feature genes in pediatric hepatoblastoma 
        
          2025-Sep, Computers in biology and medicine
          
          IF:7.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110685
          PMID:40618698
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究整合机器学习与单细胞RNA测序技术,基于液-液相分离特征基因开发了儿童肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 首次系统分析液-液相分离在肝母细胞瘤中的作用,并建立了首个基于液-液相分离的肝母细胞瘤预后预测模型 | 研究依赖于公共数据库的RNA测序数据,需要进一步实验验证 | 开发基于液-液相分离特征基因的肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 儿童肝母细胞瘤患者 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 机器学习算法 | 随机森林, SVM-RFE, Lasso回归 | RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE133039, GSE75271, GSE81928, GSE132037, GSE186975) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 3687 | 2025-10-06 | 
         PANoptosis-driven molecular stratification in esophageal squamous cell carcinoma: A multi-omics prognostic model and FGFR-Targeted therapeutic validation 
        
          2025-Sep, Computers in biology and medicine
          
          IF:7.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110688
          PMID:40628169
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究基于PANoptosis构建了食管鳞状细胞癌的多组学预后模型,并验证了FGFR靶向治疗的疗效 | 首次基于PANoptosis构建ESCC预后模型,发现FGFR抑制剂可通过抑制EMT和调控MYC/E2F通路发挥治疗作用 | 模型验证队列有限,需要更多前瞻性研究验证临床适用性 | 阐明PANoptosis在ESCC预后和治疗中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单变量Cox回归, LASSO Cox回归, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 预后风险模型 | 多组学数据, 微阵列数据, RNA-seq数据 | 多个队列的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | NA | NA | 
| 3688 | 2025-10-06 | 
         Single-cell transcriptional landscape of peripheral myeloid cells in autoimmune diseases 
        
          2025-Aug-15, iScience
          
          IF:4.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.isci.2025.113026
          PMID:40703454
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析自身免疫疾病中外周髓系细胞的转录景观 | 首次在14种自身免疫疾病中对351,905个髓系细胞进行大规模单细胞转录组分析,识别出13个具有独特免疫特征的髓系细胞亚群 | 研究主要关注外周髓系细胞,未涉及组织驻留髓系细胞或其他免疫细胞类型 | 揭示自身免疫疾病中髓系细胞的异质性和功能状态 | 375个单细胞RNA测序样本中的351,905个外周髓系细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,伪时间分析,全基因组关联研究 | NA | 单细胞转录组数据,遗传数据 | 351,905个髓系细胞,来自375个样本,覆盖14种自身免疫疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3689 | 2025-10-06 | 
         METAB-HTX: prospective, longitudinal cohort study evaluating cardiac and systemic metabolism after heart transplantation 
        
          2025-Aug, ESC heart failure
          
          IF:3.2Q2
          
         
        
          DOI:10.1002/ehf2.15330
          PMID:40375600
         
       | 
      
      研究论文 | 一项评估心脏移植后心脏和全身代谢变化的前瞻性纵向队列研究 | 首次系统性地对心脏移植患者进行长期代谢表型分析,结合多组学技术和先进影像学方法评估代谢恶化与心脏功能的关系 | 单中心研究,样本量相对有限(400例),观察性研究设计无法确定因果关系 | 探索心脏移植后代谢恶化与心脏功能受损和生存率的关系 | 心脏移植术后患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 第三代和第四代测序(短读长和长读长测序)、单细胞测序、心脏磁共振成像和波谱分析、回声心动图 | NA | 临床数据、影像数据、基因组数据、转录组数据 | 400例心脏移植术后患者,随访5年 | NA | 单细胞测序、转录组测序 | NA | NA | 
| 3690 | 2025-10-06 | 
         Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis 
        
          2025-Aug, Reproductive biomedicine online
          
          IF:3.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
          PMID:40467355
         
       | 
      
      研究论文 | 通过临床研究和单细胞分析评估孕激素预处理卵巢刺激对生殖结局的不良影响 | 结合临床队列研究和单细胞RNA测序技术探究PPOS方案对生殖结局的影响机制 | 回顾性研究设计,样本量相对有限 | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在辅助生殖中的效果差异 | 接受IVF治疗的不孕症患者及其卵泡壁颗粒细胞 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序, 逆概率处理加权 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 907例患者(临床研究), 16例患者(单细胞分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3691 | 2025-10-06 | 
         ACACA depletion activates the cPLA2-arachidonic acid-NF-κB axis to drive inflammatory reprogramming in androgen receptor-independent prostate cancer 
        
          2025-Jul-25, Cell communication and signaling : CCS
          
          IF:8.2Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12964-025-02363-0
          PMID:40713618
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了ACACA缺失通过激活cPLA2-花生四烯酸-NF-κB轴驱动雄激素受体非依赖性前列腺癌炎症重编程和转移的新机制 | 首次发现ACACA缺失在雄激素受体非依赖性前列腺癌中具有促肿瘤作用,揭示了通过花生四烯酸介导的NF-κB信号激活促进炎症和转移的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要进一步在临床样本中验证;未详细探讨其他可能涉及的信号通路 | 研究ACACA缺失在雄激素受体非依赖性前列腺癌中对炎症和转移的影响机制 | 雄激素受体非依赖性前列腺癌细胞系、小鼠转移模型 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | shRNA基因敲低、转录组测序、代谢组学、单细胞RNA测序、qPCR、western blotting、免疫荧光、伤口愈合实验、transwell实验、小鼠尾静脉注射模型 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据、蛋白质数据 | 多个转移性去势抵抗性前列腺癌数据集、ARIPC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3692 | 2025-10-06 | 
         FCGBP promotes ovarian cancer progression via activation of IL-6/JAK-STAT signaling pathway 
        
          2025-Jul-25, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12967-025-06854-z
          PMID:40713656
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了FCGBP通过激活IL-6/JAK-STAT信号通路促进卵巢癌进展的分子机制 | 首次阐明FCGBP在卵巢癌中通过调控IL-6/JAK-STAT信号通路发挥促癌作用的具体机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限 | 探究FCGBP在卵巢癌进展中的临床意义、功能作用及分子机制 | 卵巢癌组织样本、SKOV3和ES-2卵巢癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、定量PCR、Western blotting、免疫组化、双荧光素酶报告基因检测、免疫共沉淀、ELISA | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 多个公共数据库数据集、卵巢癌组织样本、两种卵巢癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3693 | 2025-10-06 | 
         Functional Diversity of Two Novel Embryonic Microglial Subpopulations and Their Developmental Trajectories in Developing Mouse Brains 
        
          2025-Jul-25, Glia
          
          IF:5.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/glia.70064
          PMID:40714978
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在小鼠胚胎大脑中发现两个新型胚胎小胶质细胞亚群并揭示其发育轨迹 | 首次识别出两个功能不同的胚胎小胶质细胞亚群(EM1和EM2),并阐明它们从CD68阴性向CD68阳性转变的发育轨迹 | 研究仅使用E14小鼠胚胎大脑样本,未采用小胶质细胞分选方法,可能影响细胞纯度 | 探索胚胎小胶质细胞的功能多样性和发育轨迹 | 小鼠胚胎大脑中的小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,生物信息学分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞基因表达数据,图像数据 | 胚胎第14天小鼠大脑细胞,以及出生后第1、14、90天小鼠大脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3694 | 2025-10-06 | 
         Spatial transcriptomics reveals macrophage domestication by epithelial cells promotes immunotherapy resistance in small cell lung cancer 
        
          2025-Jul-24, NPJ precision oncology
          
          IF:6.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41698-025-01005-5
          PMID:40702109
         
       | 
      
      研究论文 | 通过空间转录组学揭示上皮细胞驯化巨噬细胞促进小细胞肺癌免疫治疗耐药性的机制 | 首次发现上皮细胞通过MIF基因诱导髓系细胞向M2巨噬细胞极化,并通过SPP1-PI3K-AKT信号轴驱动上皮细胞亚型转化 | 样本量有限(18例患者),需要更大规模研究验证 | 探究小细胞肺癌肿瘤微环境中免疫化疗耐药机制 | 广泛期小细胞肺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 18例广泛期小细胞肺癌患者 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3695 | 2025-10-06 | 
         RBM17 promotes hepatocellular carcinoma progression by regulating lipid metabolism and immune microenvironment: implications for therapeutic targeting 
        
          2025-Jul-23, Cell death discovery
          
          IF:6.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41420-025-02642-2
          PMID:40702000
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白RBM17通过调控可变剪接影响肝细胞癌脂质代谢和免疫微环境的机制 | 首次阐明RBM17通过调控CSAD和HACD3基因的可变剪接促进M2巨噬细胞浸润和CD8 T细胞功能,并发现RUNX1-RBM17信号轴在肝癌中的新作用 | NA | 探索RBM17在肝细胞癌进展中的作用机制及其治疗靶点潜力 | 肝细胞癌细胞和组织 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 无标记蛋白质组学、单细胞测序、高通量测序、流式细胞术、液相色谱-串联质谱、多参数免疫荧光、染色质免疫沉淀 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、质谱数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA | 
| 3696 | 2025-10-06 | 
         Single-cell perspective on the Monocyte-to-HDL cholesterol ratio as a metastasis biomarker in papillary thyroid cancer 
        
          2025-Jul-23, BMC cancer
          
          IF:3.4Q2
          
         
        
          DOI:10.1186/s12885-025-14373-9
          PMID:40702447
         
       | 
      
      研究论文 | 从单细胞角度探讨单核细胞与高密度脂蛋白胆固醇比率作为甲状腺乳头状癌转移生物标志物的潜力 | 首次从单细胞视角揭示MHR在甲状腺乳头状癌中的潜在作用,发现与胆固醇稳态失调相关的细胞簇和巨噬细胞亚群 | NA | 探讨单核细胞与高密度脂蛋白胆固醇比率作为甲状腺乳头状癌淋巴结转移生物标志物的作用机制 | 甲状腺乳头状癌患者临床数据、单细胞RNA测序数据、体外实验模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 共培养实验, Transwell实验 | NA | 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | GSE191288和GSE193581数据集整合分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3697 | 2025-10-06 | 
         Prkcq in ILC2 cells-enhanced the amounts of tissue-resident macrophages promotes pancreatic fibrosis in chronic pancreatitis 
        
          2025-Jul-22, Archives of biochemistry and biophysics
          
          IF:3.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.abb.2025.110559
          PMID:40706949
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现Prkcq通过调控ILC2细胞影响组织驻留巨噬细胞数量,从而促进慢性胰腺炎中的胰腺纤维化 | 首次揭示Prkcq在ILC2细胞中通过调控IL-4表达影响TRM数量,进而驱动胰腺纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究慢性胰腺炎中纤维化形成的分子机制 | 小鼠慢性胰腺炎模型中的ILC2细胞和组织驻留巨噬细胞 | 单细胞测序 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的小鼠单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3698 | 2025-10-06 | 
         Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro 
        
          2025-Jul-22, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031
          PMID:40712580
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析体内外软骨细胞分化动态,为改善体外软骨生成提供框架 | 结合胚胎长骨单细胞RNA测序数据与公共数据构建软骨内骨化图谱,首次将人类胚胎干细胞软骨生成协议与体内数据进行轨迹对齐分析 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 改善体外软骨生成方法,促进肌肉骨骼疾病建模和再生医学发展 | 胚胎长骨组织、人类胚胎干细胞、已发表的体外软骨生成协议 | 单细胞生物学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) | 轨迹对齐分析 | 单细胞转录组数据 | 胚胎长骨样本和人类胚胎干细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA | 
| 3699 | 2025-10-06 | 
         Marsupial single-cell transcriptomics identifies temporal diversity in mammalian developmental programs 
        
          2025-Jul-22, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.037
          PMID:40712578
         
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      研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术构建了有袋类动物负鼠的早期发育图谱,揭示了哺乳动物发育程序的时间多样性 | 首次在有袋类动物中构建了原肠胚形成和早期器官发生的单细胞转录组图谱,发现了前部结构发育的转录程序比真兽类更早启动和更快进展 | 研究仅针对单一有袋类物种,未与其他有袋类物种进行比较 | 研究哺乳动物发育程序的时间多样性,特别关注有袋类动物的异时发育现象 | 负鼠(Monodelphis domestica)的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 负鼠胚胎发育多个时期的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3700 | 2025-10-06 | 
         A visual-omics foundation model to bridge histopathology with spatial transcriptomics 
        
          2025-Jul, Nature methods
          
          IF:36.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41592-025-02707-1
          PMID:40442373
         
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      研究论文 | 开发了一个名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型,能够整合组织病理学图像与空间转录组学数据 | 首个将组织病理学图像与转录组学数据整合的基础模型,通过将转录组数据转化为'句子'形式实现跨模态学习 | NA | 构建能够桥接组织病理学与空间转录组学的计算模型 | 32个器官的组织样本 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 基础模型 | 图像,转录组数据 | 220万对组织图像和转录组数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |