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当前共找到 37637 篇文献，本页显示第 3681 - 3700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2026-01-28 |
Molecular mechanisms of environmental bisphenol exposure in major depressive disorder: A multimodal analysis
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119716
PMID:41529471
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、机器学习、单细胞分析、分子对接、分子动力学模拟和动物实验，系统地揭示了双酚类化合物通过影响特定靶点和通路参与重度抑郁症发病的分子机制 | 首次采用多模态分析方法，结合计算预测与实验验证，系统阐明了双酚类环境污染物与重度抑郁症之间的分子互作网络，并识别出五个高置信度生物标志物 | 研究主要基于动物模型和计算模拟，在人类样本中的直接验证仍需进一步扩大，且环境暴露的剂量和时间效应有待更深入探讨 | 探究环境双酚暴露在重度抑郁症发病中的分子机制 | 双酚类化合物、重度抑郁症相关分子靶点与通路、小鼠模型 | 计算生物学、神经科学、环境毒理学 | 重度抑郁症 | 网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、qPCR、Western blot | 机器学习模型（未指定具体类型） | 基因表达数据、蛋白质数据、分子结构数据、行为学数据 | 涉及123个共享靶点的网络分析，以及MDD患者和小鼠模型的实验数据（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3682 | 2026-01-28 |
Enhanced MiRISC expression noise reduction by self-feedback regulation of mRNA degradation
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.12.025
PMID:41550138
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了miRISC通过负向自反馈调节mRNA降解来增强表达噪声抑制的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并直接证明通过mRNA降解的自反馈调节实现噪声降低 | NA | 研究miRNA介导的噪声抑制子系统中miRISC通过自反馈调节增强表达噪声减少的机制 | miRNA靶向的mRNAs和miRISC mRNAs（AGO1/2/3和TNRC6A/B/C） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 数学建模 | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3683 | 2026-01-28 |
Multi-modal data to identify key factors influencing lung injury in ARDS patients undergoing invasive mechanical ventilation: A prospective multi-center observational study protocol
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332985
PMID:41575959
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研究论文 | 本研究是一项前瞻性多中心观察性研究，旨在通过多模态数据分析，识别影响接受有创机械通气的ARDS患者肺损伤的关键因素 | 整合多组学分析（包括宏基因组/宏转录组测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学和代谢组学）与临床生理参数，以揭示ARDS的异质性并识别核心预后标志物 | 研究设计为观察性，样本量相对有限（计划招募165名患者），且依赖于多中心协调，可能存在数据收集的变异性 | 研究机械通气期间ARDS发生和发展的机制，为未来治疗提供理论基础和实践指导 | 中度至重度ARDS并接受机械通气的患者 | 数字病理学 | 肺损伤/ARDS | 宏基因组/宏转录组测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学检测、代谢组学分析 | 预测模型（通过早期或晚期融合构建） | 多模态数据（包括组学数据、临床参数、影像学数据） | 计划招募超过165名患者，来自10个医疗中心 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 宏基因组测序, 宏转录组测序, 蛋白质组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 3684 | 2026-01-28 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Correlation Between Immune Cell Composition and Gene Expression in Cervical Cancer
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70998
PMID:41588920
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了宫颈癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成及其与基因表达的相关性 | 通过单细胞RNA测序揭示了宫颈癌中12种独特的细胞群体，并发现了TNFRSF18等关键基因与免疫细胞比例之间的复杂关系 | 未明确说明样本来源的具体数量或临床特征，可能限制了结果的普遍适用性 | 研究宫颈癌肿瘤微环境中免疫细胞亚群的分布模式及其与基因表达的相关性 | 宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP, t-SNE | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3685 | 2026-01-28 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-Dec, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠回肠的首个整合单细胞图谱，揭示了上皮细胞和免疫细胞的异质性、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用 | 首次提供了小鼠回肠的整合单细胞图谱，系统描绘了上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫细胞间的相互作用，特别是在肠上皮细胞亚群中发现了与维生素A、类胡萝卜素和维生素B12吸收相关的特异性功能 | 研究仅基于8周龄雄性C57BL/6J小鼠，样本来源单一，未涵盖不同年龄、性别或疾病状态，且未进行功能验证实验 | 绘制回肠细胞异质性图谱，定义上皮细胞分化、营养代谢程序以及上皮-免疫相互作用，以揭示其在健康和疾病中的作用 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat | 单细胞基因表达数据 | 32,076个回肠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3686 | 2026-01-28 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬来影响恢复的机制 | 首次揭示了TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究TREM2在脊髓损伤中的潜在机制及其对小胶质细胞功能的影响 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞，以及脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，免疫荧光，3D步态分析，运动诱发电位实验，H&E染色，Masson染色 | NA | 测序数据，图像数据，行为数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3687 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
|
研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3688 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3689 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
|
研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3690 | 2026-01-28 |
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.29.564555
PMID:39677775
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺浸润性小叶癌（ILC）中MDC1蛋白作为雌激素受体共调节因子的新功能，并发现该功能与同源重组修复功能障碍及PARP抑制剂敏感性相关 | 首次发现MDC1在ILC细胞中作为雌激素受体的共调节因子，并揭示这种新功能导致独特的同源重组修复功能障碍（不同于经典BRCAness状态），且与PARP抑制剂敏感性相关 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，临床样本验证有限；MDC1共调节功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳腺浸润性小叶癌中MDC1蛋白的双重功能（DNA修复与雌激素受体共调节）及其治疗意义 | 乳腺浸润性小叶癌细胞系、异种移植模型及肿瘤数据 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析、异种移植模型 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC细胞系及异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3691 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 3692 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
DOI:10.52202/079017-1129
PMID:41551654
|
研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度 | 数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度 | 旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究 | 空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3693 | 2026-01-28 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-11-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白，抑制I型干扰素信号通路，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）持续感染和HBV诱导的肝细胞癌（HCC）发生的新机制 | 首次发现UBR7在非组蛋白（Sp110）泛素化中的新功能，并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索 | 探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制 | 乙型肝炎病毒（HBV）、肝细胞癌（HCC）细胞、HCC患者样本 | 分子生物学与肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | HCC患者样本（具体数量未明确说明） | NA | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 3694 | 2026-01-28 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集，构建了一个元图谱，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因，并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识 | 首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集，生成共识元图谱，以改善罕见神经元类别的分辨率，并连接转录组谱与历史分类系统 | 数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法，可能导致细胞类型检测差异；未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接 | 通过整合scRNA-seq数据集，达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识，并提高罕见神经元类别的检测能力 | 小鼠肠道神经系统中的神经元 | 单细胞转录组学 | 肠道动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集，涉及数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3695 | 2026-01-28 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响，覆盖多个平台和超过50个真实数据集 | 未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制，可能受数据集异质性限制 | 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3696 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3697 | 2026-01-27 |
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-Mar, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117634
PMID:41391693
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研究论文 | 本研究探讨了钾通道调节因子1（KCMF1）在卵巢癌中的生物学功能及其通过调节HRI泛素化抑制整合应激反应（ISR）的机制 | 首次揭示了KCMF1通过调控HRI泛素化抑制ISR通路促进卵巢癌进展的新机制，并鉴定出Plantainoside D作为新型KCMF1抑制剂 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏临床患者样本的深入验证 | 探究KCMF1在卵巢癌中的生物学功能及分子机制 | 卵巢癌细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、免疫组化、Western blot、Ni-NTA pull-down | 异种移植小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 未明确样本数量，使用细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3698 | 2026-01-27 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术鉴定了人脱落乳牙干细胞的功能亚群，并揭示了其血管生成和软骨生成能力 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定了SHEDs中的BAMBI⁺功能亚群，并证实其具有更强的增殖、软骨生成和血管生成能力 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源有限，可能影响结果的普适性 | 鉴定人脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标记，为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人脱落乳牙干细胞（SHEDs） | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、Western blot、组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3699 | 2026-01-27 |
Temporal single-cell landscape suggests infection-induced IgM plasma cells as a correlate of durable influenza immunity
2026-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2025.108227
PMID:41242688
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和BCR数据分析，比较了自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，揭示了感染诱导的IgM⁺浆细胞群在持久免疫中的潜在作用 | 首次在单细胞水平上全面比较了流感自然感染与疫苗接种后的B细胞反应，识别出感染特有的、具有持续HLA-II表达的IgM⁺浆细胞群，并揭示了感染与疫苗接种在干扰素刺激基因表达、克隆多样性及时间动态上的关键差异 | 样本量较小（仅7名个体），且仅针对H3N2流感病毒，可能限制了结果的普遍适用性 | 比较流感自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，以探索持久免疫的相关因素 | 人类B细胞 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组测序，BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，BCR序列数据 | 7名个体（3名自然H3N2感染者，4名四价疫苗接种者），共150,131个B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3700 | 2026-01-27 |
FAST: Scalable Factor Analysis for Spatial Dimension Reduction of Multi-section Spatial Transcriptomics
2026-Jan-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag006
PMID:41581212
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研究论文 | 本文开发了一种名为FAST的可扩展因子分析模型，用于多切片空间转录组数据的空间降维处理 | FAST模型能同时处理多切片计数数据，并利用局部空间依赖性进行可扩展计算，是唯一能在2小时内分析超过230万个空间位置数据的方法 | 论文未明确说明模型在处理极高维度或噪声数据时的具体限制 | 开发高效可扩展的空间降维方法以处理大规模多切片空间转录组数据 | 空间转录组数据，包括模拟数据集、真实数据集（小鼠胚胎Stereo-seq数据和乳腺癌Xenium数据） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学技术 | 概率因子分析模型 | 空间转录组计数数据 | 超过230万个空间位置（来自小鼠胚胎Stereo-seq数据集） | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq, Xenium | 小鼠胚胎Stereo-seq数据集和乳腺癌Xenium数据集 |