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当前共找到 37421 篇文献,本页显示第 3681 - 3700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3681 2026-01-21
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变,特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化,并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 研究样本量相对有限,且主要基于血浆分析,未深入探讨其他组织或长期临床影响 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 唐氏综合征患者和小鼠模型 代谢组学 唐氏综合征 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 Dp16小鼠模型 血浆、RNA序列数据 超过400人 NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 NA NA
3682 2026-01-21
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法,用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 scLANE测试基于可解释的广义线性模型,通过经验选择的基样条处理非线性,并扩展至估计方程和混合模型,以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 NA 开发一种可解释的轨迹推断方法,以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq 广义线性模型(GLM)、基样条、估计方程、混合模型 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3683 2026-01-21
Metabolic Adaptations Rewire CD4 T Cells in a Subset-Specific Manner in Human Critical Illness with and without Sepsis
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了危重病(包括脓毒症)患者中CD4 T细胞的代谢适应如何以亚群特异性方式重塑其功能 揭示了调节性T细胞(Tregs)在危重病中通过获得糖酵解能力来稳定其抑制性标志物,并与临床疾病严重程度相关,同时通过单细胞转录组学鉴定了犬尿氨酸代谢在Tregs中的差异作用 未明确说明样本量是否足够大以覆盖所有危重病亚型,且机制研究可能仅限于体外验证 旨在阐明危重病(包括脓毒症)中CD4 T细胞的代谢与免疫功能障碍之间的机制联系 人类CD4 T细胞,特别是来自危重病(有或无脓毒症)患者和健康成年人的样本 免疫学 脓毒症 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3684 2026-01-21
Cigarette smoke and biological age induce degenerative heterogeneity in retinal pigment epithelium
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了香烟烟雾通过表观遗传变化诱导视网膜色素上皮细胞退行性异质性,并加速衰老的过程 首次结合snRNA-seq和snATAC-seq技术,揭示了香烟烟雾诱导的RPE细胞退行性异质性及其与衰老的差异,并在人类样本中验证了与早期年龄相关性黄斑变性的关联 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,可能无法完全反映人类疾病的复杂性 探究香烟烟雾如何通过表观遗传机制诱导视网膜色素上皮细胞的退行性异质性,并加速衰老过程 年轻和老年小鼠的视网膜色素上皮/脉络膜组织,以及吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 snRNA-seq, snATAC-seq, scRNA-seq, TUNEL标记 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 年轻和老年小鼠的RPE/脉络膜组织,以及来自吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
3685 2026-01-21
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为DBiTplus的整合多模态空间组学方法,结合了基于测序的空间转录组学和基于成像的空间蛋白质分析,用于在同一组织切片上进行单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路研究 开发了DBiTplus方法,首次在同一组织切片上整合了测序和成像两种空间组学技术,实现了单细胞分辨率的转录组和蛋白质组空间图谱构建 在应用示例中,小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物,可能限制了蛋白质分析的全面性 开发一种整合多模态空间组学方法,以在同一组织切片上同时分析转录组和蛋白质组空间信息 小鼠胚胎、正常人类淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质分析、微流体技术 NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据 多个组织样本,包括小鼠胚胎、人类淋巴结和淋巴瘤FFPE组织 NA 空间转录组学、空间蛋白质分析 DBiTplus、CODEX DBiTplus整合了测序和成像技术,CODEX用于高多重蛋白质成像
3686 2026-01-21
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了DBiTplus,一种整合成像和测序的空间组学方法,用于在同一组织切片上同时进行空间转录组学和蛋白质谱分析 DBiTplus通过微流体DNA寡核苷酸递送和RNaseH处理,首次实现了测序基空间转录组学与成像基高复用蛋白质谱在同一组织切片上的整合,支持单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路探索 在应用示例中,小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物,可能影响蛋白质谱的全面性 开发一种多模态空间组学方法,以整合空间转录组学和蛋白质谱,促进对异质性细胞过程的理解 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质谱、微流体技术、RNaseH处理 NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据 包括小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞空间转录组学、空间蛋白质谱 DBiTplus、CODEX DBiTplus结合了测序基空间转录组学和CODEX高复用蛋白质成像技术,使用微流体DNA寡核苷酸进行空间条形码编码
3687 2026-01-21
Single cell RNA-sequencing identifies the effect of Normothermic ex vivo liver perfusion on liver-resident T cells
2024-10, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞的影响,并评估了抗炎细胞因子在减少T细胞激活中的作用 首次在大鼠肝脏中创建了肝脏驻留记忆T细胞的图谱,并在单细胞基因表达水平上展示了常温体外肝脏灌注对T细胞的影响 研究仅基于大鼠模型,未涉及人类样本,且样本规模有限,可能影响结果的普适性 研究常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞表型的影响,并评估抗炎细胞因子在灌注过程中的保护作用 大鼠肝脏及其中的组织驻留记忆T细胞 单细胞测序 肝脏移植相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 大鼠肝脏样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3688 2026-01-21
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为STAN的计算框架,用于从空间转录组学数据中推断空间信息化的转录因子活性 STAN是一种线性混合效应计算方法,首次整合了转录因子-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和形态学特征,以预测斑点特异性的空间转录因子活性 NA 系统性地估计调控细胞身份的转录因子活性,并揭示转录因子与空间组织之间的相互作用 淋巴结、乳腺癌和胶质母细胞瘤的空间转录组学数据集 计算生物学 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 空间转录组学 线性混合效应模型 空间转录组学数据, 成像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3689 2026-01-21
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-08, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型中,探究了缺血性卒中后1、12和24小时周细胞转录组特征的时间差异 首次在急性缺血性卒中模型中,通过单细胞RNA测序揭示了周细胞在卒中后特定时间点(12和24小时)出现一个独特的亚群,该亚群以细胞因子信号和免疫反应相关基因上调为特征 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;且仅关注了急性期(24小时内)的变化,未涉及更长期的转录组动态 探究急性缺血性卒中后周细胞的转录组变化,以寻找潜在的治疗靶点 小鼠模型中的周细胞 单细胞转录组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠永久性大脑中动脉闭塞模型在卒中后1、12和24小时的时间点样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3690 2026-01-21
Deciphering the molecular landscape of human peripheral nerves: implications for diabetic peripheral neuropathy
2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过批量与空间RNA测序分析人类胫神经和腓肠神经,揭示了糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞转录组变化 首次结合批量与空间转录组学分析人类周围神经,发现感觉轴突mRNA运输在神经退行中的潜在作用 样本主要来自糖尿病患者截肢手术,可能无法完全代表早期或轻度病变 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞变化 人类胫神经和腓肠神经 数字病理学 糖尿病周围神经病变 批量RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 来自下肢截肢手术的胫神经和腓肠神经样本,主要来自糖尿病患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3691 2026-01-21
SLC45A3 Serves as a Potential Therapeutic Biomarker to Attenuate White Matter Injury After Intracerebral Hemorrhage
2024-06, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和动物实验,发现SLC45A3基因在脑出血后白质损伤中作为潜在治疗生物标志物,其过表达可减轻脑损伤 首次结合加权基因共表达网络分析、差异表达基因筛选及单细胞RNA-seq技术,系统鉴定SLC45A3在脑出血后白质损伤中的关键作用,并验证其治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,尚未在人类临床样本中进行验证,且具体分子机制需进一步探索 探究脑出血后白质损伤的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 脑出血小鼠模型(自体血或胶原酶诱导)及公共基因表达数据集(GSE24265、GSE125512、GSE167593) 生物信息学与神经科学 脑血管疾病(脑出血) 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、差异表达基因分析、单细胞RNA-seq、扩散张量成像(DTI)、基础医学实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 两个公共数据集(GSE24265和GSE125512)及一个单细胞RNA-seq数据集(GSE167593),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3692 2026-01-20
C-X-C chemokine receptor CXCR4 mediates diurnal changes in the aggregation and dispersion of CD8+ T cells within the tumor microenvironment
2026-Mar-15, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了CXCR4介导的CD8+ T细胞在肿瘤微环境中昼夜节律性聚集与分散的机制,并提出了通过时间依赖性抑制CXCR4来增强免疫检查点抑制剂疗效的新策略 首次发现肿瘤浸润CD8+ T细胞中CXCR4表达的昼夜节律性变化及其通过TGF-β-SMAD信号通路受SMAD7时间依赖性调控的机制,并证明在CXCR4表达高峰时相给予抑制剂可促进T细胞在肿瘤组织中的分散,从而增强免疫治疗效果 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA-seq数据的重分析,在人体中的直接验证尚不充分;昼夜节律调控的具体分子机制细节仍需进一步阐明 探究肿瘤微环境中CD8+ T细胞空间分布的昼夜节律变化机制及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 肿瘤浸润CD8+ T细胞、脾脏T细胞、表达CXCL12的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肺癌患者T细胞单细胞RNA-seq数据 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3693 2026-01-20
Single-cell transcriptomic analysis reveals the molecular alterations of endothelial cells during ageing
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了年轻与年老主动脉中内皮细胞的分子变化,探讨了血管老化的潜在机制 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与年老主动脉内皮细胞的转录组差异,并提出了AP-1和Egr1作为血管老化关键转录因子的新见解 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一(主动脉),未涵盖其他血管类型;机制研究尚待深入实验验证 探究血管老化过程中内皮细胞的分子变化机制 年轻与年老小鼠主动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻组与年老组小鼠主动脉样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3694 2026-01-20
Expression profiles of GPR56 and CD99 in T cells of AIDS patients and assessment of diagnostic value
2026-Mar, Diagnostic microbiology and infectious disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的表达动态,评估其作为疾病进展和诊断生物标志物的潜力 首次系统评估了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的蛋白表达谱,并发现CD8⁺GPR56⁺CD99⁺ T细胞亚群对HIV感染具有高诊断准确性 样本量相对较小(36例患者和35例对照),且年龄和性别分布存在差异,可能影响结果的普适性 探究GPR56和CD99在艾滋病进展中的表达变化,并评估其作为诊断生物标志物的价值 艾滋病患者和健康对照者的外周血T细胞 生物信息学 艾滋病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 36例艾滋病患者(男性31例,女性5例,年龄41.58±12.42岁)和35例健康对照(男性25例,女性10例,年龄32.17±12.09岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3695 2026-01-20
Inhibition of c-Jun/Bak signaling alleviates endothelial cell senescence and inflammation caused by mitochondrial dysfunction in DMED
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了c-Jun/Bak信号通路是糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的关键驱动因素 首次在糖尿病性勃起功能障碍中鉴定出c-Jun/Bak信号通路作为内皮细胞衰老和炎症的关键驱动机制,并提出了靶向该通路线粒体调控的治疗新策略 研究主要基于啮齿动物模型,人类糖尿病的复杂性使得转化应用面临挑战,需要进一步研究 探究糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 糖尿病性勃起功能障碍大鼠的阴茎海绵体内皮细胞及体外细胞模型 数字病理学 糖尿病并发症 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA RNA测序数据 糖尿病性勃起功能障碍大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3696 2026-01-20
Mitochondrial dysregulation as a central mechanism in autism spectrum disorder pathogenesis
2026-Mar, Journal of neuroimmunology IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的作用,使用多种临床前模型 通过整合母体免疫激活和ASD高风险基因敲除模型,结合转录组分析和单细胞RNA-seq数据,揭示了线粒体代谢在ASD中的核心作用,并强调了其在人类大脑发育中的相关性 研究主要基于临床前动物模型,人类数据的直接验证有限,且环境因素与线粒体功能障碍的具体联系机制仍需进一步阐明 探究线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的角色 小鼠脑组织、母体免疫激活模型、ASD高风险基因敲除模型、人类胎儿单细胞图谱数据 神经科学 自闭症谱系障碍 转录组分析、单细胞RNA-seq、功能富集分析(GO和KEGG) NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3697 2026-01-20
LIPA-driven reprogramming of tumor-associated macrophages shapes an immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma
2026-Feb-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文研究了脂蛋白脂肪酶(LIPA)在骨肉瘤中通过重编程肿瘤相关巨噬细胞来塑造免疫抑制微环境的作用 首次将LIPA驱动的巨噬细胞重编程与骨肉瘤的免疫抑制微环境联系起来,并通过单细胞测序在多个样本中验证了LIPA表达巨噬细胞亚群的存在,同时通过虚拟筛选发现了FDA批准的药物Glecaprevir作为潜在的LIPA抑制剂 研究主要基于小鼠模型和患者来源的异种移植样本,人类临床样本的直接验证可能有限,且Glecaprevir作为LIPA抑制剂的疗效和安全性需进一步体内外实验验证 探究甘油三酯代谢在骨肉瘤进展中的作用,特别是LIPA基因如何影响肿瘤微环境和免疫抑制 骨肉瘤小鼠模型、人类骨肉瘤样本、患者来源的异种移植(PDX)样本 肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞测序、结构虚拟筛选、功能研究 风险评分模型 基因表达数据、单细胞测序数据 包括小鼠模型、人类样本和PDX样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3698 2026-01-20
Multi-omics analysis identifies a glycosyltransferase-related prognostic signature linked to the immune landscape in colorectal cancer
2026-Feb-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,构建了一个与结直肠癌免疫景观相关的糖基转移酶相关基因预后特征,并鉴定出CHPF作为核心候选基因 首次整合了批量转录组、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,系统性地揭示了糖基转移酶相关基因在结直肠癌肿瘤微环境异质性、细胞间通讯和预后中的作用,并构建了一个九基因预后特征 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证;功能实验仅聚焦于CHPF基因,其他特征基因的生物学功能有待探索 阐明糖基转移酶相关基因在结直肠癌肿瘤微环境异质性、免疫景观和患者预后中的作用,并构建预后模型 结直肠癌患者(来自TCGA-COAD/READ和GSE39582队列)的肿瘤组织、单细胞RNA-seq数据(GSE132257)以及空间转录组学数据 生物信息学与计算生物学 结直肠癌 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, LASSO-Cox回归, 单变量Cox回归, 功能实验(细胞增殖、迁移、侵袭) LASSO-Cox回归模型(用于构建预后特征) 转录组数据, 临床数据, 突变数据, 单细胞表达数据, 空间表达数据 训练队列(TCGA-COAD/READ)和外部验证队列(GSE39582)的结直肠癌患者样本;单细胞RNA-seq数据集(GSE132257) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
3699 2026-01-20
GLRX5 is a prognostic marker in bladder cancer and correlates with activation of cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment
2026-Feb-15, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨了GLRX5在膀胱癌中的表达、预后意义及其与肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞激活的关联 首次将GLRX5与膀胱癌预后及CAFs激活联系起来,并结合单细胞和空间转录组学数据验证其在TME中的作用 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证,且机制探索仍需进一步深入 探究GLRX5在膀胱癌中的功能、预后价值及其与肿瘤微环境的相互作用 膀胱癌(BLCA)患者数据、肿瘤细胞及癌症相关成纤维细胞(CAFs) 生物信息学与肿瘤学 膀胱癌 生物信息学分析、单细胞转录组学、空间转录组学、体外细胞功能实验 ssGSEA算法、GO、KEGG、GSEA富集分析 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 基于TCGA和GEO数据库的膀胱癌样本数据,具体数量未明确说明 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
3700 2026-01-20
Ketogenic diet impairs NK cell cytotoxic function in colorectal cancer liver metastasis by inducing ferroptosis via suppression of the p62-Keap1-Nrf2 pathway
2026-Feb, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了生酮饮食通过诱导NK细胞铁死亡促进结直肠癌肝转移的机制 首次发现生酮饮食通过p62-Keap1-Nrf2通路诱导NK细胞铁死亡,从而削弱抗肿瘤免疫 研究主要基于小鼠模型,人体验证数据有限;生酮饮食的具体成分和持续时间对结果的影响未充分探讨 探究生酮饮食对结直肠癌肝转移的影响及其免疫调控机制 结直肠癌肝转移小鼠模型、患者肿瘤微环境中的NK细胞 肿瘤免疫学 结直肠癌肝转移 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光染色、非靶向代谢组学 小鼠肿瘤模型 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和患者组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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