单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 3681 - 3700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3681 | 2025-02-11 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Feb-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文综述了CITE-Seq技术，一种同时分析单个细胞中基因表达和蛋白质丰度的先进单细胞测序方法 | 本文详细介绍了CITE-Seq的工作流程，并提供了使用抗体衍生标签（ADTs）染色细胞的关键考虑因素 | 本文主要基于微孔单细胞分析系统，可能不涵盖所有CITE-Seq应用场景 | 探讨CITE-Seq技术在单细胞多组学分析中的应用 | 单个细胞中的基因表达和蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签（ADTs） | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA |
| 3682 | 2025-02-11 |
Retrotrans-genomics identifies aberrant THE1B endogenous retrovirus fusion transcripts in the pathogenesis of sarcoidosis
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56567-6
PMID:39920152
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研究论文 | 本文通过短读和长读RNA-seq分析，识别了19种THE1B融合转录本，其中15种是之前未映射的，并在16名患有结节病性肌病（SM）的个体中显示出较高的表达 | 首次通过retrotrans-genomics方法识别了THE1B融合转录本在结节病发病机制中的作用，并揭示了新的读穿转录本SIRPB1-SIRPD和TREM2.1 | 研究样本量相对较小，且主要集中于结节病性肌病，可能限制了结果的普遍性 | 探索THE1B融合转录本在结节病发病机制中的作用 | 结节病性肌病（SM）患者和对照组 | 基因组学 | 结节病 | 短读和长读RNA-seq分析，单细胞或单核RNA-seq分析 | NA | RNA-seq数据 | 16名SM患者和400名其他肌肉疾病患者 |
| 3683 | 2025-02-11 |
Multiomics identify the gene expression signature of the spinal cord during aging process
2025-Feb-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07475-4
PMID:39920442
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了脊髓在衰老过程中的基因表达特征 | 结合bulk RNA测序和空间转录组学技术，首次全面描绘了衰老脊髓的转录组特征，并发现Fth1基因在衰老混合胶质细胞中介导铁死亡抗性的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究 | 探究衰老过程中脊髓的分子变化特征及其机制 | 年轻和衰老的脊髓组织 | 生物信息学 | 老年疾病 | bulk RNA测序，空间转录组学，流式细胞术，CCK-8实验，siRNA和慢病毒实验 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 年轻和衰老的脊髓组织样本 |
| 3684 | 2025-02-11 |
Transcriptomic profiles of single-cell autophagy-related genes (ATGs) in lung diseases
2025-Feb-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-09990-w
PMID:39920481
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，揭示了自噬相关基因（ATGs）在肺部疾病中的转录组图谱，重点关注肺上皮细胞和淋巴细胞 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）全面研究了健康人和不同肺部疾病患者肺组织中ATGs的RNA表达谱，揭示了ATGs在不同肺上皮细胞亚群中的显著表达差异 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 阐明ATGs在肺部疾病中的表达变化及其在疾病进展和预后中的潜在作用 | 健康人和患有不同肺部疾病（如COVID-19相关急性肺损伤、特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺病、系统性硬化症和肺腺癌）的患者的肺组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 健康人和患有不同肺部疾病的患者的肺组织样本 |
| 3685 | 2025-02-11 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
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研究论文 | 本研究旨在构建基于NK细胞标记基因的签名，以预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 通过整合单细胞RNA测序数据和TCGA结直肠癌样本的WGCNA分析，识别出NK细胞相关的核心基因和特征基因，并构建了一个新的预后签名 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 587个TCGA结直肠癌样本，124和201个GEO验证样本 |
| 3686 | 2025-02-11 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-Feb-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
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研究论文 | 本文探讨了壁细胞功能障碍如何通过促进内皮功能障碍和血管重塑导致舒张性心力衰竭 | 首次探索了壁细胞在HFpEF中的作用，并揭示了壁细胞通过TNFα依赖性旁分泌信号传导诱导内皮细胞生长停滞的机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 研究壁细胞功能障碍在HFpEF中的作用及其机制 | 糖尿病db/db小鼠和PDGFRβtg/tg-CreERT2-EYFPtg/tg小鼠 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、NicheNet分析、组织学分析 | 小鼠模型 | RNA测序数据、组织学数据 | 糖尿病db/db小鼠和PDGFRβtg/tg-CreERT2-EYFPtg/tg小鼠 |
| 3687 | 2025-02-11 |
Decoding SFRP2 progenitors in sustaining tooth growth at single-cell resolution
2025-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04190-z
PMID:39920788
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，揭示了小鼠和人类牙齿中Sfrp2hi成纤维祖细胞在维持牙齿持续生长中的关键作用 | 首次识别出小鼠门牙和人类臼齿发育根部特有的Sfrp2hi成纤维祖细胞群，并阐明了其通过MAPK磷酸化调控Twist1转录因子结合Sfrp2启动子，进而调节Wnt信号通路以维持干细胞特性的分子机制 | 将小鼠牙齿的研究结果应用于人类疾病的研究仍显不足 | 探索小鼠和人类牙齿中组织相似性和物种特异性差异，特别是牙齿持续生长的机制 | 小鼠门牙和人类臼齿的牙髓细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞数据集 |
| 3688 | 2025-02-11 |
TAp63γ is the primary isoform of TP63 for tumor suppression but not development
2025-Feb-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02326-x
PMID:39915463
|
研究论文 | 本文探讨了TP63基因的不同亚型在肿瘤抑制和发育中的作用，特别是TAp63γ的功能 | 首次通过CRISPR-cas9技术生成p63γ缺陷小鼠模型，揭示了TAp63γ在肿瘤抑制中的主要作用，而非发育 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探索TP63基因不同亚型在肿瘤抑制和发育中的具体功能 | TP63基因的不同亚型，特别是TAp63γ | 分子生物学 | 肿瘤 | CRISPR-cas9, 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | p63γ缺陷小鼠 |
| 3689 | 2025-02-11 |
Myeloma cell-derived CXCL7 facilitates proliferation of tumor cells and occurrence of osteolytic lesions through JAK/STAT3 pathway
2025-Feb-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07413-6
PMID:39915476
|
研究论文 | 本文探讨了多发性骨髓瘤（MM）细胞衍生的CXCL7通过JAK/STAT3途径促进肿瘤细胞增殖和溶骨性病变的发生 | 发现了CXCL7在MM中的关键作用，揭示了其通过JAK/STAT3途径促进肿瘤细胞增殖和溶骨性病变的机制 | 研究主要基于小鼠异种移植肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究CXCL7在多发性骨髓瘤中的作用及其对溶骨性病变的影响 | 多发性骨髓瘤细胞和小鼠异种移植肿瘤模型 | 癌症研究 | 多发性骨髓瘤 | 转录组数据分析、单细胞RNA-seq | 小鼠异种移植肿瘤模型 | RNA-seq数据 | 来自本中心和GEO数据库的转录组数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 3690 | 2025-02-11 |
Single-cell atlas of human pancreatic islet and acinar endothelial cells in health and diabetes
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55415-3
PMID:39915484
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞在健康和糖尿病状态下的分子特征 | 首次开发了富集胰岛特异性内皮细胞（ISECs）和腺泡特异性内皮细胞（ASECs）的策略，并揭示了它们在健康和糖尿病状态下的独特分子特征 | 研究仅基于三个人类胰腺样本，样本量较小 | 研究人类胰腺内皮细胞在健康和糖尿病状态下的分子特征及其在胰腺病理生理学中的作用 | 人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞 | 单细胞RNA测序 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个人类胰腺样本 |
| 3691 | 2025-02-11 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）中PRG-1的分子机制和细胞异质性，以及其在突触可塑性调节中的作用 | 揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路在DCD中的突触可塑性调节作用，并发现了miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对PRG-1的靶向调控 | 研究主要基于体外高糖诱导的HT22细胞损伤模型，尚未在体内模型中验证 | 探讨糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）的分子机制和细胞异质性，以及PRG-1在该过程中的功能作用 | 海马细胞、HT22细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 3692 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸（RA）和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据，并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
| 3693 | 2025-02-11 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
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研究论文 | 本研究探讨了OLIG2抑制剂CT-179在Sonic Hedgehog亚型髓母细胞瘤中的治疗潜力 | 首次展示了CT-179通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合来改变肿瘤细胞周期动力学，增加分化和凋亡，并延长SHH-MB模型的生存期 | 研究中未提及CT-179的长期副作用或对其他类型肿瘤的影响 | 研究旨在通过靶向OLIG2+肿瘤干细胞来改善SHH驱动的髓母细胞瘤的治疗反应和患者预后 | SHH-MB外植体器官样、PDX和GEM SHH-MB模型 | 肿瘤学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | PDX和GEM模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 3694 | 2025-02-11 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
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研究论文 | 本文介绍了Phospho-seq，一种集成方法，旨在量化细胞质和核蛋白，包括具有翻译后修饰的蛋白，并将其活性与顺式调控元件和转录目标联系起来 | Phospho-seq结合了简化的实验台抗体偶联方法，创建了大型定制神经聚焦抗体面板，用于同时进行蛋白质和scATAC-seq分析，并结合实验和计算策略整合转录组测量 | NA | 研究细胞内蛋白质动态的多模态分析，特别是在神经发育中的细胞信号状态 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄的视网膜和脑类器官 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq, 转录组测量 | NA | 蛋白质数据、转录组数据 | 细胞系、诱导多能干细胞、视网膜和脑类器官 |
| 3695 | 2025-02-11 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
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研究论文 | 本研究旨在表征小鼠视网膜中不同亚型的光敏性视网膜神经节细胞（ipRGCs）中骨桥蛋白的表达模式 | 研究发现骨桥蛋白不仅在M4-ipRGCs中表达，还在M2-ipRGCs中表达，挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs标记物的观点 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或人类视网膜 | 研究目的是确定骨桥蛋白在ipRGCs亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的光敏性视网膜神经节细胞（ipRGCs） | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学（IHC） | NA | RNA测序数据、图像数据 | C57BL/6J小鼠的视网膜切片和平面标本 |
| 3696 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3697 | 2025-02-11 |
Multimodal transcriptomics reveal neurogenic aging trajectories and age-related regional inflammation in the dentate gyrus
2025-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01848-4
PMID:39762661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了齿状回（DG）中神经源性细胞及其周围微环境的转录组特征，以及与神经源性衰老相关的分子变化 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了齿状回中神经源性细胞及其周围微环境的分子动态变化，特别是与年龄相关的神经炎症对神经源性活动的影响 | 未提及具体样本量，可能限制了结果的普适性 | 研究齿状回中神经源性细胞及其周围微环境在衰老过程中的分子变化 | 齿状回中的神经干细胞（NSCs）及其周围微环境 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | NA |
| 3698 | 2025-02-11 |
Changes in border-associated macrophages after stroke: single-cell sequencing analysis
2025-Jan-29, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092
PMID:39927762
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析研究了中风后边界相关巨噬细胞的变化 | 首次全面分析了中风后边界相关巨噬细胞的转录变化及其在炎症相关通路中的调控作用 | 许多细节和潜在机制仍不清楚 | 研究中风后边界相关巨噬细胞的变化及其在神经炎症中的作用 | 小鼠边界相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 中风 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE174574和GSE225948数据集 |
| 3699 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3700 | 2025-02-11 |
Whole-exome sequencing association study reveals genetic effects on tumor microenvironment components in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182768
PMID:39744943
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研究论文 | 本文通过全外显子测序关联研究揭示了鼻咽癌肿瘤微环境成分的遗传影响 | 揭示了与鼻咽癌易感性相关的3种遗传变异，并引入了一种改进的复合多基因风险评分（rcPRS），在预测鼻咽癌风险方面优于现有模型 | NA | 研究鼻咽癌的遗传基础及其与肿瘤微环境成分的相互作用 | 鼻咽癌患者和对照组 | 基因组学 | 鼻咽癌 | 全外显子测序、批量转录组测序、单细胞RNA测序 | 复合多基因风险评分（rcPRS） | 基因组数据、转录组数据 | 6,969例鼻咽癌患者和7,100例对照 |